Investigation of Frequency of Rotavirus and Adenovirus in Patients with Acute Gastroenteritis

Abstract

Objective: Infectious gastroenteritis is one of the most important causes of morbidity and mortality, especially in children. Rotavirus and enteric adenoviruses are important viral agents of infectious gastroenteritis. In our study, we aimed to determine the positivity of rotavirus and adenovirus and the gender, age and seasonal distribution of the causative agents in stool samples sent to the laboratory with a preliminary diagnosis of acute gastroenteritis.

Material and Methods: Stool samples sent from various clinics to the microbiology laboratory with the pre-diagnosis of acute gastroenteritis between July 2015 and June 2019 were examined for the presence of rotavirus and adenovirus. The Simple/StickRota Adeno (Operon, Spain) kit working with the qualitative immunochromatographic method was used to analyze the stool samples. We reviewed the study data retrospectively. Statistical evaluations were made according to the “chi square test”.

Results: Rotavirus positivity was found in 472 (8.91%) of 5294 samples included in the study, and adenovirus positivity was found in 237 (4.4%) samples. Both viruses were detected in 99 (1.07%) samples. Rotavirus positivity was 104 (22%) between 13-24 months and 116(24.5%) between 2-5 years of age; adenovirus positivity was found to be 38 (16%) between the ages of 2-5 and 85 (35.8%) over the age of 18. Seasonally, 179 (37.9%) of rotavirus infections were spring, 153 (32.5%) were winter, 65 (27.4%) of adenovirus infections were detected in winter and 61 (25.8%) in summer.

Conclusion: Rotavirus and adenovirus, which are viral gastroenteritis agents, can be easily detected by antigen tests in stool. Knowing the rotavirus and adenovirus positivity rates, age, gender and seasonal distributions will contribute to regional and country-wide data.

Keywords

• rotavirus
• adenovirus
• viral gastroenteritis

AKUT GASTROENTERİTLİ OLGULARDA ROTAVİRÜS VE ADENOVİRÜS SIKLIĞININ ARAŞTIRILMASI

Abstract

Amaç: Enfeksiyöz gastroenteritler, özellikle çocuklarda morbidite ve mortalitenin en önemli nedenlerinden biridir. Rotavirüs ve enterik adenovirüsler, enfeksiyöz gastroenteritlerin önemli viral etkenlerindendir. Çalışmamızda, akut gastroenterit ön tanısı ile laboratuvara gönderilen gaita örneklerinde; rotavirüs ve adenovirüs pozitifliği ile etkenlerin cinsiyet, yaş ve mevsimsel dağılımının belirlenmesini amaçladık.

Gereç ve Yöntemler: Temmuz 2015-Haziran 2019 tarihleri arasında çeşitli kliniklerden akut gastoenterit ön tanısı ile mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen gaita örnekleri rotavirüs ve adenovirüs varlığı açısından incelendi. Gaita örneklerini incelemede kalitatif immunokromotografik yöntem ile çalışan Simple/StickRota Adeno (Operon, İspanya) kiti kullanılmıştır. Çalışma verilerini retrospektif olarak inceledik. İstatistiksel değerlendirmeler, “Ki-Kare (Chi square) testine” göre yapıldı.

Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 5294 örneğin, 472’sinde (%8.91) rotavirüs pozitifliği; 237’sinde (%4.4) ise adenovirüs pozitifliği saptanmıştır. Rotavirüs pozitifliği 13-24 ay arasında 104 (%22) ve 2-5 yaş arasında 116 (%24.5); adenovirüs pozitifliği 2-5 yaş arasında 38 (%16) ve 18 yaş üstünde 85 (%35.8) olarak saptanmıştır. Mevsimsel olarak rotavirüs enfeksiyonlarının 179’u (%37.9) ilkbahar, 153’ü (%32.5) kış; adenovirüs enfeksiyonlarının 65’i (%27.4) kış, 61’i (%25.8) yaz aylarında saptanmıştır.

Sonuç: Viral gastroenterit etkenlerinden rotavirüs ve adenovirüs, dışkıda bakılan antijen testleriyle kolaylıkla tespit edilebilir. Rotavirüs ve adenovirüs pozitiflik oranlarının, yaş, cinsiyet ve mevsimsel dağılımlarının bilinmesi bölgesel ve ülke çapında verilere katkı sağlayacaktır.

Keywords

• Rotavirus
• Adenovirus
• viral gastroenterit

References

1. 1. Assis AM. Growth faltering in childhood related to diarrheae. Eur J Clin Nutr. 2005;59(11)1317-23.
2. 2. Gültepe B, Yaman G, Çıkman A, Güdücüoğlu H. Çocukluk yaş grubu gastroenteritlerde rotavirus ve adenovirus sıklığı. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2012;42(1):16-20.
3. 3. Bányai K, Estes MK, Martella V, Parashar UD. Viral gastroenteritis. Lancet. 2018;392(10142):175-86.
4. 4. Kurugöl Z, Devrim İ. Gastrointestinal infections. J Pediatr Inf. 2014;8:71-81.
5. 5. Köse H, Temoçin F. Akut gastroenteritli çocuklarda adenovirüs ve rotavirüs sıklığının araştırılması. Flora. 2019;24(1):22-6.
6. 6. Stuempfig ND, Seroy J. Viral Gastroenteritis. In: StatPearls. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing, 2018. Available from https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK518995.
7. 7. Kahyaoğlu F, Kırdar S. Akut Gastroenteritli Hastalarda İnsan Bokavirüsün Moleküler ile Araştırılması. J Biotechnol and Strategic Health Res. 2020;4(3):256-26.
8. 8. Kizirgil A, Karakoç S. Çocukluk yaş grubu akut gastroenteritlerinde etiyolojik ajanların belirlenmesi. Nobel Med. 2012;8(3):60-5.

9. 9. Çömçe M, Kafadar D, Erol M, Yiğit Ö. Akut gastroenteritle acile başvuran pediatrik popülasyonda rotavirüs ve adenovirüs enfeksiyonlarının retrospektif analizi. J Pediatr Inf. 2017;11(4):153-60.
10. 10. Yazıcı V, Manzur Y, Akbulut A. Akut Gastroenteritli olgularda rotavirus ve enterik adenovirüs infeksiyonlarının sıklığının araştırılması. Klimik Dergisi. 2013;26(1):13-16.
11. 11. Çaycı YT, Yılmaz G, Birinci A. Akut gastroenterit vakalarında rotavirüs ve adenovirüs sıklığının araştırılması. Pamukkale Tıp Dergisi. 2017;10(1):61-5.
12. 12. Doğan Y, Ekşi F, Karslıgil T, Bayram A. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirüs ve adenovirüs varlığının araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2014;44(1):18-22.
13. 13. Terzi HA, Aydemir Ö. Akut gastroenteritli hastalarda rotavirüs ve adenovirüs sıklığının araştırılması. Sakarya Tıp Dergisi. 2018;8(4):746-52.
14. 14. Gül M, Garipardiç M, Çıragil P, Aral M, Karabiber H, Guler İ. 0-5 yaş arası gastroenteritli çocuklarda rotavirus ve adenovirus tip 40/41 araştırılması. ANKEM Derg. 2005;19(2):64-67.
15. 15. Özdemir M, Demircili ME, Feyzioğlu B, Yavru S, Baysal B. İshalli hastalarda akut viral gastroenterit etkenlerinin araştırılması. Selçuk Tıp Derg. 2013;29(3):127-30.
16. 16. Griffin DD, Kırkwood CD, Parashar UD, Woods PA, Bresee JS, Glass RI et al. National Rotavirüs Strain Surveillance System of Collaborating Laboratories. Journal of Clinical Microbiology. 2000;38(7):2784-7.