New records of lichenized and non-lichenized fungi from Lifos Mountain (Hacılar, Kayseri, Türkiye): An integrative taxonomic approach using morphological and ITS sequence data

Abstract

Purpose: Lifos Mountain is one of the significant but relatively understudied regions with volcanic geology, elevational range and diverse microhabitats in the northwestern slopes of Mount Erciyes, Central Anatolia (Türkiye) in terms of fungal and lichen diversity. The aim of this study was to explore the diversity of fungi found on Lifos Mountain by an integrative taxonomic approach that integrates morphological, anatomical, ecological, chemical and molecular data. Another objective of the study was to record new taxa not previously found and to add to the knowledge of Turkish fungal and lichen biodiversity. Method: Fungi and lichens collected from various habitats on Lifos Mountain were studied by detailed macro and micro-morphological characteristics. Stereomicroscopic and light microscopic observations were conducted for anatomical purposes and in case of need, standard lichen spot tests were performed. Dried specimens were used for genomic DNA extraction, amplification and sequencing of the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region. Sequences were obtained and compared with the reference sequences found in the GenBank using BLAST, aligned using ClustalW and further analysed using Maximum Likelihood Phylogenetic analyses in MEGA 7. All of the morphological, ecological, chemical and molecular data were checked together for reliable species identification. Findings: The fungi identified were Camarosporidiella astragalicola Jaklitsch & Voglmayr, Exidia inflata Cazenave & G. Gruhn and Rhizoplaca porteri S.D. Leav., Fern.-Mend., Lumbsch, Sohrabi & St. Clair. Maximum Likelihood phylogenetic analyses showed that all specimens examined clustered within their respective species-level clades and morphological species assignments were correct. Turkish specimens grouped with their respective taxa and were significantly different from morphologically related species. Camarosporidiella astragalicola was found growing on the endemic plant Astragalus argaeus, and Exidia inflata was found on the bark of deciduous trees. Exposure high elevation, with volcanic siliceous rocks was the habitat in which Rhizoplaca porteri were found, consistent with their known ecological preferences. The results are the first records of all four taxa for Türkiye, supported by both morphological and molecular data. Conclusion: The current study is the first attempt to assess the fungal and lichen diversity of Lifos Mountain in an integrated manner, both with traditional taxonomic approach and DNA barcoding methods. The obtained results show the utility of using both morphological and molecular data for proper species delimitation and identification. In addition, three new national records were established, indicating the significance of Lifos Mountain as an important hotspot of new fungal and lichen diversity in Central Anatolia. The results significantly increase the distribution range of the recorded taxa and add to the global mycobiota valuable taxonomic, phylogenetic, ecological and biogeographical information.

Keywords

• ITS rDNA
• DNA barcoding
• fungal diversity
• lichenized fungi
• new records
• Lifos Mountain

Supporting Institution

This study was supported by Erciyes University Scientific Research Projects Unit with the project code FYL-2025-14953.

Ethical Statement

This study does not require ethical approval

Lifos Dağı’ndan (Hacılar, Kayseri, Türkiye) likenleşmiş ve likenleşmemiş mantarlar için yeni kayıtlar: Morfolojik ve ITS dizi verilerine dayalı bütüncül bir taksonomik yaklaşım

Abstract

Amaç: Orta Anadolu’da (Türkiye), Erciyes Dağı’nın kuzeybatı yamaçlarında yer alan Lifos Dağı, volkanik jeolojisi, yükselti gradyanları ve heterojen mikrohabitatları nedeniyle fungal ve liken çeşitliliği açısından önemli ancak yeterince araştırılmamış bir alanı temsil etmektedir. Bu çalışmanın amacı, morfolojik, anatomik, ekolojik, kimyasal ve moleküler verileri birleştiren bütüncül bir taksonomik yaklaşım kullanarak Lifos Dağı’nın fungal çeşitliliğini araştırmaktır. Ayrıca çalışma, daha önce kaydedilmemiş taksonları ortaya koymayı ve Türkiye fungal ile liken biyolojik çeşitliliğinin anlaşılmasına katkı sağlamayı hedeflemiştir. Yöntem: Fungal ve liken örnekleri Lifos Dağı’ndaki farklı habitatlardan toplanmış ve ayrıntılı makro- ve mikromorfolojik özellikleri bakımından incelenmiştir. Anatomik gözlemler stereomikroskop ve ışık mikroskobu teknikleri kullanılarak gerçekleştirilmiş, gerekli durumlarda standart liken spot testleri uygulanmıştır. Genomik DNA kurutulmuş örneklerden ekstrakte edilmiş ve nükleer ribozomal internal transcribed spacer (ITS) bölgesi çoğaltılarak dizilenmiştir. Elde edilen diziler, GenBank veri tabanındaki referans verilerle BLAST kullanılarak karşılaştırılmış, ClustalW ile hizalanmış ve MEGA 7 programında gerçekleştirilen Maksimum Olabilirlik (Maximum Likelihood) filogenetik analizlerine tabi tutulmuştur. Güvenilir tür teşhisi sağlamak amacıyla morfolojik, ekolojik, kimyasal ve moleküler veri setleri birlikte değerlendirilmiştir. Bulgular: Üç fungal tür tanımlanmıştır: Camarosporidiella astragalicola Jaklitsch & Voglmayr, Exidia inflata Cazenave & G. Gruhn ve Rhizoplaca porteri S.D. Leav., Fern.-Mend., Lumbsch, Sohrabi & St. Clair. Maksimum Olabilirlik filogenetik analizleri, incelenen tüm örneklerin ilgili tür düzeyindeki kladlar içerisinde konumlandığını ortaya koymuş ve morfolojik teşhislerin doğruluğunu doğrulamıştır. Türkiye’den elde edilen örnekler, ilgili taksonların doğrulanmış referans dizileriyle birlikte kümelenmiş ve morfolojik olarak benzer türlerden açık şekilde ayrılmıştır. Camarosporidiella astragalicola, endemik bir bitki olan Astragalus argaeus üzerinde; Exidia inflata ise yapraklı ağaçların kabuklarında tespit edilmiştir. Rhizoplaca porteri örnekleri, bilinen ekolojik tercihleriyle uyumlu olarak yüksek rakımlardaki açıkta bulunan volkanik silisli kayalar üzerinde bulunmuştur. Tüm dört takson, birleşik morfolojik ve moleküler kanıtlara dayanılarak Türkiye’den ilk kez rapor edilmektedir. Sonuç: Bu çalışma, Lifos Dağı’nın fungal ve liken çeşitliliğinin hem geleneksel taksonomik yöntemler hem de DNA barkodlama yaklaşımları kullanılarak gerçekleştirilen ilk bütüncül değerlendirmesini temsil etmektedir. Elde edilen sonuçlar, doğru tür sınırlandırması ve teşhisi için morfolojik ve moleküler verilerin birlikte kullanılmasının etkinliğini göstermektedir. Ayrıca, Türkiye için yeni dört kaydın ortaya konulması, Lifos Dağı’nın Orta Anadolu’daki daha önce belgelenmemiş fungal ve liken çeşitliliği açısından önemli bir sıcak nokta olduğunu ortaya koymaktadır. Bu bulgular, kayıt altına alınan taksonların bilinen yayılış alanlarını önemli ölçüde genişletmekte ve küresel mikobiyotayadeğerli taksonomik, filogenetik, ekolojik ve biyocoğrafik veriler sağlamaktadır.

Keywords

• ITS rDNA
• DNA barkodlama
• fungal çeşitlilik
• likenleşmiş mantarlar
• yeni kayıtlar
• Lifos Dağı

Supporting Institution

Bu çalışma, FYL-2025-14953 proje kodu ile Erciyes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından desteklenmiştir.

Ethical Statement

Bu çalışma için etik kurul onayı gerekli değildir.

References

1. [1] Nash, T. H. (Ed.). (2008). Lichen biology (2nd ed.). Cambridge: Cambridge University Press.
2. [2] Orange, A., James, P. W., & White, F. J. (2010). Microchemical methods for the identification of lichens (2nd ed.). London: British Lichen Society.
3. [3] Lumbsch, H. T., & Leavitt, S. D. (2011). Goodbye morphology? A paradigm shift in the delimitation of species in lichenized fungi. Fungal Diversity, 50(1), 59–72. https://doi.org/10.1007/s13225-011-0123-z
4. [4] Vondrák, J., Halıcı, M. G., Güllü, M., & Demirel, R. (2016). Taxonomy of the genus Athallia and its diversity in Turkey. Turkish Journal of Botany, 40(3), 319–328.
5. [5] Halıcı, M. G., Candan, M., & Türk, A. (2007). New records of lichenicolous and lichenized fungi from Turkey. Mycotaxon, 100..255-260.
6. [6] Schoch, C. L., Seifert, K. A., Huhndorf, S., Robert, V., Spouge, J. L., Levesque, C. A., Chen, W., & Fungal Barcoding Consortium. (2012). Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for fungi. Proceedings of the National Academy of Sciences, 109(16), 6241–6246. https://doi.org/10.1073/pnas.1117018109
7. [7] Leavitt, S. D., Fernández-Mendoza, F., Pérez-Ortega, S., Sohrabi, M., Divakar, P. K., Lumbsch, H. T., & St. Clair, L. L. (2013). DNA barcode sequencing helps to distinguish morphologically similar species in the lichen-forming fungal genus Rhizoplaca. MycoKeys, 7, 1–24. https://doi.org/10.3897/mycokeys.7.4849
8. [8] Ihlen, P. G. (2004). Taxonomy of the Rhizocarpon geographicum group in Europe. Mycological Research, 108(6), 664–678. https://doi.org/10.1017/S0953756204009989

9. [9] Milliyet. (2026). Karlar eridi, 2 bin 509 metredeki sır ortaya çıktı. Milliyet Haber. Retrieved June 12, 2026, from https://www.milliyet.com.tr/galeri/karlar-eridi-2-bin-509-metredeki-sir-ortaya-cikti-kisa-zamanda-yapilmadigi-anlasiliyor-7597453/3
10. [10] Halıcı, M. G., John, V., & Aksoy, A. (2005). Lichens of Erciyes Mountain (Kayseri, Turkey). Flora Mediterranea, 15, 567–580.
11. [11] Halıcı, M. G., & Aksoy, A. (2009). Lichenised and lichenicolous fungi of Aladağlar National Park (Niğde, Kayseri and Adana provinces) in Turkey. Turkish Journal of Botany, 33(3), 169–189.
12. [12] Barak, M. Ü., Halıcı, M. G., & Güllü, M. (2016). Identification of some lichenized fungi species of Erciyes Mountain (Kayseri, Turkey) by using ITS (rDNA) marker. Biological Diversity and Conservation, 9(2), 84–95. [13] Yazıcı, K., Aslan, A., & Aptroot, A. (2005). New lichen records from Turkey. Mycotaxon, 92, 341–344.
13. [14] Karagöz, Y., Aslan, A., Yazıcı, K., & Aptroot, A. (2011). Diplotomma, Lecanora, and Xanthoria lichen species new to Turkey. Mycotaxon, 115, 115–119. https://doi.org/10.5248/115.115
14. [15] Kocakaya, M., Barak, M. Ü., & Kocakaya, Z. (2023). New records of lichenicolous and lichenized fungi from Üzümdere Nature Park, Türkiye. Mycotaxon, 137(4), 943–951. https://doi.org/10.5248/137.943
15. [16] Akata, I., Halıcı, M. G., & Uzun, Y. (2011). Additional macrofungi records from Trabzon province for the mycobiota of Turkey. Turkish Journal of Botany, 35(3), 309–314. https://doi.org/10.3906/bot-1008-45
16. [17] Akçay, M. E., Acar, İ., & Uzun, Y. (2023). Three new records of Helotiales for the mycobiota of Türkiye. Anatolian Journal of Botany, 7(2), 117–121. https://doi.org/10.30616/ajb.1289077
17. [18] Güllü, M., & Halıcı, M. G. (2025). Contribution to the mycobiota of Türkiye: New macrofungal records from Koramaz Valley revealed by molecular methods. Biological Diversity and Conservation, 18(3), 410–415. https://doi.org/10.46309/biodicon.2025.1732263
18. [19] Jaklitsch, W. M., Blanco, M. N., Rejos, F. J., Tello, S., & Voglmayr, H. (2025). Camarosporidiella, a challenge to the concept of pseudo-camarosporium-like genera. Studies in Mycology, 111, 19–100. https://doi.org/10.3114/sim.2025.111.02
19. [20] Gruhn, G., Cazenave, R., Louis, T., & Alvarado, P. (2025). Au sujet du genre Exidia en France. Bulletin trimestriel de la Société mycologique de France, 140(3–4), 211–248.
20. [21] Leavitt, S. D., Kraichak, E., Vondrák, J., Nelsen, M. P., Sohrabi, M., Pérez-Ortega, S., St. Clair, L. L., & Lumbsch, H. T. (2016). Cryptic diversity and symbiont interactions in rock-posy lichens. Molecular Phylogenetics and Evolution, 99, 261–274. https://doi.org/10.1016/j.ympev.2016.03.030
21. [22] Hall, T. A. (1999). BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series, 41, 95–98.
22. [23] Kumar, S., Stecher, G., & Tamura, K. (2016). MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular Biology and Evolution, 33(7), 1870–1874. https://doi.org/10.1093/molbev/msw054
23. [25] Roberts, P. (2001). The genus Exidia (Heterobasidiomycetes) in the British Isles. Mycologist, 15(1), 18–29. https://doi.org/10.1017/S0269915X01001071