Antibiotic Sensitivity of the Escherichia Coli Strains Identified from Urine Samples

Yıl 2017, , 38 - 42, 14.04.2017

Mustafa Güzel , Doğan Akdoğan

https://doi.org/10.22312/sdusbed.283279

Öz

Objective: In this study, we aimed to evaluate the sensitivity of Fosfomycin and the other antibiotics against extended spectrum beta-lactamase (ESBL) negative and positive Escherichia Coli (E. Coli) strains.  

Material-Method: 100 ESBL positive and 100 ESBL negative E. Coli strains isolated from urine cultures were included to the study. Antibiotic sensitivity was determined by Kirby-Bauer disk diffusion method and /or automated Phoenix with 100 systems. ESBL was investigated with combined disk diffusion method.  

Results: Fosfomycin sensitivity was found as 96% and 98% in ESBL positive and negative E. Coli strains, respectively. It was found that, there was no İmipenem resistant strain, and the ESBL negative strains shown higher sensitivity rate than ESBL positive strains against the other antibiotics used in treatment. 

Conclusions: As a result, it was thought that, the Fosfomycin, which is also easy to use in a single dose, can be used in the treatment of uncomplicated urinary system infections caused by both ESBL positive and ESBL negative E. coli strains. 

We consider that the reasons why no early complication are the patient selection, careful follow-up, and treatment of the patients in a newly established transplantation center.

Anahtar Kelimeler

Urine, Escherichia Coli, Beta-Lactamase, Bacterial Sensitivity Tests

İdrar Örneklerinde Saptanan Escherichia Coli Suşlarının Antibiyotik Duyarlılığı

Öz

Amaç: Bu çalışmada, Fosfomisin ve diğer antibiyotiklerin genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL) negatif ve pozitif Escherichia Coli (E. Coli) suşlarına karşı duyarlılık oranları incelenmesi amaçlanmıştır.  

Materyal-Method: İdrar kültürlerinden izole edilen 100 GSBL pozitif ve 100 GSBL negatif E. Coli suşu çalışmaya dâhil edilmiştir. Antibiyotik duyarlılıkları Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ve/veya Phoenix 100 otomatize sistemi kullanılarak, GSBL varlığı ise kombine disk difüzyon yöntemi ile araştırılmıştır.  

Bulgular: E.coli suşlarının Fosfomisin’e karşı duyarlılık oranları GSBL pozitiflerde %96, GSBL negatiflerde ise %98 olarak saptanmış olup, benzer olduğu görülmüştür. İmipenem’e dirençli suş bulunmamış olup, GSBL negatif suşların tedavide kullanılan diğer antibiyotiklere karşı GSBL pozitif suşlardan daha yüksek oranda duyarlılık gösterdiği tespit edilmiştir.

Sonuç: Sonuç olarak tek doz kullanım kolaylığı da olan Fosfomisin’in hem GSBL pozitif hem de GSBL negatif E. Coli suşlarının etkeni olduğu komplike olmayan üriner sistem infeksiyonlarının tedavisinde kullanılabileceği düşünülmüştür. 

Anahtar Kelimeler

İdrar, Escherichia Coli, Beta-Laktamaz, Bakteri Duyarlılık Testleri

Kaynakça

• 1. O’Connell SC. Management of patients with urinary disorders. In: Smeltzer SC, Bare BG, Hinkle JL, Cheever KH, editors. Brunner&Suddarth’s Textbook of Medicalsurgical Nursing. 12. ed. ABD: Lippincott Williams & Wilkins; 2009. p. 1359. 2. Tuncer İ, Karabayraktar A, Kart H, Baysal B. Üriner Sistem İnfeksiyonlarında Etken Mikroorganizmaların Görülme Sıklığı. SDÜ Tıp Fakültesi Dergisi. 1996; 3(3): 33-5. 3. Geerlings SE. Clinical Presentations and Epidemiology of Urinary Tract Infections. Microbiology spectrum. 2016; 4(5). 4. Pietrucha-Dilanchian P, Hooton TM. Diagnosis, Treatment, and Prevention of Urinary Tract Infection. Microbiology spectrum. 2016; 4(6). 5. Allocati N, Masulli M, Alexeyev MF, Di Ilio C. Escherichia coli in Europe: an overview. International journal of environmental research and public health. 2013; 10(12): 6235-54. 6. Köken G, Aşık G, Çiftçi İH, Çetinkaya Z, Aktepe OC, Yılmazer M. Toplum kökenli üriner sistem infeksiyonu etkeni Escherichia coli suşlarında fosfomisin trometamol etkinliği. ANKEM Dergisi. 2008; 22(1): 23-7. 7. Doğru A, Karatoka B, Ergen P, Aydın ÖŞ, Tigen ET. İdrar yolu enfeksiyonlarında direnç oranları: 2010 yılı verilerimiz. Turkish Journal of Urology. 2013; 39(4): 237-43. 8. Garau J. Other antimicrobials of interest in the era of extended-spectrum beta lactamases: fosfomycin, nitrofurantoin and tigecycline. Clin Mikrobiol Infect. 2008; 14(1): 198-202. 9. Baylan O. Fosfomisin: Dünü, bugünü ve geleceği. Mikrobiyol Bul. 2010; 44: 311-21. 10. Karadağ A, Tanrıverdi Çaycı Y, Bilgin K, Günaydın M, Eroğlu C. In vitro efcacy of fosfomycin against clinical strains. Journal of Microbiology and Infectious Diseases. 2014; 4(2): 55-8. 11. Institute CaLS. Performance Standards for Antimicrobial Susceptibility Testing; Twenty-Fifth Informational Supplement, CLSI document. Wayne, Pa, USA: Clinical and Laboratory Standards Institute; 2013. 12. Schito GC, Naber KG, Botto H, Palou J, Mazzei T, Gualco L, et al. The ARESC study: an international survey on the antimicrobial resistance of pathogens involved in uncomplicated urinary tract infections. International journal of antimicrobial agents. 2009; 34(5): 407-13. 13. Aral M, Kireçci E, Doğan SŞ. İdrar örneklerinden izoleedilen gram negatif bakteriler ve antibiyotiklere direnç oranlarının retrospektif olarak değerlendirilmesi. Türk Mikrobiyol Cem Derg. 2011; 41(4): 139-42. 14. Bayram Y, Eren H, Berktaş M. İdrar örneklerinden izole edilen bakteriyel patojenlerin dağılımı ve GSBL pozitif ve negatif Escherichia coli suşlarının fosfomisin ve diğer antimikrobiyallere duyarlılık paterni. ANKEM Dergisi. 2011; 25(4): 232-6. 15. Çalışkan E, Dede A, Altınöz Aytar A, Biten Güven G, Kaş E. Ayaktan başvuran hastalarda üriner sistem infeksiyonuna neden olan Esherichia coli ve Klebsiella spp. suşlarının çeşitli antibiyotiklere direnç oranlarının ve Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz varlığının değerlendirilmesi. ANKEM Dergisi. 2015; 29(2): 47-53. 16. Tükenmez Tigen E, Mülazımoğlu L. Toplum kökenli infeksiyonlarda genişlemiş spektrumlu β-laktamazlar ve klinik önemi. Klimik Derg. 2012; 25(3): 94-8. 17. Uğur AR, Türk Dağı H, Tuncer İ, Fındık D, Arslan U. İdrar kültürlerinden izole edilen Esherichia coli suşlarının antibiyotik duyarlılığı ve Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz oranı. ANKEM Dergisi. 2013; 27(1): 13-8. 18. Paterson DL, Bonomo RA. Extended-spectrum beta-lactamases: a clinical update. Clinical microbiology reviews. 2005; 18(4): 657-86. 19. Pullukçu H, Aydemir Ş, Işıkgöz Taşbakan M, Sipahi OR, Çilli Hall Jr. F, Tünger A. Is there a rise in resistance rates to fosfomycin and other commonly used antibiotics in Escherichia coli-mediated urinary tract infections? A perspective for 2004–2011. Turk J Med Sci 2013; 43: 537-41. 20. Durmaz S, Toka Özer T, Çelik H, Yula E. Toplum kökenli üriner sistem infeksiyonlardan izole edilen Escherichia coli suşlarında fosfomisin trometamol ve bazı antibiyotiklerin in-vitro etkinliğinin araştırılması. Abant Med J. 2015; 4(4): 351-4. 21. İnci M, Yula E, Köksaldı Motor V, Davarcı M, Duran N, Kılınç Ç, et al. Nitrofurantoin ve Fosfomisinin İdrar Yolu Enfeksiyonu Etkeni Olan E. coli izolatlarına invitro etkinliği. Yeni Tıp Dergisi. 2013; 30(2): 75-8. 22. Uyanık MH, Hancı H, Yazgı H. Üriner sistem infeksiyonlarından soyutlanan toplum kökenli Escherichia coli suşlarına fosfomisin trometamolün ve bazı antibiyotiklerin in-vitro etkinliği. ANKEM Dergisi. 2009; 23(4): 172-6. 23. Hirsch EB, Raux BR, Zucchi PC, Kim Y, McCoy C, Kirby JE, et al. Activity of fosfomycin and comparison of several susceptibility testing methods against contemporary urine isolates. International journal of antimicrobial agents. 2015; 46(6): 642-7. 24. Zykov IN, Sundsfjord A, Smabrekke L, Samuelsen O. The antimicrobial activity of mecillinam, nitrofurantoin, temocillin and fosfomycin and comparative analysis of resistance patterns in a nationwide collection of ESBL-producing Escherichia coli in Norway 2010-2011. Infectious diseases (London, England). 2016; 48(2): 99-107. 25. Mittal S, Sharma M, Chaudhary U. Fosfomycin use in multi drug resistant uropathogenic Escherichia coli. Infectious disorders drug targets. 2015; 15(3): 196-201. 26. Li Y, Zheng B, Li Y, Zhu S, Xue F, Liu J. Antimicrobial Susceptibility and Molecular Mechanisms of Fosfomycin Resistance in Clinical Escherichia coli Isolates in Mainland China. PloS one. 2015; 10(8): e0135269. 27. Gupta K, Hooton TM, Naber KG, Wullt B, Colgan R, Miller LG, et al. International clinical practice guidelines for the treatment of acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women: A 2010 update by the Infectious Diseases Society of America and the European Society for Microbiology and Infectious Diseases. Clinical infectious diseases : an official publication of the Infectious Diseases Society of America. 2011; 52(5): e103-20. 28. Ceran N, Mert D, Kocdogan FY, Erdem I, Adalati R, Ozyurek S, et al. A randomized comparative study of single-dose fosfomycin and 5-day ciprofloxacin in female patients with uncomplicated lower urinary tract infections. Journal of infection and chemotherapy : official journal of the Japan Society of Chemotherapy. 2010; 16(6): 424-30. 29. Zhanel GG, Walkty AJ, Karlowsky JA. Fosfomycin: A First-Line Oral Therapy for Acute Uncomplicated Cystitis. The Canadian Journal of Infectious Diseases & Medical Microbiology = Journal Canadien des Maladies Infectieuses et de la Microbiologie Médicale / AMMI Canada. 2016; 2016: 2082693. 30. Hsieh C-J, Shen Y-H, Hwang K-P. Clinical Implications, Risk Factors and Mortality Following Community-onset Bacteremia Caused by Extended-spectrum β-lactamase (ESBL) and non-ESBL Producing Escherichia coli. Journal of Microbiology, Immunology and Infection. 2010; 43(3): 240-8.