BibTex RIS Cite

COMPARISON OF THE EFFECTS OF CROSS VALIDATION METHODS ON DETERMINING PERFORMANCES OF CLASSIFIERS USED IN DIAGNOSING CONGESTIVE HEART FAILURE

Year 2014, Volume: 16 Issue: 48, 1 - 8, 01.09.2014

Abstract

Congestive heart failure (CHF) occurs when the heart is unable to provide sufficient pump action
to maintain blood flow to meet the needs of the body. Early diagnosis is important since the mortality
rate of the patients with CHF is very high. There are different validation methods to measure
performances of classifier algorithms designed for this purpose. In this study, k-fold and leave-one-out
cross validation methods were tested for performance measures of five distinct classifiers in the
diagnosis the patients with CHF. Each algorithm was run 100 times and the average and the standard
deviation of classifier performances were recorded. As a result, it was observed that average
performance was enhanced and variability of performances was decreased when the number of data
sections used in the cross validation method was increased.

References

  • AHA (American Heart Association) (2006): “Heart Disease and Stroke Statistics–2006 Update: A Report From the American Heart Association Statistics Committee and Stroke Statistics Subcommittee”, Circulation, Cilt 113, sf. 85-151.
  • Duda R. O., Hart P. E., Stork D. G. (2001): “Pattern Classification”, New York: John Wiley and Sons, 2. baskı.
  • Flavell C., Stevenson L. W. (2001): “Take Heart with Heart Failure”, Circulation, Cilt 104, Sayı 89.
  • Goldberger A. L., Amaral L. A. N., Glass L., Hausdorf J. M., Ivanov P. C., Mark R. G., Mietus J. E., Moody G. B., Peng C. K., Stanley H. E. (2000): “Physiobank, Physiotoolkit, and Physionet: Components of a New Research Resource for Complex Physiologic Signals”, Circulation, Cilt 101, Sayı 23, sf. 215-220.
  • İşler Y., Kuntalp M. (2007): “Combining Classical HRV Indices with Wavelet Entropy Measures Improves to Performance in Diagnosing Congestive Heart Failure”, Comput Biol Med, Cilt 37, Sayı 10, sf. 1502–1510.
  • İşler Y., Kuntalp M. (2010): “Heart Rate Normalization in the Analysis of Heart Rate Variability in Congestive Heart Failure”, Proceedings of the Institution of Mechanical Engineers, Part H: Journal of Engineering in Medicine, Cilt 224, Sayı 3, sf. 453- 463.
  • İşler Y., Selver M. A., Kuntalp M. (2005): “Effects of Detrending in Heart Rate Variability Analysis”, In II. Mühendislik Bilimleri Genç Araştırmacılar Kongresi: MBGAK2005, İstanbul, Türkiye, sf. 213–219.
  • Lee R.G., Hsiao C.C., Kao C.Y. (2011): “Using different Entropies to Analyze the Heart Rate Variability of Congestive Heart Failure Patients”, Biomed Eng-App Bas C, Sayı 23, sf. 253.
  • Lomb N. R. (1976): “Least–Squares Frequency Analysis of Unequally Spaced Data”, Ap. Sp. Sc., Cilt 39, sf. 447–462.
  • Narin A., İşler Y. (2012): “Konjestif Kalp Yetmezliği Hastalarının Kalp Hızı Verileri Kullanılarak Teşhisi Üzerine Temel Bileşen Analizi”, IEEE 20. Sinyal İşleme ve Uygulamaları Kurultayı (SİU2012), Muğla, Türkiye, 18-20 Nisan.
  • Narin A., İşler Y., Özer M. (2013): “Konjestif Kalp Yetmezliğinin Kalp Hızı Değişkenliği Analizi ile Teşhisinde Sınıflandırıcı Başarımlarının Karşılaştırılması”, IEEE 21. Sinyal İşleme ve Uygulamaları Kurultayı (SİU2013), Girne/KKTC, 24-26 Nisan.
  • Narin A., İşler Y., Özer M. (2014): “Investigating the Performance Improvement of HRV Indices in CHF Using Feature Selection Methods Based on Backward Elimination and Statistical Significance”, Comput Biol Med, Cilt 45, sf. 72–79.
  • Pecchia L., Melillo P., Sansone M., Bracale M. (2011): “Discrimination Power of Short-Term Heart Rate Variability Measures for CHF Assessment”, IEEE T Inf Technol B, Cilt 15, Sayı 1, sf. 40– 46.
  • Quian R. Q., Rosso O.A., Başar E., Schurmann M. (2001): “Wavelet Entropy in Event-Related Potentials: A New Method Shows Ordering of EEG Oscillations”, Biol Cybern, Cilt 84, Sayı 4, sf. 291-299.
  • Task Force (of the European Society of Cardiology and the North American Society of Pacing and Electrophysiology) (1996): “Heart Rate Variability: Standards of Measurement, Physiological Interpretation, and Clinical Use”, Eur Heart J, Cilt 17, sf. 354–381.
  • Wiklund U., Akay M., Niklasson U. (1997): “Short–Term Analysis of Heart–Rate Variability by Adapted Wavelet Transforms”, IEEE Eng Med Bıol, Cilt 16, Sayı 5, sf. 113–118 ve 138.
  • Wilbur J., James P. (2005): “Diagnosis and Management of Heart Failure in the Outpatient Setting”, Prim Care, Cilt 32, sf. 1115–1129.

KONJESTİF KALP YETMEZLİĞİ TEŞHİSİNDE KULLANILAN ÇAPRAZ DOĞRULAMA YÖNTEMLERİNİN SINIFLANDIRICI PERFORMANSLARININ BELİRLENMESİNE OLAN ETKİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI

Year 2014, Volume: 16 Issue: 48, 1 - 8, 01.09.2014

Abstract

Konjestif kalp yetmezliği (KKY) vücudun ihtiyaç duyduğu miktarda kanın pompalanamaması
durumudur. Bu tanıya sahip hastaların ölüm oranı çok yüksek olduğundan erken teşhis önemlidir. Bu
amaçla gerçekleştirilen sınıflandırma algoritmalarının performanslarının ölçümü için farklı doğrulama
yöntemleri vardır. Bu çalışmada, KKY hastalarının teşhisinde sık kullanılan 5 farklı sınıflandırıcının
performans ölçümleri için k-parçalı ve birisi-dışarıda çapraz doğrulama yöntemleri denenmiştir. Her
algoritma 100 defa denenerek ortalama başarım ve standart sapmaları kayıt edilmiştir. Sonuç olarak,
çapraz doğrulamada kullanılan veri parçası sayısı arttıkça ortalama başarımın arttığı ve başarım
değişkenliğinin azaldığı tespit edilmiştir.

References

  • AHA (American Heart Association) (2006): “Heart Disease and Stroke Statistics–2006 Update: A Report From the American Heart Association Statistics Committee and Stroke Statistics Subcommittee”, Circulation, Cilt 113, sf. 85-151.
  • Duda R. O., Hart P. E., Stork D. G. (2001): “Pattern Classification”, New York: John Wiley and Sons, 2. baskı.
  • Flavell C., Stevenson L. W. (2001): “Take Heart with Heart Failure”, Circulation, Cilt 104, Sayı 89.
  • Goldberger A. L., Amaral L. A. N., Glass L., Hausdorf J. M., Ivanov P. C., Mark R. G., Mietus J. E., Moody G. B., Peng C. K., Stanley H. E. (2000): “Physiobank, Physiotoolkit, and Physionet: Components of a New Research Resource for Complex Physiologic Signals”, Circulation, Cilt 101, Sayı 23, sf. 215-220.
  • İşler Y., Kuntalp M. (2007): “Combining Classical HRV Indices with Wavelet Entropy Measures Improves to Performance in Diagnosing Congestive Heart Failure”, Comput Biol Med, Cilt 37, Sayı 10, sf. 1502–1510.
  • İşler Y., Kuntalp M. (2010): “Heart Rate Normalization in the Analysis of Heart Rate Variability in Congestive Heart Failure”, Proceedings of the Institution of Mechanical Engineers, Part H: Journal of Engineering in Medicine, Cilt 224, Sayı 3, sf. 453- 463.
  • İşler Y., Selver M. A., Kuntalp M. (2005): “Effects of Detrending in Heart Rate Variability Analysis”, In II. Mühendislik Bilimleri Genç Araştırmacılar Kongresi: MBGAK2005, İstanbul, Türkiye, sf. 213–219.
  • Lee R.G., Hsiao C.C., Kao C.Y. (2011): “Using different Entropies to Analyze the Heart Rate Variability of Congestive Heart Failure Patients”, Biomed Eng-App Bas C, Sayı 23, sf. 253.
  • Lomb N. R. (1976): “Least–Squares Frequency Analysis of Unequally Spaced Data”, Ap. Sp. Sc., Cilt 39, sf. 447–462.
  • Narin A., İşler Y. (2012): “Konjestif Kalp Yetmezliği Hastalarının Kalp Hızı Verileri Kullanılarak Teşhisi Üzerine Temel Bileşen Analizi”, IEEE 20. Sinyal İşleme ve Uygulamaları Kurultayı (SİU2012), Muğla, Türkiye, 18-20 Nisan.
  • Narin A., İşler Y., Özer M. (2013): “Konjestif Kalp Yetmezliğinin Kalp Hızı Değişkenliği Analizi ile Teşhisinde Sınıflandırıcı Başarımlarının Karşılaştırılması”, IEEE 21. Sinyal İşleme ve Uygulamaları Kurultayı (SİU2013), Girne/KKTC, 24-26 Nisan.
  • Narin A., İşler Y., Özer M. (2014): “Investigating the Performance Improvement of HRV Indices in CHF Using Feature Selection Methods Based on Backward Elimination and Statistical Significance”, Comput Biol Med, Cilt 45, sf. 72–79.
  • Pecchia L., Melillo P., Sansone M., Bracale M. (2011): “Discrimination Power of Short-Term Heart Rate Variability Measures for CHF Assessment”, IEEE T Inf Technol B, Cilt 15, Sayı 1, sf. 40– 46.
  • Quian R. Q., Rosso O.A., Başar E., Schurmann M. (2001): “Wavelet Entropy in Event-Related Potentials: A New Method Shows Ordering of EEG Oscillations”, Biol Cybern, Cilt 84, Sayı 4, sf. 291-299.
  • Task Force (of the European Society of Cardiology and the North American Society of Pacing and Electrophysiology) (1996): “Heart Rate Variability: Standards of Measurement, Physiological Interpretation, and Clinical Use”, Eur Heart J, Cilt 17, sf. 354–381.
  • Wiklund U., Akay M., Niklasson U. (1997): “Short–Term Analysis of Heart–Rate Variability by Adapted Wavelet Transforms”, IEEE Eng Med Bıol, Cilt 16, Sayı 5, sf. 113–118 ve 138.
  • Wilbur J., James P. (2005): “Diagnosis and Management of Heart Failure in the Outpatient Setting”, Prim Care, Cilt 32, sf. 1115–1129.
There are 17 citations in total.

Details

Other ID JA47FH82MH
Journal Section Research Article
Authors

Ali Narin This is me

Yalçın İşler This is me

Mahmut Özer This is me

Publication Date September 1, 2014
Published in Issue Year 2014 Volume: 16 Issue: 48

Cite

APA Narin, A., İşler, Y., & Özer, M. (2014). KONJESTİF KALP YETMEZLİĞİ TEŞHİSİNDE KULLANILAN ÇAPRAZ DOĞRULAMA YÖNTEMLERİNİN SINIFLANDIRICI PERFORMANSLARININ BELİRLENMESİNE OLAN ETKİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI. Dokuz Eylül Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Fen Ve Mühendislik Dergisi, 16(48), 1-8.
AMA Narin A, İşler Y, Özer M. KONJESTİF KALP YETMEZLİĞİ TEŞHİSİNDE KULLANILAN ÇAPRAZ DOĞRULAMA YÖNTEMLERİNİN SINIFLANDIRICI PERFORMANSLARININ BELİRLENMESİNE OLAN ETKİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI. DEUFMD. September 2014;16(48):1-8.
Chicago Narin, Ali, Yalçın İşler, and Mahmut Özer. “KONJESTİF KALP YETMEZLİĞİ TEŞHİSİNDE KULLANILAN ÇAPRAZ DOĞRULAMA YÖNTEMLERİNİN SINIFLANDIRICI PERFORMANSLARININ BELİRLENMESİNE OLAN ETKİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI”. Dokuz Eylül Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Fen Ve Mühendislik Dergisi 16, no. 48 (September 2014): 1-8.
EndNote Narin A, İşler Y, Özer M (September 1, 2014) KONJESTİF KALP YETMEZLİĞİ TEŞHİSİNDE KULLANILAN ÇAPRAZ DOĞRULAMA YÖNTEMLERİNİN SINIFLANDIRICI PERFORMANSLARININ BELİRLENMESİNE OLAN ETKİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI. Dokuz Eylül Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Fen ve Mühendislik Dergisi 16 48 1–8.
IEEE A. Narin, Y. İşler, and M. Özer, “KONJESTİF KALP YETMEZLİĞİ TEŞHİSİNDE KULLANILAN ÇAPRAZ DOĞRULAMA YÖNTEMLERİNİN SINIFLANDIRICI PERFORMANSLARININ BELİRLENMESİNE OLAN ETKİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI”, DEUFMD, vol. 16, no. 48, pp. 1–8, 2014.
ISNAD Narin, Ali et al. “KONJESTİF KALP YETMEZLİĞİ TEŞHİSİNDE KULLANILAN ÇAPRAZ DOĞRULAMA YÖNTEMLERİNİN SINIFLANDIRICI PERFORMANSLARININ BELİRLENMESİNE OLAN ETKİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI”. Dokuz Eylül Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Fen ve Mühendislik Dergisi 16/48 (September 2014), 1-8.
JAMA Narin A, İşler Y, Özer M. KONJESTİF KALP YETMEZLİĞİ TEŞHİSİNDE KULLANILAN ÇAPRAZ DOĞRULAMA YÖNTEMLERİNİN SINIFLANDIRICI PERFORMANSLARININ BELİRLENMESİNE OLAN ETKİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI. DEUFMD. 2014;16:1–8.
MLA Narin, Ali et al. “KONJESTİF KALP YETMEZLİĞİ TEŞHİSİNDE KULLANILAN ÇAPRAZ DOĞRULAMA YÖNTEMLERİNİN SINIFLANDIRICI PERFORMANSLARININ BELİRLENMESİNE OLAN ETKİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI”. Dokuz Eylül Üniversitesi Mühendislik Fakültesi Fen Ve Mühendislik Dergisi, vol. 16, no. 48, 2014, pp. 1-8.
Vancouver Narin A, İşler Y, Özer M. KONJESTİF KALP YETMEZLİĞİ TEŞHİSİNDE KULLANILAN ÇAPRAZ DOĞRULAMA YÖNTEMLERİNİN SINIFLANDIRICI PERFORMANSLARININ BELİRLENMESİNE OLAN ETKİLERİNİN KARŞILAŞTIRILMASI. DEUFMD. 2014;16(48):1-8.

Dokuz Eylül Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi Dekanlığı Tınaztepe Yerleşkesi, Adatepe Mah. Doğuş Cad. No: 207-I / 35390 Buca-İZMİR.