Menenjit Şüpheli Hastaların Beyin Omurilik Sıvısı Örneklerinde Menenjit Paneli ile Etkenlerin Araştırılması

Abstract

Amaç: Menenjit, beyni saran meningeal zarların ve spinal kordun enflamasyonudur. Bakteri, virüs ve mantarlar gibi pek çok etken menenjite yol açabilir. Menenjit; antimikrobiyal ve destek tedavi yöntemlerinde elde edilen gelişmelere rağmen hala ciddi mortalite ve morbidite nedeni olmaya devam etmektedir. Bu sebeple menenjitte acil tedavi mortalite ve morbiditenin düşürülmesi için çok önemlidir. Bu çalışmada hastanemiz mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen beyin omurilik sıvısı örneklerinde (BOS) Real-Time polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) yöntemi ile tespit edilen etkenlerin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Yöntem: Bu çalışmada 01/08/2019-30/09/2020 tarihleri arasında Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Moleküler Mikrobiyoloji Tanı Laboratuvarına gönderilen 169 hastanın BOS örneği çalışmaya dahil edilmiştir. Çalışmada Real-Time PZR yöntemi ile çalışan SmartCycler by Cepheid cihazıyla BOS örnekleri çalışılmıştır. Bu sistemde Streptococcus pneumoniae, Neisseria menengitidis, Haemophilus influenza, Herpes simplex-1 (HSV-1), Herpes simplex-2 (HSV-2), Human herpes virüs type-6 (HHV-6), Epstein barr virüs (EBV), Varicella zoster virüs (VZV) ve Cytomegalo virüs (CMV) etkenleri tespit edilebilmektedir. Bulgular: Çalışmaya 169 hastanın BOS örneği dahil edilmiştir. Çalışmamıza dahil edilen hastaların %50.88’i erkek, %49.12’si kadın hastalardan oluşmaktadır. Hastalarımızın %63.90’ı <18 yaş grubu hastalardan, %36.10’u ise >18 yaş grubu hastalardan oluşmaktadır. PZR sonucuna göre pozitiflik saptanan hasta sayısı 20 olup pozitiflik oranı %11.83’tür. Pozitiflik saptanan örneklerin %40’ını S. pneumoniae, %20’sini HSV-1, %15’ini N. menengitidis, %5’ini EBV , %5’ini H. influenzae, %5’ini HHV-6, %5’ini, HSV-2 ve %5’ini VZV oluşturmaktadır. Sonuç: Menenjit hastalarında uygun ve yeterli antimikrobiyal tedavi için öncelikle etkenin belirlenmesi gerekmektedir. PZR gibi moleküler yöntemlerle etkenlerin erken saptanması mümkündür ve bu alanda PZR’nın sağladığı erken tanı avantajından yararlanılmalıdır.

Keywords

• PZR
• menenjit
• beyinomurilik sıvısı

Investigation of the Causes of Cerebrospinal Fluid Samples of Patients with Suspected Meningitis with the Meningitis Panel

Abstract

Objectıve: Meningitis is an inflammation of the meningeal membranes and spinal cord that surround the brain. Meningitis; despite advances in antimicrobial and supportive treatment methods, it is still a serious cause of mortality and morbidity. For this reason, emergency treatment in meningitis is very important in reducing mortality and morbidity. In this study, it was aimed to evaluate the factors detected by Real-Time PCR method in cerebrospinal fluid(CSF) samples that are sent to our hospital's microbiology laboratory. Methods: In this study, CSF samples of 169 patients who were sent to Ondokuz Mayıs University Microbiology Laboratory between 01/08/2019-30/09/2020 were included. In the study, CSF samples were studied with the SmartCycler by Cepheid working with Real-Time PCR method. In this system, Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Haemophilus influenza, Herpes simplex-1 (HSV-1), Herpes simplex-2(HSV-2), Human herpes virus type-6(HHV-6), Epstein barr virus(EBV), Varicella zoster virus(VZV) and Cytomegalo virus(CMV) factors can be detected. Results: CSF samples of 169 patients were included in the study. 63.90% of our patients are patients in the <18 age group, and 36.10% are patients in the >18 age group. The number of PCR positive patients results were 20 and the positivity rate was 11.83%. Positive samples consist of 40% S. pneumoniae, 20% HSV-1, and 15% N. meningitidis. Conclusion: In meningitis patients, the agent must first be determined for appropriate and adequate antimicrobial treatment. It is possible to detect the factors early with molecular methods such as PCR, and the early diagnosis advantage provided by PCR should be used in this field.

Keywords

• pcr
• meningitis
• cerebrospinal fluid

References

1. 1. Smalling TW, Sefers SE, Li H, et al. Molecular approaches to detecting herpes simplex virus and enteroviruses in the central nervous system. J Clin Microbiol. 2002; 40:2317-2322.
2. 2. Us AD. Viral santral sinir sistemi enfeksiyonları. Moleküler, Klinik ve Tanısal Viroloji, Us AD, Ergünay K (Ed), Ankara. Bilimsel Tıp Yayınevi, 2012; s.271-294.
3. 3. Gültepe B, Bayram Y, Güdücüoğlu H, ve ark. Bir üniversite hastanesinde bakteriyel ve viral menenjit etkenlerinin farklı PCR yöntemleri ile araştırılması. Abant Med J. 2015; 4:125-129.
4. 4. Soylar M, Altuğlu İ, Sertöz R, ve ark. Ege Üniversitesi Hastanesi’ne başvuran santral sinir sistemi enfeksiyonu olgularında saptanan viral etkenler. Ege Tıp Dergisi. 2014; 53:65-70.
5. 5. Kılıç I, Altuğlu I, Ciçek C, ve ark. Santral sinir sistemi enfeksiyonu etkeni enterovirusların RT-PCR ve hücre kültür yöntemleri ile saptanması. Mikrobiyol Bul. 2011; 45:468-477.
6. 6. Akkaya O, Güvenç Hİ, Güzelant A, ve ark. Menenjit Etkenlerinin Real-Time Pcr Yöntemiyle Araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg, 2017; 47(3), 131-137.
7. 7. Amin M, Ghaderpanah M, Tahereh Navidifar T. Detection of Haemophilus influenzae type b, Streptococcus agalactiae, Streptococcus pneumoniae and Neisseria meningitidis in CSF specimens of children suspicious of meningitis in Ahvaz, Iran. Kaohsiung J Med Sci. 2016; 32:501-506.
8. 8. Chadwick DR. Viral meningitis. Brit Med Bul. 2006; 75-76:1-14.

9. 9. Delbue S, Tremolada S, Ferrante P. Application of molecular tools for the diagnosis of central nervous system infections. Neurol Sci. 2008; 29(2):283-285.
10. 10. Duman Y, Yakupoğulları Y, Tekerekoğlu MS, ve ark. Bir üniversite hastanesi laboratuvarında beyin omurilik sıvısı’nda izole edilen mikroorganizmaların üç yıllık geriye dönük analizi. Dicle Tıp Dergisi. 2012; 39 (1):70-74.
11. 11. Furyk JS, Swann O, Molyneux E. Systematic review: neonatal meningitis in the developing world. Trop Med Int Health. 2011; 16(6): 672-679.
12. 12. Brouwer MC, Tunkel AR, van de Beek D. Epidemiology, diagnosis, and antimicrobial treatment of acute bacterial meningitis. Clin Microbiol Rev. 2010; 23(3):467-492.
13. 13. Sayıner AA. Viral merkezi sinir sistemi infeksiyonlarında tanı. Ankem Derg. 2005; 19(2):130-136.
14. 14. Tunkel AR, Scheld WM. Acute meningitis. Mandell, Douglas and Bennett.s Principles and Practice of Infectious Diseases, 6. edition, GL Mandell, RG Douglas, JE Bennett (Ed), New York. Churchill Livingstone, 2005; s.1083- 1126.
15. 15. Harrison LH. Prospects for vaccine prevention of meningococcal infection. Clin Microbiol Rev. 2006; 19(1):142-164.
16. 16. Sarinoğlu RC, Sağlık İ, Mutlu D, ve ark. Beyin Omurilik Sıvısı Örneklerinden Saptanan Viral Etkenler. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2016; 46(4):152-158.
17. 17. Soylar M, Altuğlu İ, Sertöz R, ve ark. Ege Üniversitesi Hastanesi'ne başvuran santral sinir sistemi enfeksiyonu olgularında saptanan viral etkenler. Ege Tıp Dergisi. 2014; 53(2):65-70.
18. 18. Wu HM, Cordeiro SM, Harcourt BH, et al. Accuracy of real-time PCR, Gram stain and culture for Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis and Haemophilus influenzae meningitis diagnosis. BMC Infect Dis. 2013;13(1):1-10.
19. 19. Khater WS, Elabd SH. (4 Temmuz 2016). Identification of common bacterial pathogens causing meningitis in culture-negative cerebrospinal fluid samples using real-time polymerase chain reaction. Int J of Microbiol, Makale 4197187. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4983665/pdf/IJMICRO2016-4197187.pdf adresinden 9 Ocak 2021’de erişildi. doi: 10.1155/2016/4197187
20. 20. Toprak S, Can K, Çalışkan R, ve ark. Menenjit Tanısı Almış Hastalarda, Bakteriyel Menenjit Etkenlerinin Kültür ve PZR ile Belirlenmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2019; 49(4):191-196.
21. 21. Özdemir H, Tapsız A, Çiftçi E, ve ark. Çocuklarda akut bakteriyel menenjit. Çocuk Enf Derg. 2010; 4(1): 9-14.
22. 22. Çiçek C, Pullukçu H, Kalfaoğlu H,ve ark. Akut Menenjit Kliniği ile Başvuran Hastaların BOS Örneklerinde Viral Etkenlerin Erken Tanısı. Flora. 2015; 20(4):174-181.