STORAGE OF LUNG CANCER DATA IN DATA WAREHOUSE FOR DECISION SUPPORT SYSTEMS

Abstract

The usage of data warehouse and data mining together has brought a new breath to the healthcare field. The health sector has a massive amount of data waiting to be utilized and turned into information. In this study, we have created a data warehouse for lung cancer data that received from American National Cancer Institute [1]. The lung cancer data have brought into certain formats, cleaned from mistakes and repetitions. The star schema model was used as a modeling approach; hence the data warehouse is designed to respond to even the most complex queries. We plan to develop a prototype system to assist physicians by using data mining techniques in decision-making stages. When considering the size and complexity of cancer data, a decision-support system built with both data warehouse and data mining can shed light on the treatment of doctors

Keywords

• Data warehouse, Lung Cancer Data, Data Mining, Decision Support Systems

AKCİĞER KANSERİ VERİLERİNİN KARAR DESTEK SİSTEMLERİ İÇİN VERİ AMBARINDA SAKLANMASI

Abstract

Veri ambarı ve veri madenciliğinin birlikte kullanımı sağlık alanına yeni bir soluk getirmiştir. Sağlık sektörü bilgiye dönüşmeyi ve değerlendirilmeyi bekleyen çok fazla miktarda veri barındırmaktadır. Bu çalışmada Amerikan Ulusal Kanser Enstitüsü'nden (NCI)[1] alınan akciğer kanseri verileri hatalardan ve tekrarlardan arındırılarak veri ambarı modelinde tutulmuştur. Modelleme yaklaşımı olarak yıldız şema modeli kullanılmış, böylece veri ambarı en karmaşık sorgulara bile yanıt verebilecek şekilde tasarlanmıştır. Çalışmanın sonraki aşamasında kurulan bu veri ambarı kullanılarak veri madenciliği teknikleri ile doktorlara karar verme aşamalarında destek sağlayacak bir örnek sistem geliştirilecektir. Kanser verilerinin büyüklüğü ve karmaşıklığı düşünüldüğünde veri ambarı ve veri madenciliğinin birlikte kullanılmasıyla kurulan bir karar destek sistemi, doktorların tedavilerini şekillendirmesinde onlara ışık tutabilecektir

Keywords

• Veri Ambarı, Akciğer Kanseri Verileri, Veri Madenciliği, Karar Destek Sistemleri

References

1. https://www.cancer.gov/ (Erişim Tarihi: 19.03.2017)
2. http://globocan.iarc.fr/ (Erişim Tarihi: 17.02.2017)
3. http://kanser.gov.tr/ (Erişim Tarihi: 15.01.2017)
4. Kallmeyer V.,Venkat K., “Beyond e- Health: Health and IT Converge”, Siliconindia, Vol. 6, Issue 4, April 2002, p. 42.
5. Koç E, Şengül A. Y, Özkaya U. A, Klinik Karar Destek Sistemlerinin Sağlık Hizmetleri Verimliliğine Etkileri, 6.Sağlık ve Hastane İdaresi Kongresi, 2012
6. Özata M., Aslan Ş., “Klinik Karar Destek Sistemleri ve Örnek Uygulamalar”, Afyon Kocatepe Üniversitesi Tıp Dergisi, Cilt: 5, Sayı:1, Ocak 2004.
7. Savaş S., Topaloğlu N.,Yılmaz M., Veri Madenciliği ve Türkiye'deki Uygulama Örnekleri, İstanbul Ticaret Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, Sayı:21 ,Sayfa:1-23
8. A. Kusiak, Decomposition in Data Mining: A Medical Case Study, in B.V. Dasarathy (Ed.), Proceedings of the SPIE Conference on Data Mining and Knowledge Discovery: Theory, Tools, and Technology III, Vol. 4384, SPIE, Orlando, FL, April 2001, pp. 267-277

9. Kaya, E., Bulun, M., Arslan, A., (2003), Tıpta Veri Ambarları Oluşturma ve Veri Madenciliği Uygulamaları, Akademik Bilişim 2003, Çukurova Üniversitesi, Adana
10. Danacı, M., Çelik, M. ve Akkaya, A.E., (2010), "Veri Madenciliği Yöntemleri Kullanılarak Meme Kanseri Hücrelerinin Tahmin ve Teşhisi", Yenilikler ve Uygulama Sempozyumu, 21-24 Haz. 2010, Kayseri, 9-12.
11. Kaur., H.,ve Wasan., S., “Empirical Study on applications of Data Mining Techniques in Healthcare”, Journal of Computer Science 2(2), 2006.
12. Edward J. Arous, MD, MPH Electronic medical record: research tool cancer, 2013
13. Dr. Osama E.Sheta “Evaluating a Healthcare Data Warehouse for Cancer Diseases” IRACST - International Journal of Computer Science and Information Technology & Security (IJCSITS), ISSN: 2249-9555 Vol. 3, No.3, June 2013
14. Palaniappan S., Ling C., Clinical Decision Support Using OLAP With Data Mining, IJCSNS International Journal of Computer Science and Network Security, VOL.8 No.9, September 2008
15. Hua Min, Frank J. Manion, Elizabeth Goralczyk, Yu-Ning Wong, Eric Ross, J. Robert Beck, Integration of prostate cancer clinical data using an ontology,2009
16. Hai hu, Biomedical informatics: development of a comprehensive data warehouse for clinical and genomic breast cancer research,2014
17. Arslan V., Yılmaz G., Karar Destek Sistemlerinin Kullanımı İçin Geliştirilmesi, 2010 Model
18. Çorapçıoğlu M., TIPÇIT: Tıbbi Karar Destek Sistemi Çekirdeği, Yayınlanmamış Yüksek Lisans Tezi, Başkent Üniversitesi, Ankara, 2006, s. 1 [19] Poyraz Ö., Tıpta Veri Madenciliği Uygulamaları: Meme Kanseri Veri Seti Analizi, 2012
19. Malinowski E. ,Zimanyi E, 2007 , Advanced Data Warehouse Design, From Conventional to Spatial and Temporal Applications.