Akut lenfoblastik lösemi hastalarında t(12;21) TEL-AML1 translokasyonunun gerçek zamanlı qRT-PZR ile 5 yıllık sonuçlarının değerlendirilmesi

Year 2016, Volume: 2 Issue: 3, 181 - 185, 01.09.2016

Nur Selvi Günel , Burçin Tezcanlı Kayma Vildan Bozok Çetintaş Aslı Tetik Vardarlı Sunde Yılmaz Süslüer Duygu Aygüneş Ayşegül Dalmizrak Çağdaş Aktan Ali Şahin Küçükaslan Tuğçe Balcı Çağla Kayabaşı Besra Özmen Yelken Çığır Biray Avcı Buket Kosova Zuhal Eroğlu Serap Aksoylar Nazan Çetingül Can Balkan Deniz Yılmaz Yeşim Aydınok Kaan Kavaklı Mahmut Töbü Murat Tombuloğlu Filiz Büyükkeçeci Fahri Şahin Güray Saydam Cumhur Gündüz

Abstract

Amaç: Bu çalışmada akut lenfoblastik lösemi (ALL) ön tanılı olgularda t(12;21) translokasyonu gerçek zamanlı kantitatif revers transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu (qRT-PZR) yöntemi kullanılarak kantite edildi.

Hastalar ve yöntemler: Ocak 2009 - Aralık 2013 tarihleri arasında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı’na başvuran 175 pediatrik ve 138 erişkin olmak üzere toplam 313 olguya ait kan ve kemik iliği örneklerinde t(12;22) (p13;q22) translokasyonu RNA sonuçları kantitatif olarak değerlendirildi. Olgulara ait 75 kan ve 484 kemik iliği örneklerinden total RNA veya haberci RNA izole edildi. RNA izolasyonlarının ardından tamamlayıcı DNA sentezi gerçekleştirildi. t(12;21) (p13;q22) translokasyon çalışması LightCycler t(12;21) Kit’i ile füzyon transkripte özgül biçimde tasarlanmış primer ve problarla (Way2Gene) uygun olacak şekilde gerçekleştirildi. Son adım olarak, t(12;21) translokasyon sonuçlarının kantitatif olarak değerlendirilmesi gerçek zamanlı qRT-PZR yöntemi kullanılarak LightCycler2 ile gerçekleştirildi.

Bulgular: Otuz dört pediatrik olgu örneğinde (%19) ve 17 erişkin olgunun örneğinde (%12) TEL-AML-1 (ETV6-RUNX1) pozitif bulundu. TEL-AML1 (ETV6-RUNX1) kantitasyon değeri ortalaması pediatrik olgularda 0.90±3.21, erişkin olgularda ise 0.34±1.20 olarak belirlendi.

Sonuç: Elde ettiğimiz veriler, gerçek zamanlı qRT-PZR yöntemi ile ALL hastalarında yeni tanı döneminde ve tedavi sürecinde t(12;21) translokasyonunun kantitatif tayininin hem tanının kesinleştirilmesinde hem de moleküler remisyon sağlanmasına yönelik tedaviyi yönlendirmesinde değerli bir yöntem olduğunu desteklemektedir.

Keywords

Akut lenfoblastik lösemi, polimeraz zincir reaksiyonu, revers transkriptaz

References

• Linka Y, Ginzel S, Krüger M, Novosel A, Gombert M, Kremmer E, et al. The impact of TEL-AML1 (ETV6-RUNX1) expression in precursor B cells and implications for leukaemia using three different genome- wide screening methods. Blood Cancer J 2013;3:151.
• Onciu M. Acute lymphoblastic leukemia. Hematol Oncol Clin North Am 2009;23:655-74.
• Borst L, Wesolowska A, Joshi T, Borup R, Nielsen FC, Andersen MK, et al. Genome-wide analysis of cytogenetic aberrations in ETV6/RUNX1-positive childhood acute lymphoblastic leukaemia. Br J Haematol 2012;157:476-82.
• Kantner HP, Warsch W, Delogu A, Bauer E, Esterbauer H, Casanova E, et al. ETV6/RUNX1 induces reactive oxygen species and drives the accumulation of DNA damage in B cells. Neoplasia 2013;15:1292-300.
• Zelent A, Greaves M, Enver T. Role of the TEL- AML1 fusion gene in the molecular pathogenesis of childhood acute lymphoblastic leukaemia. Oncogene 2004;23:4275-83.
• Stams WA, den Boer ML, Beverloo HB, Meijerink JP, van Wering ER, Janka-Schaub GE, et al. Expression levels of TEL, AML1, and the fusion products TEL-AML1 and AML1-TEL versus drug sensitivity and clinical outcome in t(12;21)-positive pediatric acute lymphoblastic leukemia. Clin Cancer Res 2005;11:2974-80.
• Costa O, Schneider P, Coquet L, Chan P, Penther D, Legrand E, et al. Proteomic profile of pre - B2 lymphoblasts from children with acute lymphoblastic leukemia (ALL) in relation with the translocation (12; 21). Clin Proteomics 2014;11:31.
• Iqbal Z. Molecular genetic studies on 167 pediatric ALL patients from different areas of Pakistan confirm a low frequency of the favorable prognosis fusion oncogene TEL-AML1 (t 12; 21) in underdeveloped countries of the region. Asian Pac J Cancer Prev 2014;15:3541-6.
• Fueller E, Schaefer D, Fischer U, Krell PF, Stanulla M, Borkhardt A, et al. Genomic inverse PCR for exploration of ligated breakpoints (GIPFEL), a new method to detect translocations in leukemia. PLoS One 2014;9:104419.
• Borowitz MJ, DiGiuseppe JA. Acute lymphoblastic leukemia. In: Knowles DM, editor. Neoplastic hematopathology. Philadelphia. Lippincott Williams & Wilkins; 2001. p. 1643-66.
• Knowles DM. Lymphoblastic lymphoma. In: Knowles DM, editor. Neoplastic hematopathology. Philadelphia: Lippincott Williams & Wilkin; 2001. p. 915-52.
• Yakut T, Gülten T. Çocukluk çağı lösemilerindeki genetik değiiklikler ve klinik önemi Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Dergisi 2005;31:57-66.
• Aksu Uzunhan T, Karaka Z. Çocukluk çağı akut lenfoblastik lösemisi. Çocuk Dergisi 2012;12:6-15.
• Seyfarth J, Madsen HO, Nyvold C, Ryder LP, Clausen N, Jonmundsson GK, et al. Post-induction residual disease in translocation t(12;21)-positive childhood ALL. Med Pediatr Oncol 2003;40:82-7.
• Stock W, Estrov Z. Studies of minimal residual disease in acute lymphocytic leukemia. Hematol Oncol Clin North Am 2000;14:1289-305.
• Salari F, Shahjahani M, Shahrabi S, Saki N. Minimal residual disease in acute lymphoblastic leukemia: optimal methods and clinical relevance, pitfalls and recent approaches. Med Oncol 2014;31:266.
• Szczepanski T. Why and how to quantify minimal residual disease in acute lymphoblastic leukemia? Leukemia 2007;21:622-6.
• Rahnemoon AR, Zaker F, Izadyar M, Ansari S, Poopak B, Tadavosyan Y. Prevalence of ETV6/ RUNX1 Fusion Gene in Pediatric Patients with Acute Lymphoblastic Leukemia in Iran. Iran J Pediatr 2013;23:681-6.
• Gandemer V, Rio AG, de Tayrac M, Sibut V, Mottier S, Ly Sunnaram B, et al. Five distinct biological processes and 14 differentially expressed genes characterize TEL/AML1-positive leukemia. BMC Genomics 2007;8:385.