Investigation of Distribution of Uropathogens and Antibiotic Resistance Profiles in Children with Urinary Tract Infection

Yıl 2024, Cilt: 4 Sayı: 3, 948 - 960

Meryem Çolak , Esra Taş , Katre Cemre Atıcı , Erkan Doğan

Öz

Objectives: Urinary tract infections (UTIs) are the most common infections in childhood after upper respiratory tract infections. The aim of our study was to identify the most common microorganisms causing UTIs in children in our region and to determine the antibiotic resistance profiles of the identified uropathogens. Methods: The urine culture results and antibiotic resistance profiles of 4219 pediatric patients diagnosed with UTI between July 2019 and June 2022 were retrospectively evaluated. Bacteria isolated from urine cultures were identified and antibiotic resistance profiles were determined using the fully automated BD Phoenix-100™ system (Becton Dickinson Diagnostics, USA). The results were interpreted according to the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) guidelines. Results: The urine culture results showed a positivity rate of 12.9% (546/4219). It was found that 85.7% (468/546) of the isolated microorganisms were gram-negative bacteria. Of the 533 pediatric patients diagnosed with UTIs, 345 (64.7%) were female and 188 (35.3%) were male (p <0.05). The age group with the highest rate of identified uropathogens was 0-2 years old and accounted for 54.8% (n: 292) (p <0.05). The most frequently isolated uropathogens in urine samples were Escherichia coli (53.8%), Klebsiella pneumoniae (13.7%), Klebsiella oxytoca and Enterococcus faecalis (5.1%). The highest antibiotic resistance rates were observed for ampicillin (56.1%) and amoxicillin-clavulanate (42.9%) in Escherichia coli and for cefixime (44.0%) and amoxicillin-clavulanate (41.3%) in Klebsiella pneumoniae. Surveillance of regional antibiotic resistance profiles is important to guide empiric treatment. Conclusions: According to the results of our study, ampicillin, amoxicillin-clavulanate, trimethoprim-sulfamethoxazole and cefixime should not be favored for the empirical treatment of UTIs due to resistance rates above 20. Considering their oral availability and low resistance rates, we suggest that cefuroxime, fosfomycin and nitrofurantoin should be preferred for the empirical treatment of UTIs in our region.

Anahtar Kelimeler

antibiotic resistance, empirical treatment, pediatric patient, urinary tract infection

İdrar Yolu Enfeksiyonu Tanılı Çocuklarda Üropatojenlerin Dağılımı ve Antibiyotik Direnç Profillerinin Araştırılması

Öz

Amaç: İdrar yolu enfeksiyonları çocukluk çağında üst solunum yolu enfeksiyonlarından sonra en sık görülen enfeksiyondur. Çalışmamızda bölgemizdeki çocuklarda idrar yolu enfeksiyonlarında sık rastlanan mikroorganizmaların tespit edilmesi, saptanan üropatojenlerin antibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Temmuz 2019 ile Haziran 2022 tarihleri arasında idrar yolu enfeksiyonu tanısı ile takip edilen 4219 pediatrik hastanın idrar kültürü sonuçları ve antibiyotik direnç profilleri retrospektif olarak değerlendirilmiştir. İdrar kültürlerinden izole edilen bakterilerin tanımlanması ve antibiyotik direnç profili tam otomatize BD Phoenix-100™ (Becton Dickinson Diagnostics, ABD) sistemi kullanılarak tespit edilmiştir. Sonuçlar Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testi Komitesi (EUCAST) kılavuzu doğrultusunda değerlendirilmiştir. Bulgular: İdrar kültürü sonuçları doğrultusunda %12,9 (546/4219) pozitiflik saptanmıştır. İzole edilen mikroorganizmaların %85,7’sinin (468/546) gram negatif bakteriler olduğu görülmüştür. İdrar yolu enfeksiyonu tanısı almış 533 hastanın 345’i (%64,7) kız, 188’i (%35,3) erkektir (p<0.05). En yüksek oranda üropatojen tespit edilen yaş aralığının %54,8 (n:292) ile 0-2 yaş aralığı olduğu görülmüştür (p<0.05). İdrar örneklerinde en sık izole edilen üropatojenler; Escherichia coli (%53,8), Klebsiella pneumoniae (%13,7) ve Klebsiella oxytoca ile Enterococcus faecalis (%5,1) olmuştur. En yüksek antibiyotik direnç oranının Escherichia coli için ampisilin (%56,1) ve amoksisilin-klavulanik asit (%42,9); Klebsiella pneumoniae için sefiksim (%44,0) ve amoksisilin-klavulanik asit (%41,3) olduğu saptanmıştır. Bölgesel antibiyotik direnç profilinin izlenmesi ampirik tedaviye yön vermek açısından önemlidir. Sonuç: Çalışmamızın sonuçlarına göre ampisilin, amoksisilin-klavulanik asit, trimetoprim-sulfametoksazol, sefiksim direnç oranları %20’nin üzerinde olduğundan, bu antibiyotiklerin idrar yolu enfeksiyonlarının ampirik tedavisinde tercih edilmemesi hem oral alınabilmeleri hem de düşük direnç oranları nedeniyle sefuroksim, fosfomisin ve nitrofurantoinin bölgemizdeki idrar yolu enfeksiyonlarının ampirik tedavisinde öncelikle tercih edilmesi gerektiği kanaatindeyiz.

Anahtar Kelimeler

Ampirik tedavi, antibiyotik direnci, idrar yolu enfeksiyonu, pediatrik hasta

Etik Beyan

Çalışma için Karabük Üniversitesi Tıp Fakültesi Girişimsel Olmayan Klinik Araştırmalar Etik Kurulundan onay alınmıştır (01.06.2022/961).

Kaynakça

• Alim Aydın, S., Çakır, N., & Küçükbayrak, B. (2013). Çocukluk çağı idrar yolu enfeksiyonlarında etken mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. Abant Med J, 2, 95-101. http://dx.doi.org/10.5505/abantmedj.2013.07279
• Alpcan, A., Tursun, S., & Çelikel Acar, B. (2018). Çocuklarda idrar yolları enfeksiyonları. Turk J Clin Lab, 9(1), 66-69. http://dx.doi.org/10.18663/tjcl.300336
• Aşgın, N., & Kal Çakmaklıoğulları, E. (2017). Karabük İlinde Toplum kökenli Pediatrik Üriner Sistem Enfeksiyonlarından İzole Edilen E. coli Suşlarının İn-vitro Antibiyotik Direnç Profili. J Contemp Med, 7(3), 241-245. http://dx.doi.org/10.16899/gopctd.349939
• Bitsori, M., Maraki, S., & Galanakis, E. (2014). Long-term resistance trends of uropathogens and association with antimicrobial prophylaxis. Pediatr Nephrol, 29(6), 1053-1058. http://dx.doi.org/10.1007/s00467-013-2719-x
• Cullen, I. M., Manecksha, R. P., McCullagh, E., Ahmad, S., … Thornhill, J. A. (2013). An 11-year analysis of the prevalent uropathogens and the changing pattern of Escherichia coli antibiotic resistance in 38,530 community urinary tract infections, Dublin 1999-2009. Ir J Med Sci, 182(1), 81-89. http://dx.doi.org/10.1007/s11845-012-0834-5
• Dünya Sağlık Örgütü. (2017). https://platform.who.int/data/maternal-newborn-child-adolescent-ageing/child-data. (Erişim tarihi: 20.05.2024).
• Eliakim-Raz, N., Babitch, T., Shaw, E., Addy, I., … RESCUING Study Group. (2019). Risk Factors for Treatment Failure and Mortality Among Hospitalized Patients With Complicated Urinary Tract Infection: A Multicenter Retrospective Cohort Study. Clin Infect Dis, 68(1), 29-36. http://dx.doi.org/10.1093/cid/ciy41
• Gökçe, İ., Çiçek, N., Güven, S., Altuntaş, Ü., … Alpay, H. (2017). Changes in Bacterial Resistance Patterns of Pediatric Urinary Tract Infections and Rationale for Empirical Antibiotic Therapy. Balkan Med J, 34, 432-435. http://dx.doi.org/10.4274/balkanmedj.2015.1809
• Karacı, M., Karagöz, K., Örnek, Z., Yaşar, A., Yüce, N., & Okumuş, Ö. (2017). Effect of Prophylactic Antibiotic Use in the Development of Antibiotic Resistance in Children with Recurrent Urinary Tract Infections. Med Bull Haseki, 55, 221-228. http://dx.doi.org/10.4274/haseki.98608
• Kizilca O, Siraneci R, Yilmaz A, Hatipoglu, N., Ozturk, E., Kiyak, A., & Ozkoket, D. (2012). Risk factors for community-acquired urinary tract infection caused by ESBL-producing bacteria in children. Pediatr Int, 54, 858–862. http://dx.doi.org/10.1111/j.1442-200X.2012.03709.x
• Koçak, M., Büyükkaragöz, B., Tayfur, A. Ç., Çelebi Tayfur, A., … Günbey, S. (2016). Causative pathogens and antibiotic resistance in children hospitalized for urinary tract infection. Pediatr Int, 58(6), 467-471. http://dx.doi.org/10.1111/ped.12842
• Konca, C., Tekin, M., Uckardes, F., Akgun, S., … Turgut, M. (2017). Antibacterial resistance patterns of pediatric community-acquired urinary infection: Overview. Pediatr Int, 59(3), 309-315. http://dx.doi.org/10.1111/ped.13139
• Kurt-Şükür, E. D, Birsin, Özçakar Z., Doğan, Ö., Öztürk, M., … Yalçınkaya, F. (2020). The changing resistance patterns of bacterial uropathogens in children. Pediatr Int, 62, 1058–1063. http://dx.doi.org/10.1111/ped.14270
• Mert, D., Çeken, S., & Ertek, M. (2020). İdrar yolu enfeksiyonlarında kültürden izole edilen bakteriler ve antibiyotik duyarlılıkları. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 77(1), 25-32. http://dx.doi.org/10.5505/TurkHijyen.2019.57984
• Milletli Sezgin, F., & Nar, R. (2017). İdrar yolu enfeksiyonu ön tanılı çocuk hastaların idrar kültürü ve idrar analiz sonuçlarının değerlendirilmesi. Pam Tıp Derg, 10, 242-248. http://dx.doi.org/10.5505/ptd.2017.35002
• Nateghian, A. R., Karaji, S., & Zamani, K. (2021). A decade of trends in the distribution and antimicrobial susceptibility of prevalent uropathogens among pediatric patients from Tehran, Iran during 2005–2016. Asian J Urol, 8(3), 253-259. http://dx.doi.org/10.1016/j.ajur.2020.05.008
• Pana, Z. D., & Zaoutis, T. (2018) Treatment of extended-spectrum β-lactamase-producing Enterobacteriaceae (ESBLs) infections: what have we learned until now? F1000Res, 7, 1000 Faculty Rev-1347. http://dx.doi.org/10.12688/f1000research.14822.1
• Pouladfar, G., Basiratnia, M., Anvarinejad, M., Abbasi, P., Amirmoezi, F., & Zare, S. (2017). The antibiotic susceptibility patterns of uropathogens among children with urinary tract infection in Shiraz. Medicine (Baltimore), 96(37), e7834. http://dx.doi.org/10.1097/MD.0000000000007834
• Roberts, K. B. (2011). Urinary Tract Infection: Clinical Practice Guideline for the Diagnosis and Management of the Initial UTI in Febrile Infants and Children 2 to 24 Months. Pediatrics, 128(3), 595-610. http://dx.doi.org/10.1542/peds.2011-1330
• Shaikh, N., Morone, N. E., Bost, J. E., & Farrell, M. H. (2008). Prevalence of urinary tract infection in childhood: a meta-analysis. Pediatr Infect Dis J, 27(4), 302-308. http://dx.doi.org/10.1097/INF.0b013e31815e4122
• Sobel, J. D., Fisher, J. F., Kauffman, C. A, & Newman, C. A. (2011). Candida urinary tract infections--epidemiology. Clin Infect Dis, 52 (Suppl 6), 433-436. http://dx.doi.org/10.1093/cid/cir109
• Sureshkumar, P., Jones, M., Cumming, R. G., & Craig, J. C. (2009). Risk factors for urinary tract infection in children: a population-based study of 2856 children. J Paediatr Child Health, 45(3), 87-97. http://dx.doi.org/10.1111/j.1440-1754.2008.01435.x
• Swerkersson, S., Jodal, U., Ahren, C., & Hansson, S. (2014). Urinary tract infection in small outpatient children: the influence of age and gender on resistance to oral antimicrobials. Eur J Pediatr, 173(8), 1075-1081. http://dx.doi.org/10.1007/s00431-014-2289-3
• Tanrıverdi Çaycı, Y., Karacan, G., Yoosefi, M., Bilgin, K., Gür Vural, D., & Bırıncı, A. (2022). Çocuklarda idrar kültüründen izole edilen gram negatif bakterilerin ve antibiyotik duyarlılıklarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. Ahi Evran Med J, 6(2), 168-173. http://dx.doi.org/10.46332/aemj.957515
• Topal, Y. (2018). Çocuklarda idrar yolu enfeksiyonu: güncel veriler eşliğinde bir değerlendirme. Ortadogu Medical Journal, 10(1), 26-33. http://dx.doi.org/10.21601/ortadogutipdergisi.391466