Asma Ur Hastalığı Etmeni Rhizobium vitis’in Tokat İli Bağlarında Bulunma Oranı ve Tanılanması

Abstract

Bu çalışma, Tokat ili bağlarında asma ur hastalığının bulunma oranının belirlenmesi ve hastalık etmeni Rhizobium vitis’in tanılanması amacıyla yapılmıştır. 2015 yılında Haziran-Eylül aylarında Tokat ili Merkez, Pazar, Turhal, Zile, Erbaa ve Niksar ilçelerinde bulunan bağlarda sürvey çalışmaları yapılmıştır. Toplanan hastalıklı bitki örneklerinden elde edilen izolatlar Gram reaksiyon, Oksidaz, PDA+CaCO₃ ve %2 NaCl besi yerinde gelişme, Demir amonyum sitrat kullanımı gibi klasik bakteriyolojik tanılama testler ve moleküler (PCR) analizler ile tanılanmışlardır. Yapılan sürvey çalışmalarında 2015 yılında 6 ilçede, 49 köydeki 238 bağda tarama yapılmış ve 23 köyde 42 bağdan toplam 297 adet örnek toplanmıştır. Hastalıklı omcalardaki urlu dokulardan toplam 150 adet bakteri izole edilmiştir. Klasik bakteriyolojik tanılama ve PCR analizi testlerine göre 44 adet izolat Rhizobium spp. olarak, 34 tane izolat ise Rhizobium vitis olarak tanılanmıştır. İlçeler bazında hastalığın bulunma oranına bakıldığında %30 oran ile en yüksek bulaşıklık Turhal ilçesinde belirlenmiştir. Bunu sırasıyla %14,81 oranı ile Zile, %12,34 ile Erbaa, %11,26 bulaşıklık oranı ile Niksar takip etmiştir. Tokat Merkez’de %7,24’lük bir bulaşıklık tespit edilirken, Pazar ilçesinden toplanan örneklerde hastalık etmenine rastlanılmamıştır. Elde edilen sonuçlar doğrultusunda, Tokat ilinde asmalarda Rhizobium vitis ile bulaşıklığın %75,65’lik bir bulunma oranı ile büyük bir öneme sahip olduğu görülmüştür.

Keywords

• Vitis vinifera,Rhizobium vitis,asma ur,TOKAT

References

1. Abolmaaty, A., Vu, C., Oliver, J.., Levin, R.E., 2000. Development of a New Lysis Solution for Releasing Genomic DNA from Bacterial Cells for DNA Amplification by Polymerase Chain Reaction. Microbios, 101: 181-189.
2. Altınparmak, S., Baştaş, K.K., 2011. Konya İlinde Yaygın Olarak Yetiştirilen Asma Çeşitlerinde Bakteriyel Taç Uru (Agrobacterium Vitis)’nun Tanılanması Üzerine Araştırmalar. Selçuk Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi, 25(1):115-124.
3. Anonim, 2015. Tokat İl Gıda Tarım ve Hayvancılık Müdürlüğü Bitkisel Üretim Kayıtları.
4. Anonim, 2016. http://www.tarim.gov.tr/sgb/Belgeler/SagMenuVeriler/BUGEM.pdf, Erişim tarihi:1 Mayıs 2016
5. Argun, N., 2001. Orta Anadolu Bağlarında Taç Uru’na Neden Olan Agrobacterium vitis’in Bölgesel Dağılımı ve Bazı Biyolojik Özellikleri Üzerine Araştırmalar. Doktora Tezi, Ankara Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 84 s.
6. Argun, N., Momol, M.T., Maden, S., Momol, E.A., Reid, C.L., Çelik, H., Burr, T., 2002. Characterization of Agrobacterium Vitis Strains Isolated from Turkish Grape Cultivars in the Central Anatolia region. Plant Disease, 86, 162-166.
7. Cangi, R., Kaya, C., Kılıç, D., Yıldız, M., 2005. Tokat Yöresinde Salamuralık Asma Yaprak Üretimi, Hasad ve İşlemede Karşılaşılan Sorunlar ve Çözüm Önerileri. 6. Ulusal Bağcılık Sempozyumu, Bildiri Kitabı, Cilt:2, 632-640, Tekirdağ, 19-23 Eylül 2005.
8. Canik-Orel, D., Karagoz, A., Durmaz, R., Ertunc, F., 2016. Phenotypic and Molecular Characterization of Rhizobium vitis Strains from Vineyards in Turkey. Phytopathologia Mediterranea, 55 (1), 41-53.

9. Cavara, F., 1897. Tubercolosi Della Vite. Intorno Alla Eziologyia De Alcune Malattie Di Piante Colvivate. Stazoni Sperimentali Agrarie Italiane, 30,483-487.
10. Çelik, H., Kunter, B., Söylemezoğlu, G., Ergül, A., Çelik, H., Karataş, H., Özdemir, G., Atak, A., 2010. Bağcılığın Geliştirilmesi Yöntemleri ve Üretim Hedefleri, Tzm Vii. Teknik Kongresi 11-15 Ocak, 2010. Ankara 493-513.
11. S Eastwell, K.C., Wills, L.G., Cavileer, T..D., 1995. A Rapid and Sensitive Method to Detect Agrobacterium Vitis in Grapevine Cuttings Using the Polymerase Chain Reaction. Plant Disease, 79, 822-827.
12. Eşitken, A., Pırlak, L., Kara, Z., Bayramoğlu, Z., Sabır, A., 2012. Konya ili Meyvecilik ve Bağcılık Eylem Planı”. T.C. Mevlana Kalk. Ajansı Konya, 81s.
13. FAO, 2015. www.faostat.org. Erişim tarihi 5 Mayıs 2016
14. Haas, J.H., Moore, L.W., Ream, W., Manulis, S., 1995. Universal PCR Primers for Detection of Phytopathogenic Agrobacterium Strains. Applied and Environmental Microbiology, 61: 2879-2884.
15. Ignatov, A., Khodykina, M.V., Vinogradova, S.V., Polityko, V.A., Kornev, K.P., Mazurin, E. S., 2015. First Report of Agrobacterium vitis Causing Crown Galls of Wine Grape in Russia. Plant Disease, 100 (4).
16. Kılıç, D., Cangi, R., Kaya, C., 2007. Tokat’ta Üzümün Değerlendirilmesi ve Üzümden Elde Edilen Ürünler, 5. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi, Kongre Kitabı, Cilt 2: 345-348, Erzurum, 4-7 Eylül 2007.
17. Kovacs, N., 1956. Identification of Pseudomonas pyocyoanea by the Oxidase Reaction. Nature (London), 178, 703.
18. Küsek, M., 2007. Asmada (Vitis vinifera L.) Ura Neden Olan Agrobacterium vitis’in Tanılanması ve Mücadele Olanaklarının Araştırılması., Doktora Tezi. Çukurova Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 103 s.
19. Küsek, M., Aysan, Y., 2008. Asmada Ur Hastalığı, Crown Gall of Grapevine, Agrobacterium vitis. Bitki Bakteri Hastalıkları Kitabı (Saygılı, H., Şahin, F., Aysan, Y.), sayfa 41.
20. Mohammadi, M., Fatehi-Peykani, R., 1999. Phenotypical Characterization of Iranian Isolates of Agrobacterium Vitis, the Causal Agent of Crown Gall Disease of Grapevine. Vitis 38 (3), 115-121.
21. Moore, L.W., Bouzar, H., Burr, T.J., 2001. Gram Negative Bacteria, Agrobacterium. Laboratory Guide For Identification of Plant Pathogenic Bacteria (Schaad, N.W., Jones, J.B., Chun, W.) APS Pres, 373 p.
22. Ophel, K., Kerr, A., 1990. Agrobacterium vitis sp. Nov. For Strains of Agrobacterium Biovar 3 From Grapevines. International Journal of Systematic Bacteriology, 40, 236-241.
23. Sands DC. 1990. Physiological Criteria: Determinative Tests. In: Klement Z, Rudolph K, & Sands DC (eds.). Methods in Phytobacteriology. pp. 133– 143. Akademiai Kiado, Budapest
24. Saygılı, H., Aysan, Y., Şahin, F., Soylu, S., Mirik, M., Kotan, R., 2014. Fitobakteriyoloji I Kitabı. sayfa 66.
25. Topçu, N., Sucu, S., Cangi, R., Yağcı, A., Kılıç, D., 2013. Tokat Bölgesinde Yetiştirilen Narince Üzüm Çeşidinde 2012 Kış Soğuklarının Yol Açtığı Zararlar. Selçuk Tarım ve Gıda Bilimleri Dergisi Cilt :27, 413-419 (Özel sayı)
26. Young, J.M., Kuykendall, L.D., Martınez-Romero, E., Kerr, A., Sawada, H., 2001. A Revision of Rhizobium Frank 1889, With an Emended Description of The Genus, and the Inclusion of All Species of Agrobacterium Conn 1942 and Allorhizobium undicola de Lajudie et al. 1998 as New Combinations: Rhizobium radiobacter, R. rhizogenes, R. rubi, R. undicola and R. vitis. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 51, 89–103.