Copy Number Variation (CNV) in Cattle and Methods Used for CNV Determination

Abstract

In this study, the presence of Bovine Viral Diarrhoea Virus (BVDV) was investigated by serologic andvirologic methods in dairy cattle enterprises where aborts occur. Study materials include 602 blood samples taken fromaborted cows and 241 tissue samples taken from waste fetus samples (abortion/stillborn fetus) admitted to the ControlInstitute of Veterinary Medicine (Elazığ) from dairy cattle enterprises where abort cases were seen in Elazığ, Malatyaand Bingöl between September 2011 and April 2012. The lung, liver, spleen and brain tissue samples taken fromaborted fetus and blood serum samples were tested by ELISA. With regard to BVDV antibodies, the serum bloodsamples were founded to be positive in 70.76% (426/602) in total. Thisratio was determined as 76.11% (137/180),56.25% (18/32), 69.48% (271/390) in Elazığ, Malatya and Bingöl provinces, respectively.The prevalence of BVDVantigen in the tissue samples of aborted fetuses was detected as 28.63% (69/241) in total, 25.75% (17/66) in Elazığ,36.36% (4/11) in Malatya and 29.26% (48/164) in Bingöl.As a result, in aborted dairy cows in Elazığ, Malatya and Bingöl, antigens and antibodies have been reported to highseroprevalance. It was noted that in order to reduce economic losses due to this virus, there should be emphasis onpreventive measures.

Keywords

• Abortion, BVDV, dairy cattle, ELISA

Sığırlarda Kopya Sayısı Değişimleri (KSD) ve KSD Belirlemede Kullanılan Yöntemler

Abstract

Bu çalışmada, yavru atma olaylarının görüldüğü süt sığırı işletmelerinde Bovine Viral Diarrhoea Virus (BVDV)’unvarlığı serolojik ve virolojik olarak araştırıldı. Çalışma materyalini, Eylül 2011 ile Nisan 2012 ayları arasında Elazığ,Malatya ve Bingöl illerinde yavru atma olaylarının görüldüğü süt sığırı işletmelerinden Elazığ Veteriner KontrolEnstitüsüne gönderilen 602 adet inek kan serumu ile 241 adet atık numunesinden (abort/ölü doğmuş fötüsden) alınandoku örnekleri oluşturdu. Fötüse ait akciğer, karaciğer, dalak ve beyin doku örneklerinden hazırlanan doku ekstraktlarıile kan serumu örnekleri ELISA testi ile incelendi. Kan serumu örneklerinde BVDV antikorları yönünden genel toplamda%70.76 (426/602) belirlenirken Elazığ ilinde %76.11 (137/180), Malatya ilinde %56.25 (18/32) ve Bingöl ilinde %69.48(271/390) oranında pozitiflik tespit edildi. Atık numune örneklerinin ise toplamda ve illerde sırasıyla %28.63 (69/241),%25.75 (17/66), %36.36 (4/11) ve %29.26 (48/164) oranında BVDV antijenleri yönünden pozitif olduğu belirlendi.Sonuç olarak Elazığ, Malatya ve Bingöl bölgesinde atık yapmış süt ineklerinde BVDV antijen ve antikorlarının yüksekseroprevalansa sahip olduğu ve bu virusa bağılı ekonomik kayıpların önlenmesi için koruyucu tedbirlere önem verilmesi gerektiği düşünülmektedir.

Keywords

• BVDV, ELİSA, süt sığırı, yavru atma

References

1. Batmaz H. Sığırların İç Hastalıkları. Semptomdan Tanıya Tanıdan Tedaviye. Genişletilmiş İkinci Baskı. Bursa: F Özsan Mat San ve Tic Ltd Şti, 2010; pp. 308-12.
2. Beaudeau F, Belloc C, Seegers H, Assie S, Sellal E, Joly A. Evaluation of a blocking ELISA forthe detection of bovine viral diarrhoea virus (BVDV) antibodies in serum and milk. Vet Microbiol 2001; 80: 329-37.
3. Björkman C, Alenius S, Manuelsson U, Uggla A. Neosporacaninum and bovine viral diarrhoea virus infections in Swedish dairy cows in relationtoabortion. Vet J 2000; 159: 201Buik-Rudan N, Cvetnic S, Madic J, Rudan D. Prevalence of antibodies to IBR and BVD viruses in dairy cows withre productive disorders. Theriogenology 1999; 51: 875-81.
4. Burgu İ, Alkan F, Yeşilbağ K. The prevalence of persistent BVD virus infection in cattle in Turkey. Ankara Üniv Vet Fak Derg 1999; 46: 169Duong MC, Alenius S, Huong LTT, Björkman C. Prevalance of Neosporacaninum and bovine viral diarrhoea virus in dairy cows in Southern Vietnam. Vet J 2008; 175(3): 390-4. Garcia-Perez AL, Miguijon E, Barandika JF, Aduriz G, Povedano I, Juste RA, Hurtado A. Detection of border disease virus in fetuses, stillbirths, and newborn lambs from natural and experimental infections. J Vet Diagn Invest 2009; 21(3): 331-7.
5. Hilbe M, Stalder H, Peterhans E, Haessig M, Nussbaumer M, Egli C, Schelp C, Zlinszky K, Ehrensperger F. Comparison of five diagnostic methods for detecting bovine viral diarrhea virus infection in calves. J Vet Diagn Invest 2007; 19(1): 28-34.
6. İssi M, Gülaçtı İ, Kızıl Ö, Karapınar T, Bulut H, Gül Y. The mucosal disease cases observed in our clinic and confirmed with reverse transcription – polymerase chain reaction (RT - PCR). Fırat Üniv Sağlık Bil Derg 2006; 20 (3): 253-8.
7. Kalaycı Ş. SPSS Uygulamalı Çok Değişkenli İstatistik Teknikleri. İkinci Baskı, Ankara: Asil Yayın, 2006.
8. Kayacan G. Konya ve Çevresinde Bulunan Süt Sığırcılığı İşletmelerindeki Hayvanlara Ait Kan ve Süt Serumlarında Bovine Viral Diarrhoea Virus (BVDV)’una Karşı Oluşan Antikorların ELİSA ile Araştırılması. Yüksek Lisans Tezi. Selçuk Üniv. Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Konya-Türkiye, 2008.

9. Lee DH, Park SW, Choi EW, Lee CW. Investigation of the prevalence of bovine viral diarrhoea virus in dairy cows in South Korea. Vet Rec 2008; 162: 211-3.
10. Mainar-Jaime RC, Berzal-Herranz B, Arias P, Rojo-Vazquez FA. Epidemiological pattern and risk factors associated with bovine viral diarrhoea virus (BVDV) infection in a nonvaccinated dairy cattle population from the Asturias region of Spain. Prev Vet Med 2001; 52: 63-73.
11. Nettleton PF, Gilray JA, Russo P, Dlissi E. Border disease of sheep and goats. Vet Res 1998; 29(3-4): 327-40.
12. Niza-Ribeiro J, Pereira A, Souza J, Maderia H, Barbosa A, Afonso C. Estimated BVDV prevalence, -control and- vaccine use in dairy herds in Northern Portugal. Prev Vet Med 2005; 72: 81-5.
13. Ok M. Bovine viral diyare mukozal hastalığı. Cebecioğlu A. Ed. In: Ruminantlarda Yaz Sorunları Beslenme ve Hastalıkları. İstanbul: İnfovet, 2010; pp. 72-80.
14. Özel M. Yeni Doğan Buzağılarda ve Annelerinde Infectious Bovine Rhinotracheitis (IBR) ve Bovine Viral Diarrhoea (BVD) Enfeksiyonlarının Serolojik Olarak Araştırılması. Yüksek Lisans Tezi. Afyon Kocatepe Üniv. Sağlık Bilimleri Enstitüsü, AfyonTürkiye, 2008.
15. Radostits OM, Gay CC, Hinchcliff KW, Constable PD. Veterinary Medicine. Tenth Edition. Edinburgh, London, New York, Oxford, Philadelphia, St Louis, Sydney, Toronto: Saunders Elsevier, 2008; pp. 1248
16. Siegwart N, Hilbe M, Hassig M, Braun U. Increased risk of BVDV infection of calves from pregnant dams on communal Alpine pastures in Switzerland. Vet J 2006; 172: 386
17. Smith BP. Large Animal Internal Medicine. Fourth Edition. St Louis, Missouri: Mosby Elsevier, 2009; pp. 791-8.
18. Solis-Calderon JJ, Segura-Correa VM, Segura-Correa JC. Bovine viral diarrhoea virus in beef cattle herds of Yucatan, Mexico: seroprevalence and risk factors. Prev Vet Med 2005; 72: 253-62.
19. Stahl K, Rivera H, Vagsholm I, Moreno-Lopez J. Bulk milk of testing for antibody seroprevalences to BVDV and BHV-1 in a rural region of Peru. Prev Vet Med 2002; 56: 193-20
20. Tan TM, Karaoğlu T, Erol N, Yıldırım Y. Serological and virological investigations of bovine viral diarrhoea virus (BVDV) infection in dairy cattle herds in Aydın province. Turk J Vet Anim Sci 2006; 30: 299-4.
21. Yan L, Zhang S, Pace L, Wilson F, Wan H, Z h a n g M . C o m b i n a t i o n o f reverse transcription real-time polymerase chain reaction and antigen capture enzyme-linked immunosorbent assay for the detection of animals persistently infected with bovine viral diarrhea virus. J Vet Diagn Invest 2011; 23(1): 16-25.
22. Yıldırım Y, Burgu İ. The seroprevalence of bluetongue (BT), IBR, PI-3, EBL and BVD infections in cattle in northeastern Anatolia. Ankara Üniv Vet Fak Derg 2005; 52: 113-7.
23. Correspondence Address : Doç. Dr. Mustafa İSSİ Fırat Üniversitesi Veteriner Fakültesi, İç Hastalıkları Anabilim Dalı, 23119, Elazığ, TÜRKİYE Tel: [phone] / 3874
24. E-posta: [e-mail]