Araştırma Makalesi

Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu

Cilt: 13 Sayı: 1 31 Mart 2020
PDF İndir
EN TR

Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu

Öz

Posthodiplostomum Dubois, 1936 türleri dünya genelinde oldukça yaygınlık göstermektedirler. Avrupa’da yaygın olan P. cuticola türünün metaserkeri tatlı su balıklarında siyah nokta “black spot” hastalığına sebep olmaktadır. GenBank veri tabanında P. cuticola türüne ilişkin mitokondriyal ve ribozomal sekans kaydı sınırlıdır. Diğer yandan, Türkiye’de Posthodiplostomum cinsinde yer alan trematodların sekans karakterizasyonuna dair herhangi bir veri bulunmamaktadır. Bu çalışmada, tatlı su kefallerinde (Squalius cephalus) Posthodiplostomum metaserkerlerinin araştırılması ve tespit edilen izolatların mt-COI ve ITS-2 gen bölgelerinin moleküler karakterizasyonlarının yapılması amaçlanmıştır. İncelenen 123 balıktan ikisinin (%1,6) solungaçlarında Posthodiplostomum metaserkerleri saptanmıştır. Çalışmada tespit ettiğimiz izolatların (POSTC1-C2) (MN701652-3) ITS-2 gen bölgesine ait nükleotid dizilimleri, Çek Cumhuriyeti ve Macaristan’da farklı balık türlerinin deri, kas ve yüzgeçlerinden izole edilen P. cuticola izolatları ile %99,8-100 arasında identiklik göstermiştir. Yine POSTC1-C2 izolatlarının (MN700658-9) mt-COI gen bölgesine ait nükleotid dizilimleri, Litvanya’da Planorbis planorbis’te bulunan P. cuticola izolatı (serker) (KX931424) ile %99,1-98,9 oranında identik bulunmuştur. Bu çalışma ile Türkiye’de ilk kez tatlı su kefalinde (Squalius cephalus) bulunan P. cuticola izolatlarının moleküler ve filogenetik karakterizasyonları ortaya konulmuştur.

Anahtar Kelimeler

Destekleyen Kurum

Erciyes Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi

Proje Numarası

TCD-2016-6795

Teşekkür

Bu çalışma, TCD-2016-6795 proje koduyla Erciyes Üniversitesi Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından desteklenmiştir.

Kaynakça

  1. Boone EC, Laursen JR, Colombo RE, Meiners SJ, Romani MF, Keeney DB. Infection patterns and molecular data reveal host and tissue specificity of Posthodiplostomum species in centrarchid hosts. Parasitology. 2018; 145(11):1458-1468.
  2. Dönges J. Der Lebenszyklus von Posthodiplostomum cuticola (v. Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda, Diplostomatidae). Z Parasıtenk. 1964; 24(2):169-248.
  3. Güven A, Öztürk T. Metazoan parasite faunas of three Gobiid species (Actinopterygii: Gobiidae) inhabiting the lower Kızılırmak Delta in Samsun: A comparative study. Türkiye Parazitol Derg. 2018; 42:33-38.
  4. Hoogendoorn C, Smit NJ, Kudlai O. Molecular and morphological characterisation of four diplostomid metacercariae infecting Tilapia sparrmanii (Perciformes: Cichlidae) in the North West Province, South Africa. Parasitol Res. 2019; 118:1403-1416.
  5. Huelsenbeck JP, Ronquist F. MRBAYES: Bayesian inference of phylogenetic trees. Bioinformatics. 2001; 17:754-755.
  6. Kearse M, Moir R, Wilson A, Stones-Havas S, Cheung M, Sturrock S, Buxton S, Cooper A, Markowitz S, Duran C, Thierer T, Ashton B, Meintjes P, Drummond A. Geneious Basic: an integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data. Bioinformatics. 2012; 28:1647-9.
  7. Kimura M. A simple method for estimating evolutionary rate of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences. J Mol Evol. 1980; 16:111-20.
  8. Kumar S, Stecher G, Tamura K. MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol Biol Evol. 2016; 33(7):1870-4.

Ayrıntılar

Birincil Dil

Türkçe

Konular

Veteriner Cerrahi

Bölüm

Araştırma Makalesi

Yayımlanma Tarihi

31 Mart 2020

Gönderilme Tarihi

20 Kasım 2019

Kabul Tarihi

27 Ocak 2020

Yayımlandığı Sayı

Yıl 2020 Cilt: 13 Sayı: 1

Kaynak Göster

APA
Simsek, E., Yildirim, A., Inci, A., Duzlu, O., Yilmaz, E., Onder, Z., Ciloğlu, A., & Pekmezci, G. Z. (2020). Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu. Kocatepe Veterinary Journal, 13(1), 45-51. https://doi.org/10.30607/kvj.649230
AMA
1.Simsek E, Yildirim A, Inci A, vd. Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu. Kocatepe Veterinary Journal. 2020;13(1):45-51. doi:10.30607/kvj.649230
Chicago
Simsek, Emrah, Alparslan Yildirim, Abdullah Inci, vd. 2020. “Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu”. Kocatepe Veterinary Journal 13 (1): 45-51. https://doi.org/10.30607/kvj.649230.
EndNote
Simsek E, Yildirim A, Inci A, Duzlu O, Yilmaz E, Onder Z, Ciloğlu A, Pekmezci GZ (01 Mart 2020) Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu. Kocatepe Veterinary Journal 13 1 45–51.
IEEE
[1]E. Simsek vd., “Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu”, Kocatepe Veterinary Journal, c. 13, sy 1, ss. 45–51, Mar. 2020, doi: 10.30607/kvj.649230.
ISNAD
Simsek, Emrah - Yildirim, Alparslan - Inci, Abdullah - Duzlu, Onder - Yilmaz, Erdal - Onder, Zuhal - Ciloğlu, Arif - Pekmezci, Gokmen Zafer. “Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu”. Kocatepe Veterinary Journal 13/1 (01 Mart 2020): 45-51. https://doi.org/10.30607/kvj.649230.
JAMA
1.Simsek E, Yildirim A, Inci A, Duzlu O, Yilmaz E, Onder Z, Ciloğlu A, Pekmezci GZ. Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu. Kocatepe Veterinary Journal. 2020;13:45–51.
MLA
Simsek, Emrah, vd. “Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu”. Kocatepe Veterinary Journal, c. 13, sy 1, Mart 2020, ss. 45-51, doi:10.30607/kvj.649230.
Vancouver
1.Emrah Simsek, Alparslan Yildirim, Abdullah Inci, Onder Duzlu, Erdal Yilmaz, Zuhal Onder, Arif Ciloğlu, Gokmen Zafer Pekmezci. Türkiye’de Tatlı Su Kefali’nin (Squalius cephalus) Solungaçlarını Enfekte Eden Posthodiplostomum cuticola (von Nordmann, 1832) Dubois, 1936 (Trematoda: Diplostomidae) Metaserkerlerinin İlk Moleküler Karakterizasyonu. Kocatepe Veterinary Journal. 01 Mart 2020;13(1):45-51. doi:10.30607/kvj.649230

Cited By