1-Naftalen-2-il-etanon-o-propil-oksimin Kuantum Kimyasal Çalışmaları

Year 2020, Volume: 7 Issue: 100. Yıl Özel Sayı, 175 - 185, 23.03.2020

Yunus Kaya İlhan Küçük

https://doi.org/10.35193/bseufbd.632396

Abstract

Bu çalışmada, biyolojik aktif özellik gösterebilen
1-naftalen-2-il-etanon-O-propil-oksim (NEOPO) molekülünün kuantum kimyasal
özellikleri, yapısal, spektroskopik, elektronik ve moleküler yerleştirme olarak
sunulmuştur. Tüm kuantum kimyasal çalışmalar B3LYP / 6-311 ++ G (d, p) yöntem
ve temel seti ile yoğunluk fonksiyonel teorisi (DFT) ile gerçekleştirilmiştir.
Spektroskopik özellikleri, atom yükleri, HOMO-LUMO moleküler orbitalleri,
kimyasal reaktivite ve moleküler elektrostatik potansiyeli (MEP) teorik olarak
araştırılmıştır. Spektroskopik özellikler deneysel olarak desteklenmiştir.
Ayrıca, moleküler yerleştirme çalışmaları için Autodock / Vina programı
kullanılmış ve bağlanma serbest enerjileri DNA-molekül ve protein-molekül
etkileşimleri için sırasıyla -27.20 ve -34.73 kJ / mol olarak hesaplanmıştır.

Keywords

Oksim Eter, Kuantum Kimyasal Hesaplama, IR, NMR ve UV-Gör. Bölge Spektrumları, Moleküler Yerleştirme

Supporting Institution

Bursa Teknik Üniversitesi

Project Number

171N10

Quantum Chemical Studies of 1-Naphthalen-2-yl-ethanone-o-propyl-oxime

Abstract

In this work, quantum chemical properties of 1-naphthalen-2-yl-ethanone-O-propyl-oxime (NEOPO)
molecule which may be biologically active have been presented as a structural,
spectroscopic, electronic and molecular docking. All quantum chemical studies were performed by
density functional theory (DFT) with the B3LYP / 6-311++G(d,p) method and basis
set. The spectroscopic properties, atomic charges, HOMO-LUMO molecular
orbitals, chemical reactivity and molecular electrostatic potential (MEP) were
investigated as theoretically. The spectroscopic properties have been supported
as experimentally. In addition, the Autodock/Vina program was used for molecular
docking studies and the binding free energies were calculated as -27.20 and
-34.73 kJ/mol for DNA-molecule and protein-molecule interactions, respectively.

Keywords

Oxime Ether, Quantum Chemical Calculation, IR, NMR and UV-Vis Spectra, Molecular Docking

Project Number

171N10

References

• [1] Zhu, X.F. Shi, D.Q. (2009) Chin. J. Chem. 27, 565.
• [2] Abele, E. Lukevics, E. (2000) Org. Prep. Proc. Int. 32, 237.
• [3] Mobio, I.G. Soldatankov, A.T. Fedorov, V.O. (1989) Khim. Farm. Zh. 23 ,421.
• [4] Krishnakumar, V. Prabavathi, N. Muthunatesan. S. (2008) Spectrochim. Acta A:Mol. Biomol. Spectr. 69, 528.
• [5] Govindarajan, M. Karabacak. M. (2013) Spectrochim. Acta A: Mol. Biomol.Spectr. 101, 314.
• [6] Akman, F. Durak, R. Kacal, M.R. Bezgin. F. (2016) X-Ray Spectr. 45, 103.
• [7] Li, C. Zhang, H. Cui, Y. Zhang, S. Zhao, Z. Choi, M.C.K. Chan, A.S.C. (2003) Synthetic Communication 33, 543.
• [8] Frisch, M. J. et al. (2010) Gaussian 09, Revision C.01, Gaussian, Inc., Wallingford CT.
• [9] Becke, A.D. (1993) J Chem. Phys. 98, 5648.
• [10] Foresman, J.B. Frisch, E. (1993) Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods, Gaussian Inc., Pittsburgh, PA, USA.
• [11] Sundaraganesan, N. Ilakiamani, S. Saleem, H. Wojciechowski, P.M. Michalska, D. (2005) Spectrochim. Acta. A 61, 2995.
• [12] Jesus, A.J.L. Rosado, M.T.S. Reva, I. Fausto, R. Eusebio, M.E. Redinha, J.S. (2006) J. Phys. Chem. A 110, 4169.
• [13] Trott, O. Olson, A.J. (2010) J. Comput. Chem. 31, 455.
• [14] Kaya, Y. Yilmaz, V.T. Arslan, T. Buyukgungor, O. (2012) J. Mol. Struc. 1024, 65.
• [15] Colthup, N.B. Daly, L.H. Wiberley, S.E. (1964) Introduction to Infrared and Raman Spectroscopy, Academic Press Inc., London.
• [16] Kaya, Y. Yilmaz, V.T. (2014) Structural Chem. 25, 231.
• [17] Parr, R.G. Yang, W. (1989) Density Functional Theory of Atoms and Molecules. New York:Oxford University Press.
• [18] Bopp, F. Meixner, J. Kestin, J. (1967) Thermodynamics and StatisticalMechanics, fifth ed. Academic Press Inc. (London) Ltd., New York.