Farklı yamula patlıcanı genotiplerinin genetik benzerliklerinin ISSR moleküler markır yardımıyla belirlenmesi

Year 2017, Cilt: 6 Özel Sayı, 157 - 162, 01.06.2017

Hasan Pınar Ömer Faruk Coşkun , Emrah Uysal Osman Gülşen Halit Yetişir

Abstract

Yamula patlıcanı kendine özgü çizgili yapısı, sert meyve eti gibi özellikleri ile ön plana çıkmakta olup, özellikle yetiştirildiği bölgedeki insanlar tarafından kurutmalık, taze tüketim ve salamura olarak farklı şekillerde tüketilmektedir. Pazarlanabilir ürün için üniform meyve, hastalık ve zararlılara dayanımlı ve aynı zamanda verimli genotipler en önemli unsurdur. Fakat Yamula patlıcanında üreticiler kendi elde ettikleri standart tohumlarla üretim yaptıklarından dolayı genetik farklılık kaçınılmaz olmuştur. Bu amaçla Kayseri yöresinden seçilen farklı meyve tiplerine sahip 10 adet Yamula patlıcanı genotipi ile 1 adet Manisa patlıcanı ve 1 adet Anamur tipi hibrit patlıcan çeşidinin genetik benzerlik/farklılıkları ISSR markırları ile belirlenmiştir. 12 patlıcan genotipinde 15 ISSR primeri ile yürütülen çalışma ile 8 primerde polimofizm elde edilmiştir. Primer başına ortalama 8.47 bant elde edilirken toplam bant sayısı 127 ve polimorfizm oranı %21.3 olarak belirlenmiştir. Skorlanan bantlardan elde edilen UPGMA dendrogramına göre tüm genotipler arasındaki genetik benzerlik %94 olarak tespit edilmiştir. Çalışamadan elde edilen bulgular farklı meyve tiplerine göre seçilen 10 adet Yamula patlıcanı genotipleri arasında genetik farklılığın olduğunu göstermiştir.

Keywords

Yamula patlıcanı, ISSR, moleküler karakterizasyon

References

• Ali, Z., Xu, Z.L., Zhang, D.Y., He, X.L., Bahadur, S., Yi, J.X. 2011. Molecular Diversity Analysis of Eggplant (Solanum melongena) Genetic Resources, Genetics and Molecular Research, 10 (2):1141-1155.
• Behera, T., Sharma, P., Singh, B., Kumar, G., Kumar, R., Mohapatra, T., Singh, N. 2006. Assessment of genetic diversity and species relationships in eggplant (Solanum melongena L.) using STMS markers. Scientia Horticulturae, 107:352–357.
• Boyacı, H.F. 2007. Patlıcanlarda Fusarium solgunluğuna dayanıklılık kaynakları ve dayanıklılığın kalıtımı. Doktora Tezi. Çukurova Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Bitki Koruma Anabilim Dalı, Adana.
• Daunay, M.C., Janick, J. 2007. History and Iconography of Eggplant. Chronica Horticulturae 47(3):16-22.
• Demir, K., Bakır, M., Sarıkamış, G., Acunalp, S. 2010. Genetic Diversity of Eggplant (Solanum melongena) Germplasm from Turkey Assessed by SSR and RAPD Markers, Genetics and Molecular Research, 9(3):1568-1576.
• Doyle, J.J., Doyle, J.L. 1990. Isolation of Plant DNA from fresh tissue. Focus. 12: 13-15.
• FAOSTAD Statistical Databases [http://www.fao.org/] 2014.
• Isshiki, S., Iwata, N., Khan, M.M.R. 2008. ISSR variations in eggplant (Solanum melongena L.) and related Solanum species. Scientia Horticulturae, 117:186–190.
• Li, H., Chen, H., Zhuang, T., Chen, J. 2010. Analysis of genetic variation in eggplant and related Solanum species
• using sequence-related amplified polymorphism markers, Scientia Horticulturae, 125 (1):19-24.
• Munoz-Falcón, J.E., Vilanova, S., Plazas, M., Prohens, J. 2011. Diversity, relationships, and genetic fingerprinting of the Listada de Gandía eggplant landrace usinggenomic SSRs and EST-SSRs. Scientia Horticulturae 129:238–246.
• Mutlu, N., Boyacı, F.H., Göçmen, M., Abak, K. 2008. Development of SRAP, SRAP-RGA, RAPD and SCAR markers linked with a Fusarium wilt resistance gene in eggplant. Theor Appl Genet. 117:1303-1312.
• Nunome, T., Suwabe, K., Iketani, H., Hirai, M. 2003. Identification and characterization of microsatellites in eggplant. Plant Breeding, 122:256-262.
• Prohens, J., Blanca, J.M., Nuez, F. 2005. Morphological and molecular variation in a collection of eggplants from a secondary center of diversity: implications forconservation and breeding. Journal of the American Society for Horticultural Science, 130:54-64.
• Singh, A., Singh, M., Singh, R., Kumar, S., Kaloo, G. 2006. Genetic diversity within the genus (Solanecea) as revealed by RAPD markers. Current science, 90:711-716.
• Stagel, A., Portis, E., Toppino, L., Rotino, G.L., Lanteri, S. 2008. Gene-based microsatellite devolopment for mapping and phylogeny studies in eggplant. BMC genomics, 357-370.
• Sunseri, F., Polignano, G.B., Alba, V., Lotti, C., Bisignano, V., Mennella, G., D’Alessandro, A., Bacchi, M., Riccardi, P., Fiore, M.C., Ricciardi, L. 2010. Genetic Diversity and Characterization of African Eggplant Germplasm Collection, African Journal of Plant Science, 4(7):231-241.
• Tan, A. 1992. Türkiye’ de bitkisel çeşitlilik ve bitki genetik kaynakları. Anadolu, J. of AARI. 2(2): 50-54.
• Tan, A., İnal, A. 2003. Ege Tarımsal Araştırma Enstitüsü bitki genetik kaynakları çalışmaları, Ege Tarımsal Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü Yayın No:112, 13s.
• Tiwari, S.K., Karihaloo, J.L., Nowsheen, H., Gaikwad, A.B. 2009. Molecular Characterization of Brinjal (Solanum melongena L.) Cultivars Using RAPD and ISSR Markers, Journal of Plant Biochemistry and Biotechnology, 18 (2):189-195.
• TUİK, 2014. Bitkisel Üretim İstatistikleri. http://www.tuik. gov.tr/.