Clinical Research
BibTex RIS Cite

Yoğun Bakım Kan Kültürlerinden İzole Edilen Enfeksiyon Etkenlerinin Dağılımı ve Antibiyotik Direnç Profilleri

Year 2024, Volume: 7 Issue: 2, 161 - 168, 30.06.2024

Abstract

Amaç: Kan dolaşımı enfeksiyonları, yüksek morbidite ve mortalite ile seyreden ciddi enfeksiyonlardandır. Bu enfeksiyonlara neden olan etkenlerin antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi önemlidir. Bu çalışmada bir hastanenin yoğun bakım ünitelerinde, kan kültürlerinden izole edilen mikoorganizmaların dağılımları ve antibiyotik duyarlılıkları araştırılmıştır.
Yöntem: Kan örnekleri, otomatize sistemde [Bact/ALERT 3D (BioMérieux, Fransa)] inkübe edildikten sonra mikroorganizmaların identifikasyonu ve antibiyotik duyarlılık paternleri, Vitek 2 kompakt sistemle belirlenmiştir. Maya mantarlarının identifikasyonu ve antifungal duyarlılıkları için API ID 32C ve API ATB Fungus 3 (BioMérieux, Fransa) sistemi kullanılmıştır. Gerektiğinde konvansiyonel yöntemlerden yararlanılmıştır.
Bulgular: Kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalara bakıldığında, 255 pozitif üreme olduğu ve 151’inin (%59,22) gram pozitif bakteri, 71’inin (%27,84) gram negatif bakteri, 33’ünün (%12,94) ise maya mantarı olduğu belirlenmiştir. İzole edilen koagülaz negatif stafilokoklarda metisilin direnci %69,56, Staphylococcus aureus suşlarında ise %9,52 olarak saptanmıştır. Enterococcus faecium suşlarının %44,44’ünde vankomisin ve teikoplanin direnci belirlenmiştir. Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa ve Escherichia coli suşlarında karbapenem direnci sırasıyla, %96, %46, %25 ve %9 olarak saptanmıştır. En sık izole edilen maya türü Candida parapsilosis (%6,27) olup, antifungallerden en etkilileri amfoterisin B ve flusitozin olarak belirlenmiştir.
Sonuç: Koagülaz negatif stafilokoklarda yüksek oranda metisilin direnci, E. faecium suşlarında yüksek oranda vankomisin ve teikoplanin direnci dikkat çekicidir. Ayrıca, A. baumannii ve P. aeruginosa suşlarında saptanan yüksek karbapenem direnci, akılcı antibiyotik kullanımına ihtiyaç duyulduğunu ve bu etkenlere yönelik daha etkin enfeksiyon kontrol programlarına gereksinimi göstermektedir.

Ethical Statement

Çalışmaya dair etik kurul onay belgesi dosyalar sekmesinde yüklenmiştir.

Supporting Institution

Çalışma için bütçe ihtiyacı duyulmamıştır.

Thanks

Çalışmanın gerçekleşmesi için gerekli izinleri sağlayan Hatay Eğitim ve Araştırma Hastanesi Başhekimi Sayın Dr. Sıtkı Sönmez' e teşekkür ederim

References

  • Kirn TJ, Weinstein MP. Update on blood cultures: how to obtain, process, report, and interpret. Clin Microbiol Infect. 2013;19(6): 513-20. doi:10.1111/1469-0691.12180
  • Adrie C, Garrouste-Orgeas M, Ibn Essaied W, et al. Attributable mortality of ICU-acquired bloodstream infections: impact of the source, causative microorganism, resistance profle and antimicrobial therapy. J Infect. 2017;74:131-141. doi:10.1016/j.jinf.2016.11.001
  • Aiesh BM, Qashou R, Shemmessian G, et al. Nosocomial infections in the surgical intensive care unit: an observational retrospective study from a large tertiary hospital in Palestine. BMC Infect Dis. 2023;23,686. doi:10.1186/s12879-023-08677-z
  • The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Routine and extended internal quality control for MIC determination and disk diffusion as recommended by EUCAST. Version 14.0, 2024. http://www.eucast.org
  • Navon-Venezia S, Leavitt A, Carmeli Y. High tigecycline resistance in multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. J Antimicrob Chemother. 2007;59(4):772-4. doi:10.1093/jac/dkm018
  • Uzun B, Güngör S, Yurtsever S, Afşar İ, Demirci M. Yoğun bakım hastalarının kan kültürlerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii suşlarının çeşitli antibiyotiklere direnç durumları. ANKEM Derg. 2012;26(2):55-60. doi:10.5222/ankem.2012.055
  • Centers for Disease Control and Prevention Bloodstream Infection Event (Central lineassociated bloodstream infection and non-central line-associated bloodstream infection) Available: http://www.cdc.gov/nhsn/pdfs/pscmanual/4psc_ clabscurrent.pdf.2016.
  • Uğur M, Genç S. Yoğun Bakım Ünitelerinden İzole Edilen Acinetobacter baumannii ve Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Üç Yıllık Direnç Profili. J Turk Soc Intens Care. 2019;17:130-137. doi:10.4274/tybd.galenos.2018.94103
  • Şirin MC, Ağuş N, Yılmaz N, ve ark. Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017;74(4):269-278. doi:10.5505/TurkHijyen.2017.94899
  • Bozok TŞ, Bozok T. Distribution and antibiotic susceptibility of microorganisms isolated from blood cultures of patients hospitalized in intensive care units: a two-year evaluation. Turk Hij Den Biyol Derg. 2022;79(4):606-615. doi:10.5505/TurkHijyen.2022.26937
  • Toprak R, Uçmak H, Kuzhan N, ve ark. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Sağlık Uygulama Ve Araştırma Hastanesinde 2008-2011 Yılları Arası Hastane Kaynaklı Enfeksiyon Etkenleri ve Antibiyotik Direnç Değişimleri. Mustafa Kemal Üniv Tıp Derg. 2017;8(31):7-13. doi:10.17944/mkutfd.376505
  • Taşkın Kafa AH, Çubuk F, Hasbek M, Aslan R, Çubuk Z. Distribution of Microorganisms Isolated from Blood Cultures and Evaluation of Antibiotic Resistance Rates in Patients Diagnosed with Cancer. J Clin Pract Res. 2023;45(4):370-6. doi:10.14744/cpr.2023.99608
  • Sizar O, Leslie SW, Unakal CG. Gram-Positive Bacteria. [Updated 2023 May 30]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2024 Jan-. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK470553/
  • Yushchuck O, Binda E, Marinelli F. Glycopeptide Antibiotic Resistance Genes. Distribution and Function in the Producer Actinomycetes. Front. Microbiol. 2020;11:1173. doi:10.3389/fmicb.2020.01173
  • Özkaya E, Tümer S, Kirişci Ö, Çalışkan A, Erdoğmuş P. Son iki yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi’nde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Turk Hij Den Biyol Derg. 2015;72(2):115-122. doi:10.5505/TurkHijyen.2015.49260
  • DumanY, Kuzucu Ç, Çuğlan SS. Kan kültürlerinden izole edilen bakteriler ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Erciyes Med J. 2011;33(3):189-196.
  • Yılmaz N, Köse Ş, Ağuş N, Ece G, Akkoçlu G, Kıraklı C. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların kan kültürlerinde üreyen mikroorganizmalar, antibiyotik duyaklılıkları ve nozokomiyal bakteriyemi etkenleri. ANKEM Derg. 2010;24(1):12-19.
  • Yılmaz S, Gümral R, Güney M, ve ark. İki yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkların değerlendirilmesi. Gülhane Tıp Derg. 2013;55(4):247-52. doi:10.5455/gulhane.24245
  • Shah S, Rampal R, Thakkar P, Poojary S, Ladi S. The Prevalence and Antimicrobial Susceptibility Pattern of Gram-Positive Pathogens: Three-Year Study at a Tertiary Care Hospital in Mumbai, India. J Lab Physicians. 2021;14(2):109-114. doi:10.1055/s-0041-1731136
  • Lupia T, Roberto G, Scaglione L, et al. Clinical and microbiological characteristics of bloodstream infections caused by Enterococcus spp. within internal medicine wards: a two-year single-centre experience. Intern Emerg Med. 2022;17(4):1129-1137. doi:10.1007/s11739-022-02926-w
  • Duan N, Sun L, Huang C, Li H, Cheng B. Microbial Distribution and Antibiotic Susceptibility of Bloodstream Infections in Different Intensive Care Units. Front. Microbiol. 2021;12:792282. doi:10.3389/fmicb.2021.792282
  • Şanlı K, Mart Kömürcü SZ, Şahin AS. Prevalence and Antimicrobial Susceptibility of Enterococcus Faecalis and Enterococcus Faecium Grown in Adult Intensive Care Patients Blood Cultures. İKSSTD. 2022;14(3):268-273. doi:10.14744/iksstd.2022.55823
  • Van An N, Hoang LH, Le HHL, et al. Distribution and Antibiotic Resistance Characteristics of Bacteria Isolated from Blood Culture in a Teaching Hospital in Vietnam During 2014-2021. Infect Drug Resist. 2023;16:1677-1692. doi:10.2147/IDR.S402278
  • Aydın M, Yavuz MT, Korkut O, Oldacay M. Antibiotic resistance profile of Acinetobacter strains isolated from patients in intensive care unit: A surveillance study of four years. Mediterr J Infect Microb Antimicrob. 2013;2:13.
  • Güven T, Yılmaz G, Güner HR, Kaya Kalem A, Eser F, Taşyaran MA. Increasing resistance of nosocomial Acinetobacter baumannii: are we going to be defeated? Turk J Med Sci. 2014;44(1):73-8. doi:10.3906/sag-1211-21
  • Iraz M, Düzgün ÖA, Sandallı C, ve ark. Distribution of β-lactamase genes among carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae strains isolated from patients in Turkey. Ann Lab Med. 2015;35(6):595-601. doi:10.3343/alm.2015.35.6.595
  • Zarakolu P, Özgen Köseoğlu E, Aladağ E, ve ark. Epidemiology of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae colonization: a surveillance study at a Turkish university hospital from 2009 to 2013. Diagn Microbiol Infect Dis. 2016;85(4):466-70. doi:10.1016/j.diagmicrobio.2016.05.012
  • Wisplinghoff H, Bischoff T, Tallent SM, Seifert H, Wenzel RP, Edmond MB. Nosocomial bloodstream infections in US hospitals: Analysis of 24,179 cases from a prospective nationwide surveillance study. Clin Infect Dis. 2004;39(3):309-317. doi:10.1086/421946.
  • Colombo AL, Guimarães T, Sukienik T, et al. Prognostic factors and historical trends in the epidemiology of candidemia in critically ill patients: An analysis of five multicenter studies sequentially conducted over a 9-year period. Intensive Care Med. 2014;40(10):1489-1498. doi:10.1007/s00134-014-3400-y
  • González de Molina FJ, León C, Ruiz-Santana S, Saavedra P. Assessment of candidemia-attributable mortality in critically ill patients using propensity score matching analysis. Crit Care. 2012;16(3):1-8. doi:10.1186/cc11388
  • Marriott D JE, Playford EG, Chen S, et al. Determinants of mortality in non-neutropenic ICU patients with candidaemia. Crit Care. 2009;13(4):1-8. doi:10.1186/cc7964
  • Günbey F, Aşcı Toraman Z, Ayyıldız Arslan M, ve ark. Yoğun Bakım Hastalarının Kan Kültüründe Üreyen Candida Türlerinin Dağılımının Değerlendirilmesi. Mantar Dergisi. 2022;13(3):99-104. doi:10.30708/mantar.1191002
Year 2024, Volume: 7 Issue: 2, 161 - 168, 30.06.2024

Abstract

References

  • Kirn TJ, Weinstein MP. Update on blood cultures: how to obtain, process, report, and interpret. Clin Microbiol Infect. 2013;19(6): 513-20. doi:10.1111/1469-0691.12180
  • Adrie C, Garrouste-Orgeas M, Ibn Essaied W, et al. Attributable mortality of ICU-acquired bloodstream infections: impact of the source, causative microorganism, resistance profle and antimicrobial therapy. J Infect. 2017;74:131-141. doi:10.1016/j.jinf.2016.11.001
  • Aiesh BM, Qashou R, Shemmessian G, et al. Nosocomial infections in the surgical intensive care unit: an observational retrospective study from a large tertiary hospital in Palestine. BMC Infect Dis. 2023;23,686. doi:10.1186/s12879-023-08677-z
  • The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Routine and extended internal quality control for MIC determination and disk diffusion as recommended by EUCAST. Version 14.0, 2024. http://www.eucast.org
  • Navon-Venezia S, Leavitt A, Carmeli Y. High tigecycline resistance in multidrug-resistant Acinetobacter baumannii. J Antimicrob Chemother. 2007;59(4):772-4. doi:10.1093/jac/dkm018
  • Uzun B, Güngör S, Yurtsever S, Afşar İ, Demirci M. Yoğun bakım hastalarının kan kültürlerinden izole edilen Pseudomonas aeruginosa ve Acinetobacter baumannii suşlarının çeşitli antibiyotiklere direnç durumları. ANKEM Derg. 2012;26(2):55-60. doi:10.5222/ankem.2012.055
  • Centers for Disease Control and Prevention Bloodstream Infection Event (Central lineassociated bloodstream infection and non-central line-associated bloodstream infection) Available: http://www.cdc.gov/nhsn/pdfs/pscmanual/4psc_ clabscurrent.pdf.2016.
  • Uğur M, Genç S. Yoğun Bakım Ünitelerinden İzole Edilen Acinetobacter baumannii ve Pseudomonas aeruginosa Suşlarının Üç Yıllık Direnç Profili. J Turk Soc Intens Care. 2019;17:130-137. doi:10.4274/tybd.galenos.2018.94103
  • Şirin MC, Ağuş N, Yılmaz N, ve ark. Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017;74(4):269-278. doi:10.5505/TurkHijyen.2017.94899
  • Bozok TŞ, Bozok T. Distribution and antibiotic susceptibility of microorganisms isolated from blood cultures of patients hospitalized in intensive care units: a two-year evaluation. Turk Hij Den Biyol Derg. 2022;79(4):606-615. doi:10.5505/TurkHijyen.2022.26937
  • Toprak R, Uçmak H, Kuzhan N, ve ark. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Sağlık Uygulama Ve Araştırma Hastanesinde 2008-2011 Yılları Arası Hastane Kaynaklı Enfeksiyon Etkenleri ve Antibiyotik Direnç Değişimleri. Mustafa Kemal Üniv Tıp Derg. 2017;8(31):7-13. doi:10.17944/mkutfd.376505
  • Taşkın Kafa AH, Çubuk F, Hasbek M, Aslan R, Çubuk Z. Distribution of Microorganisms Isolated from Blood Cultures and Evaluation of Antibiotic Resistance Rates in Patients Diagnosed with Cancer. J Clin Pract Res. 2023;45(4):370-6. doi:10.14744/cpr.2023.99608
  • Sizar O, Leslie SW, Unakal CG. Gram-Positive Bacteria. [Updated 2023 May 30]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2024 Jan-. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK470553/
  • Yushchuck O, Binda E, Marinelli F. Glycopeptide Antibiotic Resistance Genes. Distribution and Function in the Producer Actinomycetes. Front. Microbiol. 2020;11:1173. doi:10.3389/fmicb.2020.01173
  • Özkaya E, Tümer S, Kirişci Ö, Çalışkan A, Erdoğmuş P. Son iki yılda Kahramanmaraş Necip Fazıl Şehir Hastanesi’nde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Turk Hij Den Biyol Derg. 2015;72(2):115-122. doi:10.5505/TurkHijyen.2015.49260
  • DumanY, Kuzucu Ç, Çuğlan SS. Kan kültürlerinden izole edilen bakteriler ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Erciyes Med J. 2011;33(3):189-196.
  • Yılmaz N, Köse Ş, Ağuş N, Ece G, Akkoçlu G, Kıraklı C. Yoğun bakım ünitesinde yatan hastaların kan kültürlerinde üreyen mikroorganizmalar, antibiyotik duyaklılıkları ve nozokomiyal bakteriyemi etkenleri. ANKEM Derg. 2010;24(1):12-19.
  • Yılmaz S, Gümral R, Güney M, ve ark. İki yıllık dönemde kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkların değerlendirilmesi. Gülhane Tıp Derg. 2013;55(4):247-52. doi:10.5455/gulhane.24245
  • Shah S, Rampal R, Thakkar P, Poojary S, Ladi S. The Prevalence and Antimicrobial Susceptibility Pattern of Gram-Positive Pathogens: Three-Year Study at a Tertiary Care Hospital in Mumbai, India. J Lab Physicians. 2021;14(2):109-114. doi:10.1055/s-0041-1731136
  • Lupia T, Roberto G, Scaglione L, et al. Clinical and microbiological characteristics of bloodstream infections caused by Enterococcus spp. within internal medicine wards: a two-year single-centre experience. Intern Emerg Med. 2022;17(4):1129-1137. doi:10.1007/s11739-022-02926-w
  • Duan N, Sun L, Huang C, Li H, Cheng B. Microbial Distribution and Antibiotic Susceptibility of Bloodstream Infections in Different Intensive Care Units. Front. Microbiol. 2021;12:792282. doi:10.3389/fmicb.2021.792282
  • Şanlı K, Mart Kömürcü SZ, Şahin AS. Prevalence and Antimicrobial Susceptibility of Enterococcus Faecalis and Enterococcus Faecium Grown in Adult Intensive Care Patients Blood Cultures. İKSSTD. 2022;14(3):268-273. doi:10.14744/iksstd.2022.55823
  • Van An N, Hoang LH, Le HHL, et al. Distribution and Antibiotic Resistance Characteristics of Bacteria Isolated from Blood Culture in a Teaching Hospital in Vietnam During 2014-2021. Infect Drug Resist. 2023;16:1677-1692. doi:10.2147/IDR.S402278
  • Aydın M, Yavuz MT, Korkut O, Oldacay M. Antibiotic resistance profile of Acinetobacter strains isolated from patients in intensive care unit: A surveillance study of four years. Mediterr J Infect Microb Antimicrob. 2013;2:13.
  • Güven T, Yılmaz G, Güner HR, Kaya Kalem A, Eser F, Taşyaran MA. Increasing resistance of nosocomial Acinetobacter baumannii: are we going to be defeated? Turk J Med Sci. 2014;44(1):73-8. doi:10.3906/sag-1211-21
  • Iraz M, Düzgün ÖA, Sandallı C, ve ark. Distribution of β-lactamase genes among carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae strains isolated from patients in Turkey. Ann Lab Med. 2015;35(6):595-601. doi:10.3343/alm.2015.35.6.595
  • Zarakolu P, Özgen Köseoğlu E, Aladağ E, ve ark. Epidemiology of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae colonization: a surveillance study at a Turkish university hospital from 2009 to 2013. Diagn Microbiol Infect Dis. 2016;85(4):466-70. doi:10.1016/j.diagmicrobio.2016.05.012
  • Wisplinghoff H, Bischoff T, Tallent SM, Seifert H, Wenzel RP, Edmond MB. Nosocomial bloodstream infections in US hospitals: Analysis of 24,179 cases from a prospective nationwide surveillance study. Clin Infect Dis. 2004;39(3):309-317. doi:10.1086/421946.
  • Colombo AL, Guimarães T, Sukienik T, et al. Prognostic factors and historical trends in the epidemiology of candidemia in critically ill patients: An analysis of five multicenter studies sequentially conducted over a 9-year period. Intensive Care Med. 2014;40(10):1489-1498. doi:10.1007/s00134-014-3400-y
  • González de Molina FJ, León C, Ruiz-Santana S, Saavedra P. Assessment of candidemia-attributable mortality in critically ill patients using propensity score matching analysis. Crit Care. 2012;16(3):1-8. doi:10.1186/cc11388
  • Marriott D JE, Playford EG, Chen S, et al. Determinants of mortality in non-neutropenic ICU patients with candidaemia. Crit Care. 2009;13(4):1-8. doi:10.1186/cc7964
  • Günbey F, Aşcı Toraman Z, Ayyıldız Arslan M, ve ark. Yoğun Bakım Hastalarının Kan Kültüründe Üreyen Candida Türlerinin Dağılımının Değerlendirilmesi. Mantar Dergisi. 2022;13(3):99-104. doi:10.30708/mantar.1191002
There are 32 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Subjects Intensive Care
Journal Section Research Articles
Authors

Hamdullah Suphi Bayraktar 0000-0003-3400-9292

Publication Date June 30, 2024
Submission Date January 13, 2024
Acceptance Date April 4, 2024
Published in Issue Year 2024 Volume: 7 Issue: 2

Cite

AMA Bayraktar HS. Yoğun Bakım Kan Kültürlerinden İzole Edilen Enfeksiyon Etkenlerinin Dağılımı ve Antibiyotik Direnç Profilleri. Acta Med Nicomedia. June 2024;7(2):161-168.

images?q=tbn:ANd9GcSZGi2xIvqKAAwnJ5TSwN7g4cYXkrLAiHoAURHIjzbYqI5bffXt&s

The articles in the Journal of "Acta Medica Nicomedia" are open access articles licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License at the web address https://dergipark.org.tr/tr/pub/actamednicomedia