Çocuklarda İdrar Kültürlerinden İzole Edilen Bakteriler ve Antibiyotik Duyarlılıkları

Abstract

Amaç: Bu çalışmada çocuk hastaların idrar kültürlerinden izole edilen bakterilerin antibiyotik direnç paternlerini belirlemek ve ampirik tedavide klinisyen hekimlere yardımcı olmak amaçlanmıştır.

Gereç ve Yöntemler: 1 Ocak 2021-1 Haziran 2023 tarihleri arasında 0-17 yaş aralığında çocuk hastaların idrar örneklerinden izole edilen bakterilerin antibiyotik direnç oranları retrospektif olarak analiz edilmiştir. İdrar örnekleri %5 koyun kanlı agar ve Eosin-Methylene Blue agar besiyerlerine inoküle edilmiş ve 35,5±1°C’de 18-24 saat süreyle inkübe edilmiştir. Kültür örneklerinde ≥10⁵ koloni üreme saptananlar çalışmaya dahil edilmiştir. Bakterilerin identifikasyon ve antibiyogram testleri tam otomatize cihaz (Vitek2, bioMérieux, Fransa) ile yapılmıştır.

Bulgular: 372’si (%33) erkek, 756’sı (%67) kız çocuklarında toplam 1128 hastanın idrar kültüründen en sık sırasıyla Escherichia coli (%49,7), Klebsiella spp. (%14,2) ve Enterococcus spp. (%11,2) izole edilmiştir. E. coli’ de en yüksek direnç ampisilin’e %65,6, amoksisilin-klavulonikasit’e %44,8, sefuroksim’e %39,9, sefiksim ’e %38,4, trimetoprim-sulfametoksazol’e %32,7, seftriakson’a %28,3 ve sefotaksim’e karşı %28,3 oranında görülmüştür. İdrar kültürlerinde bakteri üremesi en sık 0-2 ve 6-11 yaş gruplarında görülmüştür. E. coli 0-2 yaş grubunda diğer yaş gruplarına göre daha az sıklıkta görülürken tersine Klebsiella spp. 0-2 yaş grubunda diğer yaş gruplarına göre daha sık görülmüştür. Gram-pozitif bakterilerden Enterococcus spp. en sık 0-5 yaş grubunda, Streptococcus spp. ise 12-17 yaş grubunda görülmüştür.

Sonuç: Direnç oranlarının bölgesel farklılıklar gösterebileceği dikkate alındığında bu sonuçların bölgemizdeki çocuk hastalarda görülen üriner sistem enfeksiyonlarının ampirik tedavisine ve akılcı antibiyotik kullanım politikalarına katkı sağlayacağı düşünülmüştür.

Keywords

• Antibiyotik direnci
• çocuk
• üriner sistem enfeksiyonu

Bacteria Isolated from Urine Cultures in Children and Their Antibiotic Sensitivities

Abstract

Aim: This study aimed to determine the antibiotic resistance patterns of bacteria isolated from urine cultures of pediatric patients and to assist clinicians in empirical treatment.

Material and Methods: Antibiotic resistance rates of bacteria isolated from urine samples of pediatric patients aged 0-17 years between January 1, 2021, and June 1, 2023, were retrospectively analyzed. Urine samples were inoculated onto 5% sheep blood agar and eosin-methylene blue agar media and incubated at 35.5±1°C for 18-24 hours. Samples with ≥105 colony growth were included in the study. Bacterial identification and antibiogram tests were performed using a fully automated device (Vitek2, bioMérieux, France).

Results: In urine cultures of a total of 1128 patients, 372 (33%) boys and 756 (67%) girls, the most frequently isolated bacteria were Escherichia coli (49.7%), Klebsiella spp. (14.2%), and Enterococcus spp. (11.2%), respectively. The highest resistance in E. coli was observed against ampicillin (65.6%), amoxicillin-clavulanic acid (44.8%), cefuroxime (39.9%), cefixim (38.4%), trimethoprim-sulfamethoxazole (32.7%), ceftriaxone (28.3%), and cefotaxim (28.3%). Bacterial growth in urine cultures was most common in the 0-2 and 6-11 year age groups. E. coli was less common in the 0-2 year age group compared to other age groups, while conversely, Klebsiella spp. was more common in the 0-2 year age group compared to other age groups. Among Gram-positive bacteria, Enterococcus spp. was most common in the 0-5 year age group, and Streptococcus spp. was most common in the 12-17 year age group.

Conclusion: Considering that resistance rates may show regional differences, it is thought that these results will contribute to the empirical treatment of urinary tract infections seen in pediatric patients in our region and to rational antibiotic use policies.

Keywords

• Antibiotic resistance
• children
• urinary tract infection

References

1. Samancı S, Çelik M, Köşker M. Antibiotic resistance in childhood urinary tract infections: a single-center experience. Turk Pediatri Ars. 2020;55(4):386-92. doi:10.14744/TurkPediatriArs.2020.22309.
2. Edlin RS, Shapiro DJ, Hersh AL, Copp HL. Antibiotic resistance patterns of outpatient pediatric urinary tract infections. J Urol. 2013;190(1):222-7. doi:10.1016/j.juro.2013.01.069.
3. Daniel M, Szymanik-Grzelak H, Sierdziński J, Podsiadły E, Kowalewska-Młot M, Pańczyk-Tomaszewska M. Epidemiology and risk factors of UTIs in children-a single-center observation. J Pers Med. 2023;13(1):138. doi:10.3390/jpm13010138.
4. Kaufman J, Temple-Smith M, Sanci L. Urinary tract infections in children: an overview of diagnosis and management. BMJ Paediatrics Open. 2019;3(1):e000487. doi:10.1136/ bmjpo-2019-000487.
5. The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Version 10.0 [Internet]. EUCAST; 2020. [cited 2024 Oct 09]. Available from: http://www.eucast.org
6. IBM SPSS Statistics for Windows, Version 26.0 [Computer software]. Armonk, NY: IBM Corp.; 2019.
7. Kalaycıoğlu O, Akhanlı SE. Sağlık araştırmalarında güç analizinin önemi ve temel prensipleri: Tıbbi çalışmalar üzerinde uygulamalı örnekler. Turk J Public Health. 2020;18(1):103-12. doi:10.20518/tjph.602400.
8. Güven, S. Çocuklarda idrar yolu enfeksiyonu. Klinik Tıp Pediatri Dergisi. 2017;9(5): 8-15. izlik no:JA82KT34TR.

9. Tanrıverdi Çaycı Y, Karacan G, Yoosefi M, Bilgin K, Gür Vural D, Birinci A. Çocuklarda idrar kültüründen izole edilen gram negatif bakterilerin ve antibiyotik duyarlılıklarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. Ahi Evran Med J. 2022; 6(2): 168-73. doi:10.46332/aemj.957515.
10. Yaşar A, Yaşar B, Akyüz Özkan E, Savcı Ü. Yozgat yöresi çocukluk çağı idrar yolu enfeksiyonuna en sık sebep olan etkenler ve antibiyotik dirençleri. Bozok Tıp Dergisi. 2018; 8(2):53-8. doi:10.16919/bozoktip.343112.
11. Çolak M, Taş E, Atıcı KC, Doğan E. İdrar yolu enfeksiyonu tanılı çocuklarda üropatojenlerin dağılımı ve antibiyotik direnç profillerinin araştırılması. Unika Sağlık Bilimleri Dergisi. 2024; 4(3): 948-60. izlik no:JA79UA96HB.
12. Gunduz S, Uludağ Altun H. Antibiotic resistance patterns of urinary tract pathogens in Turkish children. Glob Health Res Policy. 2018;3:10. doi:10.1186/s41256-018-0063-1.
13. Taşkın Kafa AH, Çubuk F, Akbulut RE, Hasbek M, Taştanoğlu H. Çocuklarda üriner sistem enfeksiyon etkenlerinin dağılımı ve antibiyotiklere duyarlılıklarının değerlendirilmesi. J Curr Pediatr. 2024;22(1):24-30. doi:10.4274/jcp.2024.62444.
14. Taner S, Aydemir SŞ, Özgür S, Aksoy E, Keskinoğlu A, Tünger A. et al. In vitro antimicrobial susceptibility of urinary tract infection pathogens in children. J Pediatr Res. 2023;10(3):210-5. doi:10.4274/jpr.galenos.2023.25986.
15. Kömürlüoğlu A, Aykaç K, Özsürekçi Y, Tanır Başaranoğlu S, Bıçakçıgil A, Liste Ü, et al. Gram negatif idrar yolu enfeksiyonu etkenlerinin antibiyotik direnç dağılımı: tek merkez deneyimi. Türkiye Çocuk Hastalıkları Dergisi. 2018;12(1):10-7. izlik no:JA99CB86AT.
16. Milletli Sezgin F, Nar R. İdrar yolu enfeksiyonu ön tanılı çocuk hastaların idrar kültürü ve idrar analiz sonuçlarının değerlendirilmesi. Pamukkale Tıp Derg. 2017;10(3):242-8. doi:10.5505/ptd.2017.35002.
17. Topal Y. Çocuklarda idrar yolu enfeksiyonu: güncel veriler eşliğinde bir değerlendirme. Ortadoğu Tıp Derg. 2018;10(1):26-33. doi:10.21601/ortadogutipdergisi.391466.
18. Cağ Y, Haciseyitoglu D, Ozdemir AA, Cag Y. Antibiotic resistance and bacteria in urinary tract infections in pediatric patients. Medeni Med J. 2021;36(3):217-24. doi:10.5222/MMJ.2021.78535.
19. Shrestha LB, Baral R, Poudel P, Khanal B. Clinical, etiological and antimicrobial susceptibility profile of pediatric urinary tract infections in a tertiary care hospital of Nepal. BMC Pediatr. 2019;19(1):36. doi:10.1186/s12887-019-1410-1.
20. Fenta A, Dagnew M, Eshetie S, Belachew T. Bacterial profile, antibiotic susceptibility pattern and associated risk factors of urinary tract infection among clinically suspected children attending at Felege-Hiwot comprehensive and specialized hospital, Northwest Ethiopia. A prospective study. BMC Infect Dis. 2020;20(1):673. doi:10.1186/s12879-020-05402-y.
21. Esposito S, Maglietta G, Di Costanzo M, Ceccoli M, Vergine G, La Scola C, et al. Retrospective 8-year study on the antibiotic resistance of uropathogens in children hospitalised for urinary tract ınfection in the Emilia-Romagna Region, Italy. Antibiotics (Basel). 2021;10(10):1207. doi:10.3390/ antibiotics10101207.
22. Alzahrani MA, Sadoma HHM, Mathew S, Alghamdi S, Malik JA, Anwar S. Retrospective analysis of antimicrobial susceptibility of uropathogens isolated from pediatric patients in tertiary hospital at Al-Baha Region, Saudi Arabia. Healthcare (Basel). 2021;9(11):1564. doi:10.3390/healthcare9111564.
23. Ayelign B, Abebe B, Shibeshi A, Meshesha S, Shibabaw T, Addis Z, et al. Bacterial isolates and their antimicrobial susceptibility patterns among pediatric patients with urinary tract infection. Turk J Urol 2018;44(1):62-9. doi:10.5152/tud.2017.33678.
24. Kalal BS, Patel RB. Microbiological and antimicrobial profile of urinary tract infection in children from a teaching hospital in South India. J Pediatr Inf. 2017;11:i19-22. doi:10.5578/ced.50691.
25. Chandio MA, Anwar T, Rehman A, Safdar S, Qaisrani S, Fatima S, et al. Spectrum of urinary tract pathogens and their antimicrobial susceptibility pattern in paediatric patients. Pakistan Journal of Medical & Health Sciences. 2024;18(4):29-33. doi:10.53350/pjmhs020241848.
26. Kawalec A, Józefiak J, Kiliś-Pstrusińska K. Urinary tract ınfection and antimicrobial resistance patterns: 5-year experience in a tertiary pediatric nephrology center in the Southwestern Region of Poland. Antibiotics (Basel). 2023;12(9):1454. doi:10.3390/antibiotics12091454.
27. Pouladfar G, Basiratnia M, Anvarinejad M, Abbasi P, Amirmoezi F, Zare S. The antibiotic susceptibility patterns of uropathogens among children with urinary tract infection in Shiraz. Medicine (Baltimore). 2017;96(37):e7834. doi:10.1097/MD.0000000000007834.
28. Wanke-Rytt M, Sobierajski T, Lachowicz D, Seliga-Gasior D, Podsiadły E. Analysis of etiology of community-acquired and nosocomial urinary tract ınfections and antibiotic resistance of ısolated strains: results of a 3-year surveillance (2020–2022) at the Pediatric Teaching Hospital in Warsaw. Microorganisms. 2023;11(6):1438. doi:10.3390/ microorganisms11061438.
29. Sanmak E, Çirkin G, Orhan Ö. Polikliniklere başvuran çocuk hastaların idrar örneklerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Umraniye Pediatri Dergisi. 2023;3(3):145-51. doi:10.14744/upd.2023.83803.
30. Çalgın MK, Çetinkol Y, Erdil A. Ordu ilinde çocukların idrar örneklerinden izole edilen bakteriler ve antibiyotik direnç oranları. Bozok Tıp Dergisi. 2017;7(1):64-9. izlik no:JA88NN34DH.
31. Mawa I, Mazumder PK, Barua R, Roy B. Antimicrobial resistance pattern of bacterial isolates in urine of the children suffering from UTI. IAHS Medical Journal. 2021;4(2):17-23. doi:10.3329/iahsmj.v4i2.62517.
32. Bagnasco F, Piaggio G, Mesini A, Mariani M, Russo C, Saffioti C, et al. Epidemiology of antibiotic resistant pathogens in pediatric urinary tract ınfections as a tool to develop a prediction model for early detection of drug-specific resistance. Antibiotics (Basel). 2022;11(6):720. doi:10.3390/ antibiotics11060720.
33. Akyol Onder EN, Türkel S, Kılıçaslan C. Urinary tract infections in children: clinical and antibiotic susceptibility data from a tertiary care hospital. Med J West Black Sea. 2023;7(2):234-40. doi:10.29058/mjwbs.1217496.