Research Article
BibTex RIS Cite

CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi

Year 2022, Volume: 49 Issue: 1, 220 - 228, 11.03.2022
https://doi.org/10.5798/dicletip.1086401

Abstract

Amaç: Çalışmanın amacı, epigenetik regülatörlerden lizin demetilaz 6A (KDM6A) ve/veya lizin demetilaz 6B’nin (KDM6B) prostat kanseri oluşumu ve progresyonunda rol oynayan C Terminal bağlayıcı protein1 (CTBP1) ve Nörofibromatozis Tip2 (NF2) ekspresyonlarının regülasyonu üzerindeki modüle edici rolünün aydınlatılmasıdır.
Yöntemler: Prostat kanseri metastatik hücreleri LNCaP’lere KDM6 ailesi selektif inhibitörü GSK-J4 uygulanıp, total RNA izolasyonu ve cDNA sentezi yapılarak; CTBP1 ve NF2 mRNA düzeylerindeki değişiklikler reverse transcription-quantitative real time PCR (RT-qPCR) ile gösterilmiştir. Saptanan değişikliklerin transkripsiyonel inhibisyondan kaynaklanıp kaynaklanmadığını araştırmak üzere CTBP1 ve NF2 pre-spliced mRNA düzeylerindeki değişiklikler RT-qPCR ile ölçülmüştür. KDM6A ve/veya KDM6B’nin (KDM6A/B) small interfering RNA (siRNA) aracılı susturulduğu hücrelerde CTBP1 ve NF2 mRNA düzeylerindeki değişiklikler RT-qPCR ile gösterilerek bu genlerin KDM6 enzimlerinin hangisi tarafından regüle edildiği belirlenmiştir.
Bulgular: CTBP1 ve NF2 rölatif mRNA düzeyleri GSK-J4 ile %45 ve %49 azalmıştır. Saptanan azalmaların CTBP1 ve NF2 mRNA ekspresyonlarının GSK-J4 tarafından transkripsiyonel baskılanmasıyla ilişkili olup olmadığını belirlemek üzere yapılan RT-qPCR deneylerinde CTBP1 ve NF2 pre-spliced mRNA düzeyleri de %43, %29 azalmıştır. GSK-J4’ün KDM6 ailesine selektif bir inhibitör olması nedeniyle CTBP1 ve NF2 mRNA ekspresyonlarının hangi KDM6 enzimi tarafından kontrol edildiğini belirlemek amacıyla KDM6A ve/veya KDM6B susturulduğunda; KDM6A ve KDM6B dual inhibisyonunda CTBP1 ve NF2 mRNA düzeyleri %56, %39 azalmıştır.
Sonuç: Özetle; GSK-J4 uygulanmasıyla CTBP1 ve NF2 mRNA düzeylerinde saptadığımız azalmaların transkripsiyondaki değişiklikten kaynaklandığı pre-spliced mRNA verilerimizle güçlü bir şekilde desteklenmiştir. KDM6A ve KDM6B’nin her ikisinin de CTBP1 ve NF2 ekspresyonlarının prostat kanserindeki regülasyonunda kontrol edici rollerinin olduğunun gösterilmesi; terapötik olarak hedeflenebilecek, KDM6A ve KDM6B aracılığıyla CTBP1 ve NF2 ekspresyonlarını modüle eden yeni bir mekanizmanın aydınlatılmasına katkı sağlayabilir.

References

  • 1.Jerónimo C, Bastian PJ, Bjartell A, et al. Epigeneticsin prostate cancer: biologic and clinical relevance.Eur Urol. 2011; 60: 753-66.
  • 2.Vieira FQ, Costa-Pinheiro P, Ramalho-Carvalho J,et al. Deregulated expression of selected histonemethylases and demethylases in prostatecarcinoma. Endocr Relat Cancer. 2014; 21: 51-61.
  • 3.Graça I, Pereira-Silva E, Henrique R, et al.Epigenetic modulators as therapeutic targets inprostate cancer. Clin Epigenetics. 2016; 8: 1-24.
  • 4.Jones PA, Baylin SB. The epigenomics of cancer.Cell. 2007; 128: 683-92.
Year 2022, Volume: 49 Issue: 1, 220 - 228, 11.03.2022
https://doi.org/10.5798/dicletip.1086401

Abstract

References

  • 1.Jerónimo C, Bastian PJ, Bjartell A, et al. Epigeneticsin prostate cancer: biologic and clinical relevance.Eur Urol. 2011; 60: 753-66.
  • 2.Vieira FQ, Costa-Pinheiro P, Ramalho-Carvalho J,et al. Deregulated expression of selected histonemethylases and demethylases in prostatecarcinoma. Endocr Relat Cancer. 2014; 21: 51-61.
  • 3.Graça I, Pereira-Silva E, Henrique R, et al.Epigenetic modulators as therapeutic targets inprostate cancer. Clin Epigenetics. 2016; 8: 1-24.
  • 4.Jones PA, Baylin SB. The epigenomics of cancer.Cell. 2007; 128: 683-92.
There are 4 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Subjects Health Care Administration
Journal Section Research Articles
Authors

Gökçe Yıldırım Buharalıoğlu This is me

Publication Date March 11, 2022
Submission Date September 13, 2021
Published in Issue Year 2022 Volume: 49 Issue: 1

Cite

APA Yıldırım Buharalıoğlu, G. (2022). CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi. Dicle Tıp Dergisi, 49(1), 220-228. https://doi.org/10.5798/dicletip.1086401
AMA Yıldırım Buharalıoğlu G. CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi. diclemedj. March 2022;49(1):220-228. doi:10.5798/dicletip.1086401
Chicago Yıldırım Buharalıoğlu, Gökçe. “CTBP1 Ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi”. Dicle Tıp Dergisi 49, no. 1 (March 2022): 220-28. https://doi.org/10.5798/dicletip.1086401.
EndNote Yıldırım Buharalıoğlu G (March 1, 2022) CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi. Dicle Tıp Dergisi 49 1 220–228.
IEEE G. Yıldırım Buharalıoğlu, “CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi”, diclemedj, vol. 49, no. 1, pp. 220–228, 2022, doi: 10.5798/dicletip.1086401.
ISNAD Yıldırım Buharalıoğlu, Gökçe. “CTBP1 Ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi”. Dicle Tıp Dergisi 49/1 (March 2022), 220-228. https://doi.org/10.5798/dicletip.1086401.
JAMA Yıldırım Buharalıoğlu G. CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi. diclemedj. 2022;49:220–228.
MLA Yıldırım Buharalıoğlu, Gökçe. “CTBP1 Ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi”. Dicle Tıp Dergisi, vol. 49, no. 1, 2022, pp. 220-8, doi:10.5798/dicletip.1086401.
Vancouver Yıldırım Buharalıoğlu G. CTBP1 ve NF2 Gen Ekspresyonlarının Prostat Kanser Hücrelerinde KDM6A/B Aracılı Epigenetik Regülasyonunun İncelenmesi. diclemedj. 2022;49(1):220-8.