Detection of Alfalfa Mosaic Virus and Tomato Spotted Wilt Virus in Tomato and Pepper Growing Areas of Hakkari Province

Abstract

In order to determine of TSWV and AMV in tomato and pepper, surveys were conducted during the growing season of 2020. A total of 184 leaf samples were collected from tomato and pepper plants exhibiting yellowing, necrosis, mosaic and deformation. Collected samples were tested by Double antibody sandwich enzyme linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) for detection of Tomato spotted wilt virus (TSWV) and Alfalfa mosaic virus (AMV). As a result of DAS-ELISA test, 26 out of 184 leaf samples were found infected with TSWV, 2 out of 184 leaf samples were found infected with AMV. No mixed infections were found in collected samples. In this study, the presence of TSWV and AMV were revealed for the first time in tomato and pepper areas in Hakkari province.

Keywords

• Tomato
• Pepper
• TSWV
• AMV
• DAS-ELISA

Project Number

FM21BAP1

Hakkari İli Domates ve Biber Üretim Alanlarında Yonca Mozaik Virüsü ve Domates Lekeli Solgunluk Virüsü’nün Belirlenmesi

Abstract

Hakkari ili domates ve biber üretim alanlarında domates lekeli solgunluk virüsü (Tomato spotted wilt virus, TSWV) ve yonca mozaik virüsü (Alfalfa mosaic virus, AMV)’nün belirlenmesi için yapılan sürveyler 2020 üretim döneminde gerçekleştirilmiştir. Domates ve biber üretim alanlarında sararma, nekroz, mozaik ve şekil bozukluğu simptomu gösteren 184 bitkiden yaprak örneği toplanmıştır. Toplanan yaprak örneklerinde TSWV ve AMV’nin belirlenmesi için Double antibody sandwich enzyme linked immunosorbent assay (DAS-ELISA) yöntemi kullanılmıştır. DAS-ELISA yöntemine göre toplam 184 yaprak örneğinden 26 adedinin TSWV ve 2 adedinin AMV ile enfekteli olduğu saptanmıştır. Toplanan örneklerde karışık enfeksiyona rastlanmamıştır. Bu çalışma Hakkari ili domates ve biber alanlarında TSWV ve AMV’nin tanılanması bakımından yapılan ilk çalışmadır.

Keywords

• domates
• biber
• TSWV
• AMV
• DAS-ELISA

Supporting Institution

Hakkari Üniversitesi

Project Number

FM21BAP1

Thanks

Bu çalışma FM21BAP1 No’lu Proje ile Hakkari Üniversitesi, Bilimsel Araştırma Projeleri Birimi tarafından maddi olarak desteklenmiştir. Destekleri ve katkıları için teşekkür ederiz.

References

1. [1] Yılmaz, E. 2014. Edirne ili sebze üretim alanlarındaki virüs hastalıklarının saptanması üzerine araştırmalar. Namık Kemal Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Yüksek Lisans Tezi, 45s, Tekirdağ.
2. [2] Günay, A. 1992. Özel Sebze Yetiştiriciliği, Cilt II. Ankara Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri Bölümü Yayınları, Ankara, 103s.
3. [3] Özalp, R., Çelik, İ., Coşkun, A. 2006. Örtüaltı biber yetiştiriciliği. batı akdeniz tarımsal araştırma enstitüsü müdürlüğü, Tarımın Sesi, TMMOB Ziraat Mühendisleri Odası, 9, 18-21.
4. [4] TÜİK, 2021. Bitkisel üretim istatistikleri. http://www.tuik.gov.tr/bitkiselapp/bitkisel.zul. (Erişim Tarihi: 01.02.2022).
5. [5] Arlı-Sökmen, M., Şevik, M. A. 2006. Viruses ınfecting field grown tomatoes in Samsun province, Turkey. Archives of Phytopathology and Plant Protection, 39, 283-288.
6. [6] Yeşil, S., Gömlekli, Ö. 2021. Determination of prevalence and reservoir weed species of tomato spotted wilt tospovirus-tswv on peppers grown in greenhouses in Kumluca district of Antalya, Turkey. Turkish Journal of Agriculture-Food Science and Technology, 9, 2565-2570.
7. [7] Rosello, S., Diez, M. J., Nuez, F. 1996. Viral diseases causing the greatest economic losses to the tomato crop, the tomato spotted wilt virus-a review. Scienta Horticulturae, 67, 117-150.
8. [8] Hanssen, I. M., Lapidot, M., Thomma, B. P. 2010. Emerging viral diseases of tomato crops. Molecular Plant Microbe Interaction, 23, 539-548.

9. [9] Salem, N. M., Mansour, A., Badwan, H. 2012. Identification and partial characterization of tomato spotted wilt virus on lettuce in Jordan. Journal of Plant Pathology, 94(2), 431-435.
10. [10] Mau, R. F. L., Martin, J. L. 2002. Frankliniella occidentalis (Pergande). www.extentohawai.edu /kbase/crop/type/f-occid.html. (Erişim Tarihi: 11.12.2021).
11. [11] Sherwood, J. L., German, T. L., Moyer, J. W., Ullman, D. E. 2009. Tomato spotted wilt. the plant health ınstructor. (Erişim Tarihi: 22.10.2021).
12. [12] Güller, A., Usta, M., Korkmaz, G. 2022. Bingöl ı̇linde tanımlanan yonca mozaik virüs (amv) ı̇zolatının filogenetik ı̇lişkisi. Türk Tarım ve Doğa Bilimleri Dergisi, 9(1), 166–172.
13. [13] Jaspars, E. M. J., Bos, L. 1980. Alfalfa mosaic virus CMI/AAB. Description of Plant Viruses. No. 229.
14. [14] Kaiser, W. J., Hannan, R. M. 2005. Alfalfa mosaic. pp. 58-59. Schwartz, H. F., Steadman, J. R., Hall R., Forster, R. L., ed. Compendium of Bean Diseases, American Phytopathological Society, St. Paul, MN.
15. [15] Goldbach, R., Peters, D. 1994. Possible causes of the emergence of tospovirus diseases. Sem Virology, 5, 113-120.
16. [16] Pappu, H. R., Jones, R. A. C., Jain, R. K. 2009. Global status of tospovirus epidemics in diverse cropping systems: successes gained and challenges that lie ahead. Virus Research, 141, 219–236.
17. [17] Jain, R. K., Pappu, S. S., Pappu, H. R., Culbreath, A. K., Tood, J. W. 1998. Molecular diagnosis of tomato spotted wilt tospovirus ınfection of peanut and other field and green house crops. Plant Disease, 82, 900- 904.
18. [18] Parrella, G., Gognalons, P., Gebre-Selassie, K., Vovlas, C., Marchoux, G. 2003. An update of the host range of tomato spotted wilt virus. Journal of Plant Pathology, 227-264.
19. [19] Arlı-Sökmen, M., Mennan, H., Şevik, M. A., Ecevit, O. 2005. Occurence of viruses in field-grown pepper crops and some of their reservoir weeds hosts in Samsun, Turkey, Phytoparasitica, 33(4), 347-358.
20. [20] Güldür M. E., Marchouks, M. G. M., Yurtmen, E., Yılmaz, M. A. 1995. Mersin ve çevresinde yetiştirilen domateslerde zararlı yeni bir virüs tomato spotted wilt virus. VII. Türkiye Fitopatoloji Kongresi, 26-29 Eylül, Adana, 303-306.
21. [21] Yılmaz, M. A., Baloğlu, S., Özaslan, M., Güldür, M. E. 1995. GAP bölgesinde kültür bitkilerinde belirlenen virüsler. GAP Bölgesi Bitki Koruma Sorunları ve Çözüm Önerileri Sempozyumu, 27-29 Nisan, Şanlıurfa, 241-250.
22. [22] Şevik, M. A, Arli-Sökmen, M. 2012. Estimation of the effect of tomato spotted wilt virus (TSWV) ınfection on some yield components of Tomato. Phytoparasitica, 40(1), 87-93.
23. [23] Çulal-Kılıç, H., Yardımcı, N., Bal, A., Güneş, A., Deniz, F. 2017. Sensitive detection of tomato spotted wilt virus from pepper plants by DAS-ELISA, RT-PCR and IC-RT-PCR. Romanian Biotechnological Letters, 22(5), 12934-12939.
24. [24] Fidan, H., Koç, G., Topçu, T. 2016. Anthurium sp.'de tomato spoted wilt virus (TSWV) enfeksiyonu ve moleküler karakterizasyonu. Alatarım, 15(2), 28-36.
25. [25] Alam, A., Elçi, E. 2021. Evaluation of Eggplant cultivars for tomato spotted wilt orthotospovirus (TSWV) disease tolerance in greenhouse conditions. International Journal of Agriculture, Environment and Food Science, 5(4), 497-507.
26. [26] Zitter, T. A., Hopkins, D. L., Thomas, C. E. 1996. Compendium of cucurbit diseases. Phytopathological Society, No: 635.
27. [27] Bozdoğan, V., Kamberoğlu, M. A. 2015. Incidence and distribution of tomato spotted wilt tospovirus (tswv) in vegetable crops in antalya province of Turkey. Journal of Turkish Phytopathology, 44(1-3), 39-50.
28. [28] Değirmenci, K., Uzunoğulları, N. 2007. Marmara bölgesinde domates yetiştiricilik alanlarında sorun olan virüslerin belirlenmesi. Bitki Koruma Bülteni, 47(1-4), 72-77.
29. [29] Özdemir, S., Erilmez, S. 2007. Denizli ilinde yetiştirilen biber, patlıcan ve marul üretim alanlarında bazı viral etmenlerin saptanması. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi, 27-29 Ağustos, Isparta, 114.
30. [30] Topkaya Ş. 2021. Tokat ilinde biber alanlarında Tomato spotted wilt virus’ın yaygınlığı ve moleküler karakterizasyonu. Bitki Koruma Bülteni, 61-63.
31. [31] Weimer, J. L. 1931. Alfalfa mosaic virus (typestrain). CMI/AAB Description of Plant Viruses, No. 46.
32. [32] Xu, H., Nie, J. 2006. Identification, characterization and molecular detection of alfalfa mosaic virus in potato. Phytopathology, 96, 1237-1242.
33. [33] Ragsdale, D. W., Radcliffe, E. B., Difonzo, C. D. 2001. Epidemiology and field control of PVY and PLRV. pp. 237-270. Loebenstein, G., Berger, P. H., Brunt, A. A., Lawson, R.H. ed. 2001. Virus and virus like diseases of potatoes and production of seed potatoes. Huwer Academic Publisher, Dordrecht.
34. [34] Pernezny, K., Robert, P. D., Murphy, J. F., Goldberg, N. P. 2003. Compendium of pepper diseases. The American Phytopatholgical society, 68, 597-599.
35. [35] Demir, M. 2005. Kahramanmaraş’ta Yetiştirilen Kırmızı Biberlerde Yaprakbiti İle Taşınan Virüslerin Saptanması. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Yüksek Lisans Tezi, Kahramanmaraş, 25s.
36. [36] Buzkan, N., Denir, M., Öztekin, V., Mart, C., Çağlar B. K., Yilmaz, M. A. 2006. Evaluation of the status of capsicum viruses in the main growing regions of Turkey. Bulletin OEPP, 36(1), 15-19.
37. [37] Çetinkıran, A., Baloğlu, S. 2011. Adana ve Mersin illerinde biber arazilerinde alfalfa mozaik virüsünün araştırılması. Çukurova Üniversitesi, Fen ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, 26(2), 89-98.
38. [38] Çulal-Kılıç, H., Yardımcı, N. 2015. Occurrence of alfalfa mosaic virus (AMV) ınfecting bean crop in Burdur province, Turkey. Asian Journal of Agriculture and Food Sciences, 3(2), 173-177.
39. [39] Çarpar, H., Sertkaya, E., Sertkaya, G. 2017. Detection of alfalfa mosaic virus (AMV) in potato production areas in Hatay Province, Turkey. Iğdır Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 7(1), 23-29.
40. [40] Usta, M., Güller, A. 2020. Molecular characterization of the coat protein genome of alfalfa mosaic virus (AMV) isolates from alfalfa in Van province. Journal of the Institute of Science and Technology, 10(4), 2366-2377.
41. [41] Fidan, H., Adak, N. A., Konuksal, A., Akerzurumlu, E., Yılmaz, M. A. 2012. Occurrence of alfalfa mosaic virus (AMV) diseases on potato crops in Northern Cyprus. ActaHorticulturae, 960, 341-346.
42. [42] Özdağ, Y., Sertkaya G. 2017. ınvestigation on viruses causing yellowing disease in pepper in Hatay-Turkey. Journal of Agricultural Faculty of Mustafa Kemal University, 22(1), 16-22.