Research Article
BibTex RIS Cite

Türkiye’nin Bingöl ilinde Virüs Belirtisi Gösteren Kavun Bitkilerinde Hıyar mozaik virüsü ve Karpuz mozaik virüsünün Varlığı ve Filogenetik Yakınlıkları

Year 2020, Volume: 7 Issue: 4, 948 - 958, 20.10.2020
https://doi.org/10.30910/turkjans.740195

Abstract

2019 yılı Bingöl ilinde yapraklarda deformasyon, yeşil rengin farklı tonlarında mozaik deseni ve damar bantlaşması sergileyen kavun bitkileri tespit edilmiştir. Örnekler toplanmış ve infekteli bitkilerdeki olası viral etmeni tanımlamak ve karakterize etmek için kapsid protein genine (CP) spesifik primer setleri kullanılarak RT-PCR ile taranmıştır. İnfekte bitkilerden elde edilen agaroz jelde gözlenen yaklaşık 657 bp ve 822 bp uzunluğundaki DNA fragmentleri CMV (Cucumber mosaic virus) ve WMV (Watermelon mosaic virus) varlığını doğrulamıştır.
Her bir virüs için rastgele seçilen iki DNA fragmenti jelden temizlenerek uygun klonlama vektörü içinde klonlanmış, sonrasında E. coli bakterisine (JM109 suşu) transformasyonu gerçekleştirilmiş ve son olarak yeni nesil sekanslama (NGS) ile dizilenmiştir. Elde edilen viral CP sekansları, CMV için MT361015 ve MT361016 erişim numarasıyla ve WMV için MT413451 ve 437295 erişim numarasıyla gen bankasına (NCBI) kaydedilmiştir. Sekans analizi, CMV ve WMV izolatlarının sırasıyla% 99.84 ve% 99.88 ile aynı türleriyle yüksek oranda dizi konsensüsü gösterdiğini ortaya koymuştur. Daha ileri analizler, her iki Bingöl izolatının Çin izolatıyla (DQ399708) en yüksek sekans benzerliği gösterdiğini açığa çıkarmıştır.
Farklı coğrafyalarda çeşitli CP sekanslarından oluşturulan konsensüs ağacı, bu çalışmada tespit edilen iki CMV izolatının çeşitli bitki kaynaklarından elde edilen Türkiye, Tayland, Hindistan ve Çin'in alt grup IB izolatları ile çok yakın filogenetik ilişkide olduğunu açıkça ortaya koymuştur. Ayrıca Bingöl WMV izolatları, kavun ve kabaktan elde edilen Fransa izolatlarıyla ve karpuzdan elde edilen Çin izolatıyla evrimsel bir yakınlık sergilemiştir.
Bu çalışma, Bingöl ilindeki (Türkiye) kavun bitkilerinde CMV ve WMV infeksiyonunu gösteren ve yüksek dizi homolojisi ile konsensüs ağacı ile desteklenen ilk bilimsel kanıttır.

References

  • Abdalla, O., Bruton, B.D., Fish, W.W. and Ali, A. 2012. First Confirmed Report of Tobacco ringspot virus in Cucurbits Crops in Oklahoma. Plant Disease, 96: 1705.
  • Aguilár-Ríos, R. and Lozoya-Saldaña, H. 1994. Virus diseases of cucurbits in the state of Morelos. Revista Mexicana de Fitopatología, 12(1): 11-13.
  • Alonso-Prados, L.J., Luis-Arteage, M., Alvarez, J.M., Moriones, E., Batlle, A., Lavina, A., Garcia-Arenal, F. and Fraile, A. 2003. Epidemics of Aphid-transmitted Viruses in Melon Crops in Spain. European Journal of Plant Pathology, 109: 129-138.
  • Al-Saleh, M.A. and Al-Shahwan I.M. 1997. Viruses infecting cucurbits in Riyadh, Gassim and Hail regions of Saudi Arabia. Arab Gulf Journal of Scientific Research, 15(1): 223- 254.
  • Altınay, N. 2017. Tekirdağ ilinde bazı kabakgil türlerinde virüs infeksiyonlarının belirlenmesi. Namık Kemal Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Bitki Koruma Anabilim Dalı. Yüsek Lisans Tezi. Tekirdağ. 73s.
  • Andres, T.C. 2004. Web site for the plant family Cucurbitaceae & home of The Cucurbit Network. http://www.cucurbit.org.
  • Ayo-John, E.I., Olorunmaiye, P.M., Odedara, O.O., Dada, O.B., Abiola, K.O. and Oladokun, J.O. 2014. Assessment of field-grown cucurbit crops and weeds within farms in SouthWest Nigeria for viral diseases. AcademicPres, Cluj-Napoca, Romania, Notulae Scientia Biologicae, 6(3): 321-325.
  • Beler, Ö. and Açıkgöz, S. 2005. Ege ve Marmara Bölgelerindeki zeytin fidanlıkları ve ağaçlarında görülen bazı virüs hastalıklarının ELISA testi ile saptanması. ADÜ Ziraat Fakültesi Dergisi, 2 (1): 79–84.
  • Brunt, A., Crdotree, K., Dallwitz, M., Gibbs, A. and Watson, L. 1996. Virus of Plants. Descriptions and lists from the VIDE database. S CAB International University Press, 477-478.
  • Budak, E. 2015. Diyarbakır İli ve İlçelerinde Üretilen Kabakgillerdeki Viral Etmenlerin Tanılanması ve Yaygınlıklarının Belirlenmesi. Harran Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Bitki Koruma Anabilim Dalı. Yüksek Lisans Tezi. 50S.
  • Buzkan, N. and Yüzer, D. 2009. Molecular detection of seed-borne viruses in Kahramanmaraş red peppers. Alatarım, 8(1): 1-7.
  • Coutts, B.A. and Jones R.A.C. 2005. Incidence and distribution of viruses infecting cucurbit crops in the Northern Territory and Western Australia. Australian Journal of Agricultural Research, 56(8): 847-858.
  • Coutts, B.A., Kehoe, M.A. and Jones, R.A.C. 2011a. Minimising losses caused by Zucchini yellow mosaic virus in vegetable cucurbit crops in tropical, sub-tropical and Mediterranean environments through cultural methods and host resistance. Virus Research, 159: 141–160.
  • Çat, A., Yardımcı, N. and Kılıç, H.Ç. 2016. Antalya İli ve İlçelerindeki Örtüaltı Hıyar (Cucumis sativus L.) ve Kabak (Cucurbita pepo L.) Üretim Alanlarında Viral Etmenlerin Saptanması. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi. 1: 129-132.
  • Çulal Kılıç, H. and Yardımcı, N. 2012. Burdur Çine Ovası Fasulye Alanlarında Hıyar Mozaik Virüsü. Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 3 (2): 12-15.
  • Çulal Kılıç, H., Yardımcı, N., Toplu, S., and Konu A. 2015. Cucumber mosaic virus and Pepper mild mottle virus in pepper growing areas in Burdur Province, Turkey. International Journal of Scientific and Technological Research, 1: 1.
  • Delmiglio, C. and Pearson M.N. 2006. Effect sandincidence of Cucumber mosaic virus, Watermelon mosaic virus and Zucchini yellow mosaic virus in New Zealand’s only native cucurbit, Sicyos australis. Australasian Plant Pathology, 35: 29-35.
  • Demski, J.W. and Chalkley, J.H. 1972. “Effect of Watermelon mosaic virus on Yield and Marketability of Summer Squash” Plant Disease Report, 56: 147-50.
  • Desbiez, C., Costa, C., Wipf‒Scheibel, C., Girard, M. and Lecoq, H. 2007. Serological and molecular variability of Watermelon mosaic virus (genus Potyvirus). Archives of Virology, 152: 775‒781.
  • Dikici, S. 2019. Uşak ilinde bazı kabakgillerde karpuz mozaik virüsü (WMV)'nün serolojik yöntemle belirlenmesi ve biyolojik indeksleme çalışmaları. Uşak Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Yüksek Lisans Tezi. Tarım Bilimleri Anabilim Dalı. 102s.
  • Doolittle, S.P. 1916. A new infectious mosaic disease of cucumber. Phytopathology 6:145-147.
  • Ergün, M., Semih, E. and Paylan, I.C. 2013. Cucumber mosaic virus in globe artichoke in Turkey. Canadian Journal of Plant Pathology, 35 (4): 514-517.
  • Erkan, S., Gümüş, M. and Paylan, İ.C., Duman İ., Ergün M. 2013. İzmir ili ve çevresindeki bazı kışlık sebzelerde görülen viral etmenlerin saptanması. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 50 (3): 311-322.
  • FAO, 2018. http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC(Erişim Tarihi, 29 Ağustos 2018).
  • Fernandes, F.F. Valverde, R.A. and Black, L.L. 1991. Viruses infecting Cucurbit Crops in Louisiana. Plant Disease, 75: 431.
  • Fidan, Ü. 1995. Virus diseases of vegetables in greenhouses in İzmir and Muğla. Journal of Turkish Phytopathology, 24(1): 7-14.
  • Foissac, L., Gentit, P., Svanetia-Dumas, L., Dulucq, M. J. and Candresse, T. 2001. Polyvalent detection of fruit tree tricho, capillo, and foveaviruses by nested RT-PCR using degenerated and inosine-containing primers (PDO RT-PCR). Acta Horticulturae, 550: 37–43.
  • Fujisawa, I., Anang, S.J., Shen, Y.S. and Zhou, A.J. 1990. Identification of virus diseases affecting some vegetable crops in west Malaysia and the southern part of China. Tropical Agriculture Research Series, 23: 218-228.
  • Gibbs, A.J., Mackenzie, A.M., Wel, K.J. and Gibbs, M.J. 2008. The potyviruses of Australia. Archives of Virology, 153: 1411-1420.
  • Gökdağ, S., Karanfil, A. and Korkmaz, S. 2016. Çanakkale ili ıspanak alanlarındaki Şalgam mozaik virüsü ve Hıyar mozaik virüsü varlığının belirlenmesi. Bahçe, özel sayı (cilt II). 166-170.
  • Güllü, M. and Çalı, S. 1994. Doğu Akdeniz Bölgesi Örtü altı Sebze Alanlarında Görülen Virüs Hastalıklarının Belirlenmesi Üzerine Araştırmalar. Bitki Koruma Bülteni, 34 (3-4): 79.
  • Gümüş, M. Erkan, S. and Tok, S., 2004. Bazı Kabakgil Türlerinin Tohumlarındaki Viral Etmenlerin Saptanması Üzerinde Araştırmalar. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 41 (1): 49-56.
  • Günay, A. 2019. Adıyaman İli Tütün Üretim Alanlarındaki Bazı Tütün Virüslerinin Multipleks RT-PCR Yöntemi İle Araştırılması Ve Bazı Virüs İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Yüksek Lisans Tezi. Bitki Koruma Anabilim Dalı. Van. 63s.
  • Günay, A. 1993. Özel Sebze Yetiştiriciliği. A.Ü. Ziraat Fakültesi, Ankara, 117s.
  • Güngör, M., Uzunbacak, H., Kutluk-Yilmaz, N.D. and Şevik, M.A. 2017. Samsun ili ıspanak üretim alanlarında enfeksiyon oluşturan virüslerin belirlenmesi. Anadolu Journal of Agricultural Sciences, 32: 164-168.
  • Hseu, S.H, Huang, C.H, Chang, C.A, Yang, W.Z, Chang, Y.M. and Hsiao, C.H. 1987. The occurrence of five viruses in six cucurbits in Taiwan. Plant Protection Bulletin, Taiwan, 29(3): 233-244.
  • Ibaba, J.D, Laing, M.D. and Gubba, A. 2015. Incidence and phylogeny of viruses infecting cucurbit crops in KwaZulu-Natal, Republic of South Africa. Crop Protection, 75: 46- 54.
  • Jossey, S. and Babadoost, M. 2008.Occurrence and Distribution of Pumpkin and Squash Viruses in Illinois. Plant Disease, 92(1):61-68.
  • Karakurt, M.Y. 2015. İstanbul İlinde Karpuz Ekim Alanlarında Cucumber mosaic virus (CMV) Ve Zucchini Yellow Mosaic Virus (ZYMV)'nin Yaygınlıklarının Araştırılması. Namık Kemal Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Yüksek Lisans Tezi. Bitki Koruma Anabilim Dalı. 54s.
  • Karamanlı, A. and Kamberoğlu, M.A. 2010. Survey of Cucumber mosaic virus (CMV) and Zucchini Yellow Mosaic Virus (ZYMV) in Turkish Republic of Northern Cyprus in Cucurbits Growth Fields. Ç.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Cilt: 22-23.
  • Karanfil, A. and Korkmaz, S. 2017. Çanakkale ili börülce üretim alanlarında Hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus; CMV)’nün tespiti ve kılıf protein genine göre moleküler karakterizasyonu. Bitki Koruma Bülteni, 57(3): 293-304.
  • Karanfil, A., Soylu, B. and Korkmaz S. 2016. Çanakkale ili ve ilçelerindeki soğanlı süs bitkilerinde Hıyar mozaik virüsü enfeksiyonunun serolojik ve moleküler yöntemler ile araştırılması. Trakya University Journal of Natural Sciences, 17 (2): 105-110.
  • Katul, L. and Makkouk, K.M. 1987. Occurrence and serological relatedness of five cucurbit potyviruses in Lebanon and Syria. Phytopathologia Mediterranea, 26(1): 36-42.
  • Kaya, A., and Erkan, S. 2011. İzmir, Aydın, Manisa ve Balıkesir İllerinde Üretilen Kabakgillerdeki Viral Etmenlerin Tanılanması ve Yaygınlıklarının Belirlenmesi. Bitki Koruma Bülteni, 51 (4): 387-405.
  • Kızmaz, M.Z., Sağır, A. and Baloğlı, S. 2016. Diyarbakır ve Mardin İlleri Kabakgil Üretim Alanlarında Görülen Viral Hastalıkların Yaygınlıklarının ve Etmenlerinin Belirlenmesi. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 53 (4): 397-406.
  • Ko, S.J., Lee, Y.H., Cho, M.S., Park, J.W., Choi, H.S., Lim, G.C. and Kim, K.H. 2007. The incidence of virus diseases on melon in Jeonnam Province during 2000- 2002. Plant Pathology Journal, 23(3): 215-218.
  • Korkmaz, F., Topkaya, Ş. and Yanar Y. 2018. Tokat İli Kabakgil Üretim Alanlarında Enfeksiyon Oluşturan Virüslerin Belirlenmesi. Gaziosmanpasa Journal of Scientific Research, 7(2): 46-56.
  • Kosaka, Y., and Fukunishi, T. 1997. Multiple Inoculation with Three Attemuated Viruses for the Control of Cucumber Virus Diseases. Plant Disease, 81 (7): 733- 738.
  • Köklü, G., and Yilmaz, Ö. 2006. Occurrence of cucurbit viruses on field-grown melon and watermelon in the Thrace region of Turkey. Phytoprotection, 87 (3): 123-130.
  • Kwak, H.R., Kim, J.S., Cho, J.D., Lee, J.H., Kim, T.S., Kim, M.K. and Choi H.S. 2015. Characterization of Melon necrotic spot virus Occurring on Watermelon in Korea. Plant Pathology Journal, 31(4): 379–387.
  • Lecoq, H., and Desbiez, C. 2012. Virus of cucurbit crops in the Mediterranean Region: an ever-changing picture. In: Loebenstein, G., Lecoq, H. (Eds.), Viruses and Virus Diseases of Vegetables in the Mediterranean Basin. Adv. Virus Research, 84: 67-126.
  • Lot, H. and Kaper, J.M. 1976. Further Studies on the RNA Component Distributon Among the nucleoproteins of Cucumber mosaic virus. Virology, 74: 223-226.
  • Massumi, H., Samei, A., Pour, A.H, Shaabanian, M, and Rahimian H. 2007. Occurrence, distribution, and relative incidence of seven viruses infecting greenhouse grown cucurbits in Iran. Plant Disease, 91(2): 159-163.
  • Mnari-Hattab, M., Jebari, H., and Zouba, A. 2008. Identification and distribution of viruses responsible for mosaic diseases affecting cucurbits in Tunisia. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 38(3): 497-506.
  • Nayar, N.M. and Singh R. 1998. Taxonomy, distribution and ethnobotanical uses in Cucurbits (N.M. Nayar, and T.A. More, eds.). Science Publishers, Inc., U.S.A. pp 1-18.
  • Nematollahi, S., Haghtaghi, E., Koolivand, D. and Hajizadeh M. Molecular detection of Cucumber green mottle mosaic virus variants from cucurbits fields in Iran. Archives of Phytopathology and Plant Protection. 47 (11): 1303- 1310.
  • Ozaslan, M., Berna, B., Aytekin, T. and Siğırcı, Z. 2006. Identification of Pepper Viruses by Das-elisa Assays in Gaziantep-Turkey. Plant Pathology Journal, 5(1): 11-14.
  • Örs, F. 2018. Malatya İli Kavun Ekiliş Alanlarında Görülen Bazı Önemli Virüs Hastalıklarının Moleküler Yöntemlerle Araştırılması ve Karakterizasyonu. İnönü Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Yüksek Lisans Tezi. Bitki Koruma Anabilim Dalı. Malatya. 39s.
  • Özdemir, S., and Erilmez, S. 2007. Denizli ilinde yetiştirilen biber, patlıcan ve marul üretim alanlarında bazı viral etmenlerin Saptanması. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri.27-29 Ağustos Isparta. 114s.
  • Öztürk, S. 2000. Diyarbakır ve İlçelerinde Karpuzlarda Görülen Virüs Hastalıklarının Surveyi. Çukurova Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitki Koruma Anabilim Dalı, Adana, 58s.
  • Palukaitis, P., and Garcia-Arenal, F. 2003. Cucumber mosaic virus, Description of Plant Viruses, No. 400. http://www.dpvweb.net/dpv/showdpv.php?dpvno=400, Accessed date: 28 December 2017.
  • Palukaitis, P., Roossinck, M.J., Dietzgen, R.G. and Francki, R.I.B. 1992. Cucumber mosaic virus. Advances in Virus Research, 41: 281- 348.
  • Price, W.C. 1934. Isolation and study of some yellow strains of cucumber mosaic. Phytopathology, 24: 743-761.
  • Purcifull, D.E. and Hiebert E. 1979. Serological distinction of Watermelon mosaic virus isolates. Phytopathology, 69: 112-116.
  • Purcifull, D.E. Adlerz, W.C., Simone, G.W., Hieberth, E. and Christie, S.R. 1984. Serological Relationships and Partial Characterization of Zucchini Yellow Mosaic Virus Isolated Form Squash in Florida. Plant Disease, 68: 230- 233.
  • Raccah, B. 1999. Epidemiology and control of cucurbit viruses in Israel. 1. Israeli- Turkish Workshop “Detection of virus diseases by advanced techniques and control”, 22–29. August 1999, Adana, Turkey. 46-56.
  • Robinson, R.W. and Deckers-Walters, D.S. (eds.). 1997. Cucurbits, CAB International, Wallingford, UK. ISBN: 0 85199 133 5.
  • Rubies-Autonell, C., Ballante, M., and Turina, M. 1996. Viral infections in melon crops of centralnorthern Italy. Informatore Fitopatologico, 46(7/8): 6-10.
  • Sertkaya, G. 2015. Hatay ili marul ve ıspanak alanlarında bazı virüslerin araştırılması. Mustafa Kemal Üniversitesi, Ziraat Fakültesi Dergisi, 20 (1): 7-12.
  • Sevik, M.A. 2012. Natural occurrence of Cucumber mosaic virus infecting water mint (Mentha aquatica) in Antalya and Konya, Turkey. Acta Botanica Croatica, 71 (1): 187–193.
  • Sevik, M.A. and Akcura C. 2011. Occurrence of Cucumber mosaic virus Infecting Parsley (Petroselinum crispum) in Turkey. Notulae Botanicae Horti Agrobotanici Cluj-Napoca, 39(1): 30-33.
  • Sevik, MA. 2017. Natural occurrence of Cucumber mosaic virus infecting broccoli in Turkey. Virus disease. 28(2): 218–219.
  • Sevik, M.A. and Arli-Sokmen, M. 2003. Viruses infecting cucurbits in Samsun, Turkey. Plant Disease, 87: 341-344.
  • Sharifi, M., Massumi, H., Heydarnejad, J. Pour AH. and Shaabanian M., Rahimian. 2008. Analysis of the biological and molecular variability of Watermelon mosaic virus isolates from Iran. Virus Genes. 37: 304-313.
  • Silveira, L.M., Queiroz, M.A, Lima, J.A.A., Nascimento, A.K.Q. and Lima Neto I.S. 2009. Serological survey of virus in cucurbit species in the Lower Middle São Francisco River Basin, Brazil. Tropical Plant Pathology, 34(2): 123-126.
  • Şensoy, S. 2005. Türkiye Kavunlarındaki Genetik Varyasyonun ve Fusarium Solgunluğuna Dayanıklılığın Fenotipik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. Yüzüncü Yıl Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı. Doktora Tezi. 164s. Van.
  • Şevik, MA. and Balkaya, A. 2015. Samsun, Sinop ve Bolu İllerindeki Bal Kabağı (Cucurbita Moschata Duch) Popülasyonlarına Ait Tohum Örneklerinde Virüslerin Tanılanması ve Bulunma Durumlarının Belirlenmesi. 32(3): 70-77.
  • Tobias, I. and Tulipan, M. 2002. Results of virological assay on cucurbits in 2001. Növényvédelem. 38(1): 23-27.
  • Tobias, I., Szabo, B., Salanki, K., Sari, L., Kuhlmann, H. and Palkovics, L. 2008. Seed borne transmission of Zucchini yellow mosaic virus and Cucumber mosaic virus in Styrian Hulless group of Cucurbita pepo, in: M. Pitrat (Ed.), Proceedings of the IX EUCARPA Meeting of Genetics and Plant Breeding of Cucurbitaceae, INRA, Avignon, France, pp189–197.
  • Tomassoli, L., Tiberini, A. and Meneghini M. 2009. Zucchini Yellow Fleck Virus is an Emergent Virus on Melon in Sicily (Italy). Journal of Phytopathology, 158(4):314–316.
  • Trkulja, V., Kovačić, D., Ćurković, B., Vučurović, A., Stanković, I., Bulajić, A. and Krstić B. 2013. First report of Cucumber mosaic virus on melon in Bosnia and Herzegovina. Plant Disease, 97(8): 1124-1125.
  • Usta, M., Güller, A., Sipahioğlu H.M. 2018. Molecular Characterization of Coat Protein Gene of Two Watermelon mosaic potyvirus Isolates Infecting Muskmelon at Van Province (Turkey). 1. International GAP Agriculture & Livestock Congress. 25-27 April 2018 – Şanlıurfa/Turkey.
  • Uzunoğulları, N. and Gümüş, M. 2015. Marmara Bölgesi’nde bazı kültür bitkilerinde doğal enfeksiyona neden olan hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus, CMV)’nün Tespiti. Trakya University Journal of Natural Sciences, 16(1): 9-15.
  • Ünlü, S, and Güldür, M.E. 2004. Şanlıurfa İlinde Biberlerde Zararlı Olan Hıyar Mozayik Virüsü (CMV)'nün ELISA Yöntemiyle Saptanması. HUBAK I. Bilimsel Araştırmalar Sempozyumu, Şanlıurfa. 45s.
  • Vallejos, C.E., Astua-Monge, G., Jones, V., Plyler, T.R., Sakiyama, N.S. and Mackenzie, S.A. 2006. Genetic and molecular characterization of the I locus of Phaseolus vulgaris. Genetics, 172, 1229–1242.
  • Van Regenmortel, M.H.V., Fauquet, C.M., Bishop, D.H.L., Carstens, E.B., Estes, M.K., Lemon, S.M., Maniloff, J., Mayo, M.A., McGeoch, D.J., Pringle, C.R. and Wickner, R.B. 2000. Family Potyviridae. In: Virus Taxonomy, Seventh Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, pp 703-724. Academic Press, San Diego, USA.
  • Webb, R.E. and Scott H.A. 1965. Isolation and identification of Watermelon mosaic virus 1 and 2. Phytopathology, 55: 895–900.
  • Yamaji, Y., Maejima, K., Komatsu, K., Shiraishi, T., Okano, Y., Himeno, M., Sugawara, K., Neriya, Y., Minato, N., Miura, C., Hashimoto, M. and Namba, S. 2012. Lectin-Mediated Resistance Impairs Plant Virus Infection at the Cellular Level. The Plant Cell. 24: 778- 793.
  • Yeh, S.D., Gonsalves, D. and Provvidenti, R. 1984. Comparative studies on host range and serology of Papaya ringspot virus and Watermelon mosaic virus 1. Phytopathology, 74: 1081–1085.
  • Yeşil, S. 2014. Virus Diseases of Edible Seed Squash (Cucurbita pepo L.) in Konya province. Fifth International Scientific Agricultural Symposium. Agrosym 2014“.
  • Yeşil, S. 2018. Some Virus Diseases of Edible Seed Squash (Cucurbita pepo L.) in Aksaray Province, Turkey. Yuzuncu Yil University Journal of Agricultural Sciences. 29 (Special Issue): 63-71.
  • Yeşil, 2020. Detection of Some Virus Diseases of Edible Seed Squash (Cucurbita pepo L.) in Nevşehir Province, Turkey. Selcuk Journal of Agriculture and Food Sciences, 34 (1): 49-56.
  • Yeşil, S. 2019. Detection of Viruses on Edible Seed Squash (Cucurbita pepo L.) in Yozgat Province, Turkey. Journal of the Institute of Science and Technology, 9(3): 1212-1219.
  • Yılmaz, E. 2014. Edirne İli Sebze Üretim Alanlarındaki Virüs Hastalıklarının Saptanması Üzerine Araştırmalar. Namık Kemal Üniversitesi. Yüksek Lisans Tezi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Bitki Koruma Anabilim Dalı. 45s.
  • Yılmaz, M.A., Lecoq, H., Abak, K., Baloğlu, S. and Sarı N. 1992. Türkiye’de Kabakgil Sebze Türlerinde Zarar Yapan Virüsler. Türkiye 1. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi, Bornova, İzmir, 439-442.
  • Zitter, T.A. Hopkins, D.L. and Thomas, C.E. 1996. Compendium of Cucurbit Diseases. The American Phytopathological Society Aps Press, St. Paulk, Minesota, 87p.

Occurrence of Cucumber mosaic cucumovirus and Watermelon mosaic potyvirus on Melon exhibiting viral symptoms in Bingöl province of Turkey and Their Phylogenetic Affinities

Year 2020, Volume: 7 Issue: 4, 948 - 958, 20.10.2020
https://doi.org/10.30910/turkjans.740195

Abstract

Melon plants exhibiting foliar deformations, mosaic pattern in different concentrations of green, and vein banding were found in Bingöl, Turkey, 2019. Specimens were gathered and screened by RT-PCR using capsid protein (CP) gene-specific primer sets to characterize and to ascertain the possible viral agents related to infected plants. About 657 bp and 822 bp DNA fragments were observed in the agarose gel of infected plants, confirming the presence of CMV (Cucumber mosaic cucumovirus) and WMV (Watermelon mosaic potyvirus). Two related DNA fragments from each recovered from agarose gel randomly were inserted in the proper cloning vector, then transformed into E. coli (JM109 strain), and finally sequenced by next-generation sequencing (NGS). Viral CP sequences obtained were deposited in GenBank (NCBI) with accession number MT361015 and MT361016 for CMV and with accession number MT413451 and 437295 for WMV. Sequences analysis revealed that CMV and WMV isolates showed high sequence consensus with their same species, 99.84%, and 99.88%, respectively. Further analysis disclosed that both Bingöl isolates showed the highest sequence similarity with China isolate (DQ399708).
The consensus tree created from various CP sequences in different geographies clearly revealed that the two CMV isolates detected in this study are Subgroup IB, in the very close phylogenetic relations with Turkey, Thailand, India, and China's Subgroup IB isolates from diverse plant origins. Moreover, Bingöl WMV isolates exhibited an evolutionary affinity with isolates from melon and zucchini in France and isolate from a watermelon in China.
This work is the first scientific evidence showing infection of CMV and WMV of melon plants in Bingöl province (Turkey), supported by high sequence homology and consensus trees.

References

  • Abdalla, O., Bruton, B.D., Fish, W.W. and Ali, A. 2012. First Confirmed Report of Tobacco ringspot virus in Cucurbits Crops in Oklahoma. Plant Disease, 96: 1705.
  • Aguilár-Ríos, R. and Lozoya-Saldaña, H. 1994. Virus diseases of cucurbits in the state of Morelos. Revista Mexicana de Fitopatología, 12(1): 11-13.
  • Alonso-Prados, L.J., Luis-Arteage, M., Alvarez, J.M., Moriones, E., Batlle, A., Lavina, A., Garcia-Arenal, F. and Fraile, A. 2003. Epidemics of Aphid-transmitted Viruses in Melon Crops in Spain. European Journal of Plant Pathology, 109: 129-138.
  • Al-Saleh, M.A. and Al-Shahwan I.M. 1997. Viruses infecting cucurbits in Riyadh, Gassim and Hail regions of Saudi Arabia. Arab Gulf Journal of Scientific Research, 15(1): 223- 254.
  • Altınay, N. 2017. Tekirdağ ilinde bazı kabakgil türlerinde virüs infeksiyonlarının belirlenmesi. Namık Kemal Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Bitki Koruma Anabilim Dalı. Yüsek Lisans Tezi. Tekirdağ. 73s.
  • Andres, T.C. 2004. Web site for the plant family Cucurbitaceae & home of The Cucurbit Network. http://www.cucurbit.org.
  • Ayo-John, E.I., Olorunmaiye, P.M., Odedara, O.O., Dada, O.B., Abiola, K.O. and Oladokun, J.O. 2014. Assessment of field-grown cucurbit crops and weeds within farms in SouthWest Nigeria for viral diseases. AcademicPres, Cluj-Napoca, Romania, Notulae Scientia Biologicae, 6(3): 321-325.
  • Beler, Ö. and Açıkgöz, S. 2005. Ege ve Marmara Bölgelerindeki zeytin fidanlıkları ve ağaçlarında görülen bazı virüs hastalıklarının ELISA testi ile saptanması. ADÜ Ziraat Fakültesi Dergisi, 2 (1): 79–84.
  • Brunt, A., Crdotree, K., Dallwitz, M., Gibbs, A. and Watson, L. 1996. Virus of Plants. Descriptions and lists from the VIDE database. S CAB International University Press, 477-478.
  • Budak, E. 2015. Diyarbakır İli ve İlçelerinde Üretilen Kabakgillerdeki Viral Etmenlerin Tanılanması ve Yaygınlıklarının Belirlenmesi. Harran Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Bitki Koruma Anabilim Dalı. Yüksek Lisans Tezi. 50S.
  • Buzkan, N. and Yüzer, D. 2009. Molecular detection of seed-borne viruses in Kahramanmaraş red peppers. Alatarım, 8(1): 1-7.
  • Coutts, B.A. and Jones R.A.C. 2005. Incidence and distribution of viruses infecting cucurbit crops in the Northern Territory and Western Australia. Australian Journal of Agricultural Research, 56(8): 847-858.
  • Coutts, B.A., Kehoe, M.A. and Jones, R.A.C. 2011a. Minimising losses caused by Zucchini yellow mosaic virus in vegetable cucurbit crops in tropical, sub-tropical and Mediterranean environments through cultural methods and host resistance. Virus Research, 159: 141–160.
  • Çat, A., Yardımcı, N. and Kılıç, H.Ç. 2016. Antalya İli ve İlçelerindeki Örtüaltı Hıyar (Cucumis sativus L.) ve Kabak (Cucurbita pepo L.) Üretim Alanlarında Viral Etmenlerin Saptanması. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi. 1: 129-132.
  • Çulal Kılıç, H. and Yardımcı, N. 2012. Burdur Çine Ovası Fasulye Alanlarında Hıyar Mozaik Virüsü. Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 3 (2): 12-15.
  • Çulal Kılıç, H., Yardımcı, N., Toplu, S., and Konu A. 2015. Cucumber mosaic virus and Pepper mild mottle virus in pepper growing areas in Burdur Province, Turkey. International Journal of Scientific and Technological Research, 1: 1.
  • Delmiglio, C. and Pearson M.N. 2006. Effect sandincidence of Cucumber mosaic virus, Watermelon mosaic virus and Zucchini yellow mosaic virus in New Zealand’s only native cucurbit, Sicyos australis. Australasian Plant Pathology, 35: 29-35.
  • Demski, J.W. and Chalkley, J.H. 1972. “Effect of Watermelon mosaic virus on Yield and Marketability of Summer Squash” Plant Disease Report, 56: 147-50.
  • Desbiez, C., Costa, C., Wipf‒Scheibel, C., Girard, M. and Lecoq, H. 2007. Serological and molecular variability of Watermelon mosaic virus (genus Potyvirus). Archives of Virology, 152: 775‒781.
  • Dikici, S. 2019. Uşak ilinde bazı kabakgillerde karpuz mozaik virüsü (WMV)'nün serolojik yöntemle belirlenmesi ve biyolojik indeksleme çalışmaları. Uşak Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Yüksek Lisans Tezi. Tarım Bilimleri Anabilim Dalı. 102s.
  • Doolittle, S.P. 1916. A new infectious mosaic disease of cucumber. Phytopathology 6:145-147.
  • Ergün, M., Semih, E. and Paylan, I.C. 2013. Cucumber mosaic virus in globe artichoke in Turkey. Canadian Journal of Plant Pathology, 35 (4): 514-517.
  • Erkan, S., Gümüş, M. and Paylan, İ.C., Duman İ., Ergün M. 2013. İzmir ili ve çevresindeki bazı kışlık sebzelerde görülen viral etmenlerin saptanması. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 50 (3): 311-322.
  • FAO, 2018. http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC(Erişim Tarihi, 29 Ağustos 2018).
  • Fernandes, F.F. Valverde, R.A. and Black, L.L. 1991. Viruses infecting Cucurbit Crops in Louisiana. Plant Disease, 75: 431.
  • Fidan, Ü. 1995. Virus diseases of vegetables in greenhouses in İzmir and Muğla. Journal of Turkish Phytopathology, 24(1): 7-14.
  • Foissac, L., Gentit, P., Svanetia-Dumas, L., Dulucq, M. J. and Candresse, T. 2001. Polyvalent detection of fruit tree tricho, capillo, and foveaviruses by nested RT-PCR using degenerated and inosine-containing primers (PDO RT-PCR). Acta Horticulturae, 550: 37–43.
  • Fujisawa, I., Anang, S.J., Shen, Y.S. and Zhou, A.J. 1990. Identification of virus diseases affecting some vegetable crops in west Malaysia and the southern part of China. Tropical Agriculture Research Series, 23: 218-228.
  • Gibbs, A.J., Mackenzie, A.M., Wel, K.J. and Gibbs, M.J. 2008. The potyviruses of Australia. Archives of Virology, 153: 1411-1420.
  • Gökdağ, S., Karanfil, A. and Korkmaz, S. 2016. Çanakkale ili ıspanak alanlarındaki Şalgam mozaik virüsü ve Hıyar mozaik virüsü varlığının belirlenmesi. Bahçe, özel sayı (cilt II). 166-170.
  • Güllü, M. and Çalı, S. 1994. Doğu Akdeniz Bölgesi Örtü altı Sebze Alanlarında Görülen Virüs Hastalıklarının Belirlenmesi Üzerine Araştırmalar. Bitki Koruma Bülteni, 34 (3-4): 79.
  • Gümüş, M. Erkan, S. and Tok, S., 2004. Bazı Kabakgil Türlerinin Tohumlarındaki Viral Etmenlerin Saptanması Üzerinde Araştırmalar. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 41 (1): 49-56.
  • Günay, A. 2019. Adıyaman İli Tütün Üretim Alanlarındaki Bazı Tütün Virüslerinin Multipleks RT-PCR Yöntemi İle Araştırılması Ve Bazı Virüs İzolatlarının Moleküler Karakterizasyonu. Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Yüksek Lisans Tezi. Bitki Koruma Anabilim Dalı. Van. 63s.
  • Günay, A. 1993. Özel Sebze Yetiştiriciliği. A.Ü. Ziraat Fakültesi, Ankara, 117s.
  • Güngör, M., Uzunbacak, H., Kutluk-Yilmaz, N.D. and Şevik, M.A. 2017. Samsun ili ıspanak üretim alanlarında enfeksiyon oluşturan virüslerin belirlenmesi. Anadolu Journal of Agricultural Sciences, 32: 164-168.
  • Hseu, S.H, Huang, C.H, Chang, C.A, Yang, W.Z, Chang, Y.M. and Hsiao, C.H. 1987. The occurrence of five viruses in six cucurbits in Taiwan. Plant Protection Bulletin, Taiwan, 29(3): 233-244.
  • Ibaba, J.D, Laing, M.D. and Gubba, A. 2015. Incidence and phylogeny of viruses infecting cucurbit crops in KwaZulu-Natal, Republic of South Africa. Crop Protection, 75: 46- 54.
  • Jossey, S. and Babadoost, M. 2008.Occurrence and Distribution of Pumpkin and Squash Viruses in Illinois. Plant Disease, 92(1):61-68.
  • Karakurt, M.Y. 2015. İstanbul İlinde Karpuz Ekim Alanlarında Cucumber mosaic virus (CMV) Ve Zucchini Yellow Mosaic Virus (ZYMV)'nin Yaygınlıklarının Araştırılması. Namık Kemal Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Yüksek Lisans Tezi. Bitki Koruma Anabilim Dalı. 54s.
  • Karamanlı, A. and Kamberoğlu, M.A. 2010. Survey of Cucumber mosaic virus (CMV) and Zucchini Yellow Mosaic Virus (ZYMV) in Turkish Republic of Northern Cyprus in Cucurbits Growth Fields. Ç.Ü. Fen Bilimleri Enstitüsü, Cilt: 22-23.
  • Karanfil, A. and Korkmaz, S. 2017. Çanakkale ili börülce üretim alanlarında Hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus; CMV)’nün tespiti ve kılıf protein genine göre moleküler karakterizasyonu. Bitki Koruma Bülteni, 57(3): 293-304.
  • Karanfil, A., Soylu, B. and Korkmaz S. 2016. Çanakkale ili ve ilçelerindeki soğanlı süs bitkilerinde Hıyar mozaik virüsü enfeksiyonunun serolojik ve moleküler yöntemler ile araştırılması. Trakya University Journal of Natural Sciences, 17 (2): 105-110.
  • Katul, L. and Makkouk, K.M. 1987. Occurrence and serological relatedness of five cucurbit potyviruses in Lebanon and Syria. Phytopathologia Mediterranea, 26(1): 36-42.
  • Kaya, A., and Erkan, S. 2011. İzmir, Aydın, Manisa ve Balıkesir İllerinde Üretilen Kabakgillerdeki Viral Etmenlerin Tanılanması ve Yaygınlıklarının Belirlenmesi. Bitki Koruma Bülteni, 51 (4): 387-405.
  • Kızmaz, M.Z., Sağır, A. and Baloğlı, S. 2016. Diyarbakır ve Mardin İlleri Kabakgil Üretim Alanlarında Görülen Viral Hastalıkların Yaygınlıklarının ve Etmenlerinin Belirlenmesi. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 53 (4): 397-406.
  • Ko, S.J., Lee, Y.H., Cho, M.S., Park, J.W., Choi, H.S., Lim, G.C. and Kim, K.H. 2007. The incidence of virus diseases on melon in Jeonnam Province during 2000- 2002. Plant Pathology Journal, 23(3): 215-218.
  • Korkmaz, F., Topkaya, Ş. and Yanar Y. 2018. Tokat İli Kabakgil Üretim Alanlarında Enfeksiyon Oluşturan Virüslerin Belirlenmesi. Gaziosmanpasa Journal of Scientific Research, 7(2): 46-56.
  • Kosaka, Y., and Fukunishi, T. 1997. Multiple Inoculation with Three Attemuated Viruses for the Control of Cucumber Virus Diseases. Plant Disease, 81 (7): 733- 738.
  • Köklü, G., and Yilmaz, Ö. 2006. Occurrence of cucurbit viruses on field-grown melon and watermelon in the Thrace region of Turkey. Phytoprotection, 87 (3): 123-130.
  • Kwak, H.R., Kim, J.S., Cho, J.D., Lee, J.H., Kim, T.S., Kim, M.K. and Choi H.S. 2015. Characterization of Melon necrotic spot virus Occurring on Watermelon in Korea. Plant Pathology Journal, 31(4): 379–387.
  • Lecoq, H., and Desbiez, C. 2012. Virus of cucurbit crops in the Mediterranean Region: an ever-changing picture. In: Loebenstein, G., Lecoq, H. (Eds.), Viruses and Virus Diseases of Vegetables in the Mediterranean Basin. Adv. Virus Research, 84: 67-126.
  • Lot, H. and Kaper, J.M. 1976. Further Studies on the RNA Component Distributon Among the nucleoproteins of Cucumber mosaic virus. Virology, 74: 223-226.
  • Massumi, H., Samei, A., Pour, A.H, Shaabanian, M, and Rahimian H. 2007. Occurrence, distribution, and relative incidence of seven viruses infecting greenhouse grown cucurbits in Iran. Plant Disease, 91(2): 159-163.
  • Mnari-Hattab, M., Jebari, H., and Zouba, A. 2008. Identification and distribution of viruses responsible for mosaic diseases affecting cucurbits in Tunisia. Bulletin OEPP/EPPO Bulletin, 38(3): 497-506.
  • Nayar, N.M. and Singh R. 1998. Taxonomy, distribution and ethnobotanical uses in Cucurbits (N.M. Nayar, and T.A. More, eds.). Science Publishers, Inc., U.S.A. pp 1-18.
  • Nematollahi, S., Haghtaghi, E., Koolivand, D. and Hajizadeh M. Molecular detection of Cucumber green mottle mosaic virus variants from cucurbits fields in Iran. Archives of Phytopathology and Plant Protection. 47 (11): 1303- 1310.
  • Ozaslan, M., Berna, B., Aytekin, T. and Siğırcı, Z. 2006. Identification of Pepper Viruses by Das-elisa Assays in Gaziantep-Turkey. Plant Pathology Journal, 5(1): 11-14.
  • Örs, F. 2018. Malatya İli Kavun Ekiliş Alanlarında Görülen Bazı Önemli Virüs Hastalıklarının Moleküler Yöntemlerle Araştırılması ve Karakterizasyonu. İnönü Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Yüksek Lisans Tezi. Bitki Koruma Anabilim Dalı. Malatya. 39s.
  • Özdemir, S., and Erilmez, S. 2007. Denizli ilinde yetiştirilen biber, patlıcan ve marul üretim alanlarında bazı viral etmenlerin Saptanması. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri.27-29 Ağustos Isparta. 114s.
  • Öztürk, S. 2000. Diyarbakır ve İlçelerinde Karpuzlarda Görülen Virüs Hastalıklarının Surveyi. Çukurova Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitki Koruma Anabilim Dalı, Adana, 58s.
  • Palukaitis, P., and Garcia-Arenal, F. 2003. Cucumber mosaic virus, Description of Plant Viruses, No. 400. http://www.dpvweb.net/dpv/showdpv.php?dpvno=400, Accessed date: 28 December 2017.
  • Palukaitis, P., Roossinck, M.J., Dietzgen, R.G. and Francki, R.I.B. 1992. Cucumber mosaic virus. Advances in Virus Research, 41: 281- 348.
  • Price, W.C. 1934. Isolation and study of some yellow strains of cucumber mosaic. Phytopathology, 24: 743-761.
  • Purcifull, D.E. and Hiebert E. 1979. Serological distinction of Watermelon mosaic virus isolates. Phytopathology, 69: 112-116.
  • Purcifull, D.E. Adlerz, W.C., Simone, G.W., Hieberth, E. and Christie, S.R. 1984. Serological Relationships and Partial Characterization of Zucchini Yellow Mosaic Virus Isolated Form Squash in Florida. Plant Disease, 68: 230- 233.
  • Raccah, B. 1999. Epidemiology and control of cucurbit viruses in Israel. 1. Israeli- Turkish Workshop “Detection of virus diseases by advanced techniques and control”, 22–29. August 1999, Adana, Turkey. 46-56.
  • Robinson, R.W. and Deckers-Walters, D.S. (eds.). 1997. Cucurbits, CAB International, Wallingford, UK. ISBN: 0 85199 133 5.
  • Rubies-Autonell, C., Ballante, M., and Turina, M. 1996. Viral infections in melon crops of centralnorthern Italy. Informatore Fitopatologico, 46(7/8): 6-10.
  • Sertkaya, G. 2015. Hatay ili marul ve ıspanak alanlarında bazı virüslerin araştırılması. Mustafa Kemal Üniversitesi, Ziraat Fakültesi Dergisi, 20 (1): 7-12.
  • Sevik, M.A. 2012. Natural occurrence of Cucumber mosaic virus infecting water mint (Mentha aquatica) in Antalya and Konya, Turkey. Acta Botanica Croatica, 71 (1): 187–193.
  • Sevik, M.A. and Akcura C. 2011. Occurrence of Cucumber mosaic virus Infecting Parsley (Petroselinum crispum) in Turkey. Notulae Botanicae Horti Agrobotanici Cluj-Napoca, 39(1): 30-33.
  • Sevik, MA. 2017. Natural occurrence of Cucumber mosaic virus infecting broccoli in Turkey. Virus disease. 28(2): 218–219.
  • Sevik, M.A. and Arli-Sokmen, M. 2003. Viruses infecting cucurbits in Samsun, Turkey. Plant Disease, 87: 341-344.
  • Sharifi, M., Massumi, H., Heydarnejad, J. Pour AH. and Shaabanian M., Rahimian. 2008. Analysis of the biological and molecular variability of Watermelon mosaic virus isolates from Iran. Virus Genes. 37: 304-313.
  • Silveira, L.M., Queiroz, M.A, Lima, J.A.A., Nascimento, A.K.Q. and Lima Neto I.S. 2009. Serological survey of virus in cucurbit species in the Lower Middle São Francisco River Basin, Brazil. Tropical Plant Pathology, 34(2): 123-126.
  • Şensoy, S. 2005. Türkiye Kavunlarındaki Genetik Varyasyonun ve Fusarium Solgunluğuna Dayanıklılığın Fenotipik ve Moleküler Yöntemlerle Araştırılması. Yüzüncü Yıl Üniversitesi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı. Doktora Tezi. 164s. Van.
  • Şevik, MA. and Balkaya, A. 2015. Samsun, Sinop ve Bolu İllerindeki Bal Kabağı (Cucurbita Moschata Duch) Popülasyonlarına Ait Tohum Örneklerinde Virüslerin Tanılanması ve Bulunma Durumlarının Belirlenmesi. 32(3): 70-77.
  • Tobias, I. and Tulipan, M. 2002. Results of virological assay on cucurbits in 2001. Növényvédelem. 38(1): 23-27.
  • Tobias, I., Szabo, B., Salanki, K., Sari, L., Kuhlmann, H. and Palkovics, L. 2008. Seed borne transmission of Zucchini yellow mosaic virus and Cucumber mosaic virus in Styrian Hulless group of Cucurbita pepo, in: M. Pitrat (Ed.), Proceedings of the IX EUCARPA Meeting of Genetics and Plant Breeding of Cucurbitaceae, INRA, Avignon, France, pp189–197.
  • Tomassoli, L., Tiberini, A. and Meneghini M. 2009. Zucchini Yellow Fleck Virus is an Emergent Virus on Melon in Sicily (Italy). Journal of Phytopathology, 158(4):314–316.
  • Trkulja, V., Kovačić, D., Ćurković, B., Vučurović, A., Stanković, I., Bulajić, A. and Krstić B. 2013. First report of Cucumber mosaic virus on melon in Bosnia and Herzegovina. Plant Disease, 97(8): 1124-1125.
  • Usta, M., Güller, A., Sipahioğlu H.M. 2018. Molecular Characterization of Coat Protein Gene of Two Watermelon mosaic potyvirus Isolates Infecting Muskmelon at Van Province (Turkey). 1. International GAP Agriculture & Livestock Congress. 25-27 April 2018 – Şanlıurfa/Turkey.
  • Uzunoğulları, N. and Gümüş, M. 2015. Marmara Bölgesi’nde bazı kültür bitkilerinde doğal enfeksiyona neden olan hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus, CMV)’nün Tespiti. Trakya University Journal of Natural Sciences, 16(1): 9-15.
  • Ünlü, S, and Güldür, M.E. 2004. Şanlıurfa İlinde Biberlerde Zararlı Olan Hıyar Mozayik Virüsü (CMV)'nün ELISA Yöntemiyle Saptanması. HUBAK I. Bilimsel Araştırmalar Sempozyumu, Şanlıurfa. 45s.
  • Vallejos, C.E., Astua-Monge, G., Jones, V., Plyler, T.R., Sakiyama, N.S. and Mackenzie, S.A. 2006. Genetic and molecular characterization of the I locus of Phaseolus vulgaris. Genetics, 172, 1229–1242.
  • Van Regenmortel, M.H.V., Fauquet, C.M., Bishop, D.H.L., Carstens, E.B., Estes, M.K., Lemon, S.M., Maniloff, J., Mayo, M.A., McGeoch, D.J., Pringle, C.R. and Wickner, R.B. 2000. Family Potyviridae. In: Virus Taxonomy, Seventh Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, pp 703-724. Academic Press, San Diego, USA.
  • Webb, R.E. and Scott H.A. 1965. Isolation and identification of Watermelon mosaic virus 1 and 2. Phytopathology, 55: 895–900.
  • Yamaji, Y., Maejima, K., Komatsu, K., Shiraishi, T., Okano, Y., Himeno, M., Sugawara, K., Neriya, Y., Minato, N., Miura, C., Hashimoto, M. and Namba, S. 2012. Lectin-Mediated Resistance Impairs Plant Virus Infection at the Cellular Level. The Plant Cell. 24: 778- 793.
  • Yeh, S.D., Gonsalves, D. and Provvidenti, R. 1984. Comparative studies on host range and serology of Papaya ringspot virus and Watermelon mosaic virus 1. Phytopathology, 74: 1081–1085.
  • Yeşil, S. 2014. Virus Diseases of Edible Seed Squash (Cucurbita pepo L.) in Konya province. Fifth International Scientific Agricultural Symposium. Agrosym 2014“.
  • Yeşil, S. 2018. Some Virus Diseases of Edible Seed Squash (Cucurbita pepo L.) in Aksaray Province, Turkey. Yuzuncu Yil University Journal of Agricultural Sciences. 29 (Special Issue): 63-71.
  • Yeşil, 2020. Detection of Some Virus Diseases of Edible Seed Squash (Cucurbita pepo L.) in Nevşehir Province, Turkey. Selcuk Journal of Agriculture and Food Sciences, 34 (1): 49-56.
  • Yeşil, S. 2019. Detection of Viruses on Edible Seed Squash (Cucurbita pepo L.) in Yozgat Province, Turkey. Journal of the Institute of Science and Technology, 9(3): 1212-1219.
  • Yılmaz, E. 2014. Edirne İli Sebze Üretim Alanlarındaki Virüs Hastalıklarının Saptanması Üzerine Araştırmalar. Namık Kemal Üniversitesi. Yüksek Lisans Tezi. Fen Bilimleri Enstitüsü. Bitki Koruma Anabilim Dalı. 45s.
  • Yılmaz, M.A., Lecoq, H., Abak, K., Baloğlu, S. and Sarı N. 1992. Türkiye’de Kabakgil Sebze Türlerinde Zarar Yapan Virüsler. Türkiye 1. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi, Bornova, İzmir, 439-442.
  • Zitter, T.A. Hopkins, D.L. and Thomas, C.E. 1996. Compendium of Cucurbit Diseases. The American Phytopathological Society Aps Press, St. Paulk, Minesota, 87p.
There are 96 citations in total.

Details

Primary Language English
Journal Section Research Articles
Authors

Abdullah Güller 0000-0003-3887-4208

Mustafa Usta 0000-0002-3940-2774

Publication Date October 20, 2020
Submission Date May 20, 2020
Published in Issue Year 2020 Volume: 7 Issue: 4

Cite

APA Güller, A., & Usta, M. (2020). Occurrence of Cucumber mosaic cucumovirus and Watermelon mosaic potyvirus on Melon exhibiting viral symptoms in Bingöl province of Turkey and Their Phylogenetic Affinities. Turkish Journal of Agricultural and Natural Sciences, 7(4), 948-958. https://doi.org/10.30910/turkjans.740195

Cited By