Çevresel Örneklerde Bulunan Canlı Patojen Mikroorganizmaları Saptama ve Miktarlarını Belirlemede Yeni Yaklaşımlar
Abstract
Gıda endüstrisi, çevre endüstrisi, tıp ve tarım gibi pek çok endüstri ve
bilimsel alanda ürün kontaminasyonu halk sağlığı açısından çok kötü sonuçlar
doğurabilmektedir. Bu nedenle çevresel ve endüstriyel örneklerde indikatör
mikroorganizmaların saptanması ve miktarlarının belirlenmesi halk sağlığı ve
güvencesi açısından çok büyük önem taşımaktadır. Patojen mikroorganizmaların
canlı olanları büyük ölçüde halk sağlığını tehdit ettiği için sadece canlı
hücreleri saptayan ve miktarlarını belirleyen yeni tekniklerin geliştirilmesi
çok önemlidir. Bu derleme, bir örnek içerisinde bulunan sadece patojen
mikroorganizmaları değil aynı zamanda istenilen diğer canlı hücreleri saptamakta
ve miktarlarını belirlemekte kullanılan geleneksel yöntemler ile yeni, güncel
moleküler gelişmeleri avantaj ve dezavantajları ile birlikte özetlemektedir.
Keywords
References
- Alonso JL, Amorós I, Guy RA (2014). Quantification of viable Giardia cysts and Cryptosporidium oocysts in wastewater using propidium monoazide quantitative real-time PCR. Parasitol. Res. 113: 2671–2678
- Ayrapetyan M and Oliver JD (2016). The viable but non-culturable state and its relevance in food safety. Curr Opin Food Sci. 2016, 8:127–133
- Bae S and Wuertz S (2012). Survival of host-associated Bacteroidales cells and their relationship with Enterococcus spp., Campylobacter jejuni, Salmonella enterica serovar Typhimurium, and Adenovirus in freshwater microcosms as measured by propidium monoazide-quantitative PCR. Appl. Environ. Microbiol. 78: 922–932
- Bae S and Wuertz S (2009). Discrimination of viable and dead fecal Bacteroidales bacteria by quantitative PCR with propidium monoazide. Appl. Environ. Microbiol. 75:2940-2944.
- Berney M, Hammes F, Bosshard F, Weilenmann H-U, Thomas Egli T (2007). Assessment and interpretation of bacterial viability by using the LIVE/DEAD BacLight Kit in combination with flow cytometry. Appl. Environ. Microbiol. 73: 3283-3290.
- Boulos L, Prévost M, Barbeau B, Coallier J, Desjardins R (1999). LIVE/DEAD BacLight : application of a new rapid staining method for direct enumeration of viable and total bacteria in drinking water. J. Microbiol. Methods; 37:77-86.
- Epstein E (2003). Land application of sewage sludge and biosolids. Published by Lewis Publishers.
- Fournier PE, Dubourg G, Raoult D (2014). Clinical detection and characterization of bacterial pathogens in the genomics era. Genome Med. 6: 114
Details
Primary Language
English
Subjects
Engineering
Journal Section
Review
Authors
Bilgin Taşkın
YUZUNCU YIL UNIVERSITY, FACULTY OF AGRICULTURE, DEPARTMENT OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
Türkiye
Publication Date
June 30, 2017
Submission Date
February 18, 2017
Acceptance Date
April 1, 2017
Published in Issue
Year 2017 Volume: 27 Number: 2
