BibTex RIS Cite

Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (<i>Medicago sativa</i> L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu

Year 2016, Volume: 20 Issue: 2, 0 - , 06.06.2016

Mehmet Öten , Sebahattin Albayrak

Abstract

Medicago tür ve populasyonlarında moleküler markırlar kullanılarak genotipik varyasyon seviyesini belirlemek yaygın olarak kullanılmaktadır. Bu çalışmada; Batı Akdeniz sahil kuşağında yer alan, Antalya iline ait 13 ilçede, 26 farklı lokasyonda, doğal vejetasyondan toplanan üstün yonca genotipleri klon yöntemi ile çoğaltılmıştır. Elde edilen 26 genotip ve 2 standart çeşidin aralarındaki benzerlikler, Basit Tekrarlı Sekanslar (SSR) moleküler analiz tekniğiyle, 15 adet primer kullanılarak belirlenmiştir. SSR primerlerinin % 99,7’si polimorfik bant vermiştir. Araştırma sonucunda; kümeleme analizi sonucu oluşan dendograma göre yonca genotipleri 2 ana ve 4 alt gruba ayrılmıştır. Birinci ana grup % 60, ikinci ana grup ise % 65 seviyesinde kendi içerisinde iki alt gruba ayrılmıştır. Benzerlik katsayıları 0.58-0.88 değerleri arasında değişim göstermiştir. En yakın genetik benzerlik Kaş-2 ve Çeşit-1 arasında bulunurken, en uzak ise Gazipaşa-1-Kumluca-2 genotipleri arasında bulunmuştur. Elde edilen bu sonuca göre Batı Akdeniz sahil kuşağından toplanan yonca genotipleri arasında genetik olarak önemli bir varyasyonun olduğu tespit edilmiştir.

Keywords

Yonca; Medicago sativa L.; Moleküler karakterizasyon

References

  • [1] Brummer, E. C. 1998. Defining heterotic groups in alfalfa: A molecular marker perspective. Proceedings of the 36th North American Alfalfa Improvement Conference. Bozeman, Montana August 2-6-1998
  • [2] Brummer, E.C., Bouton J.H., Kochert, G. 1995. Analysis of annual Medicago species using RAPD markers. Genome, 38; 362-367.
  • [3] Carelli, M., Gnocchi, G., Scotti, C. 2009. Alfalfa germ plasmfrom a Saharaoasis: characterization by means of bio-agronomic trait sand SSR markers. Plant Breeding 128, 271—277 (2009) doi:10.1111/j.1439-0523.2008.01573.x, Berlin
  • [4] Diwan, N., Bouton, J.H., Kochert, G., Cregan, P.B. 2000. Mapping of Simple sequencerepeat (SSR) DNA markers in diploid and tetraploid alfalfa. Theor ApplGenet 101:165-172.
  • [5] Doyle, J.J., Doyle, J.L. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus 12, 13–15.
  • [6] Elçi, Ş. 2005. Baklagil ve Buğdaygil Yem Bitkileri. Mart Matbası, ISBN 975-407-189-6, Ankara.
  • [7] Falahati-Anbaran, M.,Habashi, A. A., Esfahany, M., Mohammadi, S. A., Ghareyazie, B. 2007. Population genetic structure based on SSR markers in alfalfa (Medicago sativa L.) from various region scontiguousto the centres of origin of the species. Journal of Genetics, Vol. 86, No. 1, April 2007
  • [8] Flajoulot, S.,Ronfort, J., Baudouin, P., Barre, P., Huguet, T., Huyghe, C., Julier, B. 2005. Genetic diversity among alfalfa (Medicago sativa) cultivars coming from a breeding program, using SSR markers. Theoretical and Applied Genetetics, 111, 1420-1429.
  • [9] Habibi, B., Farshadfar, M., Safari, H. 2012. Evaluation of Genetic Diversity in 18 Genotypes of Alfalfa (Medicago Sativa) Using of Molecular ISSR Markers. International Journal of Agriculture and Crop Sciences. Available online at www.ijagcs.com IJACS/2012/4-21/1573-1578. ISSN 2227-670X ©2012 IJACS Journal
  • [10] Harlan, J. R. 1971. Agricultural Origins Centre and non-centers. Science, 174, 468- 474.
  • [11] Karaca, M., Saha, S., Zipf, A., Jenkins, J.N., Lang, D.J. 2002. Genetic diversity among forage bermudagrass (Cynodon spp.). Evidence from chloroplast and nuclear DNA finger printing. Crop Science 42: 2118- 2127
  • [12] Keivani, M., Ramezanpour, S. S., Soltanloo, H., Choukan, Rajab, Naghavi, M., Ranjbar, Mojtaba. 2010. Genetic diversity assessment of alfalfa (Medicago sativa L.) populations using AFLP markers Australian Journal of Crop Sicience AJCS 4(7):491-497 (2010) ISSN:1835-2707
  • [13] Mckersie, B., Bowley, S. 1993. Synthetic seeds of alfalfa. In: Redenbaugh K (ed) Synseeds: Applications of Synthetic Seeds to Crop Improvement CRC Press, Boca Raton, pp. 231-256.
  • [14] Manga, Ü., Acar, Z., Ayan, İ. 1995. Baklagil Yem Bitkileri. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Ziraat Fakültesi Ders Notu No 7.
  • [15] Mengoni, A., Gori, A., Bazzicalupo, M. 2000. Use of RAPD and microsatellite (SSR) variationto ases genetic relationships among populations of tetraploidalfalfa, Medicago sativa. Plant Breeding, 119, 311-317.
  • [16] Mousavia, F., Sharifabadb, H. H., Allahdooc, M. 2010. Investigation of genetic diversity in alfalfa ecotypes collection using multivariate analysis based on morphological traits. Plant Ecophysiology 2 (2010) 103-108
  • [17] Poehlman, J.M.1983. Breeding Field Crops. Second edition. The AVI Publishing Company, Inc, Westport, Connecticut. Second Printing.
  • [18] Qiang, H., Chen, Z., Zhang, Z., Wang, X., Gao., H., Wang, Z. 2015. Molecular diversity and population structure of a worldwide collection of cultivated tetraploid alfalfa (Medicago sativa subsp.sativa L.)germplasm as revealed by micro satellite markers. PLoSOne. 2015 Apr 22;10(4):e0124592.doi:10.1371/journal.pone.0124592.
  • [19] Rohlf, F.J. 1991. NTSYS-pc. Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System. Exeter Software, Setauket, NY, USA.
  • [20] Sledge, M. K., Bouton, J. H., Kochert, G. 1998. Molecular marker diversity as a means of selecting parents for synthetic cultivars. Proceedings of the 36th North American Alfalfa Improvement Conference. Bozeman, Montana, August 2-6, 1998.
  • [21] Sneath, P.H.A., Sokal, R.R. 1973. Numerical taxonomy. W.H. Freman Co., San Francisco, 573s, USA.
  • [22] Touil, L., Guesmi, F., Fares, K., Zagrouba, C., Ferchichi, A. 2008. Genetic diversity of some mediterranean populations of the cultivated alfalfa (Medicago sativa L.) using SSR markers. Pakistan Journal of Biological Science, 11 (15), 1923-1928.
  • [23] Tucak, M., Popović, S., Čupić, T., Šimić, G., Gantner, R., Meglič, V. 2009. Evaluation of alfalfa germplasm collection by multivariate analysis based on phenotypic traits. Romanian Agricultural Research, 26: 47-52.
  • [24] Tucak, M.,Popovic, S., Bolaric, S., Kozumplik, V. 2008. Agronomic evaluation of alfalfa genotypes under ecological comditions of eastern Croatia. VII. Alps-Adria Scientific Workshop, Cereal Research Communications, 36, 651- 654.
  • [25] Tuğay, E. 1996. Genel Bitki Islahı. Gazi Osman Paşa Üniversitesi Ziraat Fakültesi. Ders Notları s. 223 Tokat.
  • [26] Ulukapı, K., Onus, A.N. 2013. Selekte Edilmiş Bazı Yerel Taze Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Genotiplerinin Moleküler Karakterizasyonu. Tarım Bilimleri Dergisi 18, 277-286.

Year 2016, Volume: 20 Issue: 2, 0 - , 06.06.2016

Mehmet Öten , Sebahattin Albayrak

Abstract

References

  • [1] Brummer, E. C. 1998. Defining heterotic groups in alfalfa: A molecular marker perspective. Proceedings of the 36th North American Alfalfa Improvement Conference. Bozeman, Montana August 2-6-1998
  • [2] Brummer, E.C., Bouton J.H., Kochert, G. 1995. Analysis of annual Medicago species using RAPD markers. Genome, 38; 362-367.
  • [3] Carelli, M., Gnocchi, G., Scotti, C. 2009. Alfalfa germ plasmfrom a Saharaoasis: characterization by means of bio-agronomic trait sand SSR markers. Plant Breeding 128, 271—277 (2009) doi:10.1111/j.1439-0523.2008.01573.x, Berlin
  • [4] Diwan, N., Bouton, J.H., Kochert, G., Cregan, P.B. 2000. Mapping of Simple sequencerepeat (SSR) DNA markers in diploid and tetraploid alfalfa. Theor ApplGenet 101:165-172.
  • [5] Doyle, J.J., Doyle, J.L. 1990. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus 12, 13–15.
  • [6] Elçi, Ş. 2005. Baklagil ve Buğdaygil Yem Bitkileri. Mart Matbası, ISBN 975-407-189-6, Ankara.
  • [7] Falahati-Anbaran, M.,Habashi, A. A., Esfahany, M., Mohammadi, S. A., Ghareyazie, B. 2007. Population genetic structure based on SSR markers in alfalfa (Medicago sativa L.) from various region scontiguousto the centres of origin of the species. Journal of Genetics, Vol. 86, No. 1, April 2007
  • [8] Flajoulot, S.,Ronfort, J., Baudouin, P., Barre, P., Huguet, T., Huyghe, C., Julier, B. 2005. Genetic diversity among alfalfa (Medicago sativa) cultivars coming from a breeding program, using SSR markers. Theoretical and Applied Genetetics, 111, 1420-1429.
  • [9] Habibi, B., Farshadfar, M., Safari, H. 2012. Evaluation of Genetic Diversity in 18 Genotypes of Alfalfa (Medicago Sativa) Using of Molecular ISSR Markers. International Journal of Agriculture and Crop Sciences. Available online at www.ijagcs.com IJACS/2012/4-21/1573-1578. ISSN 2227-670X ©2012 IJACS Journal
  • [10] Harlan, J. R. 1971. Agricultural Origins Centre and non-centers. Science, 174, 468- 474.
  • [11] Karaca, M., Saha, S., Zipf, A., Jenkins, J.N., Lang, D.J. 2002. Genetic diversity among forage bermudagrass (Cynodon spp.). Evidence from chloroplast and nuclear DNA finger printing. Crop Science 42: 2118- 2127
  • [12] Keivani, M., Ramezanpour, S. S., Soltanloo, H., Choukan, Rajab, Naghavi, M., Ranjbar, Mojtaba. 2010. Genetic diversity assessment of alfalfa (Medicago sativa L.) populations using AFLP markers Australian Journal of Crop Sicience AJCS 4(7):491-497 (2010) ISSN:1835-2707
  • [13] Mckersie, B., Bowley, S. 1993. Synthetic seeds of alfalfa. In: Redenbaugh K (ed) Synseeds: Applications of Synthetic Seeds to Crop Improvement CRC Press, Boca Raton, pp. 231-256.
  • [14] Manga, Ü., Acar, Z., Ayan, İ. 1995. Baklagil Yem Bitkileri. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Ziraat Fakültesi Ders Notu No 7.
  • [15] Mengoni, A., Gori, A., Bazzicalupo, M. 2000. Use of RAPD and microsatellite (SSR) variationto ases genetic relationships among populations of tetraploidalfalfa, Medicago sativa. Plant Breeding, 119, 311-317.
  • [16] Mousavia, F., Sharifabadb, H. H., Allahdooc, M. 2010. Investigation of genetic diversity in alfalfa ecotypes collection using multivariate analysis based on morphological traits. Plant Ecophysiology 2 (2010) 103-108
  • [17] Poehlman, J.M.1983. Breeding Field Crops. Second edition. The AVI Publishing Company, Inc, Westport, Connecticut. Second Printing.
  • [18] Qiang, H., Chen, Z., Zhang, Z., Wang, X., Gao., H., Wang, Z. 2015. Molecular diversity and population structure of a worldwide collection of cultivated tetraploid alfalfa (Medicago sativa subsp.sativa L.)germplasm as revealed by micro satellite markers. PLoSOne. 2015 Apr 22;10(4):e0124592.doi:10.1371/journal.pone.0124592.
  • [19] Rohlf, F.J. 1991. NTSYS-pc. Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System. Exeter Software, Setauket, NY, USA.
  • [20] Sledge, M. K., Bouton, J. H., Kochert, G. 1998. Molecular marker diversity as a means of selecting parents for synthetic cultivars. Proceedings of the 36th North American Alfalfa Improvement Conference. Bozeman, Montana, August 2-6, 1998.
  • [21] Sneath, P.H.A., Sokal, R.R. 1973. Numerical taxonomy. W.H. Freman Co., San Francisco, 573s, USA.
  • [22] Touil, L., Guesmi, F., Fares, K., Zagrouba, C., Ferchichi, A. 2008. Genetic diversity of some mediterranean populations of the cultivated alfalfa (Medicago sativa L.) using SSR markers. Pakistan Journal of Biological Science, 11 (15), 1923-1928.
  • [23] Tucak, M., Popović, S., Čupić, T., Šimić, G., Gantner, R., Meglič, V. 2009. Evaluation of alfalfa germplasm collection by multivariate analysis based on phenotypic traits. Romanian Agricultural Research, 26: 47-52.
  • [24] Tucak, M.,Popovic, S., Bolaric, S., Kozumplik, V. 2008. Agronomic evaluation of alfalfa genotypes under ecological comditions of eastern Croatia. VII. Alps-Adria Scientific Workshop, Cereal Research Communications, 36, 651- 654.
  • [25] Tuğay, E. 1996. Genel Bitki Islahı. Gazi Osman Paşa Üniversitesi Ziraat Fakültesi. Ders Notları s. 223 Tokat.
  • [26] Ulukapı, K., Onus, A.N. 2013. Selekte Edilmiş Bazı Yerel Taze Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) Genotiplerinin Moleküler Karakterizasyonu. Tarım Bilimleri Dergisi 18, 277-286.
There are 26 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Journal Section Makaleler
Authors

Mehmet Öten

Sebahattin Albayrak

Publication Date June 6, 2016
Published in Issue Year 2016 Volume: 20 Issue: 2

Cite

APA Öten, M., & Albayrak, S. (2016). Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 20(2). https://doi.org/10.19113/sdufbed.59290
AMA Öten M, Albayrak S. Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu. J. Nat. Appl. Sci. August 2016;20(2). doi:10.19113/sdufbed.59290
Chicago Öten, Mehmet, and Sebahattin Albayrak. “Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu”. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 20, no. 2 (August 2016). https://doi.org/10.19113/sdufbed.59290.
EndNote Öten M, Albayrak S (August 1, 2016) Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 20 2
IEEE M. Öten and S. Albayrak, “Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu”, J. Nat. Appl. Sci., vol. 20, no. 2, 2016, doi: 10.19113/sdufbed.59290.
ISNAD Öten, Mehmet - Albayrak, Sebahattin. “Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu”. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 20/2 (August 2016). https://doi.org/10.19113/sdufbed.59290.
JAMA Öten M, Albayrak S. Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu. J. Nat. Appl. Sci. 2016;20. doi:10.19113/sdufbed.59290.
MLA Öten, Mehmet and Sebahattin Albayrak. “Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu”. Süleyman Demirel Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, vol. 20, no. 2, 2016, doi:10.19113/sdufbed.59290.
Vancouver Öten M, Albayrak S. Batı Akdeniz Sahil Kuşağından Toplanan Yonca (Medicago sativa L.) Populasyonlarının Moleküler Karakterizasyonu. J. Nat. Appl. Sci. 2016;20(2).
 Download Cover Image

e-ISSN :1308-6529
Linking ISSN (ISSN-L): 1300-7688

All published articles in the journal can be accessed free of charge and are open access under the Creative Commons CC BY-NC (Attribution-NonCommercial) license. All authors and other journal users are deemed to have accepted this situation. Click here to access detailed information about the CC BY-NC license.