Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu
Öz
Posthodiplostomum Dubois, 1936 türleri dünya genelinde oldukça yaygınlık göstermektedirler. Avrupa’da yaygın olan P. cuticola türünün metaserkeri tatlı su balıklarında siyah nokta “black spot” hastalığına sebep olmaktadır. GenBank veri tabanında P. cuticola türüne ilişkin mitokondriyal ve ribozomal sekans kaydı sınırlıdır. Diğer yandan, Türkiye’de Posthodiplostomum cinsinde yer alan trematodların sekans karakterizasyonuna dair herhangi bir veri bulunmamaktadır. Bu çalışmada, tatlı su kefallerinde (Squalius cephalus) Posthodiplostomum metaserkerlerinin araştırılması ve tespit edilen izolatların mt-COI ve ITS-2 gen bölgelerinin moleküler karakterizasyonlarının yapılması amaçlanmıştır. İncelenen 123 balıktan ikisinin (%1,6) solungaçlarında Posthodiplostomum metaserkerleri saptanmıştır. Çalışmada tespit ettiğimiz izolatların (POSTC1-C2) (MN701652-3) ITS-2 gen bölgesine ait nükleotid dizilimleri, Çek Cumhuriyeti ve Macaristan’da farklı balık türlerinin deri, kas ve yüzgeçlerinden izole edilen P. cuticola izolatları ile %99,8-100 arasında identiklik göstermiştir. Yine POSTC1-C2 izolatlarının (MN700658-9) mt-COI gen bölgesine ait nükleotid dizilimleri, Litvanya’da Planorbis planorbis’te bulunan P. cuticola izolatı (serker) (KX931424) ile %99,1-98,9 oranında identik bulunmuştur. Bu çalışma ile Türkiye’de ilk kez tatlı su kefalinde (Squalius cephalus) bulunan P. cuticola izolatlarının moleküler ve filogenetik karakterizasyonları ortaya konulmuştur.
Anahtar Kelimeler
Supporting Institution
Project Number
Thanks
References
- Boone EC, Laursen JR, Colombo RE, Meiners SJ, Romani MF, Keeney DB. Infection patterns and molecular data reveal host and tissue specificity of Posthodiplostomum species in centrarchid hosts. Parasitology. 2018; 145(11):1458-1468.
- Dönges J. Der Lebenszyklus von Posthodiplostomum cuticola (v. Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda, Diplostomatidae). Z Parasıtenk. 1964; 24(2):169-248.
- Güven A, Öztürk T. Metazoan parasite faunas of three Gobiid species (Actinopterygii: Gobiidae) inhabiting the lower Kızılırmak Delta in Samsun: A comparative study. Türkiye Parazitol Derg. 2018; 42:33-38.
- Hoogendoorn C, Smit NJ, Kudlai O. Molecular and morphological characterisation of four diplostomid metacercariae infecting Tilapia sparrmanii (Perciformes: Cichlidae) in the North West Province, South Africa. Parasitol Res. 2019; 118:1403-1416.
- Huelsenbeck JP, Ronquist F. MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees. Bioinformatics. 2001; 17:754-755.
- Kearse M, Moir R, Wilson A, Stones-Havas S, Cheung M, Sturrock S, Buxton S, Cooper A, Markowitz S, Duran C, Thierer T, Ashton B, Meintjes P, Drummond A. Geneious Basic: an integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data. Bioinformatics. 2012; 28:1647-9.
- Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. J Mol Evol. 1980; 16:111-20.
- Kumar S, Stecher G, Tamura K. MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol Biol Evol. 2016; 33(7):1870-4.
Details
Primary Language
Turkish
Subjects
Veterinary Surgery
Journal Section
Research Article
Authors
Emrah Simsek
*
0000-0002-0492-9840
Türkiye
Abdullah Inci
0000-0003-1614-0756
Türkiye
Onder Duzlu
0000-0002-6951-0901
Türkiye
Erdal Yilmaz
0000-0001-6348-3618
Türkiye
Zuhal Onder
0000-0002-6143-3630
Türkiye
Arif Ciloğlu
This is me
0000-0003-2695-7102
Türkiye
Publication Date
March 31, 2020
Submission Date
November 20, 2019
Acceptance Date
January 27, 2020
Published in Issue
Year 2020 Volume: 13 Number: 1
