BibTex RIS Cite

Two Different Population of Clarias gariepinus searched for Genetic polymorphism

Year 2011, Volume: 31 Issue: 1, 261 - 271, 01.03.2011

Yasemin Kaçar Ayşe Kılınç

Abstract

In this present study, individuals of two different cultuvates of Clarias gariepinus species living in the Orontes river of Hatay regoin and Göksu river of Mersin region were genetically analized. Genomic DNA microsatellite loci Cga01, Cga02, Cga05, Cga06, Cga09 and Cga10 were separately amplified and compared. Cga01 and Cga02 loci amplification resulted in approximately 100 bp DNA fragment; for Cga05 and Cga09 loci app. 200bp; for Cga06 and Cga10 loci 150bp DNA fragment were obtained. DNA length polimorfism for all analyzed microsatellite loci did not show any difference.

Keywords

Clarias gariepinus Microsatellite loci Orontes and Göksu River PCR.

References

  • Agnese, J. F., Teugels, G. G., Galbusera, P., Guyomard, R., Volckaert, F. (1997). Morphometric and Genetic Characterization of Sympatric Populations of Clarias gariepinus and C. anguillaris from Senegal. J. Fish Biol., 50, 1143–1157
  • Agnese, J. F., Teugels, G. G. (2005). Insight Into the Phylogeny of African Clariidae (Teleostei, Siluriformes): Implications for Their Body Shape Evolution, Biogeography and Taxonomy. Mol. Phylogenet. Evol., 36, 546-553.
  • Ergene, S. (1994). Silifke Akgöl-Paradeniz Dalyanında Yaşayan Bazı Ekonomik Balık Türlerinin Büyüme Oranları, Üreme ve Beslenme Özellikleri. Doktora Tezi, Gazi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Ankara, 207
  • Ergene, S., Yalcın, S. ve Karahan, A. (1998). İki Farklı Lokalitede Yaşayan Clarias lazera`nın (Valeciennes, 1840) Metrik ve Meristik Karakter Değişimi Üzerine Ön Çalışma. III. Su Ürünleri Sempozyumu, Erzurum, 569-574.
  • Ergene, S., Portakal, E. ve Karahan, A. (1999). Karyological Analysis and Body Proportion of Catfish (Clariidae, Clarias lazera, Valenciennes, 1840) in the Göksu Delta, Turkey. Tr. J. Zoology, 23, 423-426.
  • Galbusera, P., Volckaert, F. A., Hellemans, B., Ollevier, F. (1996). Isolation and Characterization of Microsatellite Markers in the African Catfish Clarias gariepinus (Burchell, 1822). Molecular Ecology, 5, 703-705.
  • Geldiay, R. ve Balık, S. (1996). Türkiye Tatlısu Balıkları. İzmir: E.Ü. Su Ürünleri Fakültesi Yayınları. sf. 410.
  • Kosswig, C. (1969). New Contributions to the Zoogeography of Fresh Water Fish of Asia Minor, Based on Collections Made Between 1964-1967. Israel Journal of Zoology, 18, 249-254.
  • Kuru, M. (1978). The Freshwater Fish of South-Eastern Turkey 2 (Euphrates_Tigris System). Hacettepe Bulletin of Natural Sciences and Engineiring, 7-8, 105-114.
  • Kuru, M. (1980). Türkiye Tatlı Su Balıkları Katalogu. Hacettepe Üniversitesi, Fen Fakültesi Yayınları Yardımcı Kitaplar Dizisi-1, 73.
  • Kuru, M. (2004). Türkiye İçsu Balıklarının Son Sistematik Durumu. Gazi Eğitim Fakültesi Dergisi, 24(3), 1-21.
  • Küçük, F., Gümüş, E., Gülle, İ. and Güçlü, S. S. (2007). The Fish Fauna of the Göksu River (Türkiye): Taxonomic and Zoogeographic Features. Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 7, 53-63.
  • O'connell, M. and Wright J. M. (1997). Microsatellite DNA in fishes. Reviews in Fish Biology and Fisheries 7, 331-363.
  • Ozout Costaz, C., Teugels, G. G. and Legendre, M. “Karyological Analysis of Three Strains of the African Catfish, Clarias gariepinus (Clariidae) Used in Aquaculture”, Aquaculture, 87, 271-277 (1990)
  • Skelton, P., Teugels, G. (1992). Neotype Description for the African catfish Clarias gariepinus (Burchell, 1822) (Pisces: Siluroidei: Clariidae). Ichthyological Bulletin of the J. L. B. Smith Institute of Ichthyology, 56, 1-8.
  • Teugels, G. G. (1996). Taxonomy, Phylogeny and Biogeography of Catfishes (Ostariophysi, Siluroidei): An Overview. Aquat. Living Resource, 9, 9-34.

Clarias gariepinusun İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması

Year 2011, Volume: 31 Issue: 1, 261 - 271, 01.03.2011

Yasemin Kaçar Ayşe Kılınç

Abstract

Bu çalışmada Hatay bölgesinde yer alan Asi ve Mersin bölgesinde Göksu Nehir\'lerinde yetiştiriliciliği yapılan Clarias gariepinus bireylerinin genetik polimorfizmi araştırıldı. Mikrosatellit lokuslar Cga01, Cga02, Cga05, Cga06, Cga09 ve Cga10 ayrı ayrı PZR ile çoğaltılarak karşılaştırıldı. Cga01 ve Cga02 lokusları için yaklaşık 100 bp; Cga05 ve Cga09 lokusları için yaklaşık 200bp; Cga06 ve Cga10 lokusları için yaklaşık 150bp uzunluğunda DNA bantları elde edildi. Araştırılan mikrosatellit lokuslarının Asi ve Göksu bireyleri arasında DNA uzunluğu bakımından bir farklılık göstermediği bulundu.

Keywords

Clarias gariepinus Mikrosattelit lokus Asi ve Göksu Nehri PZR.

References

  • Agnese, J. F., Teugels, G. G., Galbusera, P., Guyomard, R., Volckaert, F. (1997). Morphometric and Genetic Characterization of Sympatric Populations of Clarias gariepinus and C. anguillaris from Senegal. J. Fish Biol., 50, 1143–1157
  • Agnese, J. F., Teugels, G. G. (2005). Insight Into the Phylogeny of African Clariidae (Teleostei, Siluriformes): Implications for Their Body Shape Evolution, Biogeography and Taxonomy. Mol. Phylogenet. Evol., 36, 546-553.
  • Ergene, S. (1994). Silifke Akgöl-Paradeniz Dalyanında Yaşayan Bazı Ekonomik Balık Türlerinin Büyüme Oranları, Üreme ve Beslenme Özellikleri. Doktora Tezi, Gazi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Ankara, 207
  • Ergene, S., Yalcın, S. ve Karahan, A. (1998). İki Farklı Lokalitede Yaşayan Clarias lazera`nın (Valeciennes, 1840) Metrik ve Meristik Karakter Değişimi Üzerine Ön Çalışma. III. Su Ürünleri Sempozyumu, Erzurum, 569-574.
  • Ergene, S., Portakal, E. ve Karahan, A. (1999). Karyological Analysis and Body Proportion of Catfish (Clariidae, Clarias lazera, Valenciennes, 1840) in the Göksu Delta, Turkey. Tr. J. Zoology, 23, 423-426.
  • Galbusera, P., Volckaert, F. A., Hellemans, B., Ollevier, F. (1996). Isolation and Characterization of Microsatellite Markers in the African Catfish Clarias gariepinus (Burchell, 1822). Molecular Ecology, 5, 703-705.
  • Geldiay, R. ve Balık, S. (1996). Türkiye Tatlısu Balıkları. İzmir: E.Ü. Su Ürünleri Fakültesi Yayınları. sf. 410.
  • Kosswig, C. (1969). New Contributions to the Zoogeography of Fresh Water Fish of Asia Minor, Based on Collections Made Between 1964-1967. Israel Journal of Zoology, 18, 249-254.
  • Kuru, M. (1978). The Freshwater Fish of South-Eastern Turkey 2 (Euphrates_Tigris System). Hacettepe Bulletin of Natural Sciences and Engineiring, 7-8, 105-114.
  • Kuru, M. (1980). Türkiye Tatlı Su Balıkları Katalogu. Hacettepe Üniversitesi, Fen Fakültesi Yayınları Yardımcı Kitaplar Dizisi-1, 73.
  • Kuru, M. (2004). Türkiye İçsu Balıklarının Son Sistematik Durumu. Gazi Eğitim Fakültesi Dergisi, 24(3), 1-21.
  • Küçük, F., Gümüş, E., Gülle, İ. and Güçlü, S. S. (2007). The Fish Fauna of the Göksu River (Türkiye): Taxonomic and Zoogeographic Features. Turkish Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 7, 53-63.
  • O'connell, M. and Wright J. M. (1997). Microsatellite DNA in fishes. Reviews in Fish Biology and Fisheries 7, 331-363.
  • Ozout Costaz, C., Teugels, G. G. and Legendre, M. “Karyological Analysis of Three Strains of the African Catfish, Clarias gariepinus (Clariidae) Used in Aquaculture”, Aquaculture, 87, 271-277 (1990)
  • Skelton, P., Teugels, G. (1992). Neotype Description for the African catfish Clarias gariepinus (Burchell, 1822) (Pisces: Siluroidei: Clariidae). Ichthyological Bulletin of the J. L. B. Smith Institute of Ichthyology, 56, 1-8.
  • Teugels, G. G. (1996). Taxonomy, Phylogeny and Biogeography of Catfishes (Ostariophysi, Siluroidei): An Overview. Aquat. Living Resource, 9, 9-34.
There are 16 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Journal Section Articles
Authors

Yasemin Kaçar This is me

Ayşe Kılınç This is me

Publication Date March 1, 2011
Published in Issue Year 2011 Volume: 31 Issue: 1

Cite

APA Kaçar, Y., & Kılınç, A. (2011). Clarias gariepinusun İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması. Gazi Üniversitesi Gazi Eğitim Fakültesi Dergisi, 31(1), 261-271.
AMA Kaçar Y, Kılınç A. Clarias gariepinusun İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması. GUJGEF. March 2011;31(1):261-271.
Chicago Kaçar, Yasemin, and Ayşe Kılınç. “Clarias Gariepinusun İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması”. Gazi Üniversitesi Gazi Eğitim Fakültesi Dergisi 31, no. 1 (March 2011): 261-71.
EndNote Kaçar Y, Kılınç A (March 1, 2011) Clarias gariepinusun İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması. Gazi Üniversitesi Gazi Eğitim Fakültesi Dergisi 31 1 261–271.
IEEE Y. Kaçar and A. Kılınç, “Clarias gariepinusun İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması”, GUJGEF, vol. 31, no. 1, pp. 261–271, 2011.
ISNAD Kaçar, Yasemin - Kılınç, Ayşe. “Clarias Gariepinusun İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması”. Gazi Üniversitesi Gazi Eğitim Fakültesi Dergisi 31/1 (March 2011), 261-271.
JAMA Kaçar Y, Kılınç A. Clarias gariepinusun İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması. GUJGEF. 2011;31:261–271.
MLA Kaçar, Yasemin and Ayşe Kılınç. “Clarias Gariepinusun İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması”. Gazi Üniversitesi Gazi Eğitim Fakültesi Dergisi, vol. 31, no. 1, 2011, pp. 261-7.
Vancouver Kaçar Y, Kılınç A. Clarias gariepinusun İki Farklı Populasyonunda Genetik Polimorfizimin Araştırılması. GUJGEF. 2011;31(1):261-7.