Evaluation of Influenza Virus Frequency, Influenza Types, Clinical Characteristics and Vaccination Rates of Patients Admitted to the Hospital with Flu-like Complaints

Abstract

Objective: Influenza viruses, which can cause seasonal epidemics and pandemics with antigenic changes, cause an acute respiratory tract infection that requires hospitalization and can be fatal, especially in risk groups. In this study, we aimed to evaluate the respiratory viral panel results of adult patients with flu complaints, retrospectively. Methods: Respiratory tract samples from adult patients were studied by multiplex real-time polymerase chain reaction (mRT-PCR) between 30.09.2019 and 10.03.2020. Demographic data, treatments, respiratory viral panel results, hemogram, and CRP values of the patients were obtained from the automation system of our hospital. Vaccination status was checked from the vaccine registration system. The way of discharge (death/healing) of inpatients was determined. Results: Of the 225 patients, 126 (56%) were female and, 99 (44%) were male, with a mean age of 51.20±20.27 years. Influenza virus positivity was detected in 59 (26.2%) cases. Influenza A (H1N1) was found with a rate of 57.6% and influenza B with a rate of 42.4%. 150 of the patients had at least one concomitant disease and, 10 had a pregnancy. Only two patients were vaccinated with the flu vaccine. Death due to influenza A(H1N1) was detected in seven patients. Influenza virus positivity was the highest in January (48.1%). 18.6% of the patients with influenza virus took oseltamivir, 54.3% took oseltamivir and antibiotics together, and 18.6% took only antibiotics. Conclusion: Although the determination of influenza virus subtypes is important for surveillance and definitive diagnosis, early diagnosis and early use of antivirals are important in preventing deaths.

Keywords

• influenza virus
• respiratory viruses
• polymerase chain reaction
• antiviral
• antiviral
• antiviral
• antiviral

Grip Benzeri Şikayetler ile Hastaneye Başvuran Hastaların İnfluenza Sıklığı, İnfluenza Tipleri, Klinik Özelliklerinin ve Aşılanma Oranlarının Değerlendirilmesi

Abstract

Amaç: Antijenik değişiklikler ile mevsimsel salgın ve pandemiler oluşturabilen influenza virüsleri özellikle risk gruplarında hastaneye yatışı gerektiren ve ölümcül olabilen akut bir solunum yolu enfeksiyonuna yol açarlar. Moleküler testler ile hızlı tanı olanakları, erken antiviral tedavi ile hastalık süresi ve komplikasyonları azaltabilir. Bu çalışmada gribal yakınmaları nedeni ile solunum yolu viral panel gönderilen, ayaktan ve yatırılarak izlenen erişkin hastaların retrospektif olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Gereç-Yöntem: 30.09.2019 ile 10.03.2020 tarihleri arasında solunum yolu örneklerinden multipleks real-time polimeraz zincir reaksiyonu (mRT-PZR) yöntemiyle solunum yolu viral etkenleri çalışılan erişkin hastalar çalışmaya dahil edilmiştir. Hastaların demografik verileri, tedavileri, solunum yolu viral panel sonuçları, hemogram ve CRP değerleri hastanemiz otomasyon sisteminden elde edilmiştir. Aşılanma durumları aşı kayıt sisteminden kontrol edilmiştir. Yatan hastaların taburcu şekli (ölüm/şifa) belirlenmiştir. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 225 hastanın 126’sı (%56) kadın, 99’ı (%44) erkek olup yaş ortalaması 51.20±20.27’dir. 118 (%52.4) olguda etken saptanmazken 59 olguda (%26.2) influenza virüs pozitifliği belirlenmiştir. İnfluenza A (H1N1) %57.6, influenza B %42.4 oranında bulunmuştur. İnfluenza virüs pozitif hastaların 24’ü pnömoni tanısıyla izlenmiştir. Hastaların 150’sinde en az bir eşlik eden hastalık, 10’unda gebelik mevcuttur. Sadece iki hastanın grip aşısı ile aşılandığı saptanmış ve bu hastalarda influenza virüs tespit edilmemiştir. Yedi hastada influenza A(H1N1)’e bağlı ölüm saptanmıştır. En fazla örneğin Ocak ayında gönderildiği ve 51 (%48.1) örnekte influenza virüs pozitifliği olduğu bulunmuştur. İnfluenza virüsü saptanan hastaların %18.6’sına oseltamivir, %54.3’üne oseltamivir ve antibiyotik birlikte, %18.6’na sadece antibiyotik verilmiştir. Sonuç: İnfluenza virüs alt tiplerinin belirlenmesi sürveyans ve kesin tanı için önemli olmakla birlikte erken tanı ile antivirallerin erken kullanımı ölümlerin önlenmesinde önemlidir.

Keywords

• influenza virüs
• solunum virüsleri
• polimeraz zincir reaksiyonu
• antiviral
• antiviral
• antiviral
• antiviral

References

1. Baselga-Moreno V, Trushakova S, McNeil S, et al. Influenza epidemiology and influenza vaccine effectiveness during the 2016–2017 season in the Global Influenza Hospital Surveillance Network (GIHSN). BMC Public Health. 2019;19:(487)1-23.
2. Dawood FS, Chaves SS, Pérez A, et al. Emerging Infections Program Network. Complications and associated bacterial coinfections among children hospitalized with seasonal or pandemic influenza, United States, 2003-2010. J Infect Dis. 2014;209:686-94.
3. Belongia EA, Irving SA, Waring SC, et al. Clinical characteristics and 30-day outcomes for influenza A 2009 (H1N1), 2008-2009 (H1N1), and 2007-2008 (H3N2) infections. JAMA - J Am Med Assoc. 2010; 304: 1091-8.
4. Havuz SG, Erdem F. Samsun Halk Sağlığı Laboratuvarında 2016-2018 Yılları Arasında İnfluenza ve Diğer Solunum Yolu Virüsleri Sürveyans Verilerinin Retrospektif Olarak Değerlendirilmesi. Flora 2021;26(1):172-182.
5. Influenza (seasonal), World Health Organization, Geneva (2018) ve Influenza (Seasonal), Factsheet [homepage on the Internet]. World Health Organization updated November 2016; 08.10.2021'de erişildi.
6. Park J-E, Ryu Y. Transmissibility and severity of influenza virüs by subtype. Infec Gen Evol. 2018; 65:288-292.
7. CDC (Center for Disease Control and Prevention) 2017b, Influenza Type A viruses. https://www.cdc.gov/flu/avianflu/influenza-a-virus-subtypes.htm (2017). 07.10.2021'de erişildi.
8. Suntur BM, Kaya H, Kuşcu F. Bir mevsimsel influenza epidemisi deneyimi. Ege Tıp Derg. 2018;57(1):46-50.

9. Ciblak MA, Tütenyurd MK, Asar S ve ark. 2003-2012 Yıllarını Kapsayan Dokuz Sezonda Grip Sürveyansı Bulguları: İstanbul Tıp Fakültesi Ulusal İnfluenza Referans Laboratuvarı Sonuçları. Mikrobiyol Bül. 2012 46(4): 575-593.
10. Antiviral drugs for influenza for 2020-2021.Med Lett Drugs Ther. 2020;62(160): 169-172. https://secure.medicalletter.org/sites/default/files/freedocs/w1610a.pdf. 07.10.2021’de erişildi.
11. Kaygusuz S, Gül S. Grip ve aşı. Kırıkkale Üniversitesi Tıp FakültesiDerg.2018;20(3):329-344.
12. Özışık L, Tanrıover MD, Akçay MÇ ve ark. İnfluenza benzeri hastalık nedeniyle hastaneye yatış gerektiren hastalarda mortaliteyle ilişkili faktörler. Mikrobiyol Bul. 2017;51(1):20-31.
13. American Academy of Pediatrics Committee on Infectious Diseases. Recommendations for Prevention and Control of Influenza in Children, 2016–2017. Pediatrics 2016;138(4):e20162527.
14. Ortiz JR, Neuzil KM, Shay DK, et al. The burden of influenza-associated critical illness hospitalizations. Crit Care Med. 2014;42(11):2325-32.
15. T.C. Sağlık Bakanlığı, Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü, 2019-2020 Haftalık İnfluenza Raporları (https://grip.gov.tr/tr/haftalik‐influenza‐raporu). 06.10.2021'de erişildi.
16. Kırdar S, Ozcolpan G, Ceylan E et al. Circulating Respiratory Viruses In Aydın Province. J Environ Protect Ecol. 2018;19(3):1389–1396.
17. Kuşkucu MA, Mete B, Tabak F, Midilli K. Yetişkinlerde Solunum Yolu Viral Etkenlerinin 2010-2018 Yılları Arasındaki Prevalansı ve Mevsimsel Dağılımı. Turk Mikrobiyol Cemiy Derg. 2020;50(1):21-6.
18. Çiçek C, Arslan A, Soydaner H ve ark. Akut Solunum Yolu Enfeksiyonu Olan Hastalarda Solunum Viruslarının Prevalansı ve Mevsimsel Dağılımı, 2002-2014. Mikrobiyol Bul 2015; 49(2): 188-200.
19. Özışık L, Durusu Tanrıöver M, Çıblak Akçay M ve ark. İnfluenza benzeri hastalık nedeniyle hastaneye yatış gerektiren hastalarda mortaliteyle ilişkili faktörler. Mikrobiyol Bul. 2017;51(1):20-31.
20. Şimşek AÇ, Akdoğan D. Ankara İli 2017 Yılı 40. Hafta ile 2018 Yılı 20. Hafta Arasında Yapılan Sentinel İnfluenza Benzeri Hastalık (İBH) Sürveyansının Değerlendirilmesi. Ankara Med J. 2019;(1):298‐306.
21. Karlsson EA, Mook NPA, Vandemaele K, et al. Review of global influenza circulation, late 2019 to 2020, and the impact of the COVID-19 pandemic on influenza circulation https://www.who.int/publications/i/item/who-wer-9625-241-264. 07.10.2021'de erişildi.
22. Khalil A, Elhadry A, Talo M, et al. Comparison of the Demographics, Clinical Presentations, Seasonality, and Outcome between Adult Patients with Influenza A and B in Two Seasons (2014-2015 and 2015-2016) with Emphasis on H1N1 Infection Outcome. Open Infect Dis J. 2019; 11: 43-51.
23. Marcos MA, Ramo’n S, Anton A, et al. Clinical relevance of mixed respiratory viral infections in adults with influenza A H1N1. Eur Respir J.2011;38(3):739-42.
24. Gültekingil A. 2017-2018 Mevsimsel İnfluenza Salgını Klinik Özellikleri: Tek Merkez Deneyimi. J Pediatr Emerg Intens Care Med. 2018;5:119-123.
25. Grgic S, Skocibusic S, Tosev E, et al. Different features of influenza A H1N1pdm09 virus infection among adults in 2009/10 and 2010/11. J Infect Dev Ctries 2016; 10(2):155-162. Hussain M, Nasir N, Irfan M, et al. Clinical characteristics and outcomes of patients with H1N1 influenza pneumonia admitted at a tertiary care hospital in Karachi, Pakistan. Pneumonia. 2020;12:5.
26. Ciblak MA, Grip Platformu. Influenza vaccination in Turkey: prevalence of risk groups, current vaccination status, factors influencing vaccine uptake and steps taken to increase vaccination rate. Vaccine 2013;31(3):518-23.
27. Acar M, Sütçü M, Aktürk H ve ark. Clinical differences of influenza subspecies among hospitalized children. Turk Pediatri Arş. 2017;52:15-22.
28. Kazanasmaz H, Gümüş H, Solmaz A ve ark. Epidemik Dönemde Şanlıurfa İli Pandemik H1N1 İnfluenza Olgularının Klinik Değerlendirmesi. Acta Medica Alanya 2018;2(1):14-19.
29. Tang X, Du RH, Wang R, et al. Comparison of Hospitalized Patients with ARDS Caused by COVID-19 and H1N1. Chest 2020; 195-205.
30. Duggal A, Pinto R, Rubenfeld G, et al. Global variability in reported mortality for critical illness during the 2009-10 influenza A(H1N1) pandemic: a systematic review and meta-regression to guide reporting of outcomes during disease outbreaks. PLoSOne 2016: e0155044.
31. Johansson N, Kalin M, Tiveljung-Lindell A, et al. Etiology of community-acquired pneumonia: increased microbiological yield with new diagnostic methods. Clin Infect Dis. 2010;50(2):202-9.
32. Uyeki TM, Berstein HH, Bradley JS, et al. Clinical Practice Guidelines by the Infectious Diseases Society of America: 2018 Update on Diagnosis, Treatment, Chemoprophylaxis, and Institutional Outbreak Management of Seasonal Influenza. Clin Infect Dis. 2019; 68(6): 895–902.