Detection of genetic polymorphism by RAPD-PCR in two Trichogramma (Hymenoptera: Trichogrammatidae) species in Turkey

Year 2012, Volume: 36 Issue: 2, 177 - 182, 01.04.2012

Fahriye Sümer Ercan Sevcan Öztemiz Servet Özcan Aydın Ş. Tuncbilek 177-182

Abstract

Keywords

-

Türkiye'deki iki Trichogramma (Hymenoptera: Trichogrammatidae) türünde RAPD-PCR ile genetik polimorfizmin belirlenmesi

Abstract

Biyolojik mücadelede, tür teşhisi ilk basamağı oluşturur. Bu durum, mikroskobik boyutları ve güvenilir morfolojik karakterlerinin olmayışından dolayı özellikle Trichogramma cinsi için zordur. Bu küçük arıların tanımlanması için farklı moleküler belirteçler kullanılmıştır. Bu çalışmada iki Trichogramma türünü temsil eden [Trichogramma brassicae (Bezdenko) ve Trichogramma euproctidis (Girault)] üç laboratuvar kültüründen elde edilen rastgele çoğaltılmış polimorfik DNA-polimeraz zincir reaksiyonu (RAPD-PCR) bantlaşma şekilleri karşılaştırılmıştır. Onbeş primerden onüçü bireysel olarak tür ayırt edilmesinde kullanılmıştır. Tür içi ve türler arası varyasyonu ölçmek için, genetik uzaklıklar, ortak skorlanabilen bantların oranına dayanarak hesaplanmıştır. Tür içi genetik uzaklığın (%0.8), türler arası genetik uzaklıktan (68%) çok daha düşük olduğu bulunmuştur. Sonuçlar, RAPD yönteminin, tür teşhisinin ilerlemesi ve Trichogramma türlerinin genetik çeşitliliğinin daha iyi anlaşılması için etkili olarak kullanılabileceğini ortaya koymaktadır. Bu çalışmada, parazitik Hymenoptera üzerindeki genetik incelemelerde RAPD-PCR’ın potansiyel kullanımı tartışılmıştır

Keywords

Parazitoit, Trichogramma brassicae, Trichogramma euproctidis, genetik çeşitlilik, moleküler belirteç

References

• Barnay, O., G. Hommay, C. Gertz, J. C. Kienlen, G.,Schubert, J. P. Marro, J. Pizzol & P. Chavigny, 2001. Survey of natural populations of Trichogramma (Hymenoptera: Trichogrammatidae) in the vineyards of Alsace (France). Journal of Applied Entomology, 125: 469-477.
• De Almeida, R. P., 2004. Trichogramma and Its Relationship with Wolbachia: Identification of Trichogramma Species, Phylogeny, Transfer and Costs of Wolbachia Symbionts. PhD thesis, Wageningen University, The Netherlands, 142 pp.
• Edwards, O. R. & M. A. Hoy, 1993. Polymorphism in two parasitoids detected using random amplified polymorphic DNA polymerase chain reaction. Biological Control, 3 (4): 243-257.
• Jain, S. K., B. Neekhra, D. Pandey & K. Jain, 2010. RAPD marker system in insect study: A review. Indian Journal of Biotechnology, 9: 7-12.
• Laurent V., E. Wajnberg, B. Mangin, T. Schiex, C. Gaspin, F. Vanlerberghe-Masutti, 1998. A composite genetic map of the parasitoid wasp Trichogramma brassicae based on RAPD markers. Genetics, 150: 275–282.
• Li, Z. X., 2007. Molecular differentiation of the four most commonly occurring Trichogramma (Hymenoptera: Trichogrammatidae) species in China. European Journal of Entomology, 104: 363-367.
• Li, Z. X. & Z. M. Shen, 2002. PCR-Based technique for identification and detection of Trichogramma spp. (Hymenoptera: Trichogrammatidae) with specific primers. Entomologia Sinica, 9 (3): 9-16.
• Nagarkatti, S. & H. Nagaraja, 1977. Biosystematics of Trichogramma and Trichogrammatoidea species. Annual Review of Entomology, 22: 157-176.
• Oztemiz, S., 2007. Trichogramma species (Hymenoptera: Trichogrammatidae) egg parasitoids of Lepidoptera in the Eastern Mediterranean Region of Turkey. Proceedings of the Entomological Society of Washington, 109 (3): 718-720.
• Pinto, J. D., 1998. Systematics of the North American species of Trichogramma (Hymenoptera: Trichogrammatidae). Memoirs of the Entomological Society of Washington, 22: 1-287.
• Pinto, J. D., R. K. Velten, G. R. Platner & E. R. Oatman, 1989. Phenotypic plasticity and taxonomic characters in Trichogramma Hymenoptera: Trichogrammatidae). Annals of the Entomological Society of America, 82: 414- 425.
• Roehrdanz, R. L., 1996. RAPD-PCR With Parasitic Hymenoptera. In: Methods in Molecular Biology, Species Diagnostics Protocols. (Ed J. P. Clapp) Humana Pres Inc., Totowa, 50: 381-390.
• Rohlf, F., 1988. NTSYS-PC Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, Version 2.0. Exeter Publishing, Ltd., Setoukat, New York.
• Silva, I. S., J. Honda, F. M. Van Kan, J., Hu, L. Neto, B. Pintureau & R. Stouthamer, 1999. Molecular differentiation of five Trichogramma species occurring in Portugal. Biological Control, 16: 177-184.
• Sneath, P. H. A. & R. R. Sokal, 1963. Numerical Taxonomy: The Principles and Practice of Numerical Classification.
• nd Edn., WH Freeman and Co., San Francisco, CA., USA, 573 pp.