The Evaluation of Chromogenic Medium in Identification of Candida Species Isolated from Various Clinical Samples

Year 2014, , 248 - 252, 01.09.2014

Ayşegül Çopur Çiçek A. Nedret Koç Ayşe Ertürk Gonca Demir İlkay Bahçeci

https://doi.org/10.5505/abantmedj.2014.74046

Abstract

OBJECTIVE: To compare of conventional mycologic methods used to determine yeast or candida spp extracted from some clinical samples with the definitions identified using the chromogenic medium CM, Oxoid Brilliance™ Candida agar, United Kingdom was aimed in this study. METHODS: Total of 113 clinical samples 33 of urine, 34 of transtracheal aspirate TAT , 7 of bronchoalveolar lavage BAL , 13 of sputum, 12 of blood, 9 of wound, 3 of catheter, 2 of vaginal smear were included. Species identification was carried out using convantional mycologic methods; microscopic and macroscopic morphology, germ tube test, urea hydrolysis, carbonhydrate use API 20C AUX, Biomerieux, France , growth temperature and cycloheximide sensitivity. The strains were inoculated in the chromogenic medium Oxoid Brilliance™ Candida agar, UK and colour changes were evaluated, and two methods were compared. RESULTS: With both method, 91.2% of n=103 total 113 samples was identified as similar whilest 8.8% of them n=10 was defined differently. 94.1% of Candida albicans spp, 88.9% of C. parapsilosis and 81.3% of C. glabrata was truly identified. C. krusei and C. tropicalis were correctly identified whereas C. lusitania was wrongly identified. It was understood that one of total 6 of our stock cultures was found as mixed culture with bacteria, and the rest of them was found as mixed with two types of Candida species, with using chromogenic medium. CONCLUSION: There is a need to further studies for rare yeast species although the sensitivity of chromogenic medium is high for using the determination of common candida species as infectious agents.

Keywords

Candida, species identification, chromogenic medium

Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Candida Türlerinin Tanımlanmasında Kromojenik Besiyerinin Değerlendirilmesi

Abstract

AMAÇ: Bu çalışmada çeşitli klinik örneklerden izole edilen mayaların tür düzeyinde tanımlanmasında konvansiyonel mikolojik yöntemler ile Kromojenik besiyeri Oxoid Brilliance™ Candida agar, İngiltere KB kullanılarak yapılan tanımlamaların karşılaştırılması amaçlandı. YÖNTEMLER: Otuz üç idrar, 34 transtrakeal aspirat TAK , 7 bronkoalvaolar lavaj BAL örneği, 13 balgam, 12 kan, 9 yara,üç kateter ve iki vajinal akıntı olmak üzere toplam 113 klinik örnek çalışmaya alındı. İzole edilen suşların konvansiyonel mikolojik yöntemlerle; mikroskopik ve makroskopik morfoloji, germ tüp testi, üre hidrolizi, karbonhidrat kullanımı API 20 C AUX, Biomerieux, Fransa , üreme ısısı ve sikloheksimid hasasiyetine göre tür tanımlaması yapıldı. Suşlar kromojenik besiyerine Oxoid Brilliance™ Candida agar, İngiltere ekilerek renk değişimleri değerlendirildi ve her iki yöntem karşılaştırıldı. BULGULAR: Çalışılan klinik örneklerde her iki yöntemle toplam 113 örneğin 103’ünde % 91.2 aynı tür tanımlaması yapılırken,10 %8.8 tanesinde farklı tür tanımlanmıştır. Kromejenik besiyeri C. albicans suşlarını %94.1, C. parapsilosis %88.9, C. glabrata %81.3 oranında doğru tanımlarken birer suş olan C. krusei ve C. tropicalis doğru, C. lusitania yanlış tanımlanmıştır. Stok kültürlerimizin 6 tanesinden birinin bakteri ile 5’inin iki çeşit Candida türü ile karışık kültür olduğu kromojenik besiyeri ile anlaşılmıştır.SONUÇ: İnfeksiyon etkeni olarak sık karşılaşılan Candida suşlarının tür düzeyinde tanımlanmasında ve karışık kültürlerin ayırt edilmesinde kromojenik besiyerinin duyarlılığınınyuksek olmasına rağmen nadir karşılaşılan maya türleri için daha fazla çalışmalara gereksinim vardır.

Keywords

Candida, tür tanımlaması, kromojenik besiyeri

References

• Atalay MA, Sav H, Demir G, Koç AN. Kan Kültürle- rinden İzole Edilen Candida Türlerinin Dağılımı ve Amfoterisin B ve Flukonazole İn Vitro Duyarlılıkları. Selçuk Tıp Derg 2012; 28: 149-51.
• Lass-Flörl C. Thechancingfaxe of epidemiology of invasivefungalDisease in Europe. Mycoses 2009; 52: 197-205.
• İnci M, Atalay MA, Koç AN, Özer B, Kılınç Ç, Dur- maz S. Candida albicans dışı mayaların tanımlanma- sında VITEK 2 YST kart ile API 20C AUX sisteminin karşılaştırılması. Dicle Tıp Derg 2012; 39: 80-82.
• Ener B. İn vitro antifungal duyarlılık testleri: stan- dardizasyon ve klinik önemi. Mikrobiyol Bul 1996; 30: 419-25.
• Freydiere AM, Guinet R, Boiron P: Yeast identifi- cation in the clinical microbiology laboratory: phe- notypical methods. Med Mycol 2001; 39: 9-33.
• Kaçmaz B, Sipahi AB, Aksoy A. Candıda Türlerinin Tanımlanmasında “API 32C” Ve “RapidYeast Plus” Sistemlerinin Karşılaştırılması. ANKEM Derg 2006; 20: 214-6.
• Otağ F, Aslan G, Şen S, Emekdaş G. Fungemi et- keni Candida türlerinin hızlı tanısında CHROMagar Candida besiyerinin kullanımı. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2006; 36: 200-4.
• Horvath LL, Hospenthal DR, Murray CK, Dooley DP. Direct isolation of Candida spp. From blood cultures on the chromogenic medium CHROMagar Candida: J Clin Microbiol 2003; 41: 2629-32.
• Yücesoy M, Marol S. Performance of CHROMA- GAR candida and BIGGY agar for identification of yeast species. Annals Clin Microbiol Antimicrobial 2003; 2: 8.
• Pfaller MA, Diekema DJ, Sheehan DJ. Interpreti- ve breakpoints for fluconazole and Candida revisi- ted: a blue print for the future of antifungal suscep- tibility testing. Clin Microbiol Rev 2006; 19: 435-47.
• Koehler AP, Chu KC, Houang ET, Cheng AF: Simp- le, reliable, and cost-effective yeast identification scheme for the clinical laboratory. J Clin Microbiol 1999, 37: 422-6.
• Gültekin B. Yazıcı V, Aydın N. Vajinal örnekler- den izole edilen candida suşlarının dağılımı ve chrom agar candida besiyerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2005; 39: 319-24.
• Odds FC. Presidential address. Candida albicans, the life and times of a pathogenic yeast. J Medical and Veterinary Mycology 1994; 32: 1-8.
• Pulimood S, Ganesan L, Alangaden G, Chandra- sekar P. Polymicrobial candidemia. Diag Microbiol Infect Dis 2002; 44: 353-7.
• Yera H, Poulain D, Lefebvre A, Camus D, Sendid B. Polymicrobial candidemia revealed by peripheral blood smear and chromogenic medium. J Clin Pat- hol 2004; 57: 196-8.
• Willinger B, Manafi M. Mycoses. Evaluation of CHROMagar Candida for rapid screening of clinical specimens for Candida species. 1999; 42: 61-5.
• Mahmoudi Rad M, Zafarghandi S, Abbasabadi B, Tavallaee M. The epidemiology of Candida species associated with vulvovaginal candidiasis in an Ira- nian patient population. Eur J Obstet Gynecol Rep- rod Biol 2011; 155: 199-203.
• Castro LA, Alvarez MI, Martínez E. Pseudo- membranous Candidiasis in HIV/AIDS Patients in Cali, Colombia Mycopathologia. 2013; 175: 91-8.
• López-Soria LM, Bereciartua E, Santamaría M, Soria LM, Hernández-Almaraz JL, Mularoni A, Nieto J, Montejo M. First case report of catheter-related fungemia by Candida nivariensis in the Iberian Pe- ninsula. Rev Iberoam Micol. 2013; 30: 69-71
• Eddouzi J, Hofstetter V, Groenewald M, Manai M, Sanglard D. J ClinMicrobiol. Characterization of a new clinical yeast species, Candida tunisiensis sp. nov., isolated from a strain collection of Tunisian hospitals. 2013; 51: 31-9.
• Otag F, Kuyucu N, Erturan Z, Sen S, Emekdas G, Sugita T. An outbreak of Pichiaohmeri infection in the paediatric intensive care unit: case reports and review of the literature. Mycoses 2005; 48: 265-9.
• Ersoz G, Otag F, Erturan Z, Aslan G, Kaya A, Emekdas G, Sugita T. An outbreak of Dipodascus capitatus infection in the ICU: three case reports and review of the literature. Jpn J Infect Dis 2004; 57: 248-52.
• Agarwal S, Manchanda V, Verma N, Bhalla P. Yeast identification in routine clinical microbiology laboratory and its clinical relevance Indian J Med Microbiol 2011 ; 29: 172-7