Antibiotics resistance rates of gram negative esbl positive bacteria isolated from various clinical specimen

Abstract

Aim: The difficulties in the treatment of infections caused by Extended Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) positive microorganisms are one of the most important health problems today. In this study, it was aimed to determine the antibiotics effective in empirical and symptomatic treatment according to the sample type of Gram negative ESBL positive bacteria isolated from various bacteriological cultures. Materials and Methods: This study was carried out by retrospective investigation of bacterial agents and antimicrobial susceptibility various samples sent to routine microbiology laboratory from various services and outpatient clinics between 1 August 2019 and 1 February 2020. Identification of Gram-negative ESBL-positive bacteria and antibiotic susceptibility tests were performed using the conventional method and MicroScan (Beckman Coultre, USA) automated system. Results: Of the 1735 Gram-negative bacteria isolated from 13,968 clinical samples sent to the laboratory, 1041 (60%) were ESBL positive. 1041 for example; 901 (86.55%) were urine, 47 (4.51%) were aspirate, 35 (3.36%) were wounds. Escherichia coli with 732 (70.3%) of ESBL positive bacteria, Klebsiella pneumonia with 249 (23.9%) and Proteus mirabilis with 22 (2.11%) were the most frequently isolated bacteria. While all of these bacteria were resistant to ampicillin-sulbactam, cephalosporin group antibiotics, the group to which the bacteria were most susceptible was carbapenem group antibiotics. Conclusion: Determining the antibiotic resistance status of Gram-negative ESBL-positive bacteria, which are resistant to multiple antibiotics and frequently cause infections, will reveal the current resistance rate and will help increase the success of treatment. Each institution should contribute to country data by detecting its own antibiotic resistance.

Çeşitli klinik örneklerden izole edilen gram negatif gsbl pozitif bakterilerin antibiyotiklere direnç oranları

Abstract

Amaç: Genişlemiş Spektrumlu Beta Laktamaz (GSBL) pozitif mikroorganizmaların neden olduğu enfeksiyonların tedavisindeki zorluklar günümüzde en önemli sağlık sorunlarından biridir. çeşitli bakteriyolojik kültürlerinden izole edilen Gram negatif GSBL pozitif bakterilerin örnek türüne göre ampirik ve semptomatik tedaviye etkili antibiyotiklerin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç Ve Yöntem: Bu çalışma 1 Ağustos 2019-1 Şubat 2020 tarihleri arasında çeşitli servis ve polikliniklerden rutin mikrobiyoloji laboratuvarına yollanan idrar, kan, yara, balgam, eklem sıvısı, plevral sıvı örneklerinden izole edilen bakteriyel etkenler ve antimikrobiyal duyarlılıkların retrospektif araştırılması ile yapılmıştır. Gram negatif GSBL pozitif bakterilerin tanımlanmaları ve antibiyotik duyarlılık testleri konvansiyonel yöntem ve MicroScan (Beckman Coultre, USA ) otomatize sistem ile yapılmıştır. Bulgular: Laboratuvara gönderilen 13,968 klinik örnekten izole edilen 1735 Gram negatif bakterinin 1041 (%60)’i GSBL pozitif idi. 1041 örneğin; 901 (%86,55)’i idrar, 47 (%4,51)’si Trakeal aspirat, 35 (%3,36)’i yara idi. GSBL pozitif bakterilerin en sık izole edilenleri 732(%70,3) ile Escherichia coli, 249(%23,9)’u Klebsiella pneumonia, 22(%2,11)’si Proteus mirabilis oluşturmaktaydı. Bu bakterilerin tamamı ampisilin, ampisilin-sulbaktam ve sefalosporin grubu antibiyotiklere dirençli iken bakterilerin en duyarlı olduğu grup ise karbapenem grubu antibiyotikler idi. Sonuç: Gram negatif bakterilerde, antibiyotiklere dirençli izole edilen suşların oranlarındaki artış, kullanılabilecek tedavi seçeneklerini oldukça kısıtlamaktadır. Özellikle çoklu antibiyotik dirençli, sıklıkla toplum ve hastane kökenli enfeksiyonlara neden olan Gram negatif GSBL pozitif bakterilerin antibiyotik direnç durumlarının belirlenmesi güncel direnç oranını ortaya çıkaracağı gibi tedavi başarısının artırılmasında yardımcı olacaktır. Her kurum kendi antibiyotik direncini saptayarak ülke verilerine katkı sunmalıdır.

Keywords

• Gram negatif bakteri;
• GSBL pozitif;
• antibakteriyel direnç

References

1. 1. Murray PR, Baron EJ, Jorgensen JH. Manual of Clinical Mikrobiology. Başustaoğlu A, Kubar A, Yıldıran ŞT, Tanyüksel M (Çevirenler). 9. baskı, İstanbul: Atlas Basımevi, 2007; 8: 1721-92
2. 2. Abayneh M, Worku T. P Prevalence of multidrug-resistant and extended-spectrum beta- lactamase (ESBL)-producing gramnegative bacilli: A meta-analysis report in Ethiopia. Drug Target Insights. 2020; 14: 16–25.
3. 3. Moges F, Eshetie S, Abebe W et al. High prevalence of extendedspectrum beta-lactamase-producing gram-negative pathogens from patients attending Felege Hiwot Comprehensive Specialized Hospital, Bahir Dar, Amhara region. PLoS One. 2019; 14: 0215177.
4. 4. EUCAST 2019. The European committee on antimicrobial susceptibility testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 9.0, 2019. http://www.eucast.org .
5. 5. Aykan ŞB, Çiftçi İH. Türkiye’de idrar kültürlerinden izole edilen E. coli suşlarının antibiyotiklere direnç durumu: Bir meta analiz. Mikrobiyol Bul 2013; 47: 603-18.
6. 6. Kahraman EP, Karakeçe E, Erdoğan F, Uluyurt H,Köroğlu M, Çiftçi İH. Klebsiella pneumoniae izolatlarının antibiyotikler direnç durumlarının değerlendirilmesi ortadogutipdergisi 2017.
7. 7. Kim YK, Pai H, Lee HJ, et al. Bloodstream infections by extendedspectrum beta-lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in children: epidemiology and clinical outcome. Antimicrob Agents Chemother 2002; 46: 1481–91.
8. 8. Quan J, Zhao D, Liu L, et al. High prevalence of ESBL-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in community-onset bloodstream infections in China. J Antimicrob Chemother 2017; 72: 273–80.

9. 9. Tükenmez T.E, Mülazımoğlu L. Toplum kökenli infeksiyonlarda genişlemiş spektrumlu β-laktamazlar ve klinik önemi. Klimik Derg. 2012; 25: 94-8.
10. 10. Cho YH, Jung SI, Chung HS et al. Antimicrobial susceptibilities of extended-spectrum beta- lactamase-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae in health care-associated urinary tract infection: focus on susceptibility to fosfomycin, Int Urol Nephrol 2015; 47: 1059-66.
11. 11. Coşkun M, Uyanık M, Ağan İ. Hastanede yatan hastaların üriner sistem infeksiyonlarından izole edilen genişlemiş spektromlu beta laktamaz üreten Klebsiella pneumonia ve Escherichia coli suşlarının fosfomisin ve nitrofrantoine duyarlılıklarının araştırılması. ANKEM dergi 2016; 30: 37-41.
12. 12. Özçerezci Ö, Savcı Ü. Yeni doğan yoğun bakım ünitesinde preterm ve term bebeklerde genişlemiş spektromlu bete laktamaz üreten gram negatif bakteri enfeksiyonlarını değerlendirmesi. J.Pediatri Emeg İntensive Care Med. 2019; 6: 91-7.
13. 13. Özel Y, Vardar-Ünlü G. Üriner sistem infeksiyonlarından soyutlanan Escherıchıa coli suşlarında fosfomisinin in vitro etkinliği. ANKEM Dergi, 2015; 29: 95-8.
14. 14. Ndir A, Diop A, Faye PM, et al. Epidemiology and Burden of Bloodstream Infections Caused by Extended- SpectrumBetaLactamase Producing Enterobacteriaceae in a Pediatric Hospital in Senegal. PLoS One 2016; 11: 0143729.
15. 15. European Centre for Disease Prevention and Control. Healthcareassociated infections acquired in intensive care units. In: ECDC. Annual epidemiological report for 2015; 4-5.
16. 16. Er H, Aşık G, Yoldaş Ö, et al. Kan kültürlerinde izole edilerek tanımlanan mikroorganizmaların ve antibiyotik direnç oranlarının belirlenmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2015; 45: 48-54.
17. 17. Küçükateş E, Gültekin N. Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Med Bull Haseki 2016; 54: 97-102.
18. 18. Şirin MC, Ağuş N, Yılmaz N ve ark. Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017; 74: 269-78.
19. 19. Bayraktar B, Pelit S, Bulut M, et al. Genişlemiş Spektrumlu Beta Laktamaz Üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae Kan Dolaşımı Enfeksiyonlarında Antibiyotik Direnç Oranlarının Yıllar İçindeki Değişimi Med Bull Sisli Etfal Hosp 2019; 53: 70–5 .
20. 20. Şen P, Yula E, Demirdal T, et al. Solunum yollarından izole edilen genişlemiş spektrumlu ve indüklenebilir beta-laktamaz üreten bakterilerin direnç oranları.ortadogutipdergisi 2017; 4: 170-6.
21. 21. Bahçeci İ . Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Stenotrophomonas maltophilia Suşlarının Dağılımı ve Antimikrobiyal Duyarlılıkları: 8 Yılık Çalışma. Dicle Tıp Dergisi. 2021; 48: 147-52.
22. 22. Koçak A, Yayla B, Güçlü A ve ark. Adana’da Bir Üniversite Hastanesinde İzole Edilen Solunum Yolu Patojenleri ve Antibiyotik Direnç Profillerinin Değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyoloji Cem Derg 2019; 49: 226-32 .
23. 23. Çaycı Y, Torun E, Bilgin K, et al.Yara Yeri Örneklerinden İzole Edilen Etkenler ve Antibiyotik Direnç Profilleri.Düzce Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi 2021; 11: 123-8.
24. 24. Avcıoğlu F, Behçet M, Karabörk Ş, et al. Yara Örneklerinden İzole Edilen Mikroorganizmaların Antimikrobiyal Direnç Oranları - Üç Yıllık Değerlendirme .Düzce Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Dergisi 2019; 9: 110-4 .
25. 25. Bahçeci İ. Microorganisms that Reproduce in Wound Cultures in Rize Region and Their Antimicrobial Susceptibility. Middle Black Sea Journal of Health Science. 2020; 6: 358-68.