İdrar Örneklerinden İzole Edilen Escherichia coli Kökenlerinin Antibiyotik Duyarlılığı

Abstract

ÖZ Amaç: Üriner sistem enfeksiyonları insanlarda en yaygın görülen bakteriyel enfeksiyonlardır. Komplike ve nonkomplike üriner sistem enfeksiyonlarının en sık nedeni Escherichia coli’dir. E.coli’nin neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde kullanılan antibiyotiklere karşı oluşan direnç, dünyada ve ülkemizde artmaktadır. Bu direnç artışının önüne geçmek için tedavide uygun antibiyotik seçimi önemlidir. Bu çalışmada, idrar yolu enfeksiyonu ön tanısı ile mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen orta akım idrar örneklerinden izole edilen Escherichia coli izolatlarının, antibiyotik duyarlılığı yönünden incelenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve yöntemler: Çalışmamızda 1 Ocak 2016 – 31 Aralık 2016 tarihleri arasında Düzce Üniversitesi Sağlık Araştırma ve Uygulama Merkezi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen 1594 orta akım idrar örneğinden izole edilen Escherichia coli kökenlerinin antibiyotik duyarlılıkları retrospektif olarak incelenmiştir. 18 farklı antimikrobiyal ajana karşı duyarlılık oranları The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) önerileri doğrultusunda değerlendirilmiştir. Servis ve polikliniklerden gelen örneklerin duyarlılıkları ayrı ayrı belirlenmiştir. Bulgular: Çalışmada, izole edilen E.coli izolatlarının servis ve polikliniklere göre dağılımı incelendiğinde hem yatan hastalar hem de poliklinik hastalarında en yüksek duyarlılık sırasıyla imipenem, amikasin ve nitrofurantoine olarak saptanırken, en yüksek direnç ise sırasıyla ampisilin, piperasilin ve amoksisilin klavulonik aside karşı bulunmuştur. Sonuç: Sonuç olarak bulgularımız E.coli kaynaklı idrar yolu enfeksiyonlarının tedavisinde uygun antibiyotik seçiminde, gereksiz veya yanlış antibiyotik kullanımının önlenmesinde bölgesel yaklaşım için yol gösterici olmuştur.

Keywords

• Escherichia coli
• Antibiyotik duyarlılığı
• Üriner kanal enfeksiyonları

Antibiotic Susceptibility Of Escherıchia coli Strains Isolated From Urine Samples

Abstract

ABSTRACT Aim: Urinary tract infections are the most common bacterial infections in humans. Escherichia coli is the most common cause of complicated and noncomplicated urinary tract infections. The resistance against antibiotics used in the treatment of infections caused by E. coli has increased in the world and in our country in recent years. In this study, it was aimed to determine the antibiotic susceptibility in Escherichia coli isolates isolated from midstream urine samples sent to microbiology laboratory with a prediagnose of urinary tract infection. Materials and methods: In our study, antibiotic susceptibilities of Escherichia coli strains isolated from 1594 urine samples sent to Duzce University Health Application And Research Center between 1 January 2016 and 31 December 2016 were analyzed retrospectively. Sensitivity rates against 18 different antimicrobial agents were evaluated in line with the recommendations of The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). The sensitivities of the samples coming from the service and polyclinics were determined separately. Results: Distribution of isolated E. coli strains according to service and outpatient clinics were examined. In both inpatients and outpatient patients, the highest sensitivity was found to imipenem, amikacin and nitrofurantoine, respectively, while the highest resistance was found to ampicillin, piperacillin and amoxicillin clavulonic acid, respectively. Conclusion: In conclusion, our findings have guided the regional approach in the treatment of E.coli-associated urinary tract infections, appropriate antibiotic selection and prevention of unnecessary antibiotic use.

Keywords

• Escherichia coli
• Antibiotic resistance
• Urinary tract infections

References

1. 1. Arslan H, Azap OK, Ergonul O, Timurkaynak. Risk factors for ciprofloxacin resistance among Escherichia coli strains isolated from community-acquired urinary tract infections in Turkey. J Antimicrob Chemoter. 2005; 56(5): 914-8.
2. 2. Köken G, Aşık G, Çiftçi İH, Çetinkaya Z, Aktepe OC, Yılmazer M. Toplum kökenli üriner sistem infeksiyonu etkeni Escherichia coli suşlarında fosfomisin trometamol etkinliği. ANKEM Dergisi. 2008; 22(1): 23-7.
3. 3. Kaygusuz S, Apan TZ, Kılıç D. Toplum kökenli üriner sistem infeksiyonu etkeni Gram negatif bakterilerde çeşitli antibiyotiklere direnç. ANKEM Derg. 2001; 15(4): 753-9.
4. 4. Murray PR, Rosenthal KS. and Pfaller MA. Tıbbi Mikrobiyoloji. 6. Baskı. Ankara: Atlas kitapçılık; 2015.
5. 5. Perfetto EM, Keating K, Merchant S, Nichols BR. Acute uncumplicated urinary tract infection and E.coli resistance: Implications for first-line emprical antibiotic therapy. Journal of Managed Care Pharmacy. 2004; 10(1): 17-25.
6. 6. Öztürk CE, Kaya AD, Göçmen F, Arslan E. Toplum kaynaklı idrar yolu infeksiyonu etkeni olan Escherichia coli izolatlarının fosfomisin ile idrar yolu infeksiyonlarında sık kullanılan antibiyotiklere duyarlılıkları. ANKEM Dergisi. 2008; 22(2): 81-4.
7. 7. Rosenberg M. Pharmacoeconomics of treating uncomplicated urinary tract infections. Int J Antimicrob Agents. 1999; 11(3-4): 247-51.
8. 8. Alo ́s JI, Serrano MG, Go ́mez-Garce ́s JL, Perianes J. Antibiotic resistance of Escherichia coli from community-acquired urinary tract infections in relation to demographic and clinical data. Clin Microbiol Infect. 2005; 11: 199-203.

9. 9. Ironmonger D, Edeghere O, Gossain S, Hawkey P.M. Use of antimicrobial resistance informationan prescribing guidance for management of urinary tract infections: Survey of general practitioners in the West Midlands. BMC Infectious Diseases. 2016; 16: 226.
10. 10. Rahn DD. Urinary tract infections: contemporary management. Urol Nurs. 2008; 28(5): 333-41.
11. 11. Uyanık MH, Hancı H, Yazgı H. Üriner sistem infeksiyonlarından soyutlanan toplum kökenli Escherichia coli suşlarına fosfomisin trometamolün ve bazı antibiyotiklerin in-vitro etkinliği. ANKEM Derg. 2009; 23(4): 172-6.
12. 12. Canton R, Loza E, Anzar J, Castillo FJ, Cercenado E, Ribot PA. Monitoring the antimicrobial susceptibility of Gram-negative organisms involved in intraabdominal and urinary tract infections recovered during the SMART study (Spain, 2016 and 2017). Rew Esp Quimioter. 2019; 32(2): 145–55.
13. 13. Geçit İ, Yücel M, Kebeci F, Özaydın Ç, Öksüz Ş, Yavuz T. Düzce Atatürk Devlet Hastanesi üroloji polikliniğine başvuran hastaların İdrar kültürlerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotik dirençleri. Konuralp Tıp Dergisi 2013; 5(3): 34-7.
14. 14. Şahin İ, Şencan İ, Kaya D, Gülcan A, Öksüz Ş. Hastane infeksiyonu etkeni üropatojen Escherichia coli izolatlarının çeşitli antibiyotiklere direnç durumu. ANKEM Derg. 2004; 18(4): 193-5.
15. 15. Gözüküçük R, Çakıroğlu B, Nas Y. Toplum kaynaklı üriner sistem enfeksiyonu etkeni olarak saptanan Escherichia coli izolatlarının antibiyotik duyarlılıkları. Journal of academic research in medicine. 2012; 2:101-3.
16. 16. Lecomte F, Allaert FA. Single-dose treatment of cystitis with fosfomycin trometamol (Monuril): analysis of 15 comparative trials on 2048 patients. Giorn It Ost Gin. 1997; 19: 399-404.
17. 17. Bryce A, Hay AD, Lane IF, Thomton HV, Wootton M, Costelloe C. Global prevalence of antibiotic resistance in paediatric urinary tract infections caused by Escherichia coli and association with routine use of antibiotics in primary care: systematic review and meta-analysis. BMJ. 2016; 352: 939.
18. 18. Uzun A, Gülen D, Tanrıverdi Y, Kaya AD. Fosfomisin ve bazı antimikrobiyal ajanların üriner Escherichia coli izolatlarına in vitro etkinliğinin değerlendirilmesi. Klimik Dergisi. 2012; 25(2): 77-80.
19. 19. Ny S, Edquist P, Dumpis U, Yli-Hannuksela KG, Hermes J, Kling AM. Antimicrobial resistance of Escherichia coli isolates from outpatient urinary tract infections in women in six European countries including Russia. Journal of Global Antimicrobial Resistance. 2019; 17: 25-34.
20. 20. Gülcan A, Aslantürk A, Gülcan E. İdrar kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve in vitro antibiyotik duyarlılık durumları. Abant Medical Journal. 2012; 1(3): 129-35.
21. 21. Sağlam AG, Otlu S, Çoşkun MR, Çelik E, Büyük F, Şahin M. İneklerde subklinik mastitis prevalansı, etken izolasyonu ve antibiyotik duyarlılıklarının belirlenmesi. Eurasian J Vet Sci. 2018; 34 (2): 92-8.
22. 22. Gupta K, Hooton TM, Naber KG et al. International clinical practice guidelines for the treatment of acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women: a 2010 update by the Infectious Diseases Society of America and the European Society for Microbiology and Infectious Diseases. Clin Infect Dis. 2011; 52(5): 103-20.
23. 23. Ağca H. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotiklere duyarlılıkları. The Medical Journal of Kocatepe. 2011; 12: 95-100.
24. 24. Zhang H, Johnson A, Zhang G, Yang Y, Li D. Susceptibilities of Gram-negative bacilli from hospital- and community-acquired intra-abdominal and urinary tract infections: a 2016–2017 update of the Chinese SMART study. Infect Drug Resist. 2019; 4: 905-14.
25. 25. Kitagawa K, Yamamichi F, Alimsardjono L, Rahardjo D, Kuntaman K; International comparison of causative bacteria and antimicrobial susceptibilities of urinary tract infections between Kobe, Japan, and Surabaya, Indonesia. Jpn. J. Infect. Dis. 2018; 71: 8–13.
26. 26. Altoparlak Ü, Özbek A, Aktaş F. Üriner sistem infeksiyonlarından izole edilen bakterilerin çeşitli antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2002; 32: 167-73.
27. 27. Uğur, A., Türk Dağı, H., Tuncer, İ., Fındık, D. ve Arslan, U. İdrar kültürlerinden izole edilen Esherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılığı ve genişlemiş spektrumlu beta laktamaz oranı. Ankem Derg. 2013; 27(1): 13-8.