Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Mantarların Tür Dağılımının ve Antifungal Direnç Profilinin Belirlenmesi

Year 2025, Volume: 14 Issue: 3, 581 - 589, 31.10.2025

Esra Taş , Meryem Yeşil Çolak

Abstract

Amaç: Bu çalışmanın amacı, üçüncü basamak bir sağlık merkezinin çeşitli bölümlerinden ve yoğun bakım ünitelerinden alınan klinik örneklerde mantarların yaygınlığını araştırmak, tür düzeyindeki izolatları belirlemek ve ampirik tedavi ve gözetim çabalarını desteklemek için antifungal direnç profillerini değerlendirmektir. Gereç ve Yöntem: Mantar tanımlama ve kan kültürlerinin antifungal direnç testi, BD BACTEC FX sistemi kullanılarak gerçekleştirildi. Kan dışı örnekler BD Phoenix™ M50 sistemi ile belirlendi ve direnç profilleri ATB Fungus 3 kiti kullanılarak saptandı. Bulgular: Mantar pozitifliği saptanan hastaların yaşları 10 ile 95 arasında değişmekte olup, ortalama yaş 72.4±15.2 olarak saptanmıştır. Hastaların %46’sını kadınlar, %54’ünü ise erkekler oluşturmaktadır (p>0.05). Olguların %81’i 65 yaş üzerindeydi ve ileri yaş ile mantar pozitifliği arasında istatistiksel olarak anlamlı bir ilişki saptandı (p<0.05). Candida albicans, en sık izole edilen tür olarak belirlenmiştir (%33). İzolatlarda saptanan antifungal direnç oranları; amfoterisin B için %14, flusitozin için %7, itrakonazol için %30, vorikonazol için %23 ve flukonazol için %18 olarak bulunmuştur. Sonuç: Yaşlı hastalarda mantar enfeksiyonlarının yüksek yaygınlığı, özellikle yoğun bakım ortamlarında hedefli gözetimin önemini vurgulamaktadır. Mantar epidemiyolojisi ve antifungal direncin düzenli kurumsal izlenmesi, uygun tedaviyi yönlendirmek ve sonuçları iyileştirmek için kritik öneme sahiptir.

Keywords

Klinik Örnekler , Mantar , Antifungal Direnç

Ethical Statement

Bu çalışma Karabük Üniversitesi Tıp Fakültesi Girişimsel Olmayan Klinik Araştırmalar Etik Kurulu tarafından 19/12/2022 tarihinde 2022/1170 numaralı kararı ile onaylanmıştır.

Supporting Institution

Bu çalışma Karabük Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinasyon Birimi (KBUBAP-23-YL-006) tarafından desteklenmiştir.

Project Number

Karabük Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü (KBÜBAP-23-YL-006).

Thanks

Yazar, bu çalışmaya katkıda bulunan herkese içten teşekkürlerini sunar.

Determination of Species Distribution and Antifungal Resistance Profile of Fungi Isolated from Various Clinical Samples

Abstract

Objective: This study aims to investigate the prevalence of fungi in clinical samples collected from various departments and intensive care units of a tertiary healthcare center. It further seeks to identify fungal isolates at the species level and evaluate antifungal resistance profiles to support empirical treatment and surveillance efforts. Materials and Methods: Fungal identification and antifungal susceptibility testing for blood cultures were performed using the BD BACTEC FX system. Non-blood samples were analyzed with the BD Phoenix™ M50 system, and resistance profiles were determined using the ATB Fungus 3 kit. Results: The age range of patients with fungal positivity was 10–95 years (mean: 72.4 ± 15.2). Females comprised 46% and males 54% (p > 0.05). A significant association was found between advanced age (≥65 years; 81% of cases) and fungal positivity (p < 0.05). Candida albicans was the most frequently isolated species (33%). Antifungal resistance rates were: amphotericin B 14%, flucytosine 7%, itraconazole 30%, voriconazole 23%, and fluconazole 18%. Conclusion: The high prevalence of fungal infections in elderly patients highlights the need for targeted surveillance, particularly in intensive care. Institutional monitoring of fungal epidemiology and antifungal resistance is crucial for guiding effective therapy and improving outcomes.

Keywords

Clinical Samples , Fungus , Antifungal Resistance

Ethical Statement

Institution: Karabuk University Ethics Committee Date: 19.12.2022 Approval no: 2022/1170

Supporting Institution

This study was supported by Karabuk University Scientific Research Projects Coordination (KBUBAP-23-YL-006).

Project Number

Karabük Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü (KBÜBAP-23-YL-006).

Thanks

The author would like to extend their sincere thanks to anyone who contributed to this study.

References

• Adıloğlu, A. K., Şirin, M. C., Cicioğlu-Arıdoğan, B., Can, R., & Demirci, M. (2004). Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Candida kökenlerinin identifikasyonu ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması. Adnan Menderes Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi, 5(3), 33–36.
• Alçi, G., Keçeli, S. A., & Sarıtaş, B. M. (2022). Distribution of Candida species isolated from different clinical specimens and their antifungal susceptibility profile: A 5-year retrospective analysis. Kocaeli Üniversitesi Sağlık Bilimleri Dergisi, 8(1), 92–98. https://doi.org/10.30934/kusbed.1037788
• Arendrup, M. C., Meletiadis, J., Mouton, J. W., Lagrou, K., Hamal, P., & Guinea, J., et al. (2020). Method for the determination of broth dilution minimum inhibitory concentrations of antifungal agents for yeasts. EUCAST E.DEF 7.3.2, 1–21.
• Aydoğan, S., Samadzade, R., Maçin, S., Türk Dağı, H., & Fındık, D. (2022). Pandemi döneminde kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıklarının değerlendirilmesi. Mantar Dergisi, 13(3), 105–110. https://doi.org/10.30708/mantar.1192975
• Bailly, S., Maubon, D., Fournier, P., Pelloux, H., Schwebel, C., Chapuis, C., Foroni, L., Cornet, M., & Timsit, J. F. (2016). Impact of antifungal prescription on relative distribution and susceptibility of Candida spp. – Trends over 10 years. Journal of Infection, 72(1), 103–111. https://doi.org/10.1016/j.jinf.2015.09.024
• Batçık, Ş., Bahçeci, İ., Kazancıoğlu, L., Kazdal, H., & Özcan, M. (2021). Candida species and antifungal susceptibility isolated in intensive care units: A three‑year study. Van Medical Journal (Van Med J), 28(3), 459–465. https://doi.org/10.5505/vtd.2021.69937
• Bayram, Y., Gültepe, B., Özlük, S., & Güdücüoğlu, H. (2012). Çeşitli klinik örneklerden izole edilen Candida kökenlerinin identifikasyonu ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması. Van Tıp Dergisi, 19(4), 177–181.
• Bedini, A., Venturelli, C., Mussini, C., Guaraldi, G., Codeluppi, M., Borghi, V., Rumpianesi, F., Barchiesi, F., & Esposito, R. (2006). Epidemiology of candidaemia and antifungal susceptibility patterns in an Italian tertiary-care hospital. Clinical Microbiology and Infection, 12(1), 75–80. https://doi.org/10.1111/j.1469-0691.2005.01314.x
• Bilal, H., Shafiq, M., Hou, B., Islam, R., Khan, M. N., Khan, R. U., & Zeng, Y. (2022). Distribution and antifungal susceptibility pattern of Candida species from mainland China: A systematic analysis. Virulence, 13(1), 1573–1589. https://doi.org/10.1080/21505594.2022.2123325
• Borg-von Zepelin, M., Kunz, L., Rüchel, R., Reichard, U., Weig, M., & Gross, U. (2007). Epidemiology and antifungal susceptibilities of Candida spp. to six antifungal agents: Results from a surveillance study on fungaemia in Germany from 2004 to August 2005. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 60(2), 424–428. https://doi.org/10.1093/jac/dkm208
• Borjian Boroujeni, Z., Shamsaei, S., Yarahmadi, Y., Getso, M. I., Khorashad, A. S., Haghighi, L., et al. (2021). Distribution of invasive fungal infections: Molecular epidemiology, etiology, clinical conditions, diagnosis and risk factors: A 3-year experience with 490 patients under intensive care. Microbial Pathogenesis, 152, 104616. https://doi.org/10.1016/j.micpath.2020.104616
• Brown, G. D., Denning, D. W., & Levitz, S. M. (2012). Tackling human fungal infections. Science, 336, 647. https://doi.org/10.1126/science.1222236 Černáková, L., Roudbary, M., Brás, S., Tafaj, S., & Rodrigues, C. F. (2021). Candida auris: A quick review on identification, current treatments, and challenges. International Journal of Molecular Sciences, 22(9), 4470. https://doi.org/10.3390/ijms22094470
• Çolak, M., & Aşgın, N. (2021). Retrospective assessment of fungal pathogens isolated from various clinical samples in a tertiary care hospital in Turkey: A cross-sectional study. Journal of Surgery and Medicine, 5(4), 362–366.
• Er, H., Özkalay Yılmaz, N., Karaca Derici, Y., Hancı, S., & Saba Çopur, Ş. (2021). Kandidemi etkenlerinin tür dağılımı ve duyarlılıkları: Hastanemizde ampirik antifungal tedavi politikası değiştirilmeli mi? Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 51, 75–82.
• Eren, E., Sav, H., & Beştepe Dursun, Z. (2022). The epidemiology and antifungal susceptibility of Candida species isolated from patients in intensive care units of a research hospital. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 79(1), 93–102.
• Etiz, P., Kibar, F., Ekenoğlu, Y., & Yaman, A. (2015). Kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımının ve antifungal duyarlılıklarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. ANKEM Dergisi, 29(3), 105–113.
• Güldemir, D., Karagöz, A., Dal, T., Tekin, A., Özekinci, T., & Durmaz, R. (2015). Hastane kaynaklı enterokok izolatlarının pulsed-field jel elektroforezis yöntemiyle moleküler tiplendirilmesi. Türk Hijyen ve Deneysel Biyoloji Dergisi, 72(1), 1–10.
• Gülmez, D., & Alp, Ş. (2021). Mantar enfeksiyonlarının laboratuvar tanısında klasik yöntemler ve yeni gelişmeler. FLORA, 26(1), 34–49.
• Gülmez, D., Sığ, A. K., Akar, N., Duyan, S., & Arıkan Akdağlı, S. (2021). Enfeksiyon etkeni mantarların zamana göre sıklık ve tür dağılımlarındaki değişimler: 12 yıllık (2008–2019) mikoloji laboratuvarı verileri ne söylüyor? Mikrobiyoloji Bülteni, 55(1), 53–66.
• Gündüz, A., & Mansur, A. (2025). Kan kültürlerinden izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları: 8 yıllık retrospektif inceleme. Nobel Medicus, 21(1), 40–48. https://doi.org/10.5505/nobelmedicus.2025.34356
• Güngör, K. (2019). Bir yıl boyunca gelişen kandidemi vakalarının retrospektif incelenmesi (Uzmanlık tezi). Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesi, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Edirne.
• Hancı Yılmaz, S., Derici Karaca, Y., Şirin, M. C., Şamlıoğlu, P., Bayram, A., Ağuş, N., & Yılmaz, N. (2015). Üçüncü basamak bir hastanede, geriatrik olgularda izole edilen candida türlerinin tiplendirilmesi ve kanda üreyen mayalarda antifungal duyarlılık. Dicle Tıp Dergisi, 42(4), 438–444.
• İzci Yıldız, H., Berktaş, M., Yaman, G., Güdücüoğlu, H., & Çıkman, A. (2016). Yoğun Bakım Ünitesi’nden gelen hasta örneklerinden izole edilen Candida türleri ve antifungal duyarlılıkları. Van Tıp Dergisi, 23(2), 143–147.
• Karvar, Ş., & Delialioğlu, N. (2023). Kan kültüründen izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılığının araştırılması. FLORA, 28(3), 331–340.
• Kılınçel, Ö., Akar, N., Karamurat, Z. D., Yılmaz, A., Demir, S., & Kaya, M. (2018). Kan kültürlerinde izole edilen Candida türlerinin dağılımı ve antifungal duyarlılıkları. Türk Mikrobiyoloji Cemiyeti Dergisi, 48, 256–263.
• Kohler, J. R., Casadevall, A., & Perfect, J. (2014). The spectrum of fungi that infects humans. Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine, 5, a019273. https://doi.org/10.1101/cshperspect.a019273
• Kooshki, P., Rezaei-Matehkolaei, A., & Mahmoudabadi, A. Z. (2018). The patterns of colonization and antifungal susceptibility of Candida, isolated from preterm neonates in Khorramabad, South West of Iran. Journal de Mycologie Médicale, 28(2), 340–344. https://doi.org/10.1016/j.mycmed.2018.01.003
• Kumar, S., Kumar, A., Roudbary, M., Mohammadi, R., Černáková, L., & Rodrigues, C. F. (2022). Overview on the Infections Related to Rare Candida Species. Pathogens, 11(9), 963. https://doi.org/10.3390/pathogens11090963
• Lee, H., & Lee, D. G. (2018). Novel approaches for efficient antifungal drug action. Journal of Microbiology and Biotechnology, 28(11), 1771–1781. https://doi.org/10.4014/jmb.1808.08035
• Logan, C., Martin-Loeches, I., & Bicanic, T. (2020). Invasive candidiasis in critical care: Challenges and future directions. Intensive Care Medicine, 46, 2001–2014. https://doi.org/10.1007/s00134-020-06046-8
• Márquez, F., Iturrieta, I., Calvo, M., Urrutia, M., & Godoy-Martínez, P. (2017). Epidemiology and antifungal susceptibility of species producing candidemia in Valdivia, Chile. Revista Chilena de Infectología, 34(5), 441–446. https://doi.org/10.4067/S0716-10182017000500441
• Murray, P. R., Rosenthal, K. S., & Pfaller, M. A. (2021). Medical microbiology (9th ed., pp. 650–661). Philadelphia: Elsevier Saunders.
• Nett, J. E., & Andes, D. R. (2016). Antifungal agents: Spectrum of activity, pharmacology, and clinical indications. Infectious Disease Clinics of North America, 30(1), 51–83. https://doi.org/10.1016/j.idc.2015.10.001
• Özcan, N., Ezin, Ö., Akpolat, N., Bozdağ, H., & Mete, M., Gül, K. (2016). Klinik örneklerde saptanan Candida türlerinin MALDI-TOF MS ile tiplendirilmesi. Dicle Tıp Dergisi, 43(3), 390–394.
• Sarıgüzel, F. M., Koç, A. N., & Karagöz, S. (2015). Kan kültürlerinden izole edilen maya türlerinin Vitek 2 sistemi ile tanımlanması ve antifungal duyarlılıkları. Harran Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi, 12, 261–268.
• Savcı, Ü., & Yılmaz, N. (2018). Çeşitli örneklerden izole edilen Candidaların tür dağılımı ve antifungal direnç oranları. Turkish Journal of Clinical Laboratory, 8, 85–90.
• Sütçü, M., Acar, M., Erköse Genç, G., Kökçü, İ., Aktürk, H., Atay, G., Hançerli Törun, S., Salman, N., Erturan, Z., & Somer, A. (2017). Evaluation of Candida species and antifungal susceptibilities among children with invasive candidiasis. Turkish Archives of Pediatrics, 52(3), 145–153. https://doi.org/10.5152/TurkPediatriArs.2017.5139
• Taei, M., Chadeganipour, M., & Mohammadi, R. (2019). An alarming rise of non-albicans Candida species and uncommon yeasts in the clinical samples: A combination of various molecular techniques for identification of etiologic agents. BMC Research Notes, 12(1), 779. https://doi.org/10.1186/s13104-019-4815-z
• Temiz, H., Temiz, S., & Kaya, Ş. (2015). Çeşitli Klinik Örneklerden İzole Edilen Kandida Türlerinin Dağılımı ve Antifungal Duyarlılıkları. Okmeydanı Tıp Dergisi, 31(1), 13–17.
• Tosun, M. İ., & Kirişci, Ö. (2024). Kan kültürlerinde tespit edilen Candida izolatlarının dağılımı ve antifungal duyarlılıklarının ticari bir sıvı mikrodilüsyon testi ile belirlenmesi. ANKEM Dergisi, 38(2), 53–61.
• Wang, M., Zhang, C., Li, Z., Ji, B., Man, S., Yi, M., Li, R., Hao, M., & Wang, S. (2024). Epidemiology and antifungal susceptibility of fungal infections from 2018 to 2021 in Shandong, eastern China: A report from the SPARSS program. Indian Journal of Medical Microbiology, 47, 100518. https://doi.org/10.1016/j.ijmmb.2023.100518