CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi

Gökçe Yıldırım Buharalıoğlu

doi:10.5798/dicletip.1086401

CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi

Abstract

Amaç: Çalışmanın amacı, epigenetik regülatörlerden lizin demetilaz 6A (KDM6A) ve/veya lizin demetilaz 6B’nin (KDM6B) prostat kanseri oluşumu ve progresyonunda rol oynayan C Terminal bağlayıcı protein1 (CTBP1) ve Nörofibromatozis Tip2 (NF2) ekspresyonlarının regülasyonu üzerindeki modüle edici rolünün aydınlatılmasıdır. Yöntemler: Prostat kanseri metastatik hücreleri LNCaP’lere KDM6 ailesi selektif inhibitörü GSK-J4 uygulanıp, total RNA izolasyonu ve cDNA sentezi yapılarak; CTBP1 ve NF2 mRNA düzeylerindeki değişiklikler reverse transcription-quantitative real time PCR (RT-qPCR) ile gösterilmiştir. Saptanan değişikliklerin transkripsiyonel inhibisyondan kaynaklanıp kaynaklanmadığını araştırmak üzere CTBP1 ve NF2 pre-spliced mRNA düzeylerindeki değişiklikler RT-qPCR ile ölçülmüştür. KDM6A ve/veya KDM6B’nin (KDM6A/B) small interfering RNA (siRNA) aracılı susturulduğu hücrelerde CTBP1 ve NF2 mRNA düzeylerindeki değişiklikler RT-qPCR ile gösterilerek bu genlerin KDM6 enzimlerinin hangisi tarafından regüle edildiği belirlenmiştir. Bulgular: CTBP1 ve NF2 rölatif mRNA düzeyleri GSK-J4 ile %45 ve %49 azalmıştır. Saptanan azalmaların CTBP1 ve NF2 mRNA ekspresyonlarının GSK-J4 tarafından transkripsiyonel baskılanmasıyla ilişkili olup olmadığını belirlemek üzere yapılan RT-qPCR deneylerinde CTBP1 ve NF2 pre-spliced mRNA düzeyleri de %43, %29 azalmıştır. GSK-J4’ün KDM6 ailesine selektif bir inhibitör olması nedeniyle CTBP1 ve NF2 mRNA ekspresyonlarının hangi KDM6 enzimi tarafından kontrol edildiğini belirlemek amacıyla KDM6A ve/veya KDM6B susturulduğunda; KDM6A ve KDM6B dual inhibisyonunda CTBP1 ve NF2 mRNA düzeyleri %56, %39 azalmıştır. Sonuç: Özetle; GSK-J4 uygulanmasıyla CTBP1 ve NF2 mRNA düzeylerinde saptadığımız azalmaların transkripsiyondaki değişiklikten kaynaklandığı pre-spliced mRNA verilerimizle güçlü bir şekilde desteklenmiştir. KDM6A ve KDM6B’nin her ikisinin de CTBP1 ve NF2 ekspresyonlarının prostat kanserindeki regülasyonunda kontrol edici rollerinin olduğunun gösterilmesi; terapötik olarak hedeflenebilecek, KDM6A ve KDM6B aracılığıyla CTBP1 ve NF2 ekspresyonlarını modüle eden yeni bir mekanizmanın aydınlatılmasına katkı sağlayabilir.

Keywords

References

1.Jerónimo C, Bastian PJ, Bjartell A, et al. Epigeneticsin prostate cancer: biologic and clinical relevance.Eur Urol. 2011; 60: 753-66.
2.Vieira FQ, Costa-Pinheiro P, Ramalho-Carvalho J,et al. Deregulated expression of selected histonemethylases and demethylases in prostatecarcinoma. Endocr Relat Cancer. 2014; 21: 51-61.
3.Graça I, Pereira-Silva E, Henrique R, et al.Epigenetic modulators as therapeutic targets inprostate cancer. Clin Epigenetics. 2016; 8: 1-24.
4.Jones PA, Baylin SB. The epigenomics of cancer.Cell. 2007; 128: 683-92.

Details

Primary Language

Turkish

Subjects

Health Care Administration

Journal Section

Research Article

Authors

Gökçe Yıldırım Buharalıoğlu ^* This is me
Türkiye

Publication Date

March 11, 2022

Submission Date

September 13, 2021

Acceptance Date

February 25, 2022

Published in Issue

Year 2022 Volume: 49 Number: 1

DOI

https://doi.org/10.5798/dicletip.1086401

IZ

https://izlik.org/JA67TX38XH

Cite

RIS / Bibtex

APA

Yıldırım Buharalıoğlu, G. (2022). CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi. Dicle Medical Journal, 49(1), 220-228. https://doi.org/10.5798/dicletip.1086401

AMA

1.Yıldırım Buharalıoğlu G. CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi. Dicle Medical Journal. 2022;49(1):220-228. doi:10.5798/dicletip.1086401

Chicago

Yıldırım Buharalıoğlu, Gökçe. 2022. “CTBP1 Ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi”. Dicle Medical Journal 49 (1): 220-28. https://doi.org/10.5798/dicletip.1086401.

EndNote

Yıldırım Buharalıoğlu G (March 1, 2022) CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi. Dicle Medical Journal 49 1 220–228.

IEEE

[1]G. Yıldırım Buharalıoğlu, “CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi”, Dicle Medical Journal, vol. 49, no. 1, pp. 220–228, Mar. 2022, doi: 10.5798/dicletip.1086401.

ISNAD

Yıldırım Buharalıoğlu, Gökçe. “CTBP1 Ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi”. Dicle Medical Journal 49/1 (March 1, 2022): 220-228. https://doi.org/10.5798/dicletip.1086401.

JAMA

1.Yıldırım Buharalıoğlu G. CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi. Dicle Medical Journal. 2022;49:220–228.

MLA

Yıldırım Buharalıoğlu, Gökçe. “CTBP1 Ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi”. Dicle Medical Journal, vol. 49, no. 1, Mar. 2022, pp. 220-8, doi:10.5798/dicletip.1086401.

Vancouver

1.Gökçe Yıldırım Buharalıoğlu. CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi. Dicle Medical Journal. 2022 Mar. 1;49(1):220-8. doi:10.5798/dicletip.1086401