Alt Solunum Yolu Örneklerinden İzole Edilen Nonfermenter Gram Negatif Bakterilerin Antibiyotik Duyarlılıkları

Abstract

Amaç: Bu çalışmada, hastanemizde yatarak takip edilmiş hastaların alt solunum yolu örneklerinden izole edilen Acinetobacter spp., Pseudomonas spp., Stenotrophomonas maltophilia suşlarının çeşitli antibiyotiklere direnç oranlarının belirlenmesi ve ampirik antibiyotik tedavisine yol gösterilmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Ocak 2019-Ocak 2020 tarihleri arasında laboratuvarımıza gönderilen, nonfermenter gram-negatif bakteriler (NFGNB)’in izole edildiği alt solunum yolu örnekleri retrospektif olarak incelenmiştir. Bakteri identifikasyonu ve antibiyotik duyarlıkları konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemler ve otomatize sistem (Vitek 2, bioMerieux, Fransa) ile belirlenmiştir. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 332 etkenin izole edildiği 207 hastanın % 40’ı serviste, % 60’ı yoğun bakım ünitesinde takip edilmekteydi. Örneklerin 70’i (% 21) balgam, 248’i (% 75) derin trakeal aspirat, 14’ü (% 4) bronkoalveolar lavajdı. Etkenlerin 160’ı (% 48) Pseudomonas spp., 145’i (% 44) Acinetobacter spp., 27’si (% 8) Stenotropmomonas maltophilia olarak saptanmıştır. Acinetobacter spp. suşlarına en etkili antibiyotiğin kolistin (% 98), Pseudomonas spp. suşlarına da kolistin (% 95), amikasin (% 85) ve gentamisin (% 81) olduğu bulunmuştur. S. maltophilia suşlarında ise trimetoprim-sulfametoksazol (% 96) duyarlılığının yüksek olduğu saptanmıştır. Sonuç: Acinetobacter spp. ve Pseudomonas spp. suşlarında nefrotoksik etkisi bilinen kolistin ve kombine tedavilerde kullanımı mümkün olan aminoglikozidler dışındaki antibiyotiklere karşı yüksek direnç oranları saptanmıştır. Bu nedenle tedavilerin etkenlerin antibiyotik duyarlılıkları belirlenerek başlanması gerekmektedir.

Keywords

• Acinetobacter spp
• alt solunum yolu enfeksiyonu
• Pseudomonas spp
• Stenotropmomonas maltophilia

Antibiotic Sensitivity of Nonfermentative Gram-Negative Bacteria Isolated from Lower Respiratory Tract Specimens

Abstract

Aim: In this study, it was aimed to determine the resistance rates of Acinetobacter spp., Pseudomonas spp., Stenotrophomonas maltophilia strains isolated from lower respiratory tract samples of patients who were followed up in our hospital, and to guide empirical antibiotic treatment. Materials and Methods: Lower respiratory tract samples sent to our laboratory between January 2019 and January 2020, in which nonfermentative gram-negative bacteria (NFGNB) were isolated, were retrospectively analyzed. Bacterial identification and antibiotic susceptibility were determined using conventional microbiological methods and automated system (Vitek 2, bioMerieux, France). Results: 332 agents were isolated from 207 patients who were followed up 40% in the service and 60% in the intensive care unit in this study. 70 (21 %) of the samples were sputum, 248 (75 %) were deep tracheal aspirate, 14 (4 %) were bronchoalveolar lavage. 160 (48 %) of the agents were Pseudomonas spp., 145 (44 %) were Acinetobacter spp., 27 (8 %) were S. maltophilia. Most effective antibiotic was determined against Acinetobacter spp. strains as colistin (98 %) while most effective antibiotics were found against Pseudomonas spp. starins as colistin (95 %), amikacin (85 %) and gentamicin (81 %). Trimethoprim-sulfamethoxazole (96%) sensitivity was found to be high in S. maltophilia strains. Conclusions: Acinetobacter spp. and Pseudomonas spp. strains have been found to have high resistance rates against antibiotics other than aminoglycosides that can be used in combined therapies and colistin with known nephrotoxic effects. Therefore, the treatments should be started by determining the antibiotic sensitivity of the agents

Keywords

• Acinetobacter spp
• lower respiratory tract infection
• Pseudomonas spp
• Stenotropmomonas maltophilia

References

1. Chastre J, Fagon J. State of the Art Ventilator-associated Pneumonia. Am J Respir Crit Care Med. 2002;165(23):867-903. doi:10.1164/rccm.2105078
2. Vincent J-L. The Prevalence of Nosocomial Infection in Intensive Care Units in Europe. JAMA. 1995;274(8). doi:10.1001/jama.1995.03530080055041
3. Andriesse GI, Verhoef J. Nosocomial pneumonia: Rationalizing the approach to empirical therapy. Treat Respir Med. 2006;5(1). doi:10.2165/00151829-200605010-00002
4. Fadda G, Spanu T, Ardito F, et al. Antimicrobial resistance among non-fermentative Gram-negative bacilli isolated from the respiratory tracts of Italian inpatients: A 3-year surveillance study by the Italian Epidemiological Survey. Int J Antimicrob Agents. 2004;23(3). doi:10.1016/j.ijantimicag.2003.07.017
5. Fontana R, Lo Cascio G, Ligozzi M, Friscia O, Oldoni T. Antimicrobial susceptibility of respiratory isolates of Enterobacteriaceae and Staphylococcus aureus in Italy: Incidence and trends over the period 1997-1999. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2001;20(12). doi:10.1007/s100960100628
6. Jr WW, Allen S, Janda W, et al. Nonfermenting Gram negative bacilli. In: Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology. Vol 125. 6th Editio. Lippincott Williams and Wilkins Company; 2006:305-391. doi:10.1097/prs.0b013e3181c9151b
7. Gales AC, Jones RN, Forward KR, Liñares J, Sader HS, Verhoef J. Emerging importance of multidrug-resistant Acinetobacter species and Stenotrophomonas maltophilia as pathogens in seriously ill patients: Geographic patterns, epidemiological features, and trends in the SENTRY Antimicrobial Surveillance Program (1997-1999). In: Clinical Infectious Diseases. Vol 32. ; 2001. doi:10.1086/320183
8. Steinberg JP, BURD EM. Other Gram-Negative and Gram-Variable Bacilli. In: Mandell, Douglas, and Bennett’s Principles and Practice of Infectious Diseases. ; 2010. doi:10.1016/b978-0-443-06839-3.00237-x

9. James H. Jorgensen and Michael A. Pfallerc. Manual of C Linical Microbiology. Asm Press; 2015. http://estore.asm.org
10. Esen B, Albayrak N, Alışkan HE, et al. Tıbbi Mikrobiyoloji Uzmanları İçin Klinik Örnekten Sonuç Raporuna Uygulama Rehberi. Klinik Mikrobiyoloji Uzmanlık Derneği Yayınları; 2015.
11. EUCAST. MİK ve Zon Çaplarının Değerlendirilmesi Için Sınır Değer Tabloları MİK ve Zon Çaplarının Değerlendirilmesi Için Sınır Değer Tabloları.; 2019.
12. CLSI. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing: 26th Informational Supplement, Document M100-S26. Clin Lab Stand Inst. 2016;(January).
13. Genc Y, Gurkan Y, Mumcuoglu I, Kanylmaz D, Aksoy A, Aksu N. Evaluation of nosocomial pneumonia in intensive care unit patients and investigation of antimicrobial resistance of frequently encountered bacterial isolates. Turk Hij Den Biyol Derg, 2016; 73(4): 355 - 364. doi:10.5505/TurkHijyen.2016.84755
14. Küme G, Demirci M. Antimicrobial susceptibilities of non-fermantative gram-negative bacilli isolated from lower respiratory tracts specimens of intensive care units patients and associated risc factors of lower repiratort tract infections. Deu Med J. 2012;26(1):37-44. https://dergipark.org.tr/tr/pub/deutip/issue/4662/63519 15 Ocak 2021' de ulaşıldı.
15. Sharma S, Pujari S, Kumar Sharma A. Isolation of non-fermenting Gram negative bacteria in respiratory tract infections. IP Int J Med Microbiol Trop Dis. 2020;6(3):184-187. doi:10.18231/j.ijmmtd.2020.041
16. Cikman A, Gundem NS, Karakeçili F, Korkmaz E, Cikman O. Microorganisms Isolated from Various Clinical Samples of Intensive Care Unit Patients and their Antibiotic Susceptibilities. ANKEM Derg. 2012;26(3):131-136. doi:10.5222/ankem.2012.131
17. Altay Koçak A, Yayla B, Üsküdar Güçlü A, et al. Evaluation of Respiratory Pathogens Isolated in a University Hospital in Adana and Their Antibiotic Resistance Profiles. Türk Mikrobiyoloji Cemiy Derg. 2019;49(4):226-232. doi:10.5222/tmcd.2019.226
18. Tran GM, Ho-Le TP, Ha DT, et al. Patterns of antimicrobial resistance in intensive care unit patients: A study in Vietnam. BMC Infect Dis. 2017;17(1). doi:10.1186/s12879-017-2529-z
19. Ece G, Ece C, Aslan D. Yoğun Bakım Hastaları Alt Solunum Yolu Örneklerinden İzole Edilen Acinetobacter Baumannii ve Pseudomonas Aeruginosa Suşlarının Antimikrobiyal Direnç Profilinin ve Risk Faktörlerinin İncelenmesi. BALIKESİR Med J. 2020;4(3):46-54. https://dergipark.org.tr/tr/pub/bmedj/issue/57940/826132 15 Ocak 2021' de ulaşıldı.
20. Yüksek A, Turan B, Güneş H, et al. Yoğun Bakım Ünitesinde Yatan Hastalardan İzole edilen Etkenler ve Antibiyotik Direnç Paternleri. Int J Basic Clin Med. 2015;1:1-6. https://dergipark.org.tr/tr/pub/ijbcm/issue/7989/104874 15 Ocak 2021' de ulaşıldı.
21. Chawla K, Vishwanath S, Gupta A. Stenotrophomonas maltophilia in lower respiratory tract infections. J Clin Diagnostic Res. 2014;8(12). doi:10.7860/JCDR/2014/10780.5320
22. Gajdács M, Urbán E. Prevalence and Antibiotic Resistance of Stenotrophomonas maltophilia in Respiratory Tract Samples: A 10-Year Epidemiological Snapshot. Heal Serv Res Manag Epidemiol. 2019;6. doi:10.1177/2333392819870774