The antibiotic sensitivity of bacteria isolated from urine cultures

Abstract

Objective: Urinary tract infections (UTI) come upon a common infection disease in hospital. Empiric antibiotic therapy for patients with suspected UTI is commonly used because obtaining antibiogram result is usually time consuming. Aim of the study was to investigate urine culture and antibiogram results of patients who were admitted to our hospital. Methods: Urine cultures were investigated between November 2008 and June 2010 in database of laboratory information system. Samples of isolated microorganism and antibiogram results were evaluated. Results: Microorganisms were isolated in 691 of 1342 urine cultures. Polymicrobial infection was determined in 46 patients. Most common identified microorganism was E. coli (71.3%). If all samples considered, bacteria resistance was detected against to ampicilline, trimethoprim/sulfamethoxazole (TMP/SMX) ampicilline/sulbactam (AMS) and ciprofloxacin (CIP) (52.1%, 39.5%, 22.7% and 19.6%). Lower bacterial resistance was determined against amicasin, gentamicine, tobramicine and nitrofurantoin (7.9%, 3.3%, 17.5% and 12.6%). As E. coli isolated samples were investigated, bacterial resistance was detected against ampicilline, CIP, levofloxacin and TMP/SMX (58.1%, 40.8%, 36.1% ve 39.5%). Nitrofurantoin, amicasin, gentamicine and tobramicine were found as sensitive antibiotics (90.3%, 88.9%, 79.4% and 69.9%). Conclusion: High bacterial resistance was determined against to most preferred empiric antibiotics which are TMP/SMX, AMS and also CIP. J Clin Exp Invest 2013; 4 (3): 356-359

Keywords

• antibiogram; drug resistance; urine culture

İdrar kültürlerinde izole edilen bakterilerin antibiyotik duyarlılıkları

Abstract

Amaç: İdrar yolu enfeksiyonu (İYE) hastanelerde sık karşılaşılan enfeksiyon hastalıklarından birisidir. Tanısında idrar kültürü altın standarttır ve tedavinin sürdürülmesinde antibiyogramlardan yararlanılır. Ancak antibiyogram sonuçlarının elde edilmesi zaman aldığı için, İYE\'den şüphelenilen hastalarda ampirik antibiyotik tedavisine başlanmaktadır. Bu çalışmanın amacı hastanemize başvuran hastalardan istenen idrar kültür ve antibiyogram sonuçlarını incelemektir. Yöntemler: Laboratuvar bilgi sistemi veritabanından Kasım 2008 - Haziran 2010 tarihleri arasında istenen idrar kültürleri incelendi. Üreme olan örnekler ve antibiyogram sonuçları değerlendirildi. Bulgular: İdrar kültürü istenen 1342 örneğin 691 tanesinde üreme saptandı. 46 hastada polimikrobiyal enfeksiyon saptandı. İdrar kültürlerinde en sık karşılaşılan mikroorganizma E. coli (%71,3) olarak bulundu. Tüm örnekler incelendiğinde ampisilin, trimetoprim/sulfometaksazol (TMP/SMX), ampisilin/sulbaktam (AMS) ve siprofloksasine (CIP) karşı antibiyotik direnci sırasıyla, %52,1, %39,5, %22,7 ve %19,6 idi. Antibiyotik direncinin daha az olduğu antibiyotikler amikasin (%7,9), gentamisin (%3,3), tobramisin (%17,5) ve nitrofurantoin (%12,6) olarak bulundu. E. coli üreyen örneklerde antibiyogramlar incelendiğinde ampisilin, CIP, levofloksasin ve TMP/SMX\'e karşı antibiyotik direnci sırasıyla %58,1, %40,8, %36,1 ve %39,5 olarak saptandı. Duyarlı antibiyotikler sırasıyla nitrofurantoin (%90,3), amikasin (%88,9), gentamisin (%79,4) ve tobramisin (%69,9) olarak saptandı. Sonuç: Ampirik antibiyotik seçiminde sıklıkla tercih edilen CIP dahil TMP/SMX ve AMS\'e karşı yüksek oranda direnç saptanmıştır. İYE olgularında ampirik antibiyotik seçiminin gözden geçirilmesi gerektiği kanaatindeyiz.

Keywords

• antibiyogram; ilaç direnci; idrar kültürü

References

1. Forbes BA, Sahm DF, Weissfeld AS, editors. Bailey and Scott’s diagnostic microbiology. 12th ed. Missouri: Mosby Elsevier; 2007. Bacterial identification flow charts and schemes: A Guide to Part III; pp. 251–253.
2. Foxman B. Epidemiology of urinary tract infections: incidence, morbidity, and economic costs. Dis Mon 2003;49:53-70.
3. Ertuğrul MB, Atilla-Güleç L, Akal D, ve ark. Üropatojen Escherichia coli suşlarının tedavide sık kullanılan an- tibiyotiklere duyarlılıkları. Klimik Dergisi 2004;17:132- 136.
4. Sucu N, Aktoz-Boz G, Bayraktar Ö, ve ark. Üropato- jen Escherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlı- lıklarının yıllar içerisindeki değişimi. Klimik Dergisi 2004;17:128-131.
5. Amábile-Cuevas CF, Arredondo-García JL, Cruz A, Ro- sas I. Fluoroquinolone resistance in clinical and envi- ronmental isolates of Escherichia coli in Mexico CIty. J Appl Microbiol 2010;108:158-162.
6. Güneysel Ö, Erdede M, Denizbaflı A. Trimethoprim sul- famethoxazole resistance in urinary tract infections: which is next? Eur J Emerg Med 2006;13:48.
7. Pekdemir M, Yılmaz S, Öztürk Dündar D, Uygun M. Acil servisten istenen idrar kültür ve antibiyogramla- rinin analizi. Türkiye Acil Tıp Dergisi 2006;6:154-157.
8. Wright SW, Wrenn KD, Haynes ML. Trimethoprim- sulfamethoxazole resistance among urinary coliform isolates. J Gen Intern Med 1999;14:606-609.

9. Akbaş E, Zarakolu P, Aktepe OC, ve ark. İdrar yolu en- feksiyonu ön tanısı ile başvuran olgularda idrar örnek- lerinin mikrobiyolojik olarak değerlendirilmesi: iki yıllık bir çalışma. Mikrobiyoloji Bülteni 1997;31:351-361.
10. Koç E, Koç F, Sivrikaya A, Özgür KG. Üriner sistem infeksiyonlarından izole edilen bakterilerin ve antibi- yotik duyarlılık durumlarının araştırılması. Klimik Derg 1993;16:13-14.
11. Yaylı G, Oltan N, Ak Ö, ve ark. Üriner infeksiyon etkeni Escherichia coli suşlarında kotrimoksazol direnci. Kli- mik Dergisi 2000;13:86-87.
12. Amyes SG, Baird DR, Crook DW, et al. A multicentre study of the in-vitro activity of cefotaxime, cefurox- ime, ceftazidime, ofloxacin and ciprofloxacin against blood and urinary pathogens. J Antimicrob Chemother 1994;34:639-648.
13. Cizman M, Orazem A, Krizan-Hergouth V, Kolman J. Correlation between increased consumption of fluo- roquinolones in outpatients and resistance of Esch- erichia coli from urinary tract infections. J Antimicrob Chemother 2001;47:502-505.