BibTex RIS Cite

Distribution of Sulfate Reducing Bacteria in Aliağa Marine Area (İzmir) as Evaluated by Most-Probable-Number (MPN) Counts

Year 2014, Volume: 5 Issue: 2, 5 - 12, 01.12.2014

Abstract

Sülfat indirgenmesi anoksik kıyısal sedimanlardaki en önemli bakteriyal süreç olup, sülfat indirgeyen bakterilerin (SRB) dağılımlarından ve metabolik aktivitelerinden yoğun olarak etkilenmektedir. Sülfat indirgeyen bakteriler, sedimanlardaki karbon ve kükürdün biyojeokimyasal döngüsünde kilit organizma grubudur. Doğal ve endüstriyel çevrelerde SRB’lerin tespiti ve sayımı için hızlı ve güvenilir metodların geliştirilmesinde önemli çaba sarfedilmektedir. SRB’lerin sayımında kültürel metotlardan olan EMS (En Muhtemel Sayı) tekniği uzun yıllardır güvenle kullanılmaktadır. Bu çalışmada, yoğun endüstri ve petrokimya faaliyet alanı olan Aliağa Petkim bölgesindeki denizsuyu ve sedimandaki sülfat indirgeyen bakteri yoğunluğu EMS metodu ile tespit edilmiştir. Sediman ve denizsuyu örneklerindeki SRB miktarlarını belirlemek amacı ile ASTM D4412-84 standart test metodu kullanılmıştır. Çalışma alanından örneklenen 23 numunenin tamamında SRB bakterisinin varlığı tespit edilmiştir. Sediman örneklerinde tespit edilen en düşük değer 5.4x102 EMS/g, en yüksek değer ise 2.4x103 EMS/g olarak belirlenmiştir. Sülfat indirgeyen bakterilerin, mikrobiyal yol ile oluşan korozyonun en önemli etkenini oluşturduğu düşünülmektedir. Bu nedenle, bu bakteriler sülfat içeren su ve sediman ile temas haldeki metal yapılarda ciddi sorunlara neden olabilirler.

References

  • Aranda, C., Paredes, J., Valenzuela, C., Lam, P., Guillou, L. (2010). 16S rRNA gene-based molecular analysis of mat-forming and accompanying bacteria covering organically-enriched marine sediments underlying a salmon farm in Southern Chile (Calbuco Island). Gayana 74(2): 125-135.
  • APHA (1998). Standard methods for the examination of water and wastewater, 20th edition. Available from American Public Health Association, 1015 18th St. N.W., Washington, DC 20036.
  • ASTM (2009). Standard Test Methods for Sulfate- Reducing Bacteria in Water and Water-Formed Deposits. West Conshohocken, United States.
  • Barton, L. L., Fauque, G. D. (2009). Biochemistry, physiology and biotechnology of sulfate-reducing bacteria. Advances in Applied Microbiology 68: 41–98.
  • Coulon, F., McKew, B.A., Osborn, A.M., McGenity, T.J., Timmis, K.N. (2007). Effects of temperature and biostimulation communities in temperate estuarine waters. Environmental Microbiology 9: 177–186.
  • Jİrgensen, B. B. ve Nelson, D. (2004). Sulfide oxidation in marine microbiology. Geological Society of America. Special Paper 379. Geochemistry meets
  • Knoblauch, C., Jİrgensen, B.B. ve Harder, J. (1999). Community psychrophilic sulfate-reducing bacteria in Arctic metabolic rates of estuary, UK. Environmental
  • Madigan, M.T., Martinko, J.M. ve Stahl, D. (2010). Brock Biology of Microorganisms (13th ed.). New Jersey: Pearson Education.
  • Matsui, G.Y., Ringelberg, D.B., Lovell, C.R. (2004). Sulfate-reducing bacteria in tubes constructed by the marine infaunal polychaete Diopatra cuprea. Applied and Environmental Microbiology 7053– 7065.
  • Muyzer, G. and Stams, A.J. (2008). The ecology and biotechnology of sulfate-reducing bacteria. Nature Reviews Microbiology 6: 441–454.
  • Neser, G., Unsalan, D., Tekogul, N., Stuer-Lauridsen, F. (2008). The ship breaking industry in Turkey: environmental, safety and health issues. Journal of Cleaner Production 16: 350-358.
  • Paisse, S., Coulon, F., Goni-Urriza, M., Peperzak, L., McGenity, T.J., Duran, R. (2008). Structure of bacterial communities along a hydrocarbon contamination gradient in a coastal sediment. FEMS Microbiology Ecology 66: 295–305. ve
  • Perez-Jimenez, J.R., Kerkhof, L.J. (2005). Phylogeography of sulfate-reducing bacteria among analysis of the dissimilatory sulfite reductase disclosed by genes (dsrAB). Applied and Environmental Microbiology 71(2): 1004–1011.
  • Saas, H., Cypionka, H., Babenzien, H-D. (1997). Vertical distribution of sulfate-reducing bacteria at the oxic-anoxic interface in sediments of the oligotrophic Lake Stechlin. FEMS Microbiology Ecology 22: 245-255.
  • Sahrani, F.K., Zaharan, I., Adibah, Y. and Madzlan, A. (2008). Isolation and Identification of Marine Sulfate-Reducing Bacteria, Desulfovibrio sp. and Citrobacter freundii from Pasir Gudang. Malaysia. Sains Malaysiana 37(4): 365–371.
  • Sponza, D., Karaoğlu N. (2002). Environmental geochemistry and pollution studies of Aliağa metal industry district. Environmental International 27(7): 541-553.
  • Ucuncuoglu, E., Arli O., Eronat A.H. (2006). Evaluating the impact of coastal land uses on water-clarity conditions from Landsat TM/ETM+ imagery: Candarli Bay, Aegean Sea. International Journal of Remote Sensing 27(17): 3627-3643.
  • Vester, F., Ingvorsen, K. (1998). Improved most-probable- number bacteria with natural media and a radiotracer. Applied and Environmental Microbiology 64 (5): 1700–1707.
  • detect sulfate-reducing
  • Wargin, A., Olańczuk-Neyman, K., Skucha, M. (2007). Sulfate-reducing bacteria, their properties and methods of elimination from groundwater. Polish Journal of Environmental Studies 16(4): 639-644.

Aliağa (İzmir) Denizel Ortamındaki Sülfat İndirgeyen Bakterilerin Dağılımının En-Muhtemel-Sayı Metodu (EMS) ile Araştırılması

Year 2014, Volume: 5 Issue: 2, 5 - 12, 01.12.2014

Abstract

Sülfat indirgenmesi anoksik kıyısal sedimanlardaki en önemli bakteriyal süreç olup, sülfat indirgeyen bakterilerin (SRB) dağılımlarından ve metabolik aktivitelerinden yoğun olarak etkilenmektedir. Sülfat indirgeyen bakteriler, sedimanlardaki karbon ve kükürdün biyojeokimyasal döngüsünde kilit organizma grubudur. Doğal ve endüstriyel çevrelerde SRB’lerin tespiti ve sayımı için hızlı ve güvenilir metodların geliştirilmesinde önemli çaba sarfedilmektedir. SRB’lerin sayımında kültürel metotlardan olan EMS (En Muhtemel Sayı) tekniği uzun yıllardır güvenle kullanılmaktadır. Bu çalışmada, yoğun endüstri ve petrokimya faaliyet alanı olan Aliağa Petkim bölgesindeki denizsuyu ve sedimandaki sülfat indirgeyen bakteri yoğunluğu EMS metodu ile tespit edilmiştir. Sediman ve denizsuyu örneklerindeki SRB miktarlarını belirlemek amacı ile ASTM D4412-84 standart test metodu kullanılmıştır. Çalışma alanından örneklenen 23 numunenin tamamında SRB bakterisinin varlığı tespit edilmiştir. Sediman örneklerinde tespit edilen en düşük değer 5.4x102 EMS/g, en yüksek değer ise 2.4x103 EMS/g olarak belirlenmiştir. Sülfat indirgeyen bakterilerin, mikrobiyal yol ile oluşan korozyonun en önemli etkenini oluşturduğu düşünülmektedir. Bu nedenle, bu bakteriler sülfat içeren su ve sediman ile temas haldeki metal yapılarda ciddi sorunlara neden olabilirler.

References

  • Aranda, C., Paredes, J., Valenzuela, C., Lam, P., Guillou, L. (2010). 16S rRNA gene-based molecular analysis of mat-forming and accompanying bacteria covering organically-enriched marine sediments underlying a salmon farm in Southern Chile (Calbuco Island). Gayana 74(2): 125-135.
  • APHA (1998). Standard methods for the examination of water and wastewater, 20th edition. Available from American Public Health Association, 1015 18th St. N.W., Washington, DC 20036.
  • ASTM (2009). Standard Test Methods for Sulfate- Reducing Bacteria in Water and Water-Formed Deposits. West Conshohocken, United States.
  • Barton, L. L., Fauque, G. D. (2009). Biochemistry, physiology and biotechnology of sulfate-reducing bacteria. Advances in Applied Microbiology 68: 41–98.
  • Coulon, F., McKew, B.A., Osborn, A.M., McGenity, T.J., Timmis, K.N. (2007). Effects of temperature and biostimulation communities in temperate estuarine waters. Environmental Microbiology 9: 177–186.
  • Jİrgensen, B. B. ve Nelson, D. (2004). Sulfide oxidation in marine microbiology. Geological Society of America. Special Paper 379. Geochemistry meets
  • Knoblauch, C., Jİrgensen, B.B. ve Harder, J. (1999). Community psychrophilic sulfate-reducing bacteria in Arctic metabolic rates of estuary, UK. Environmental
  • Madigan, M.T., Martinko, J.M. ve Stahl, D. (2010). Brock Biology of Microorganisms (13th ed.). New Jersey: Pearson Education.
  • Matsui, G.Y., Ringelberg, D.B., Lovell, C.R. (2004). Sulfate-reducing bacteria in tubes constructed by the marine infaunal polychaete Diopatra cuprea. Applied and Environmental Microbiology 7053– 7065.
  • Muyzer, G. and Stams, A.J. (2008). The ecology and biotechnology of sulfate-reducing bacteria. Nature Reviews Microbiology 6: 441–454.
  • Neser, G., Unsalan, D., Tekogul, N., Stuer-Lauridsen, F. (2008). The ship breaking industry in Turkey: environmental, safety and health issues. Journal of Cleaner Production 16: 350-358.
  • Paisse, S., Coulon, F., Goni-Urriza, M., Peperzak, L., McGenity, T.J., Duran, R. (2008). Structure of bacterial communities along a hydrocarbon contamination gradient in a coastal sediment. FEMS Microbiology Ecology 66: 295–305. ve
  • Perez-Jimenez, J.R., Kerkhof, L.J. (2005). Phylogeography of sulfate-reducing bacteria among analysis of the dissimilatory sulfite reductase disclosed by genes (dsrAB). Applied and Environmental Microbiology 71(2): 1004–1011.
  • Saas, H., Cypionka, H., Babenzien, H-D. (1997). Vertical distribution of sulfate-reducing bacteria at the oxic-anoxic interface in sediments of the oligotrophic Lake Stechlin. FEMS Microbiology Ecology 22: 245-255.
  • Sahrani, F.K., Zaharan, I., Adibah, Y. and Madzlan, A. (2008). Isolation and Identification of Marine Sulfate-Reducing Bacteria, Desulfovibrio sp. and Citrobacter freundii from Pasir Gudang. Malaysia. Sains Malaysiana 37(4): 365–371.
  • Sponza, D., Karaoğlu N. (2002). Environmental geochemistry and pollution studies of Aliağa metal industry district. Environmental International 27(7): 541-553.
  • Ucuncuoglu, E., Arli O., Eronat A.H. (2006). Evaluating the impact of coastal land uses on water-clarity conditions from Landsat TM/ETM+ imagery: Candarli Bay, Aegean Sea. International Journal of Remote Sensing 27(17): 3627-3643.
  • Vester, F., Ingvorsen, K. (1998). Improved most-probable- number bacteria with natural media and a radiotracer. Applied and Environmental Microbiology 64 (5): 1700–1707.
  • detect sulfate-reducing
  • Wargin, A., Olańczuk-Neyman, K., Skucha, M. (2007). Sulfate-reducing bacteria, their properties and methods of elimination from groundwater. Polish Journal of Environmental Studies 16(4): 639-644.
There are 20 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Journal Section Research Paper
Authors

Aslı Kaçar This is me

Publication Date December 1, 2014
Published in Issue Year 2014 Volume: 5 Issue: 2

Cite

APA Kaçar, A. (2014). Aliağa (İzmir) Denizel Ortamındaki Sülfat İndirgeyen Bakterilerin Dağılımının En-Muhtemel-Sayı Metodu (EMS) ile Araştırılması. Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 5(2), 5-12.