Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar

Hakan Engin; Fatih Cem Kuzucu; Zeliha Gökbayrak

doi:10.33202/comuagri.1387460

Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar

Abstract

Öz Bu çalışmada, asma çeliklerinden kök oluşumunun mikroskobik incelenme ve görüntülenmesinde oldukça etkili olan ve tarafımızdan geliştirilen boyama ve görüntüleme yöntemleri sunulmaktadır. Farklı boya maddeleri farklı hücre tipleri ve bileşenleriyle tepkimeye girerek kendilerine özğü renk özelliklerini ortaya çıkarırlar. Asma kesitlerinde doğal renk farklılıkları birbirine çok yakındır. Bundan dolayı asma kök oluşumunun ve dal dokularının yüzey ve iç özellikleri göstermek için konsantrasyonunu arttırmanın en iyi yolu boyamadır. Bu amaçla araştırmamızda asma çeliklerinden kök oluşumunda hücre ve doku düzeyleri üzerine ayırt edici bilgiler sağlayarak net bir tanımlama ortaya koyabilmek için farklı boyama maddeleri ve bunların farklı karışımları üzerinde çalışılmıştır. Asma kesitlerine yapılan boyama uygulamaları Toluidine blue O, Aniline blue, Safranin O, Bromophenol blue, Methyl green, Basic fuchsin, Giemsa stain, Fast green FCF ve Carmin’dir. Bu uygulamalardan Toluidine blue O, Safranin O, Bromophenol blue, Fast green FCF ve Aniline blue boyamaları hücre ve doku düzeyleri üzerine etkili sonuçlar ortaya koymuştur. Ayrıca araştırmamızda kullanılan iki çift boyama yönteminden (Safranin O+ Bromophenol blue ve Bromophenol blue+Fast green FCF) başarılı sonuçlar alınmıştır. Her iki çift boyama yöntemi de asma gövde ve kök kesitlerinin mikroskop altında incelenmesinde kullanılması tavsiye edilir. Boyanan kesitlerin yüzeyindeki renklenmelerin ve keskinliğin mikroskop altında görüntüleme ve fotoğraflamasının iyileştirilmesi için tarafımızdan ‘halka ışık’ geliştirilmiştir. Halka ışık, numunenin tamamı üzerine beyaz ışık, sarı ışık ve her iki ışık yoğunluğunu farklı oranlarda kullanarak aydınlatma olanağı sunmaktadır.

Keywords

References

Anderson, G., Bancroft, J., 2002. Tissue processing and microtomy. In: Bancroft J, Gamble M. Theory and practice of histological techniques. Churchill Livingstone, London, pp 85–107.
Arık, C., Altındişli, A., 2020. The effects of fixation and staining methods in histological investigation on the grafted cuttings of grapevine. Journal of Agricultural Faculty of Gaziosmanpasa University. 38 (1): 65-72.
Berlyn, G.P., Miksche, J.P., 1976. Botanical microtechnique and cytochemistry. Iowa State University Press, Ames.
Bond, J., Donaldson, L., Hill, S., Hitchcock, K., 2008. Safranine fluorescent staining of wood cell walls. Biotech. Histochem. 83: 161-171.
Bracegirdle, B., 1986. A history of microtechnique: the evolution of the microtome and the development of tissue preparation. History of microscopy series. Science Heritage Ltd, Lincolnwood.
Camarero, J.J., Olano, J.M., Parras, A., 2010. Plastic bimodal xylogenesis in conifers from continental Mediterranean climates. New Phytol. 185:471–480.
Chaffey, N.J., 2002. Wood formation in trees: cell and molecular biology techniques. Taylor-Francis, New York. Çalı, Ö. İ, Candan, F., 2011. Bitki Anatomisi Uygulamaları Kitabı, Nobel Yayınları, 112 s., Ankara
Dapson, R. W., 2007. The history, chemistry and modes of action of carmine and related dyes. Biological Stain CommissionBiotechnic & Histochemistry.82(45): 173187.

Engin, H., Gökbayrak, Z., 2023. Microscopic analyzes on stem samples. New frontiers in agriculture, forest and water issues. 27: 533-549.
Fabien, B., Corentin, S., Laure, T., Sophie, B., Godfrey, N. 2020. A rapid and quantitative safranin-based fluorescent microscopy method to evaluate cell wall lignification. The Plant Journal. John Wiley & Sons Ltd.
Fields, S.D., Strout, G.W., Russell, S.D., 1997. Spray-freezing freeze substitution (SFFS) of cell suspensions for improved preservation of ultrastructure. Micro Res Tech. 38: 315–328.
Foglia, R., Landi, L., Romanazzi, G. 2022. Analyses of xylem vessel size on grapevine cultivars and relationship with incidence of esca disease, a threat to grape quality. Appl. Sci. 12: 1177.
Gahan, P.B., 1984. Plant histochemistry and cytochemistry-an introduction. Academic Press, London.
Galigher, A.E., Kozloff, E.N., 1971. Essentials of practical microtechnique. Lea & Febiger, Philadelphia.
Gartner, H., Heinrich, I., 2010. Anatomie des cernes chez les plantes ligneuses en regions temperees et tropicales. In: Payette S, Filion L La Dendrochronologie: Principes, methodes et applications. Presses de Universite Laval, Quebec, 33–60. Gartner, H., Schweingruber, F.H., 2013. Microscopic preparation techniques for plant stem analysis. Kessel Publishing House, Germany.
Hacke, U., 2015. Functional and ecological xylem anatomy. Springer International Publishing Switzerland. 133(15783):2-5.
Hacke, U.G., Venturas, M.D., MacKinnon, E.D., Jacobsen, A.L., Sperry J.S., Pratt, R.B., 2015. The standard centrifuge method accurately measures vulnerability curves of long-vesselled olive stems. New Phytol. 205:116–127.
Horobin, R.W., 1982. Histochemistry. Gustav Fischer, Stuttgart.
Horobin, R.W., Kiernan, J.A., 2002. Conn’s biological stains. BIOS Scientific, Oxford.
Jewell, F.F., 1958. Stain technique for rapid diagnosis of rust in southern pines. For Sci. 4:42–44.
Kutscha, N.P., Gray, J.R., 1972. The suitability of certain stains for studying lignification in balsam fir Abies balsamea (L.) Mill. Tech Bull 72. Life Sciences and Agriculture Experimental Station, University of Maine.
Lancelle, S.A., Callahan, D.A., Hepler, P.K., 1986. A method for rapid freeze fixation of plant cells. Protoplasma. 131:153–165.
Micco, V., Aronne, G., 2007. Combined histochemistry and autofluorescence for identifying lignin distribution in cell walls. Biotech Histochem. 82:209–216.
Osipov, A., Andreyan, O., 2014. DNA comet Giemsa staining for conventional bright-field microscopy. International Journal of Molecular Sciences 15(4): 6086-6095.
Rapp, A.O., Behrmann, K., 1998. Preparation of wood for microscopic analysis after decay testing. Holz als Roh und Werkstoff. 56:277–278.
Rauter, R.W., Zufa, L., 1972. A rapid technique for the determination of Cronartium ribicola mycelium in white pine bark tissues. In: Biology of rust resistance in forest trees. Proc of a NATO-IUFRO Advanced Study Institute, USDA Forest Service, (Miscellaneous Publ No 1221), Washington DC, 387–392.
Ruzin, S.E., 1999. Plant microtechnique and microscopy. Oxford University Press, New York.
Schubert, A., Lovisolo, C., Peterlunger, E., 1999. Shoot orientation affects vessel size, shoot hydraulic conductivity and shoot growth rate in Vitis vinifera L. Plant Cell Environ. 22:197–204.
Schwarze, F.W., 2007. Wood decay under the microscope. Fungal Biol Rev. 21:133–170.
Schweingruber, F.H., 1990. Microscopic wood anatomy. Swiss Federal Institute for Forest, Snow and Landscape Research, Birmensdorf.
Schweingruber, F.H., Börner, A., Schulze, E.D., 2006. Atlas of woody plant stems: evolution, structure, and environmental modifications. Springer, Berlin.
Selvakumar, N., Ander, A., 2002. Inefficiency of 0.3% carbol fuchsin in ziehl-neelsen staining for detecting acid-fast bacilli. Journal of clinical microbiology 40(8): 3041-3043.
Smith, G.M., 1915. The development of botanical microtechnique. Trans Am Microsc Soc. 34:71–129
Srebotnik, E., Messner, K., 1994. A simple method that uses differential staining and light microscopy to assess the selectivity of wood delignification by white rot fungi. Appl Environ Microbiol. 60:1383–1386.
Sutton, A., Tardif, J., 2005. Distribution and anatomical characteristics of white rings in Populus tremuloides. IAWA J. 26:221–238.
Vazquez-Cooz I., Meyer, R.W., 2002. A differential staining method to identify lignified and unlignified tissues. Biothech Histochem. 77:277–282.
Wegner, L., Sass-Klaassen, U., Eilmann, B., 2014. Micro-core processing a time and cost efficient protocol. Wageningen University.
Werf, G.W., Sass-Klaassen, U., Mohren, G.M.J., 2007. The impact of the summer drought on the intra-annual growth pattern of beech ( Fagus sylvatica L.) and oak ( Quercus robur L.) on a dry site in the Netherlands. Dendrochronologia. 25:103–112.

Details

Primary Language

Turkish

Subjects

Zootechny (Other)

Journal Section

Research Article

Authors

Hakan Engin ^*
0000-0001-6897-8708
Türkiye

Fatih Cem Kuzucu
0000-0003-0497-4331
Türkiye

Zeliha Gökbayrak
0000-0002-0012-9782
Türkiye

Publication Date

July 22, 2024

Submission Date

November 7, 2023

Acceptance Date

March 20, 2024

Published in Issue

Year 2024 Volume: 12 Number: 1

DOI

https://doi.org/10.33202/comuagri.1387460

IZ

https://izlik.org/JA72UW35EG

Cite

RIS / Bibtex

APA

Engin, H., Kuzucu, F. C., & Gökbayrak, Z. (2024). Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar. ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi, 12(1), 108-120. https://doi.org/10.33202/comuagri.1387460

AMA

1.Engin H, Kuzucu FC, Gökbayrak Z. Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar. COMU J. Agri. Fac. 2024;12(1):108-120. doi:10.33202/comuagri.1387460

Chicago

Engin, Hakan, Fatih Cem Kuzucu, and Zeliha Gökbayrak. 2024. “Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme Ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar”. ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi 12 (1): 108-20. https://doi.org/10.33202/comuagri.1387460.

EndNote

Engin H, Kuzucu FC, Gökbayrak Z (July 1, 2024) Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar. ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi 12 1 108–120.

IEEE

[1]H. Engin, F. C. Kuzucu, and Z. Gökbayrak, “Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar”, COMU J. Agri. Fac., vol. 12, no. 1, pp. 108–120, July 2024, doi: 10.33202/comuagri.1387460.

ISNAD

Engin, Hakan - Kuzucu, Fatih Cem - Gökbayrak, Zeliha. “Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme Ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar”. ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi 12/1 (July 1, 2024): 108-120. https://doi.org/10.33202/comuagri.1387460.

JAMA

1.Engin H, Kuzucu FC, Gökbayrak Z. Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar. COMU J. Agri. Fac. 2024;12:108–120.

MLA

Engin, Hakan, et al. “Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme Ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar”. ÇOMÜ Ziraat Fakültesi Dergisi, vol. 12, no. 1, July 2024, pp. 108-20, doi:10.33202/comuagri.1387460.

Vancouver

1.Hakan Engin, Fatih Cem Kuzucu, Zeliha Gökbayrak. Odun Çeliklerinin Mikroskobik İnceleme ve Görüntülenmesinde Farklı Boyama Tekniklerinin Kullanımı Üzerine Araştırmalar. COMU J. Agri. Fac. 2024 Jul. 1;12(1):108-20. doi:10.33202/comuagri.1387460

Cited By

Specific anatomical identification of Convallaria majalis (Asparagaceae), a medicinal plant with a sciophytic character

Regulatory Mechanisms in Biosystems

https://doi.org/10.15421/0225140

Anatomical diagnostic indicators of adaptation to ecological conditions in the vegetative and generative organs of Peganum harmala (Nitrariaceae)

Biosystems Diversity

https://doi.org/10.15421/012555

Anatomical identification and diagnostic characteristics of Tragopogon pratensis (Asteraceae) within the flora of Azerbaijan

Biosystems Diversity

https://doi.org/10.15421/012545