Research Article

Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu

Volume: 13 Number: 1 March 31, 2020
EN TR

Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu

Öz

Posthodiplostomum Dubois, 1936 türleri dünya genelinde oldukça yaygınlık göstermektedirler. Avrupa’da yaygın olan P. cuticola türünün metaserkeri tatlı su balıklarında siyah nokta “black spot” hastalığına sebep olmaktadır. GenBank veri tabanında P. cuticola türüne ilişkin mitokondriyal ve ribozomal sekans kaydı sınırlıdır. Diğer yandan, Türkiye’de Posthodiplostomum cinsinde yer alan trematodların sekans karakterizasyonuna dair herhangi bir veri bulunmamaktadır. Bu çalışmada, tatlı su kefallerinde (Squalius cephalus) Posthodiplostomum metaserkerlerinin araştırılması ve tespit edilen izolatların mt-COI ve ITS-2 gen bölgelerinin moleküler karakterizasyonlarının yapılması amaçlanmıştır. İncelenen 123 balıktan ikisinin (%1,6) solungaçlarında Posthodiplostomum metaserkerleri saptanmıştır. Çalışmada tespit ettiğimiz izolatların (POSTC1-C2) (MN701652-3) ITS-2 gen bölgesine ait nükleotid dizilimleri, Çek Cumhuriyeti ve Macaristan’da farklı balık türlerinin deri, kas ve yüzgeçlerinden izole edilen P. cuticola izolatları ile %99,8-100 arasında identiklik göstermiştir. Yine POSTC1-C2 izolatlarının (MN700658-9) mt-COI gen bölgesine ait nükleotid dizilimleri, Litvanya’da Planorbis planorbis’te bulunan P. cuticola izolatı (serker) (KX931424) ile %99,1-98,9 oranında identik bulunmuştur. Bu çalışma ile Türkiye’de ilk kez tatlı su kefalinde (Squalius cephalus) bulunan P. cuticola izolatlarının moleküler ve filogenetik karakterizasyonları ortaya konulmuştur.

Anahtar Kelimeler

Supporting Institution

Erciyes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi

Project Number

TCD-2016-6795

Thanks

Bu çalışma, TCD-2016-6795 proje koduyla Erciyes Üniversitesi Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından desteklenmiştir.

References

  1. Boone EC, Laursen JR, Colombo RE, Meiners SJ, Romani MF, Keeney DB. Infection patterns and molecular data reveal host and tissue specificity of Posthodiplostomum species in centrarchid hosts. Parasitology. 2018; 145(11):1458-1468.
  2. Dönges J. Der Lebenszyklus von Posthodiplostomum cuticola (v. Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda, Diplostomatidae). Z Parasıtenk. 1964; 24(2):169-248.
  3. Güven A, Öztürk T. Metazoan parasite faunas of three Gobiid species (Actinopterygii: Gobiidae) inhabiting the lower Kızılırmak Delta in Samsun: A comparative study. Türkiye Parazitol Derg. 2018; 42:33-38.
  4. Hoogendoorn C, Smit NJ, Kudlai O. Molecular and morphological characterisation of four diplostomid metacercariae infecting Tilapia sparrmanii (Perciformes: Cichlidae) in the North West Province, South Africa. Parasitol Res. 2019; 118:1403-1416.
  5. Huelsenbeck JP, Ronquist F. MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees. Bioinformatics. 2001; 17:754-755.
  6. Kearse M, Moir R, Wilson A, Stones-Havas S, Cheung M, Sturrock S, Buxton S, Cooper A, Markowitz S, Duran C, Thierer T, Ashton B, Meintjes P, Drummond A. Geneious Basic: an integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data. Bioinformatics. 2012; 28:1647-9.
  7. Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. J Mol Evol. 1980; 16:111-20.
  8. Kumar S, Stecher G, Tamura K. MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol Biol Evol. 2016; 33(7):1870-4.

Details

Primary Language

Turkish

Subjects

Veterinary Surgery

Journal Section

Research Article

Publication Date

March 31, 2020

Submission Date

November 20, 2019

Acceptance Date

January 27, 2020

Published in Issue

Year 2020 Volume: 13 Number: 1

APA
Simsek, E., Yildirim, A., Inci, A., Duzlu, O., Yilmaz, E., Onder, Z., Ciloğlu, A., & Pekmezci, G. Z. (2020). Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu. Kocatepe Veterinary Journal, 13(1), 45-51. https://doi.org/10.30607/kvj.649230
AMA
1.Simsek E, Yildirim A, Inci A, et al. Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu. kvj. 2020;13(1):45-51. doi:10.30607/kvj.649230
Chicago
Simsek, Emrah, Alparslan Yildirim, Abdullah Inci, et al. 2020. “Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius Cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum Cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu”. Kocatepe Veterinary Journal 13 (1): 45-51. https://doi.org/10.30607/kvj.649230.
EndNote
Simsek E, Yildirim A, Inci A, Duzlu O, Yilmaz E, Onder Z, Ciloğlu A, Pekmezci GZ (March 1, 2020) Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu. Kocatepe Veterinary Journal 13 1 45–51.
IEEE
[1]E. Simsek et al., “Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu”, kvj, vol. 13, no. 1, pp. 45–51, Mar. 2020, doi: 10.30607/kvj.649230.
ISNAD
Simsek, Emrah - Yildirim, Alparslan - Inci, Abdullah - Duzlu, Onder - Yilmaz, Erdal - Onder, Zuhal - Ciloğlu, Arif - Pekmezci, Gokmen Zafer. “Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius Cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum Cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu”. Kocatepe Veterinary Journal 13/1 (March 1, 2020): 45-51. https://doi.org/10.30607/kvj.649230.
JAMA
1.Simsek E, Yildirim A, Inci A, Duzlu O, Yilmaz E, Onder Z, Ciloğlu A, Pekmezci GZ. Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu. kvj. 2020;13:45–51.
MLA
Simsek, Emrah, et al. “Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius Cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum Cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu”. Kocatepe Veterinary Journal, vol. 13, no. 1, Mar. 2020, pp. 45-51, doi:10.30607/kvj.649230.
Vancouver
1.Emrah Simsek, Alparslan Yildirim, Abdullah Inci, Onder Duzlu, Erdal Yilmaz, Zuhal Onder, Arif Ciloğlu, Gokmen Zafer Pekmezci. Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu. kvj. 2020 Mar. 1;13(1):45-51. doi:10.30607/kvj.649230

Cited By