Clinical and Laboratory Assessment of Serotype Distribution and Antimicrobial Resistance in Salmonella Isolates from the Aksaray Region: A One-Year Experience

Abstract

Aim: This study aimed to evaluate the serotype distribution, clinical characteristics, and antimicrobial susceptibility profiles of Salmonella isolates recovered from clinical specimens submitted to the Microbiology Laboratory of Aksaray Training and Research Hospital throughout 2025Material and Method: A total of six Salmonella isolates were analyzed. Serotyping was performed by the National Reference Laboratory. Antimicrobial susceptibility testing was interpreted according to EUCAST 2025 criteria. Demographic and clinical data were retrospectively reviewed Results: Four distinct serotypes were identified: S. Typhi (n=2), S. Enteritidis (n=2), S. Typhimurium (n=1), and S. Hadar (n=1). The two S. Typhi isolates were recovered from blood cultures of patients living in the same household and detected two months apart, suggesting potential household transmission. Both isolates exhibited resistance to ampicillin, ciprofloxacin, and ceftriaxone. Among non-typhoidal Salmonella (NTS) isolates, ampicillin resistance was 66%, while all isolates remained susceptible to trimethoprim–sulfamethoxazole. Ciprofloxacin resistance among NTS isolates was 50%. Clinically, NTS infections presented with mild-to-moderate gastrointestinal symptoms, whereas S. Typhi infections were associated with systemic involvement and prolonged hospitalization. Conclusion: This study indicates ongoing Salmonella serotype diversity in Aksaray region and highlights notable antimicrobial resistance, particularly the detection of two multidrug-resistant S. Typhi isolates from the same household. The increasing fluoroquinolone resistance in NTS isolates and the unusual ceftriaxone resistance in S. Typhi underscore the need for strengthened regional surveillance and updated empirical treatment strategies.

Keywords

• Antimicrobial resistance
• non-typhoidal Salmonella
• S. Typhi
• Salmonella
• serotype distribution

Ethical Statement

This study was reviewed and approved by the Health Sciences Scientific Research Ethics Committee of Aksaray University (Decision No: 2026/06; Protocol No: SAGETİK 2026-001; Meeting Date: January 8, 2026). The committee unanimously concluded that there was no ethical or scientific objection to conducting the study at the Aksaray Training and Research Hospital, Medical Microbiology Laboratory. All procedures were carried out in accordance with relevant regulations, and the necessary institutional permissions were obtained.

Aksaray Bölgesinden Elde Edilen Salmonella İzolatlarında Serotip Dağılımı ve Antimikrobiyal Direncin Klinik ve Laboratuvar Değerlendirmesi: Bir Yıllık Deneyim

Abstract

Amaç: Bu çalışmada, 2025 yılı boyunca Aksaray Eğitim ve Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen klinik örneklerden izole edilen Salmonella izolatlarının serotip dağılımı, klinik özellikleri ve antimikrobiyal duyarlılık profillerinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Toplam altı Salmonella izolatı incelenmiştir. Serotiplendirme Türkiye Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü Mikrobiyoloji Referans Laboratuvarı tarafından yapılmıştır. Antimikrobiyal duyarlılık testleri EUCAST 2025 kriterlerine göre yorumlanmıştır. Hastaların demografik ve klinik verileri geriye dönük olarak değerlendirilmiştir. Bulgular: Çalışmada dört farklı serotip saptanmıştır: S. Typhi (n=2), S. Enteritidis (n=2), S. Typhimurium (n=1) ve S. Hadar (n=1). İki S. Typhi izolatı, aynı hanede yaşayan iki hastadan ve iki ay arayla alınan kan kültürlerinden elde edilmiştir. Her iki S. Typhi izolatı da ampisilin, siprofloksasin ve seftriaksona direnç göstermiştir. Non-tifoidal Salmonella (NTS) izolatları arasında ampisilin direnci %66 olup tüm izolatlar trimetoprim–sülfametoksazole duyarlı bulunmuştur. NTS izolatlarında siprofloksasin direnci %50 olarak saptanmıştır. Klinik olarak NTS olguları hafif–orta şiddette gastrointestinal yakınmalarla seyretmiş, S. Typhi olguları ise sistemik bulgular ve uzamış yatış süreleri ile karakterize olduğu belirlenmiştir. Sonuç: Aksaray bölgesinde Salmonella serotip çeşitliliğinin sürdüğü ve antimikrobiyal direncin dikkat çekici düzeyde olduğu görülmüştür. Aynı hanede iki ay arayla tespit edilen iki çoklu dirençli S. Typhi izolatı, bölgesel sürveyansın güçlendirilmesi gerekliliğini göstermektedir. Artan fluorokinolon direnci ve olağandışı seftriakson direnci, bölgesel ampirik tedavi yaklaşımlarının güncellenmesi ihtiyacını vurgulamaktadır.

Keywords

• Antimikrobiyal direnç
• non-tifoidal Salmonella
• S. Typhi
• Salmonella
• serotip dağılımı

Ethical Statement

Bu çalışma, Aksaray Üniversitesi Sağlık Bilimleri Bilimsel Araştırmalar Etik Kurulu tarafından incelenmiş ve uygun bulunmuştur (Karar No: 2026/06, Protokol No: SAGETİK 2026-001, Toplantı Tarihi: 08.01.2026). Çalışmanın, Aksaray Eğitim ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’nda yürütülmesinde etik ve bilimsel açıdan sakınca olmadığına oy birliği ile karar verilmiştir. Çalışma süresince ilgili mevzuat hükümlerine uyulmuş olup gerekli kurumsal izinler alınmıştır.

References

1. 1. Liu G, Zhang X, Cao Q, et al. The global burden of typhoid and paratyphoid fever from 1990 to 2021 and the impact on prevention and control. BMC Infect Dis. 2025; 25:919.
2. 2. Wu Y, Zeng Z. Antibiotic residues, antimicrobial resistance and intervention strategies of foodborne pathogens. Antibiotics (Basel). 2024;13(4):321.
3. 3. Food and Agriculture Organization of the United Nations, World Health Organization. Measures for the control of Salmonella spp. in poultry meat: meeting report. Geneva: WHO; 2023. Available from: https://openknowledge.fao.org/server/api/core/bitstreams/ae90def6-b1c6-43c4-a0b3-9b0fb228123c/content
4. 4. Di Ciccio PA. Antimicrobial-resistance of food-borne pathogens. Antibiotics (Basel). 2021;10(4):372.
5. 5. Kumar S, Kumar Y, Kumar G, et al. Non-typhoidal Salmonella infections across India: emergence of a neglected group of enteric pathogens. J Taibah Univ Med Sci. 2022;17(5):747–754.
6. 6. Hancuh M, Walldorf J, Minta AA, et al. Typhoid fever surveillance, incidence estimates, and progress toward typhoid conjugate vaccine introduction—worldwide, 2018–2022. MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2023;72(7):171–176.
7. 7. Boakye Okyere P, Twumasi-Ankrah S, Newton S, et al. Risk factors for typhoid fever: systematic review. JMIR Public Health Surveill. 2025;11:e67544.
8. 8. Chowdhury G, Bhattacharya S, Goel G, et al. Phenotypic and potential virulence features of Salmonella enterica serotypes from cancer patients in Kolkata, India. BMC Infect Dis. 2025;25(1):1263.

9. 9. Hong W, Yang Z, Wu G, et al. Integrating serotyping, MLST, and phenotypic data: decoding the evolutionary drivers of Salmonella pathogenicity and drug resistance. Appl Environ Microbiol. 2025;91(10):e01511-25.
10. 10. Unalan-Altintop T, Demirci-Duarte S, Koseoglu-Eser O, et al. Salmonella serovars in a tertiary hospital in Turkey, 2015–2017: molecular epidemiology and antimicrobial resistance. Afr Health Sci. 2025;25(2):70–78.
11. 11. Dalyan Cilo B, Özmerdiven GE, Efe K, et al. Serotype distribution and antimicrobial susceptibility profiles of Salmonella isolates from South Marmara Region, Turkey. Turk Mikrobiyol Cem Derg. 2015;45(3):122–127.
12. 12. T.C. Sağlık Bakanlığı Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü. Etken Dağılımı ve Direnç: 2024 Yılı Ulusal Raporu. Ankara: HSGM; 2024. Available from: https://hsgm.saglik.gov.tr/depo/birimler/bulasici-hastaliklar-ve-erken-uyari-db/Dokumanlar/Raporlar/ETKEN_DAGILIM_VE_DIRENC_2024.pdf
13. 13. Polat İ, Güngör İ, Şen B. Prevalence of Salmonella enterica serotypes isolated from broiler liver and their antibiotic resistance profiles. J Food Prot. 2025;7:100535.
14. 14. Çınar C, Tanrıverdi Çaycı Y, Bıyık İ, et al. 2014–2024 yılları arasında izole edilen Salmonella türlerinin antibiyotik direnç profilleri. Sağlık Bilimlerinde Değer. 2025;15(2):168–171.
15. 15. Nusrat N, Islam MR, Paul N, et al. Clinical and laboratory features of enteric fever in children and antibiotic sensitivity pattern in a tertiary care hospital of a low- and middle-income country. Cureus. 2022;14(10):e30784.
16. 16. Çetin FT, Çay Ü, Bakanoğlu E, et al. Salmonella bacteremia and antibiotic resistance profile in pediatric patients at a tertiary care hospital. J Pediatr Inf. 2025;19(4):e228-e232.
17. 17. Beşli Y, Keske Ş, Dikenelli BE, et al. Alarming increase in fluoroquinolone resistance among non-typhoidal Salmonella isolates. Clin Microbiol Infect. 2024;30(7):961–963.
18. 18. Konyali D, Guzel M, Soyer Y. Genomic characterization of Salmonella enterica resistant to cephalosporin, quinolones, and macrolides. Curr Microbiol. 2023; 80:344.