Zucchini yellow mosaic virüsüne tolerant yazlık kabak (Cucurbita pepo) hatlarında genetik farklılığın SRAP markır sistemleriyle belirlenmesi

Öz

Gen havuzunda bulunan yazlık kabak genotiplerinin moleküler karekterizasyonu ve bunlar arasındaki akrabalık derecelerinin tespit edilmesi ıslah programları açısından önemlidir. Bu çalışmanın amacı F1 hibrit kabak ıslah programlarında kullanılmak üzere Alata Bahçe Kültürleri Araştırma Enstitüsü (ABKAE) gen havuzunda bulunan Zucchini Yellow Mosaic Virusü (ZYMV)’ne tolerant hatların moleküler olarak uzaklık derecelerinin ortaya çıkarılmasıdır. Çalışmada ZYMV’ye tolerant 38 hatta 11 SRAP markır çifti ile moleküler karakterizasyon yapılmıştır. Benzerlik İndeksinden yararlanılarak UPGMA metodu ile kümeleme (Cluster) analizleri yapılmış ve dendrogram elde edilmiştir. Dendrogram incelendiğinde hatların birbirinden ayrıldığı, hatlar arasında çeşitliliğin olduğu görülmüştür. 38 adet hattın genetik benzerlik düzeyi 0.63 ile 0.95 arasında değişmiştir. 0.74 benzerlik düzeyinde 5 ana grup tespit edilmiştir. Oluşan 5 ana farklı heterotik grubu temsilen seçilen hatlar ileride ZYMV’ye tolerant yazlık kabak ıslahında kullanılabilecektir.

Anahtar Kelimeler

• Yazlık kabak,ZYMV,moleküler karakterizasyon,SRAP

References

1. Doyle, J.J., Doyle, J.L., 1990. A Rapid Isolation Procedure for Small Quantities of Fresh Leaf Tissue. Phytochemical Bulletin, 19: 11-15.
2. Ertunç, F., 1992. Ankara İlinde Kabaklarda Enfeksiyon Oluşturan Viral Etmenlerin Teşhisi Üzerine Araştırmalar. A. Ü. Ziraat Fak.Yay., No: 1252.
3. FAO, 2014. http://www.fao.org/faostat/en/#data/QC. Erişim Tarihi: 19.12.2016.
4. Ferriol, M., Pico, B., Nuez, F., 2004. Morphological and Molecular Characterization of Cucurbita maxima Landraces. J. Amer. Soc. Hort. Sci., 129 (1): 60-69.
5. İnan, N., 2008. Çekirdek Kabaklarında Morfolojik ve Moleküler Karakterizasyon. Çukurova Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı Yüksek Lisans Tezi, Adana, 60 s.
6. Jaccard, P., 1908. Nouvelles Researches sur la Distribution Florale, Bull. Soc. Vaud. Sci. Nat., 44: 223-270.
7. Mantel, N., 1967. The Detection of Disease Clustering and Generalized Regression Approach. Cancer Res., 27: 209-220.
8. Nacar, Ç., Pınar, H., Ünlü, M., Aras, V., Denli, N., Keleş, D., 2011. Bazı Yazlık Kabak (Cucurbita pepo) Hatlarında Genetik Farklılığın SRAP (Sequence-Related Amplified Polymorphism) Marker Sistemleriyle Belirlenmesi. 6. Bahçe Bitkileri Kongresi, 1: 383-387.

9. Nacar, C., Fidan, H., Ekbiç, E., Aras, V., Denli, N., Keles, D., 2012. Development of Suitable Sourcess of Resistance to ZYMV in Cucurbita pepo. Proceedings of the Xth EUCARPIA Meeting on Genetics and Breeding of Cucurbitaceae, 633-638.
10. Nacar, Ç., Sarı, N., Mutlu, N., 2012. Determination of Heterotic Groups in Summer Squash (Cucurbita pepo L.) Using Morhphological and Molecular Methods. Proceeding of the Xth EUCARPIA Meeting on Genetics and Breedinng of Cucurbitaceae , 723-732.
11. Özalp, M. O., 1964. İzmir İli Civarında görülen önemli Sebze Virüsleri Üzerinde İncelemeler. Bitki Koruma Bülteni, 4 (1): 18-25.
12. Purcifull, D. E., Aldrez, W. C., Simone, G. W., Hiebbert, E., Christie, S. R., 1984. Serological Relationships and Partial Characterization of Zucchini Yellow Mosaic Virus Isolated from Squash in Florida. Plant Diseases, 68: 230-233.
13. Sarı, N., Abak, K., Yılmaz, M.A., Harbelioğlu, A., 1996. Effects of Cross Protection by ZYMV-WK and Agryl on occurrence of ZYMV, Fruit Yield and Quality. 1st Egyptian Hungarian Horticultural Conference, II: 106-111.
14. TÜİK, 2015. Bitkisel Üretim İstatistikleri. https://biruni tuik.gov.tr/bitkiselapp/bitkisel.zul (07.10.2016)
15. Uçar, F., Ertunç, F., 1998. Antalya İli Kabak Seralarında Görülen Zucchini Sarı Mozayik Virüsünün Enfeksiyon Kaynaklarının Belirlenmesi Üzerine Araştırmalar. Türkiye VII. Fitopatoloji Kongresi Bildirileri, 228-233.
16. Vargün, Z., Ertunç, F., 1994. Research on Interaction of Cucumber Mosaic and Zucchini Yellow Mosaic Virüs on Squash. 9th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union, 387-391.
17. Yılmaz, M.A., Davis, R.F., 1985. Identification of Viruses Infecting Vegetable Crops Along the Mediterranean Sea Coast in Turkey. J. Turkish Pytopathology, 14.