Investigation of rotavirus in stool samples and seasonal Frequency

Abstract

Diarrhea ranks in the first three of deaths due to infections in the world. Rotaviruses are responsible for the majority of acute diarrhea in children. In this study we aim to investigate the positivity and seasonal frequency of the rotaviruses at child patients stool samples that sent to our laboratory for rotavirus detection. 483 pediatric patients fresh stool samples were included the study, between January 2008-December 2010. Rotavirus positivity in stool samples were investigated with Immunochromatographic method (Rota strip, CORIS Bioconcept, Belgium). The analyzed faecal samples of 49 (10.1%) were positive for rotavirus antigen. 46.9% of cases of rotavirus during the winter months, 28.6% were in the spring months. In conclusion, this study, Rota virus is detected one in ten pediatric patients who have diarhea and the seasonal increase during the winter months have been revealed.

Keywords

• Rotavirus, diarrhea, Seasonal Frequency

Dışkı Örneklerinde Rotavirus Pozitifliği ve Mevsimsel Sıklığının İncelenmesi

Abstract

İshaller dünyada enfeksiyonlara bağlı ölümler arasında ilk üç sırada yer almaktadır. Rotaviruslar çocuklardaki akut ishallerin çoğundan sorumludurlar. Bu çalışmada, laboratuvarımıza çocuk hastalardan rotavirus araştırılması için gönderilen dışkı örneklerinde rotavirus pozitifliğinin tespiti ve dönemsel sıklığının incelenmesi amaçlanmıştır. Ocak 2008 – Aralık 2010 yılları arasında incelenen 483 çocuk hastanın taze dışkı örneğini içeren kayıtlar çalışmaya dahil edilmiştir. Dışkı örneklerinde rotavirus pozitifliği immunokromatografik yöntem (Rota strip, CORIS BioConcept, Belçika) ile araştırılmıştır. Analiz edilen dışkı örneklerinin 49'unda (% 10,1) rotavirus antijeni pozitifliği saptanmıştır. Rotavirus olgularının %46,9'u kış aylarında, %28,6'sı ise ilkbahar aylarında saptanmıştır. Sonuç olarak, bu çalışmada çocuk hastalarındaki ishal vakalarının onda birinde Rota virus tespit edilmiş ve kış aylarında da mevsimsel artış gösterdiği ortaya konmuştur.

Keywords

• Rotavirus, ishal, mevsimsel sıklık

References

1. Kosek M, Bern C, Guerrant RL. The global burden of diarrhoeal disease, as estimated from studies published between 1992 and 2000. Bull World Health Organ 2003; 81: 197-204.
2. Wilks D, Farrington M, Rubenstein D. The Infectious Diseases Manual, 2. baskı, Blackwell Science Ltd, Berlin 2003, s.350-351,.
3. Parashar UD, Bresee JS, Gentsch JR, Glass RI. Rotavirus. Emerg Infect Dis 1998;4(4):561-570.
4. Bulut Y, İşeri L, Ağel E, Durmaz B. Akut gastroenterit ön tanılı çocuklarda rotavirüs pozitifliği. İnönü Üniv Tıp Bült 2003;10(3):143-145.
5. Bozdayı G, Doğan B, Dalgıç B, et al. Diversity of human rotavirus G9 among children in Turkey. J Med Virol 2008; 80:733-740
6. Offit PA, Clark HF: Rotavirus, “Mandell GL, Bennet JE, Dolin R: Principles and Practice of Infectious Disease, 5. baskı” kitabında, Churchill Livingstone, Philadelphia, 2000, s. 1696-1703.
7. Kurugol Z, Salman N. Rotavirus enfeksiyonları ve aşıları. ANKEM derg 2008; 22:160-170.
8. Lee SY, Hong JH, Lee SW, Lee M. Comparisons of latex agglutination, immunochromatography and enzyme immunoassay methods for the detection of rotavirus antigen. Korean J Lab Med 2007; 27: 437- 441.

9. Öngen B: Türkiye’de ishal etkenleri, ANKEM Derg 2006;20(Ek 2):122-134.
10. Regagnon C, Chambon M, Archimbaud C et al. Rapid diagnosis of rotavirus infections: comparative prospective study of two techniques for antigen detection in stool. Pathol Biol (Paris) 2006;54(6):343- 346.
11. Gil A, Carrasco P, Jimenez R, San-Martin M, Oyaguez I, Gonzalez A. Burden of hospitalizations attributable to rotavirus infection in children in Spain, period 1999-2000, Vaccine 2004;22(17-18):2221-2225.
12. Nakagomi T, Nakagomi O, Takahashi Y, Enoki M, Suzuki T, Kilgore PE. Incidence and burden of rotavirus gastroenteritis in Japan, as estimated from a prospective sentinel hospital study, J Infect Dis 2005;192(Suppl 1):106-110.
13. Durmaz Çetin B, Hatipoğlu S, Önal Sönmez E, Gündüz A, Seber E. 0-5 yaş gastroenterit olgularında rotavirus infeksiyonları, Mikrobiyol Cem Derg 2001;31(3-4):263-265.
14. Karslıgil T, Kılıç İH, Balcı İ. 0-6 yaş çocuklarda rotavirus gastroenteritleri ve bunun laktoz intoleransı üzerine etkisi Türk Mikrobiyol Cem Derg 2003;33(2):137-142.
15. Tünger Ö, Özbakkaloğlu B, Sürücüoğlu S, Gündüz T. Akut gastroenteritli çocuklarda rotavirus ve adenovirus tip 40/41 sıklığının araştırılması, İnfeksiyon Derg 2001;15(1):43-46
16. Kurugol Z, Geylani S, Karaca Y, et al. Rotavirus gastroenteritis among children under five years of age in İzmir, Turkey. Turk J Pediatr. 2003; 45(4): 290- 294.
17. Nazik H, İlktac M, Ongen B. Cocukluk yaş grubu gastroenteritlerinde rotavirus sıklığının araştırılması. Ankem Derg. 2006; 20(4): 233-235.
18. Yaman A ÇS, Alhan E, Taşova Y, Apan TZ, Aksungur P, Dündar İH. İshalli çocuklarda rotavirus prevalansının ELISA ve lateks aglütinasyon yöntemi ile araştırılması. İnfeksiyon Derg 1997;11(3):279- 281.
19. Gül M, Garipardıç M, Çıragil P, Aral M, Karabiber H, Güler İ. 0-5 yaş arası gastroenteritli çocuklarda rotavirus ve adenovirus tip 40/41 araştırılması. ANKEM Derg 2005;19(2):64-67.