Research Article

HCT116 ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi ile İncelenmesi

Volume: 11 Number: 1 January 31, 2023
EN TR

HCT116 ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi ile İncelenmesi

Abstract

Kolon kanseri, tüm dünyada yaygın olan ve yüksek oranda ölümcül bir kanser tipidir. Tüm kanserlerde olduğu gibi kolon kanserinin seyrinin izlenmesi kritik bir öneme sahiptir. 5-Florourasil (5-FU) kolon kanserlerinde sıklıkla kullanılan bir antikanser ilaçtır ve hücre ölümü esnasında hücrelerde bir takım biyokimyasal ve moleküler farklılıklara neden olmaktadır. Bu çalışmada HCT116 ve HT29 kolon kanseri hücreleri 5-FU kemoterapi ilacı ile inkübe edildikten sonra, 5FU’nun hücreler üzerinde oluşturduğu biyokimyasal değişikliğin tespiti için Fourier transform kızılötesi (FTIR) spektroskopisi kullanılmıştır. 5-FU'nun inhibisyon yüzdesinin 50'ye eşit olduğu konsantrasyonu (IC50), MTT yöntemi kullanılarak belirlendi. IC50 değeri saptandıktan sonra FTIR ölçümleri alındı. Buna göre, 5-FU IC50 değeri sırasıyla HCT116 hücreleri için 12,69 µg/ml, HT29 hücreleri için 10,10 µg/ml bulunmuştur. 5-FU’nun sebep olduğu hücre ölümünün göstergeleri olduğu söylenen lipit içeriğindeki artış ile nükleik asit oranı, total hücresel proteinlerin α-sarmal ve β-yaprak ikincil yapıları ve aminoasit kalıntılarının azalması, kollajen konformasyonundaki değişiklikler gibi IR biyobelirteçlerindeki değişiklikler FTIR spektroskopisi ile gösterilmiştir. Sonuç olarak hem ucuz ve hem de hızlı bir yöntem olan FTIR ile kanser hücre ölümünün incelenmesi alternatif bir yöntem olarak kullanılabilir.

Keywords

Thanks

Çalışmada gerek laboratuvar imkanları gerek fikirleriyle bize yol gösteren sayın Prof. Dr. D. Serap KURUCA’ya teşekkürlerimizi iletiriz.

References

  1. [1]T. Reya, S.J. Morrison, M.F. Clarke, and I.L. Weissman, “Stem cells, cancer, and cancer stem cells,” Nature, vol. 414, pp. 105–111, 2001.
  2. [2]L.H. Kushi, T. Byers, C. Doyle, C. L. Rock, W. Demark‐Wahnefried, E. V. Bandera, et al. “American cancer society guidelines on nutrition and physical activity for cancer prevention: reducing the risk of cancer with healthy food choices and physical activity,” CA Cancer J Clin, vol. 56, pp. 254‑281, 2006.
  3. [3]F. Bray, J. Ferlay, I Soerjomataram, R.L. Siegel, L.A. Torre, and A. Jemal, “Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries,” CA Cancer J Clin, vol. 68, pp. 394-424, 2018.
  4. [4]K. Sasaki, N.H. Tsuno, E. Sunami, G. Tsurita, K. Kawai, Y. Okaji, et al. “Chloroquine potentiates the anti cancer effect of 5 fluorouracil on colon cancer cells,” BMC Cancer, vol. 10, pp. 370, 2010.
  5. [5]G. Folprecht and C.H. Kohne, “The role of new agents in the treatment of colorectal cancer,” Oncology, vol. 66, pp. 1‑17, 2004.
  6. [6]M.D. Wyatt and D.M. Wilson, “Participation of DNA repair in the response to 5‑fluorouracil,” Cell Mol Life Sci, vol. 66, no.3, pp. 788‑799, 2009.
  7. [7]A.L. Stelling, D. Toher, O. Uckermann, J. Tavkin, E. Leipnitz, J. Schweizer, et al. “Infrared spectroscopic studies of cells and tissues: triple helix proteins as a potential biomarker for tumors,” PLoS One, vol. 8, pp. e58332, 2013.
  8. [8]M.J. Baker, J. Trevisan, P. Bassan, R. Bhargava, H. J. Butler, et al. (2014). “Using Fourier transform IR spectroscopy to analyze biological materials,” Nature protocols, vol.9(8), pp. 1771-1791, 2014.

Details

Primary Language

Turkish

Subjects

Engineering

Journal Section

Research Article

Publication Date

January 31, 2023

Submission Date

September 10, 2021

Acceptance Date

May 29, 2022

Published in Issue

Year 2023 Volume: 11 Number: 1

APA
Özerkan, D., Danışman Kalındemirtaş, F., & Tüzemen, N. (2023). HCT116 ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi ile İncelenmesi. Duzce University Journal of Science and Technology, 11(1), 524-535. https://doi.org/10.29130/dubited.993669
AMA
1.Özerkan D, Danışman Kalındemirtaş F, Tüzemen N. HCT116 ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi ile İncelenmesi. DUBİTED. 2023;11(1):524-535. doi:10.29130/dubited.993669
Chicago
Özerkan, Dilşad, Ferdane Danışman Kalındemirtaş, and Naci Tüzemen. 2023. “HCT116 Ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi Ile İncelenmesi”. Duzce University Journal of Science and Technology 11 (1): 524-35. https://doi.org/10.29130/dubited.993669.
EndNote
Özerkan D, Danışman Kalındemirtaş F, Tüzemen N (January 1, 2023) HCT116 ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi ile İncelenmesi. Duzce University Journal of Science and Technology 11 1 524–535.
IEEE
[1]D. Özerkan, F. Danışman Kalındemirtaş, and N. Tüzemen, “HCT116 ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi ile İncelenmesi”, DUBİTED, vol. 11, no. 1, pp. 524–535, Jan. 2023, doi: 10.29130/dubited.993669.
ISNAD
Özerkan, Dilşad - Danışman Kalındemirtaş, Ferdane - Tüzemen, Naci. “HCT116 Ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi Ile İncelenmesi”. Duzce University Journal of Science and Technology 11/1 (January 1, 2023): 524-535. https://doi.org/10.29130/dubited.993669.
JAMA
1.Özerkan D, Danışman Kalındemirtaş F, Tüzemen N. HCT116 ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi ile İncelenmesi. DUBİTED. 2023;11:524–535.
MLA
Özerkan, Dilşad, et al. “HCT116 Ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi Ile İncelenmesi”. Duzce University Journal of Science and Technology, vol. 11, no. 1, Jan. 2023, pp. 524-35, doi:10.29130/dubited.993669.
Vancouver
1.Dilşad Özerkan, Ferdane Danışman Kalındemirtaş, Naci Tüzemen. HCT116 ve HT29 Kolon Kanseri Hücrelerinde 5-Florourasil Kaynaklı Hücre Ölümünün Fourier Dönüşümlü Kızılötesi Spektroskopisi ile İncelenmesi. DUBİTED. 2023 Jan. 1;11(1):524-35. doi:10.29130/dubited.993669