Retrospective Evaluation of Covid-19 PCR Test Results and PCR Positive Patients in a Pandemic Hospital

Abstract

Aim: In this study, we aimed to retrospectively analyze the results of the polymerase chain reaction (PCR) test performed in our hospital and to investigate the rates of diagnosis and the rates of outpatients and inpatients.

Method: In this retrospective study, the Covid-19 polymerase chain reaction test results of the patients who were evaluated within the scope of the Covid-19 pandemic, who applied to our hospital in March 2020 and September 2020, were included. Age, gender, pneumonia status, symptomatic treatment, outpatient or inpatient follow-up, and discharge status of the patients were obtained retrospectively from the hospital records.

Results: A total of 5658 patients were included in the study. In our study, 2252 (39.8%) of the patients who underwent PCR tests were symptomatic, and 3406 (60.2%) were asymptomatic. 5280 (93.3%) patients were PCR negative and 378 (6.7%) patients were PCR positive. The PCR-positive patient had a recent travel history. Of the PCR-positive patients, 123 (33%) were hospitalized and treated. The remaining 249 (67%) patients were treated orally at home.

Conclusion: Polymerase chain reaction test is the gold standard method in the diagnosis of Covid-19. Appropriate collection and handling of samples may affect test positivity rates. It is important to know the local and national PCR rates to take the necessary measures in the management and prevention of epidemics.

Keywords

• retrospective
• sarsCOV-2
• polymerase chain reaction
• COVID-19

Bir Pandemi Hastanesinin Covid-19 PCR Test Sonuçlarının ve PCR Pozitif Hastalarının Retrospektif İrdelenmesi

Abstract

Amaç: Bu çalışmada hastanemizde yapılan polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) testi sonuçlarını retrospektif olarak inceleyip tanı koyma oranlarımızı, ayaktan ve yatarak takip ettiğimiz hastaların oranlarını araştırmayı amaçladık.

Yöntem: Bu retrospektif çalışmada, Mart 2020 ve Eylül 2020 aylarında hastanemize başvuran Covid-19 pandemi kapsamında değerlendirilen hastaların Covid-19 polimeraz zincir reaksiyonu testi sonuçları dahil edildi. Hastalara ait yaş, cinsiyet, pnömoni durumu, semptomatik olması, verilen tedavi, ayaktan veya hastanede takip edilmesi ve hastanede yatırılanların taburculuk durumları retrospektif olarak hastane kayıtlarından elde edilmiştir.

Bulgular: Çalışmaya toplam 5658 hasta dâhil edildi. Çalışmamızda PCR testi yapılan hastaların 2252’si (%39,8) semptomatik olup 3406’sı (%60,2) asemptomatikti. 5280 (%93,3) hasta PCR negatif, 378(%6.7) hasta PCR pozitifti. PCR pozitif hastanın yakın zamanlı seyahat öyküleri mevcuttu. PCR pozitif hastaların 123’ünün (%33) hastanede yatırılarak tedavi edildi. Kalan 249(%67) hasta evde oral tedavi edildi.

Sonuç: Polimeraz zincir reaksiyonu testi Covid-19 tanısında altın standart yöntemdir. Örneklerin uygun şekilde alınması ve taşınması testin pozitiflik oranlarını etkileyebilmektedir. Salgınların yönetilmesinde ve önlenmesinde gerekli önlemlerin alınması adına yerel ve ulusal pcr oranlarının bilinmesi önem arz etmektedir. 

Keywords

• COVID-19
• SARS-CoV-2
• polimeraz zincir reaksiyonu testi

References

1. T.C. Sağlık Bakanlığı. T.C. Sağlık Bakanlığı Halk Sağlığı Genel Müdürlüğü Covid-19 (Sars-Cov-2 Enfeksiyonu) Genel Bilgiler, Epidemiyoloji ve Tanı. T.C. Sağlık Bakanlığı Covid-19 Bilgilendirme Platformu. T.C. Sağlık Bakanlığı. https://covid19.saglik.gov.tr/Eklenti/39060/0/covid-19rehberigenelbilgilerepidemiyolojivetanipdf.pdf
2. Guan WJ, Ni ZY, Hu Y, et al. Clinical characteristics of coronavirus disease 2019 in China. New England Journal of Medicine. 2020;382(18):1708-20.
3. World Health Organization. WHO Coronavirus Disease (COVID-19) Dashboard. World Helath Organizations. https://covid19.who.int/. Updated July 2021.
4. T.C. Sağlık Bakanlığı. Genel Koronavirus Tablosu. T.C. Sağlık Bakanlığı Covid-19 Bilgilendirme Platformu. https://covid19.saglik.gov.tr/TR-66935/genel-koronavirus-tablosu.html. Updated July 2021.
5. He L, Zeng Y, Zeng C, et al. Positive rate of serology and RT-PCR for COVID-19 among community residents and healthcare workers in Wuhan, China. Japanese Journal of Infectious Diseases. 2021;74(4):333-6.
6. Liu R, Han H, Liu F, et al. Positive rate of RT-PCR detection of SARS-CoV-2 infection in 4880 cases from one hospital in Wuhan, China, from Jan to Feb 2020. Clinica Chimica Acta. 2020;505:172-5.
7. Si Y, Zhao Z, Chen R,et al. Epidemiological surveillance of common respiratory viruses in patients with suspected COVID-19 in Southwest China. BMC Infectious Diseases. 2020;20(1):1-7.
8. Shen N, Zhu Y, Wang X, et al. Characteristics and diagnosis rate of 5630 subjects receiving SARS-CoV-2 nucleic acid tests from Wuhan, China. JCI Insight. 2020;5(10):e137662.

9. Khan M, Khan H, Khan S, Nawaz M. Epidemiological and clinical characteristics of coronavirus disease (COVID-19) cases at a screening clinic during the early outbreak period: a single-centre study. Journal of Medical Microbiology. 2020;69(8):1114-23.
10. Deng Y, Liu W, Liu K, et al. Clinical characteristics of fatal and recovered cases of coronavirus disease 2019 in Wuhan, China: A retrospective study. Chinese Medical Journal. 2020;133(11):1261-7.
11. Yang X, Yu Y, Xu J, et al. Clinical course and outcomes of critically ill patients with SARS-CoV-2 pneumonia in Wuhan, China: a single-centered, retrospective, observational study. The Lancet Respiratory Medicine. 2020;8(5):475-81.
12. Ussaid A, Riaz B, Rafai W, et al. Clinical characteristics of 47 death cases with COVID-19: a retrospective study at a tertiary center in Lahore. Cureus. 2020;12(12):e12039.
13. Cai H. Sex difference and smoking predisposition in patients with COVID-19. The Lancet Respiratory Medicine. 2020;8(4):e20.
14. Klein SL, Flanagan KL. Sex differences in immune responses. Nature Reviews Immunology. 2016;16(10):626-38.
15. Patel SK, Velkoska E, Burrell LM. Emerging markers in cardiovascular disease: Where does angiotensin‐converting enzyme 2 fit in? Clinical and Experimental Pharmacology and Physiology. 2013;40(8):551-9.
16. Bertakis KD, Azari R, Helms LJ, Callahan EJ, Robbins JA. Gender differences in the utilization of health care services. Journal of Family Practice. 2000;49(2):147-52.
17. Johnson HD, Sholcosky D, Gabello K, Ragni R, Ogonosky N. Sex differences in public restroom handwashing behavior associated with visual behavior prompts. Perceptual and Motor Skills. 2003;97(3):805-10.
18. Hocanlı İ, Kabak M. Yoğun bakım ve serviste takip edilen Pcr pozitif Covid 19 tanılı hastaların genel özelliklerinin karşılaştırılması. Van Tıp Dergisi. 2021;28(2):258-264.
19. Sumer S, Ural O, Aktug-Demir N, et al. Selçuk Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'nde izlenen COVID-19 olgularının klinik ve laboratuvar özellikleri. Klimik Journal. 2020;33(2):122-8.