Seasonal Change in Frequency of Adenovirus and Rotavirus in Children Prediagnosed with Acute Gastroenteritis

Abstract

Objective: Viruses are one of the most common causes of gastroenteritis all over the world. The causative agents and severity of acute gastroenteritis in childhood can vary depending on age, season, and geographic region. In this study, we aimed to evaluate the prevalence of enteric adenovirus and rotavirus in patients aged 0-17 years who were admitted to the hospital with a prediagnosed of acute gastroenteritis according to age groups, gender and seasons. Methods: Laboratory results of stool samples sent for viral agent research from pediatric patients who applied to Necmettin Erbakan University Faculty of Medicine Hospital with complaints such as diarrhea, nausea, and vomiting between September 1, 2020 and August 31, 2023 were retrospectively examined from the hospital information management system. Results: Viral antigen was detected in 1161 (17.7%) of 6556 stool samples. Rotavirus was detected in 916 (14.0%) and enteric adenovirus in 245 (3.7%) of the viral antigen positive samples. It was observed that 524 (45.3%) of the positive samples belonged to female patients and 637 (54.7%) to male patients. The prevalence of rotavirus was found to be higher than adenovirus in every age group. It was observed that the frequency of adenovirus was highest in October-November-January, and the frequency of rotavirus was highest in February-March. Conclusion: Early diagnosis of viral gastroenteritis, which is common in childhood, is important in determining the treatment approach, preventing unnecessary antibiotic use and predicting the course of the disease.

Keywords

• Adenovirus
• rotavirus
• gastroenteritis
• immunochromatography
• child

Akut Gastroenterit Ön Tanılı Çocuklarda Adenovirus ve Rotavirus Sıklığının Mevsimsel Değişimi

Abstract

Amaç: Günümüzde tüm dünyada viruslar en yaygın gastroenterit etkenlerindendir. Çocukluk döneminde görülen akut gastroenteritlerde etken ve hastalığın şiddeti; yaşa, mevsime ve coğrafi bölgeye göre değişkenlik gösterir. Bu çalışmada, akut gastroenterit ön tanısı ile hastaneye başvuran 0-17 yaş grubu hastalarda enterik adenovirus ve rotavirus görülme sıklığının yaş gruplarına, cinsiyete ve aylara göre değerlendirilmesi hedeflendi. Yöntemler: Necmettin Erbakan Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesine; ishal, bulantı, kusma gibi şikayetlerle, 1 Eylül 2020 ile 31 Ağustos 2023 tarihleri arasında başvuran çocuk yaş grubu hastalardan viral etken araştırma amacı ile gönderilen dışkı örneklerinin laboratuvar sonuçları hastane bilgi yönetim sisteminden retrospektif olarak incelendi. Bulgular: Toplam 6556 gaita örneğinden 1161 (%17,7)’inde viral antijen saptandı. Viral antijen pozitif bulunan örneklerden 916 (%14,0)’sında rotavirus, 245 (%3,7)’inde enterik adenovirus tespit edildi. Pozitif örneklerin 524 (%45,3)’ünün kız, 637 (%54,7)‘sinin erkek hastalara ait olduğu görüldü. Rotavirus sıklığı her yaş grubunda adenovirus sıklığından fazla bulundu. Adenovirus sıklığının Ekim-Kasım-Ocak aylarında, rotavirus sıklığının ise Şubat-Mart aylarında pik yaptığı görüldü. Sonuç: Çocukluk çağında sık rastlanan viral gastroenteritlere erken tanı konulması; tedavi yaklaşımını belirlemek, gereksiz antibiyotik kullanımının önüne geçmek ve hastalığın seyrini öngörmek açısından önemlidir.

Keywords

• Adenovirus
• rotavirus
• gastroenterit
• immünokromatografi
• çocuk

References

1. 1. Tüzüner U, Gülcen BS, Özdemir M, Feyzioğlu B. Gastroenteritli çocukların dışkılarında adenovirus ve rotavirus sıklığı ve mevsimsel dağılımı. Klimik Dergisi 2016; 29(3):121-4.
2. 2. Wilhelmi I, Roman E, Sanchez-Fauquier A. Viruses causing gastroenteritis. Clinical Microbiology and Infection 2003; 9(4):247-62.
3. 3. Demiray T. Prevalence of rotavirus and adenovirus in children with acute gastroenteritis. Journal of Immunology and Clinical Microbiology 2016; 1(2):37-40.
4. 4. Lekana-Douki SE, Kombila-Koumavor C, Nkoghe D, Drosten C, Drexler JF, Leroy EM. Molecular epidemiology of enteric viruses and genotyping of rotavirus A, adenovirus and astrovirus among children under 5 years old in Gabon. International Journal of Infectious Diseases 2015;34:90-5.
5. 5. İlhan O. Dışkı örneklerinde rotavirüsün iki farklı serolojik metotla araştırılması/Investigation of rotavirus by two different serological methods. Doctoral Dissertation. 2016.
6. 6. Pius OO, Ekundayo IO, Damilare SI. Sero-epidemiology of rotavirus gastroenteritis in children in Ilorin, Kwara State. Journal of Bioresource Management 2023; 10(3):1.
7. 7. Palanduz A. Gastrointestinal enfeksiyon etkenleri ve neden oldukları klinik tablolar. Journal of Pediatric Infection/Cocuk Enfeksiyon Dergisi 2009; 3(1):16-8.
8. 8. Baskın E, Türkay S, Gökalp A. Adenovirüs gastroenteritleri. Turkiye Klinikleri Journal of Medical Sciences 1995; 15:121-5.

9. 9. Gültepe B, Güdücüoğlu H, Çıkman A, Parlak M, Berktaş M. Van yöresinde gözlenen gastroenteritlerde rotavirus ve adenovirus sıklığı. Sakarya Tıp Dergisi 2013; 3(3):131-4.
10. 10. Şafak B. Akut gastroenteritli çocuk hastalarda rotavirus ve adenovirus sıklığı. Acıbadem Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi 2014; (2):121-4.
11. 11. Tekin A. Mardin\'deki akut gastroenteritli çocuklarda rotavirüs ve enterik adenovirüs sıklığı. Journal of Clinical and Experimental Investigations 2010; 1(1):41-5.
12. 12. Bahçe YG, Ozudogru O, Omer A. Siirt yöresinde gözlenen gastroenterit vakalarında rotavirüs ve adenovirüs sıklığı. Gevher Nesibe Journal of Medical and Health Sciences 2022; 7(19):23-8.
13. 13. Şenol FF, Öner P, Aytaç Ö, Babacan A, Toraman ZA. Gastrointestinal enfeksiyonlarda paraziter ve viral etkenlerin yeri. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2022; 52(4):281-90.
14. 14. Aydın E, Aydın N, Perçin Renders D. Evaluation of the effect of acute gastroenteritis factors on laboratory parameters in pediatric patients. Flora Infeksiyon Hastaliklari ve Klinik Mikrobiyoloji Dergisi 2022; 27(1):125-34.
15. 15. Demir A, Gümüş H. Çocuklarda akut gastroenterit etkenlerinin mevsimsel farklılığı. Van Sağlık Bilimleri Dergisi 2023; 16(2):100-4.
16. 16. Dinç HÖ, Taner Z, Özbey D, Gareayaghi N, Sirekbasan S, Kocazeybek BS. Çocukluk yaş grubu gastroenteritlerinde rotavirüs ve adenovirüs sıklığı: Ocak 2013-Aralık 2018 Cerrahpaşa Tıp Fakültesi verileri. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2019; 49(4):206-11.
17. 17. Gültepe B, Yaman G, Çıkman A, Güdücüoğlu H. Çocukluk yaş grubu gastroenteritlerde rotavirus ve adenovirus sıklığı. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2012; 42(1):16-20.
18. 18. Özkan EA, Yeşilyurt E, Çilsal Z, Yılmaz N, Öztürk O, Ssdigov A. Akut gastroenteritle çocuk polikliniğine başvuran hastalardaki rotavirüs ve enterik adenovirüs sıklığı. Bozok Tıp Dergisi 2020; 10(3):61-4.
19. 19. Aytaç Ö, Şenol FF, Pınar O, Erkmen N, Aslan R, Doğukan M, Toraman ZA. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirüs ve adenovirüs sıklığı. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 2019; 77(2):179-84.
20. 20. Taşbent FE, Gülseren YD, Özdemir M. Investigation of adenovirus and rotavirus frequencies and seasonal distribution in patients with gastroenteritis. Ahi Evran Medical Journal 2021; 5(3):218-22.
21. 21. Tokak S, Uğurcan D, Atılgan Güzeş E. Akut gastroenteritli çocuklardaki adenovirüs ve rotavirüs sıklığının ve mevsimsel dağılımının araştırılması. Kırıkkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2022; 24(1):163-70.
22. 22. Coşkun USŞ, Kasap T. Frequency of rotavirus and adenovirus in pediatric patients with acute gastroenteritis. Journal of Contemporary Medicine 2019; 9(1):85-8.
23. 23. Biçer S, Sahin GT, Koncay B, Gemici H, Siraneci R, Ozturk N, Sevketoglu E. Incidence assessment of rotavirus and adenovirus associated acute gastroenteritis cases in early childhood Infez Med 2011; 19(2):113-9.
24. 24. Yalçın TY, Yıldırım D, Alkan S. Frequency of rotavirus and adenovirus in children with diarrhea in Sivas Numune Hospital. Cumhuriyet Medical Journal 2016; 38(4):258-62.
25. 25. Celik C, Gozel MG, Turkay H, Bakici MZ, Güven AS, Elaldi N. Rotavirus and adenovirus gastroenteritis: time series analysis. Pediatrics International 2015; 57(4):590-6.
26. 26. Karagün BŞ, Gürsu HA, Korkmaz Ö, Bozdağ İ, Hasbek M. Beş yaşın altında akut gastroenteritli çocuklarda rotavirüs ve enterik adenovirüs sıklığının araştırılması. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2014; 44(2):70-4.
27. 27. Çaycı YT, Yılmaz G, Birinci A. Investigation of the frequency of rotavirus and adenovirus in acute gastroenteritis cases. Pamukkale Medical Journal 2017; 10(1):61-5.
28. 28. Sert S, Erayman B. Akut gastroenterit tanısı konulan çocuklarda adenovirüs ve rotavirüsün sıklığı ve mevsimsel dağılımı: Tek merkez deneyimi. J Contemp Med 2023; 13(2):353-9.
29. 29. Topkaya AE, Aksungar B, Özakkaş F, Çapan N. Examination of rotavirus and enteric adenovirus in children with acute gastroenteritis. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2006; 36(4):210-3.
30. 30. İrvem A, Yücel FM, Yıldırım M, Kadanalı A, Dede B. Akut gastroenteritli çocuk hastalarda rotavirüs görülme sıklığı. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2014; 44(3):98-100.
31. 31. Bilman FB, Yetik M. Rotavirüslerin etken olduğu pediyatrik ishallerde epidemiyolojik faktörler: İzmir’de 5 yıllık sürveyans verilerinin değerlendirilmesi. FLORA 2018; 23(4):208-13.
32. 32. World Health Organization (WHO). Global Rotavirus Information and Surveillance Bulletin [press release]. 2012;6.
33. 33. Çaycı YT, Yılmaz G, Birinci A. Akut gastroenterit vakalarında rotavirüs ve adenovirüs sıklığının araştırılması. Pamukkale Medical Journal 2017; 10(1):61.
34. 34. İnan N, Ünsur EK, Demirel A, Mamçu D, Sönmez E, Arısoy A. Akut viral gastroenterit öntanılı vakalarda rotavirus, adenovirus ve norovirus sıklığının araştırılması. ANKEM Dergi 2014; 28(1):14-9.
35. 35. Akıncı N, Ercan T, Yalman N, Eren A, Severge B, Ercan G. Akut gastroenteritli çocuklarda adenovirus ve rotavirus. J Pediatr Inf 2007; 1(3):98-101.
36. 36. Türk Dağı H, Fındık D. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirüs ve adenovirüs antijenlerinin araştırılması. Journal of Clinical and Experimental Investigations 2014; 5(2):256-60.
37. 37. Kırca F, Demirel F. Frequency and seasonal distribution of rotavirus and adenovirus in patients with acute gastroenteritis. Journal of Contemporary Medicine 2023; 13(4):697-701.
38. 38. Kızılırmak A, Çalışkan E, Temizkan RC. Akut gastroenteritli çocuklarda rotavirus ve adenovirus sıklığı. Konuralp Medical Journal/Konuralp Tip Dergisi 2017; 9(2):35-9.
39. 39. Vural DG, Torun EG, Bıyık İ, Çaycı YT, Bilgin K, Birinci A. Akut gastroenteritli olgularda rotavirüs ve adenovirüs sıklığının araştırılması. Kırıkkale Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2022; 24(2):289-94.
40. 40. Barutçu A, Barutçu S. Frequency of rotavirus and enteric adenovirus in children with acute gastroenteritis in Halfeti district, Sanliurfa, Turkey. Cukurova Medical Journal 2020; 45(2):448-54.
41. 41. Avcioglu F, Behcet M. Investigation of rotavirus and enteric adenovirus antigens in children between 0-14 years old. Medicine 2020; 9(4):885-7.
42. 42. Çağ Y, Hacıseyitoğlu D. Viral gastroenterit tanısı alan çocuklarda adenovirüs ve rotavirüslerin yaşa ve mevsimlere göre dağılımları. Mediterranean Journal of Infection Microbes and Antimicrobials 2021; 10:32.
43. 43. Güzel M, Akpınar O, Kılıç MB. Prevalence of rotavirus-associated acute gastroenteritis cases in early childhood in Turkey: meta-analysis. children. Children 2020; 7(10):159.
44. 44. Alp EK, Özdemir YÜ. Akut gastroenteritli çocuklarda rotavirüs prevelansının araştırılması: Tek merkezli çalışma. Pediatric Practice and Research 2022; 10(2):78-82.
45. 45. İnci A, Kurtoğlu MG, Baysal B. Bir eğitim ve araştirma hastanesinde rotavirus gastroenteriti prevalansının araştırılması. İnfeksiyon Dergisi (Turkish Journal of Infection) 2009; 23(2):79-82.
46. 46. Öner SZ, Kaleli̇ İ, Demi̇r M, Mete E, Çalişkan A. Rotavirus and adenovirus prevalence in patients with acute viral gastroenteritis in Denizli, Turkey, 2017–2021. Journal of Medical Virology 2022; 94(8):3857-62.
47. 47. Sugeçti S, Çelen U, Azaklı PT, Yenice S, Koçer F. Seasonal prevalence of acute gastroenteritis, enteric adenovirus and rotavirus antigen: immunochromatographic presence in children. Journal of Pediatric Infection 2015; 9:161-5.
48. 48. Çapan Konca MT, Akgün S, Bülbül M, Çoban M, Kahramaner Z, Turgut M. Prevalence of rotavirus in children with acute gastroenteritis, seasonal distribution, and laboratory findings in the Southeast of Turkey. Journal of Pediatric Infection 2014; 8:7-11.
49. 49. Khetsuriani N, LaMonte-Fowlkes A, Oberst S, Pallansch MA, Control CfD, Prevention. Enterovirus surveillance—United States, 1970–2005. MMWR Surveill Summ 2006; 55(8):1-20.
50. 50. Çömçe M, Kafadar D, Erol M, Yiğit Ö. A retrospective analysis of rotavirus and adenovirus infections in pediatric population admitted to emergency department with acute gastroenteritis. Journal of Pediatric Infection 2017; 11(4):135-42.
51. 51. Kandemir İ, Atalay MA, Delice S, Taş SK, Gökahmetoğlu S. Gastroenteritli çocuklarda enterik adenovirüs antijenleri. Turkish Journal of Immunology 2014; 2(1):1-4.
52. 52. Ozdemir S, Delialioğlu N, Emekdaş G. Investigation of rotavirus, adenovirus and astrovirus frequencies in children with acute gastroenteritis and evaluation of epidemiological features. Mikrobiyoloji Bülteni 2010; 44(4):571-8.
53. 53. Ozsari T, Bora G, Kaya B, Yakut K. The prevalence of rotavirus and adenovirus in the childhood gastroenteritis. Jundishapur Journal of Microbiology 2016; 9(6):34867.
54. 54. Xiao DJ, Fei LA, Qing LR, Shuang C, Song Y, Ying ZX. Epidemiological and clinical features of rotavirus and adenovirus related gastroenteritis in Beijing: A retrospective case-control study in pediatric patients. Biomedical and Environmental Sciences 2020; 33(3):196-200.
55. 55. Thwiny HT, Alsalih NJ, Saeed ZF, Al-Yasari AMR, Al-Saadawe MAA, Alsaadawi MAE. Prevalence and seasonal pattern of enteric viruses among hospitalized children with acute gastroenteritis in Samawah, Iraq. Journal of Medicine and Life 2022; 15(1):52.
56. 56. Deliu I, Georgescu SC. The incidence of adenovirus and rotavirus in pediatric patients with gastroenteritis. Current Trends in Natural Sciences 2023; 12(23):54-8.
57. 57. Cho SR, Chae SJ, Jung S, Choi W, Han MG, Yoo CK, Lee DY. Trends in acute viral gastroenteritis among children aged≤ 5 years through the national surveillance system in South Korea, 2013–2019. Journal of Medical Virology 2021; 93(8):4875-82.
58. 58. Keita AM, Doh S, Sow SO, Powell H, Omore R, Jahangir Hossain M. Prevalence, clinical severity, and seasonality of adenovirus 40/41, astrovirus, sapovirus, and rotavirus among young children with moderate-to-severe diarrhea: results from the Vaccine Impact on Diarrhea in Africa (VIDA) study. Clinical Infectious Diseases 2023; 76:123-31.
59. 59. Terzi HA, Aydemir Ö. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirüs ve adenovirüs sıklığının araştırılması; Sakarya. Sakarya Tıp Dergisi 2018 ;8(4):746-52.
60. 60. Ramsay M, Brown D. Epidemiology of group a rotaviruses surveillance and burden of disease studies. Rotaviruses: Methods and Protocols 2000; 34:217-38.
61. 61. Devrim İ. Çocuklarda viral gastroenteritler. Klinik Tıp Pediatri Dergisi 2016; 8(4):12-6.
62. 62. Varışlı AN, Tekin S, Bıçak İ. Akut gastroenterit olgularında rotavirus ve adenovirus ne kadar sorun?: Dört yıllık sonuçlar. Klimik Dergisi 2019; 32(1):67-70.
63. 63. Gübudak H, Kurnaz N, Tezcan-Ülger S, Vural-Taşdemir E, Bozlu G, Türkegün M. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirus ve enterik adenovirus sıklığının araştırılması. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi 2019; 77(2):185-94.
64. 64. Bayraktar B, Toksoy B, Bulut E. Akut gastroenteritli çocuklarda rotavirus ve adenovirus saptanması. Klimik Dergisi 2010; 23(1):15-7.
65. 65. Balkan ÇE, Çelebi D, Çelebi Ö, Altoparlak Ü. Erzurum’da 0-5 yaş arası çocuklarda rotavirus ve adenovirus sıklığının araştırılması. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi 2012; 42(2):51-4.
66. 66. Gülen D, Aydın Kurç M, Uzun A, Kaya AD. Presence of rotavirus and adenovirus antigens in children with gastroenteritis who attended the tekirdağ state hospital. Çocuk Enfeksiyon Dergisi 2013; 7:131-5.
67. 67. Kirişci Ö, Muratdağı G. Bir devlet hastanesine akut gastroenterit ile başvuran hastalarda rotavirüs ve enterik adenovirüs enfeksiyonu sıklığı. Sakarya Tıp Dergisi 2019; 9(4):585-91.
68. 68. Jasielska M, Kalita B, Kałużny-Czyż M, Grzybowska-Chlebowczyk U. Rotavirus and adenovirus infections and co-infections as a cause of acute gastroenteritis in hospitalized children–a single centre study. Pediatria Polska-Polish Journal of Paediatrics 2023; 98(1):12-15.
69. 69. Akdag AI, Gupta S, Khan N, Upadhayay A, Ray P. Epidemiology and clinical features of rotavirus, adenovirus, and astrovirus infections and coinfections in children with acute gastroenteritis prior to rotavirus vaccine introduction in Meerut, North India. Journal of Medical Virology 2020; 92(8):1102-9.
70. 70. Zaraket R, Salami A, Bahmad M, El Roz A, Khalaf B, Ghssein G, Bahmad HF. Prevalence, risk factors, and clinical characteristics of rotavirus and adenovirus among Lebanese hospitalized children with acute gastroenteritis. Heliyon 2020; 6(6):04248.
71. 71. Pratte‐Santos R, Miagostovich MP, Fumian TM, Maciel EL, Martins SA, Cassini ST, Keller R. High prevalence of enteric viruses associated with acute gastroenteritis in pediatric patients in a low‐income area in Vitória, Southeastern Brazil. Journal of Medical Virology 2019; 91(5):744-50.