Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması

Arif Parmaksız; Burçak Ateş; Şahin Toprak

Investigation of Usefulness of DNA Microsatellite Markers in Some Carp Species

Year 2016, Volume: 5 Issue: 1, 1 - 4, 01.01.2016

Abstract

In this study; application of different microsatellite markers were investigated for three species (Capoeta trutta
(Heckel, 1843), Barbus luteus (Heckel, 1843) ve Cyprinion macrostomus (Heckel, 1843)) belonging to Cyprinidae family.
Taking muscle tissue from the fishes that are caught from the Euphrates and Tigris rivers system, DNA extraction was
performed by using kits. Then, the usefullness of Polymerase Chain Reaction (PCR) system was searched by using eight
microsatellite markers (MFW-1, CyPG3, CyPG8, SarN7G5, Barbus27, Barbus31, Barbus33, Barbus50). The PCR products were
then obtained in four of them (MFW-1 CyPG3, Barbus27, Barbus3) by amplification. The fragment analysis of the resulting
products were performed by capillary electrophoresis in order to identify te alleles of individuals. As a result, it is possible to
benefit from these four microsatellite markers in genetic diversity studies.

Keywords

Capoeta, Barbus, Cyprinion, microsatellite, polymorphism, PCR

Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması

Year 2016, Volume: 5 Issue: 1, 1 - 4, 01.01.2016

Arif Parmaksız Burçak Ateş Şahin Toprak

Abstract

Bu çalışmada; Cyprinidae familyasına ait üç tür (Capoeta trutta (Heckel, 1843), Barbus luteus (Heckel, 1843) ve
Cyprinion macrostomus (Heckel, 1843)) için farklı mikrosatellit markörlerin çalışma durumu araştırılmıştır. Fırat ve Dicle
nehir sistemlerinden yakalanan balık örneklerinden kas dokusu alınarak DNA izolasyonu kit ile yapılmıştır. Daha sonra sekiz
mikrosatellit markör (MFW-1, CyPG3, CyPG8, SarN7G5, Barbus27, Barbus31, Barbus33, Barbus50) kullanılarak Polimeraz
Zincir Reaksiyonu (PZR) sisteminin kullanılabilirliği çalışılmıştır. Bu markörlerden dört tanesinde (MFW-1, CyPG3, Barbus27,
Barbus31) hibridizasyon (eşleşme) sağlanarak PZR ürünü elde edilmiştir. Oluşan ürünler kapiller elektroforez ile fragman
analizi yapılarak bireylerin allelleri tespit edilmiştir. Sonuç olarak; genetik çeşitlilik çalışmalarında bu dört mikrosatellit
markörden yararlanmak mümkündür.

Keywords

Capoeta, Barbus, Cyprinion, mikrosatellit, polimorfizm, PZR

There are 0 citations in total.

Details

Other ID	JA56CU48RZ
Journal Section	Research
Authors	Arif Parmaksız This is me Burçak Ateş This is me Şahin Toprak This is me
Publication Date	January 1, 2016
Submission Date	January 1, 2016
Published in Issue	Year 2016 Volume: 5 Issue: 1

Cite

APA	Parmaksız, A., Ateş, B., & Toprak, Ş. (2016). Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması. Harran Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, 5(1), 1-4.
AMA	Parmaksız A, Ateş B, Toprak Ş. Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması. Harran Univ Vet Fak Derg. January 2016;5(1):1-4.
Chicago	Parmaksız, Arif, Burçak Ateş, and Şahin Toprak. “Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması”. Harran Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 5, no. 1 (January 2016): 1-4.
EndNote	Parmaksız A, Ateş B, Toprak Ş (January 1, 2016) Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması. Harran Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 5 1 1–4.
IEEE	A. Parmaksız, B. Ateş, and Ş. Toprak, “Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması”, Harran Univ Vet Fak Derg, vol. 5, no. 1, pp. 1–4, 2016.
ISNAD	Parmaksız, Arif et al. “Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması”. Harran Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi 5/1 (January 2016), 1-4.
JAMA	Parmaksız A, Ateş B, Toprak Ş. Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması. Harran Univ Vet Fak Derg. 2016;5:1–4.
MLA	Parmaksız, Arif et al. “Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması”. Harran Üniversitesi Veteriner Fakültesi Dergisi, vol. 5, no. 1, 2016, pp. 1-4.
Vancouver	Parmaksız A, Ateş B, Toprak Ş. Bazı Sazan Türlerinde Mikrosatellit DNA Markörlerinin Kullanılabilirliğinin Araştırılması. Harran Univ Vet Fak Derg. 2016;5(1):1-4.