Santral Sinir Sistemi Enfeksiyonunda Viral Etkenlerin Gerçek Zamanlı PCR Yöntemi ile Saptanması

Year 2024, Volume: 19 Issue: 3, 145 - 150, 04.11.2024

Özlem Kirişci , Kezban Tülay Yalçınkaya , Filiz Orak

https://doi.org/10.17517/ksutfd.1336081

Abstract

Amaç: Santral sinir sistemi (SSS) enfeksiyonu etkenlerinin saptanmasında konvansiyonel kültür yöntemleri altın standart olmasına rağmen polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) giderek artan sıklıkta kullanılmaya başlanmıştır. Patojenin saatler içinde saptanması, canlı mikroorganizmaya gereksinim olmaması, antimikrobiyal kullanımından etkilenmemesi PZR yönteminin avantajları arasındadır. Birçok virüs benzer klinik tablo oluşturabildiğinden aynı anda birden fazla etkeni belirleyebilecek PZR yöntemleri tanımlandı. Bu çalışmada Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı’na viral santral sinir sistemi enfeksiyonu ön tanısı düşünülerek gönderilen beyin omurilik sıvısı (BOS) örneklerinde nükleik asit testleri ile saptanan viral etkenlerin değerlendirilmesi amaçlandı.
Gereç ve Yöntemler: Bu amaçla, Mart 2018-Ocak 2020 tarihleri arasında Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı’na gönderilen, SSS enfeksiyonu öntanılı hastalara ait 141 (BOS) örneğinde multipleks gerçek zamanlı PZR yöntemi ile viral etkenler araştırılmıştır. Hastaların 11’i 0-5 (beşi erkek), 10’u 6-15 (altısı erkek), 120’si 16-88 (50’si erkek) yaş aralığındaydı. Kullanılan ticari PZR test kiti (FTD Neuro9, Fast-Track Diagnostics, Lüksemburg) panelinde Adenovirüs (AdV), Sitomegalovirüs (CMV), Enterovirüs (EV), Epstein-Barr virüs (EBV) Herpes simpleks virüs 1 ve 2 (HSV 1-2), İnsan herpes virüs 6 ve 7 (HHV 6-7), İnsan “parecho” virüs, Parvovirüs B19 ve Varisella-zoster virüs (VZV) bulunmaktadır.
Bulgular: Çalışmaya alınan 141 BOS örneğinin beşinde (%3,5) viral etken saptanmıştır. Bir örnekte HHV-7 (yaş, 7), bir örnekte Enterovirüs (yaş, 8), iki örnekte VZV (yaş, 35 ve 66) ve bir örnekte AdV (yaş, 56) saptanmıştır.
Sonuç: Sonuç olarak özellikle klasik tanı yöntemlerinin yetersiz kaldığı bilinen etkenlerin tanımlanmasında multipleks gerçek zamanlı PZR yönteminin kullanılması tanısal duyarlılığa ve hasta yönetimine katkı sağlayacaktır.

Keywords

Santral sinir sistemi enfeksiyonu, Beyin omurilik sıvısı, Gerçek Zamanlı PCR

Supporting Institution

YOK

Project Number

YOK

Thanks

YOK

Detection of Viral Pathogens in Central Nervous System Infection by Real-Time PCR Method

Abstract

Objective: Although conventional culture methods are the gold standard in detecting central nervous system (CNS) infection agents, polymerase chain reaction (PCR) has been used with increasing frequency. The detection of the pathogen within hours, the absence of live microorganisms, and the fact that it is not affected by antimicrobial use are among the advantages of the PCR method. Since many viruses can produce similar clinical pictures, PCR methods have been defined that can identify more than one pathogen simultaneously. In this study, viral agents detected by nucleic acid tests in the cerebrospinal fluid (CSF) samples of patients with a suspicion of viral CNS infection were sent to the Medical Microbiology Laboratory of Kahramanmaraş Sütçü İmam University Hospital and evaluated.

Material and Methods: For this purpose, viral agents were investigated by multiplex real-time PCR method in 141 CSF samples from the patients with prediagnosed CNS infection, sent to Kahramanmaraş Sütçü İmam University Health Practice and Research Hospital Microbiology Laboratory between March 2018 and January 2020. Of the patients, 10 were in the age range of 0-5 years (five males), 10 were in 6-15 years (six males), and 120 were in 16-88 years (50 males). The panel of commercial PCR test kit (FTD Neuro9, Fast-Track Diagnostics, Luxembourg) consists of Adenovirus (AdV), Cytomegalovirus (CMV), Enterovirus (EV), Epstein-Barr virus (EBV), Herpes simplex virus 1 and 2 (HSV 1-2), Human herpes virus 6 and 7 (HHV 6-7), Human parechovirus, Parvovirus B19, and Varicella-zoster virus (VZV).

Results: Viral agents were detected in five (3.5%) of 141 CSF samples included in the study. HHV-7 was detected in one sample (age, 7 years), Enterovirus in one sample (age, 8), VZV in two samples (ages, 35 and 66), and AdV (age, 56) in one sample.

Conclusion: As a result, the use of multiplex real-time PCR methods will contribute to diagnostic sensitivity and patient management, especially in the identification of agents for which conventional methods are insufficient.

Keywords

Central nervous system infection, Cerebrospinal fluid, Real-Time PCR

Project Number

YOK

References

• Soylar M, Altuğlu I, Sertöz R, Aydın, D, Akkoyun F, Zeytinoğlu A. Ege Üniversitesi Hastanesine Başvuran Santral Sinir Sistemi Enfeksiyonu Olgularında Saptanan Viral Etkenler. Ege Journal of Medicine 2014;53:65-70.
• Gökkılıç B, Çiçek C, Zeytinoğlu A, Kartal E. Türkiye’de Son On Yılda Saptanan Santral Sinir Sistemi Enfeksiyonlarında Viral Etkenlerin Değerlendirilmesi ve Bibliyometrik Analizi. Türk Mikrobiyol Cemiy Derg 2021;51(1):70-85.
• Sarınoğlu Can R, İmran S, Mutlu D, Baysan Özhak B, Öğünç D, Çolak D. Beyin Omurilik Sıvısı Örneklerinden Saptanan Viral Etkenler. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2016;46(4):152-158.
• Us AD. Viral santral sinir sistemi snfeksiyonları. Us AD, Ergünay K (Eds). Moleküler, Klinik ve Tanısal Viroloji. Ankara, Bilimsel Tıp Yayınevi, 2012:271-94.
• Bhaskaran A, Racsa L, Gander R, Southern P, Cavuoti D, Alatoom A. Interpretation of Positive Molecular Tests of Common Viruses in the Cerebrospinal Fluid. Diagn Microbiol Infect Dis 2013;77:236-40.
• Chadwick DR. Viral meningitis. Br Med Bull 2006;75-76:1-14.
• Sayıner AA. Viral Merkezi Sinir SSistemi İnfeksiyonlarında Tanı. ANKEM Derg 2005; 19(Ek 2):E130-6.
• Delbue S, Tremolada S, Ferrante P. Application of Molecular Tools for the Diagnosis of Central Nervous System Infections. Neurol Sci 2008; 29(Suppl 2):S283-5.
• Gültepe B, Bayram Y, Güdücüoğlu H, Çıkman A, Berktaş M. Bir Üniversite Hastanesinde Bakteriyel ve Viral Menenjit Etkenlerinin Farklı PCR Yöntemleri ile Araştırılması. Abant Med J 2015;4:125-9.
• Pehlivanoğlu F, Yaşar KK, Şengöz G. Beyin Omurilik Sıvısından İzole Edilen Mikroorganizmalar ve Antibiyotik Duyarlılıkları. ANKEM Derg 2011;25:1-5.
• Zeytinoğlu, A, Erensoy S, Sertöz, R, Altuğlu İ, Çiçek C, Kayın M ve ark. Santral Sinir Sistemi Enfeksiyonlarında Viral Etiyolojinin İzmir’de Bir Üniversite Hastanesinin Yedi Yıllık Verileri Üzerinden Değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul, 2017;51(2):127-135.
• Akkaya O, Güvenç Hİ, Güzelant A, Kaya M, Yüksekkaya Ş, Opuş A, ve ark. Menenjit Etkenlerinin Real-time PCR Yöntemiyle Araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2017;47(3):131-137.
• Koskiniemi M, Rantalaiho T, Piiparinen H, Henrik von Bonsdorf C, Farkkila, M, Jarvinen A et al. Infections Of The Central Nervous System Of Suspected Viral Origin: A Collaborative Study From Finland. J Neurovirol 2001;7(5):400-8.
• Altunal LN, Öztürk S, Aydın M, Özel AS, Kadanalı A. Santral Sinir Sistemi İnfeksiyonu Tanılı 98 Olgunun Klinik Özellikleri. ANKEM Derg 2021;35(3):77-84
• Varıcı Balcı FK, Sayıner AA. Viral Etkenlere Bağlı Santral Sinir Sistemi Enfeksiyonlarının Yedi Yıllık Değerlendirmesi. Mikrobiyol Bul. 2019;53(4):434-41.
• Dirim CÇ, Ülger ST, Aslan G, Ülger M, Kuyucu N, Kaya A, ve ark. Aseptik Menenjit Şüpheli Hastalara Ait BOS Örneklerinde Human Parechovirus Ve Enterovirusların Araştırılması. 3. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi 18-22 Kasım 2015, Antalya, Türkiye. Kongre Kitabı, s: 347,PS365.
• Sili U, Kaya A, Mert A. HSV Encephalitis Study Group. Herpes Simplex Virus Encephalitis: Clinical Manifestations, Diagnosis And Outcome In 106 Adult Patients. J Clin Virol 2014; 60(2):112-8.
• Arısoy ES. Viral menenjit. Turkiye Klinikleri. J Pediatr-Special Topics 2004;2:237-43
• Guney C, Ozkaya E, Yapar M, Gumus I, Kubar A, Dogancı L. Laboratory Diagnosis Of Enteroviral İnfections Of The Central Nervous System By Using A Nested RT-Polymerase Chain Reactin (PCR) Assay. Diagn Micr Infec Dis 2003;47(4):557-62.
• Özkaya E, Uysal G, Atak T, Alkan M. 2001-2004 Yılları Arasında Aseptik Menenjit Ön Tanılı Pediatrik Olgulardan İzole Edilen Enterovirüs Serotiplerinin Dağılımı. Mikrobiyol Bült 2005;39(1):43-51.
• Karakadıoğlu S. Aseptik menenjit ve kardit etiyolojisinde enteroviruslerin chip tekniği (microarray) ile araştırılması (Uzmanlık tezi); Manisa:2007.
• Deniz E. Aseptik menenjitli hastaların BOS örneklerinde enterovirüs ve herpesvirüslerin hücre kültürü ve PCR yöntemleri ile araştırılması (Uzmanlık tezi);Kayseri:2006.
• Kılıç I, Altuğlu I, Ciçek C, Pullukçu H, Bayram N, Şirin H, et al. Identification Of Enteroviruses From Central Nervous System İnfections By RT-PCR And Cell Culture Methods. Mikrobiyol Bul 2011;45(3):468-77.
• Çalışkan Demirkıran B, Yalçı A, Filiz M, Artuk C, Bulut C, Avcı İY. İmmün Sağlam Bireyde HHV-7 İlişkili Geçici Splenial Lezyon ile Birlikte Hafif Ensefalit/Ensefalopati (MERS), Olgu Sunumu ve Literatür Taraması. Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Mecmuası 2021;74(Suppl 1):103-107.
• de Ory F, Avellon A, Echevarria JE, Sanchez-Seco MP, Trallero G, Cabrerizo M, et al. Viral İnfections Of The Central Nervous System İn Spain: A Prospective Study. J Med Virol 2013;85(3):554-62.
• Jmor F, Emsley HC, Fischer M, Solomon T, Lewthwaite P. The Incidence Of Acute Encephalitis Syndrome In Western Industrialised And Tropical Countries. Virol J 2008;30(5):134-7.