Akrabalık Matrisinin Tersinin Henderson Metodu İle Hesaplanması ve Hesaplamada Python Programlama Dili Kullanımı

Abstract

Bu çalışmanın  iki amacı olup, bunlardan birincisi Python programlama diliyle yazılmış ve hayvan ıslahında oldukça önemli bir parametre olan akrabalık matrisinin direk tersinin Henderson metoduyla (Akrabalık ilişkisini göz ardı eden)  hesaplanmasının anlatımı ve ikincisi ise bu hesaplamada kullanılabilen Python programlama dili ile yazar tarafından yazılmış bir programın tanıtımıdır. Program Python 2.7.11 sürümü ile yazılmış olup Numpy, Pandas, Xlrd ve XlsWriter modülleri kullanılmıştır. Diğer programlardan farklı olarak ilk üç sütununa hayvan, baba ve anaya ait kulak numaraları yazılmış bir MS Excel dosyası programda direk girdi dosyası olarak kullanılabilmektedir. Programın çalışması tamamlandıktan sonra program tarafından akrabalık matrisinin tersinin kaydedildiği “txt” uzantılı ve NRM isimli bir dosya ve aynı zamanda soy kütüğü ile ilgili çeşitli bilgi ve istatistikleri içeren üç farklı “xlsx” uzantılı çıktı dosyaları oluşturulur. Program http://www.kemalyazgan.com.tr/indexturk.htm adresinden edinilebilir. Hayvan ıslahında kullanılan birçok program Fortran programlama dili ile yazılmıştır. Bu çalışma Python programlama dilinin Fortran’a iyi bir alternatif olabileceğini göstermesi açısından ve ülkemizde damızlık değer tahmini yapan yerli programların geliştirilmesi için öncülük edebilir. 

Keywords

• Python programlama dili,Akrabalık matrisi,Pedigri analizi

References

1. Tüzemen, N., M. Yanar,., Ö. Akbulut,. 2003. Hayvan ıslahı. Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Ders Yayınları No: 230, Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Ofset Tesisi, Erzurum, s.234-250.
2. Elandt-Johnson, R.C, 1971. Probability models and statistics. John Wiley, Newyork.
3. Toktamış, Ö, 1978. Akrabalık ve Akrabalı Yetiştirme Katsayılarını Hesaplama ve Tahmin Yöntemlerinin incelenmesi, Yayınlanmamış Doktora Tezi, Ankara. Henderson, C.R, 1973. Sire evaluation and genetic trends. Proc. Anim. Breed. Genet. Sym. Honor of Lush, ASA and ADSA, Champaign, II.