Elma Mozaik Ilarvirusu Türkiye ve Ukrayna İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu
Abstract
Özet
Ülkemiz elma ve fındık üretimini kısıtlayan en önemli etmenlerden biri de Elma mozaik ilarvirusu’(ApMV) dur. Etmenin vejetatif olarak aşı ve polen ile yayılması, etkili bir kimyasal mücadelesinin olmaması, ülkemizde gerek yumuşak çekirdekli ve gerekse de fındık ekim alanlarında giderek yayılmasına neden olmaktadır. Ele alınan bu çalışma kapsamında ülkemiz fındık ve elma ekim alanlarında, hastalığa ait izolatlar toplanmış ve patojenin varlığı, DAS-ELISA ve RT-PCR çalışmaları ile ortaya konmuştur. 2008 ve 2009 yıllarında Ukrayna’nın elma üretim alanlarında örnekleme yapılmış ve toplanan bu izolatlar, A.Ü.Bitki Koruma Bölümünde koleksiyondaki ApMV izolatları ile karşılaştırılmıştır. Enfekteli örneklerden total RNA izolasyonu ve RT-PCR analizinde Menzel et al. (2002)’ın yöntemi uygulanmış ve 262 bp uzunluğunda PCR ürünü elde edilmiştir. Tüm PCR ürünleri, HinfI, BamHI, AvaII, EcoRI, SspI, RsaI, HindIII, HincII enzimleri enzimatik kesime maruz bırakılmış ve bunlardan sadece AvaII BamHI, HinfI, SspI enzimleri PCR ürününü kesmiştir. Yapılan filogenetik analiz sonucunda Türk izolatlarının 9 genotipe ayrıldığı tesbit edilmiştir. Yapılan analiz sonucunda Turk izolatlarının değişken oldukları, buna karşılık Ukrayna elma izolatlarının oldukça benzer oldukları belirlenmiştir. Her iki ülkeye ait elma izolatları sekansları karşılaştırıldığında ise benzer oldukları saptanmıştır.
Keywords
Details
Primary Language
Turkish
Subjects
-
Journal Section
Research Article
Publication Date
June 5, 2011
Submission Date
June 22, 2010
Acceptance Date
-
Published in Issue
Year 2011 Volume: 17 Number: 2