The microorganisms isolated from urine culture and their in vitro antibiotic susceptibility

Year 2012, , 129 - 135, 01.09.2012

Aynur Gülcan Ahmet Aslantürk Erim Gülcan

https://doi.org/10.5505/abantmedj.2012.36035

Abstract

Background: Urinary tract infections UTI are most common causes of bacterial infections in adults. The causative agent spectrum and resistance patterns are affected by many factors. In this study, we aimed to determine the microorganisms that cause UTI and their antibiotic resistance rates and efficient several demographic features. Method: In this study, between December 2008-May 2010, microorganisms isolated from midstream urine specimens sent to Kütahya State Hospital Microbiology laboratory with pre-diagnosis of UTI from various clinics, their antibiotic resistance rates and several demographic features age, gender, policlinic / service/intensive care unit ICU where the sample was sent of these patients were retrospectively analysed. Statistical analysis was done by using SPSS version 15.0. Results: Out of 4100 urine samples, in 935 22,8% , significant bacteriuriae was determined. In order of frequency isolated microorganisms were Enterobacteriaceae spp 77,2% , Enterococcus spp 8% ve non-fermenting NF gram negative bacteria 5,3% , Staphylococcus spp 4,8% ve Candida spp 3,9% . NF bacteria and Enterococcus spp were isolated in significantly higher rates in men, 65 years of age and over and service/ICU patients. Conclusion: Because of variations in the causative agent spectrums and in the resistance rates of antibiotics using for empiric treatment in outpatients and inpatients, identification and antibiotic susceptibility testing of UTI isolates and screening for extended spectrumlu beta lactamase ESBL producing Enterobacteriaceae should necessarily be performed for a successful treatment. Statistical analysis of this type of laboratory data at the local, provincial or national level with the several intervals will be very instructive for the relevant clinicians about empiric therapy.

Keywords

Urinary tract infection, uropathogen, antibiotic resistance rates

İdrar kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve in vitro antibiyotik duyarlılık durumları

Abstract

Amaç: : İdrar yolu enfeksiyonları İYE yetişkinlerde bakteriyel enfeksiyonların en sık görülen sebebi olup etken spektrumu ve direnç paternleri birçok faktörden etkilenmektedir. Bu çalışmada İYE’na neden olan mikroorganizmaları, antibiyotik direnç oranlarını ve etkili bazı demografik özellikleri belirlemeyi amaçladık. Yöntem: Bu çalışmada, Aralık 2008 ile Mayıs 2010 tarihleri arasında Kütahya Devlet Hastanesi Mikrobiyoloji laboratuvarına çeşitli kliniklerden İYE şüphesi ile gönderilen orta akım idrar örneklerinden izole edilen mikroorganizmalar, bu hastalara ait demografik bazı özellikler yaş, cinsiyet ve numunenin gönderildiği poliklinik/servis/yoğun bakım ünitesi YBÜ ve antibiyotik direnç oranları retrospektif olarak araştırıldı, istatistiksel analiz SPSS 15.0 programı kullanılarak yapıldı. Bulgular: Toplam 4100 idrar örneğinin 935 %22,8 ’inde anlamlı bakteriüri saptandı. Sıklık sırasına göre izole edilen mikroorganizmalar, Enterobacteriaceae spp %77,2 , Enterococcus spp %8 ve nonfermenter NF gram negatif bakteriler %5,3 , Staphylococcus spp %4,8 ve Candida spp %3,9 idi. NF bakteriler ile Enterococcus spp erkeklerde, 65 yaş ve üzeri ve servis/yoğun bakım hastalarında belirgin olarak yüksek oranda izole edildi. Sonuç: Ayaktan ve yatan hastalarda ampirik tedavi için kullanılan antibiyotiklere direnç oranları ve etken patojen spektrumundaki farklılıklar nedeniyle, başarılı bir tedavi için İYE etkenlerin tanımlanması, antibiyogram testlerinin yapılması ve genişlemiş spektrumlu beta laktamaz GSBL çalışması da mutlaka yapılması gerekir. Bu sonuçları içeren laboratuvar verilerinin, hastane veya il bazında ya da ulusal düzeyde belli aralıklarla istatistiksel olarak analiz edilmesi, gerek ayaktan gerekse yatan hastalar için klinisyenlere ampirik tedavide önemli ölçüde yol gösterecektir.

Keywords

İdrar yolu enfeksiyonu, üropatojen, antibiyotik direnç oranları

References

• Ayşe Willke İdrar yolu enfeksiyonları. Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi Bölüm 18, S:1487
• Bilgehan H. İdrar yolu enfeksiyonlarının mikrobiy- olojik incelenmesi. Klinik Mikrobiyolojik Tanı Kitabı 2009. Bölüm 19 s:377-381
• www.merckmanuals.com/professional/genitourinary _disorders/urinary tract infections.html. Bacterial urinary tract infections
• Dündar D, Willke A, Sönmez T.G. İdrar yolu in- feksiyonu etkenleri ve antibiyotik duyarlılıkları. Klimik Derg 2008; 21: 7-11
• Gazi H, Sürücüoğlu S, Kurutepe S. İdrar kültürlerin- den izole edilen Gram negatif bakterilerde anti- biyotiklere direnç. Ankem Derg 2007;21:19-22.
• Yurtsever SG, Baran N, Şener AG, Çeken N, Kurultay N, Türker M. İdrar Örneklerinden izole Edilen Mikroorganizmalar ve Antibiyotiklere Duyarlılıkları. Klimik Derg 2006; 19:60-62
• Pullukçu H, Taşbakan M, Aydemir Ş ve ark. İdrar kültürlerinden soyutlanan bakteriler ve çeşitli anti- biyotiklere in-vitro lenıdirilmesi, Ankem Derg 2006; 20:26-30. değer
• Temiz H, Akkoç H, Gül K. Laboratuarımızda idrar kültürlerinden izole edilen Gram negatif bakterilerde antibiyotiklere direnç. Dicle Tıp Derg 2008; 35: 234- 239
• Albayrak N, Kaya Ş. Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Escherichia coli ve Klebsıella pneumonıae suşlarının genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üretimleri ve antibiyotik direnç oranları. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2009; 39: 16-21
• Güdücüoğlu H, Baykal S, İzci H, Berktaş M. Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) üreten Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının antibiyotiklere direnci. Ankem Derg 2007; 21:155- 160
• Aydemir H, Yalçı A, Pişkin N, Gürbüz Y, Türkyılmaz R. Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae suşlarının genişlemiş spektrumlu β Laktamaz üretme ve anti- biyotik direnç oranları. Klimik Derg 2006; 19:63-68
• Uyanık MH, Hancı H, Yazgı H. Üriner sistem in- feksiyonlarından soyutlanan toplum kökenli Esch- erıchıa colı suşlarına fosfomisin trometamolün ve bazı antibiyotiklerin in-vitro etkinliği. Ankem Derg 2009; 23:172-176
• Köken G, Aşık G, Çiftçi İH, Çetinkaya Z, Aktepe OC, Yılmazer M. Toplum kökenli üriner sistem en- feksiyonu etkeni Escherichia colı suşlarında fosfom- isin trometamol etkinliği. Ankem Derg 2008; 22:23- 27
• Prakash V, Lewis JS 2nd, Herrera ML, Wickes BL, Jorgensen JH. Oral and parenteral therapeutic op- tions for outpatient urinary infections caused by en- terobacteriaceae producing CTX-M extended- spectrum beta-lactamases. Antimicrob Agents Chemother 2009 53:1278-80.
• Mittal R, Aggarwal S, Sharma S, Chhibber S, Harjai K. Urinary tract infections caused by Pseudomonas ae- ruginosa: A minireview. Journal of Infection and Pub- lic Health 2009; 2: 101—111
• Elaldı N, Turan M, Duran B, Bakır M ve ark. Bir ün- iversite hastanesinde nozokomiyal üriner sistem in- feksiyonları: Etken Mikroorganizmalar ve anti- mikrobiyal direnç. C. Ü. Tıp Fakültesi Dergisi 2003;25: 63 – 68
• Teixeria LM, Gloria MD, Carvalho S, Facklam RR. Enterococcus. Murray PR (ed). Manual of Clinical Microbiology, 9th Edition ASM Press, Washington DC 2007 kitabında: 430-442.
• Gulcan A, Celik G, Gulcan E, Cansever Z, Aladag DM. Performance evaluation of urinanalysis and culture results in patients suspected urinary tract infection. Abant Med J. 2012; 1: 61-64
• Murray BE. Enterococci. In Gorbach SL, Bartlett JG, Blacklow NR (eds): Infectious Diseases. Second edi- tion, Philadelphia: W. B. Saunders Company 1998 : 1723-1730