İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması

Elif Sevim; Ali Sevim; Ahu Kanburoğlu; Zuhal Kalyoncu

doi:10.7240/marufbd.290786

İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması

Abstract

Çay bitkisi (Camellia cinensis) dünyada sudan sonra en çok kullanılan içecektir. Bu çalışmada, fabrikaya getirilen yaş çayın kuru çay ola- rak imal edilinceye kadar olan her bir işlenme aşamasındaki süreçte üzerinde doğal olarak bulunan, Gram negatif koliformbakterilerin an- tibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi hedeflenmiştir. İzole edilen koliform bakterilerin identifikasyonu koloni morfolojisi, Gram bo- yanma özelliği geleneksel yöntemler kullanılarak yapılmıştır. Agar disk difüzyon metodu ile antibiyotik direnç profilleri belirlenmiş ve TEM tipi beta-laktamaz ve tetrasiklindirenç genlerinin varlığı PCR ile araştırılmıştır. Yaş çayın işleme aşamalarında toplam 312 enterik bakteri izole edilirken işlenmiş çayda herhangi bir mikroorganizma gözlemlenmemiştir. İzolatların %35,8’i Klebsiella, %17,6’sı Citrobac- ter, %15,1’i Enterobacter, %8,3’ü Edwarsiella, %7,1’i Escherichia cinslerine ait oldukları belirlenirken %16,1’i tanımlanamamıştır. İzole edilen suşlarda en yüksek direnç %81,73 ile ampisiline karşı gözlenirken, nalidiksik asit, netilmisin ve imipeneme dirençli suş bulunma- mıştır. Ampisilin dirençli suşların ikisinde TEM tipi β-laktamaz geni (blaTEM) tespit edilmiştir. İzole edilen suşlarda tet(A), (B) ve (C) gen- lerinin varlığı araştırılmış ve tetrasiklin dirençli suşlarda tet(B) geninin yaygın olarak bulunduğu tespit edilmiştir. Yapılan transformasyon çalışmaları sonucunda tetrasiklin, ampisilin, streptomisin, seftazidim ve trimethoprim/sülfametaksazol dirençlerinin transfer edilebilir ol- duğu tespit edilmiştir.

Keywords

Çay yaprakları,koliform bakteriler,antibiyotik direnci,blaTEM geni,tet(A)-(B)-(C) geni

References

Silva, C.F., Schwan, R.F., Dias, E.S. ve Wheals, A.E. (2000). Microbial diversity during maturation and natural processing of coffee cherries of Coffeaarabica in Brazil.International Journal of Food Microbiology, 60, 251–260.
Madigan, M., Martinko, J. ve Dunlap, P. (2009). Brock Bio- logy of Microorganisms, 12 th.Edition, New York.
Bashan, Y. ve de-Bashan, L.E. (2005). Plant growth-promo- ting. In: Hillel, D. (Ed.), Encyclopedia of Soils in the Envi- ronment, vol. 1. Elsevier, Oxford, U.K., pp. 103–115.
Claus, M. (1992). A standardized gram staining procedure. World Journal of Microbiology and Biotechnology, 8, 451– 452.
Prescott, M. ve Harley, J.P. (2001). Laboratory Exercises in Microbiology, McGraw-Hill | Fifth edition, 449-451.
Holt, J.,Krieg, N., Sneath,P., Staley, J. ve Williams, S. (2000). Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology. 9th ed. Lip- pincott Williams & Wilkins, Philadelphia, Pennsylvania, USA.
CLSI- Clinical and Laboratory Standards Institute. (2006). Approved standard M45-A. Methods for antimicrobial dilu- tion and disk susceptibility testing of infrequently isolated or fastidious bacteria.CLSI., Wayne, Pennsylvania, USA.
Sambrook, J., Fritsch, E.F. veManiatis, T. (1990). Molecu- lar Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Lab. Press, Plainview, NY.

Aarestrup, F.M., Lertworapreecha, M. ve Evans, M.C. (2003). Antimicrobial susceptibility and occurrence of resis- tance genes among Salmonella entericaserovarWeltevreden from different countries.Journal of Antimicrobial Chemothe- rapy, 52,715–8.
Ausubel, F.M., Brient, R. ve Kingston, R.E. (1995). Short Protocols in Molecular Biology. 2nd ed. New York:John Wil- ley and Sons.
Özdemir, F., Topuz, A. ve Erbağ, M. (1999). Ortodoksveçay- kuryöntemleriileüretilenfarklısınıfsiyahçayların mineral içe- rikleri.Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 23, 809- 815.
Bilgehan, H. (2000). KlinikMikrobiyoloji, ÖzelBakteriyolo- jiveBakteriEnfeksiyonları. 10. baskı, Barışyayınları, İzmir.
Scott,E.,Bloomfield,S.F.VeBarlow,C.G.(1982).Aninves- tigation of microbial contamination in the home. Journal of Hygiene, 89, 279–93.
Mo, H., Yang, Z. ve Zongmao, C. (2007). Microbial fermen- ted tea a potential source of natural food preservatives. Trends in Food Science and Technology, 19, 124-130.
Chorianopoulos, N.G., Boziaris, I.S., Stamatiou, A. ve Ny- chas, G.J.E. (2005). Microbial association and acidity de- velopment of unheated and pasteurized green-table olives fermented using glucose or sucrose supplements at various levels. Food Microbiology, 22, 117–124.
Nijjens,S.,Florjin,A.,Bonten,m.J.,Schmitz,F.J.,Verhoef,J. Ve Fluit, A.C. (2004). Beta lactam susceptibilities and preve- lance ESBL-producing isolates among more than 5000 Euro- pean Enterobacteriaceae isolates. International Journal of Antimicrobial Agents, 24, 585-591.
Alpay-Karaoglu, S., Ozgumus, O.B., Sevim, E., Kolaylı, F., Sevim, A. ve Yesilgil, P. (2007). Investigation of antibiotic resistance profile and TEM-type β-lactamase gene carriage of ampicillin-resistant Escherichia coli strains isolated from drinking water. Annals of Microbiology, 57, 281-288.
Ozgumus, O.B., Celik-Sevim, E., Alpay-Karaoglu, S., San- dalli, C. ve Sevim, A. (2007). Molecular Characterization of Antibiotic Resistant Escherichia coli Strains Isolated from Tap and Spring Waters in a Coastal Region in Turkey .The Journal of Microbiology, 45, 379-387.
Ozgumus, O.B., Sandalli, C., Sevim, A., Celik-Sevim, E. ve Sivri, N. (2009). Class 1 and Class 2 Integrons and Plas- mid-Mediated Antibiotic Resistance in Coliforms Isolated from Ten Rivers in Northern Turkey. The Journal of Microbi- ology, 47, 1- 10.
Çolakoğlu, F., Özgümüş, O.B., Sandalli, C., Çelik-Sevim, E. ve Alpay- Karaoğlu, Ş. (2010). Deniz suyu kökenliKoliform- lardaSınıf 1 veSınıf 2 Integron gen kasetlerive antibiyotik di- rencinin karakterizasyonu.TürkMikrobiyoloji Cemiyeti Der- gisi, 40, 97 – 108.
Nwosu, V.C. (2001). Antibiotic resistance with particular re- ference to soil microorganisms.Research Microbiology, 152, 421-430.
Livermore, D.M. (1995). β-Lactamases in laboratory and cli- nical resistance. Clinical Microbiology Review, 8, 557-84.
Bush, K. ve Jacoby, G.A. (1997). Nomenclature of TEM β-la- ctamases.Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 39, 1-3.
Roe, M.T., Vega, E. ve Pillai, S.D. (2003). Antimicrobial re- sistance markers of class 1 and class 2 integron bearing Es- cherichia coli from irrigation water and sediments.Emerging Infectious. Diseases, 9, 822-6.
Chopra, I. ve Roberts, M. (2001). Tetracycline antibiotics: mode of action, applications, molecular biology, and epide- miology of bacterial resistance. Microbiology and Molecular Biology Review, 65, 232–60.

Details

Primary Language

Turkish

Subjects

Engineering

Journal Section

Research Article

Authors

Elif Sevim

Ali Sevim This is me

Ahu Kanburoğlu This is me

Zuhal Kalyoncu This is me

Publication Date

January 30, 2017

Submission Date

February 13, 2017

Acceptance Date

November 1, 2016

Published in Issue

Year 2016 Volume: 28 Number: 4

DOI

https://doi.org/10.7240/marufbd.290786

IZ

https://izlik.org/JA78ER27XK

Cite

RIS / Bibtex

APA

Sevim, E., Sevim, A., Kanburoğlu, A., & Kalyoncu, Z. (2017). İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması. Marmara Fen Bilimleri Dergisi, 28(4), 150-157. https://doi.org/10.7240/marufbd.290786

AMA

1.Sevim E, Sevim A, Kanburoğlu A, Kalyoncu Z. İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması. MAJPAS. 2017;28(4):150-157. doi:10.7240/marufbd.290786

Chicago

Sevim, Elif, Ali Sevim, Ahu Kanburoğlu, and Zuhal Kalyoncu. 2017. “İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından Izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması”. Marmara Fen Bilimleri Dergisi 28 (4): 150-57. https://doi.org/10.7240/marufbd.290786.

EndNote

Sevim E, Sevim A, Kanburoğlu A, Kalyoncu Z (January 1, 2017) İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması. Marmara Fen Bilimleri Dergisi 28 4 150–157.

IEEE

[1]E. Sevim, A. Sevim, A. Kanburoğlu, and Z. Kalyoncu, “İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması”, MAJPAS, vol. 28, no. 4, pp. 150–157, Jan. 2017, doi: 10.7240/marufbd.290786.

ISNAD

Sevim, Elif - Sevim, Ali - Kanburoğlu, Ahu - Kalyoncu, Zuhal. “İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından Izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması”. Marmara Fen Bilimleri Dergisi 28/4 (January 1, 2017): 150-157. https://doi.org/10.7240/marufbd.290786.

JAMA

1.Sevim E, Sevim A, Kanburoğlu A, Kalyoncu Z. İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması. MAJPAS. 2017;28:150–157.

MLA

Sevim, Elif, et al. “İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından Izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması”. Marmara Fen Bilimleri Dergisi, vol. 28, no. 4, Jan. 2017, pp. 150-7, doi:10.7240/marufbd.290786.

Vancouver

1.Elif Sevim, Ali Sevim, Ahu Kanburoğlu, Zuhal Kalyoncu. İşlenme Aşamalarındaki Çay Yapraklarından izole Edilen Koliform Grubu Bakterilerde Antibiyotik Direnç Profilinin Araştırılması. MAJPAS. 2017 Jan. 1;28(4):150-7. doi:10.7240/marufbd.290786