KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

Melek Pehlivan; Mustafa Soyöz; Hatice İlayhan Karahan Çöven; Burcu Çerçi; Tülay Kılıçaslan Ayna; Halil Ateş; Zeynep Yüce; Hakkı Ogün Sercan

doi:10.17343/sdutfd.624530

KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ

Abstract

Amaç: Kronik Miyeloid Lösemi (KML), hematopoetik kök hücreden (HKH) köken alan miyeloproliferatif bir hastalıktır. MikroRNA'lar, transkripsiyon sonrası gen ekspresyonunu düzenlenleyen küçük kodlamayan RNA’lardır. miRNA’lar KML’nin progresyonunda, lösemik kök hücre büyümesi ve tirozin kinaz inhibitörü (TKİ) direncinin gelişmesinde hücre homeostazisini etkilemektedirler. Bu çalışmada KML lösemik hücresi ve KML lösemik kök hücresi (LKH) arasında değişen miRNA ekspresyon profillerinin incelenmesi amaçlanmıştır.

Gereç ve yöntem: KML hücre hattı olan K562 hücrelerinden, manyetik hücre ayrımlama (MACS) yöntemi kullanılarak CD34⁺CD38^- lösemik kök hücreleri ayrımlanmıştır. Ayrımlanan LKH’lerin saflığının %85-92 arasında olduğu akım sitometri yöntemi ile gösterilmiştir. K562 ve K562 LKH’leri arasında, gerçek zamanlı kantitatif PCR ile kanser kök hücre ilişkili 84 adet miRNA’nın ekspresyon değişimleri incelenmiştir.

Bulgular: K562 ve K562 LKH’leri arasında, kök hücre ilişkili olduğu bilinen 84 adet miRNA’dan 7’sinin anlamlı düzeyde değiştiğini gözledik (P<0,05). K562 LKH’lerinde hsa-miR-29b-3p’nin ekspresyon düzeylerinde artış izlenirken; hsa-miR-320d, hsa-miR-96-5p, hsa-let-7e-5p, hsa-miR-17-5p, hsa-miR-181b-5p hsa-miR-423-5p’da azalma olduğu gözlenmiştir.

Sonuç : KML lösemik hücreleri ile KML LKH’leri arasında proliferasyon, eritroid farklılaşma, kendi kendini yenileme ve apoptoz sürecinde rol alan miRNA’lar ve hedef genlerinin ekspresyonlarındaki değişim, hastalığın ilerlemesinde miRNA’larında rol oynayabileceğini göstermektedir. Bu nedenle KML LKH’lerine özgü miRNA’ların hastalığın progresyonunun ve TKI direncinin önlenmesi için yeni terapötik stratejilerin geliştirilmesinde hedef moleküller olabileceğini düşünmekteyiz.

Keywords

Supporting Institution

İzmir Katip Çelebi Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü

Project Number

2016.ÖNP.SHMY.0026

Thanks

Bu çalışma 2016.ÖNP.SHMY.0026 proje numarası ile İzmir Katip Çelebi Üniversitesi Bilimsel Araştırma Projeleri Koordinatörlüğü tarafından desteklenmiştir.

References

1. Comert M, Baran Y, Saydam G. Changes in molecular biology of chronic myeloid leukemia in tyrosine kinase inhibitor era. Am J Blood Res 2013;19(3):191-200. 2. Litwińska Z, Machaliński B. miRNAs in chronic myeloid leukemia: small molecules, essential function. Leuk Lymphoma 2017; 58(6):1297-1305.
3. Holyoake TL, Vetrie D. The chronic myeloid leukemia stem cell: stemming the tide of persistence. Blood 2017;129(12):1595-1606.
4. Jabbour E, Kantarjian H. Chronic myeloid leukemia: 2018 update on diagnosis, therapy and monitoring. Am J Hematol 2018;93(3):442-459.
5. Herrmann H, Cerny-Reiterer S, Gleixner KV, Blatt K, Herndlhofer S, Rabitsch W et al.CD34(+)/CD38(-) stem cells in chronic myeloid leukemia Express Siglec-3 (CD33) and are responsive to the CD33-targeting drug gemtuzumab/ozogamicin. Haematologica 2012;97(2):219-26.
6. Nestal de Moraes G, Souza PS, Costas FC de F, Vasconcelos FC, Reis FRS, Maia RC. The Interface between BCR-ABL-Dependent and -Independent Resistance Signaling Pathways in Chronic Myeloid Leukemia. Leuk Res Treatment 2012;2012:1–19.
7. Elias J, Sameer A P, Hagop K, Jorge C. Chronic myeloid leukemia: mechanisms of resistance and treatment. Hematol Oncol Clin North Am 2011;25(5):981–95.
8. Corbin AS, Agarwal A, Loriaux M, Cortes J, Deininger MW, Druker BJ. Human chronic myeloid leukemia stem cells are insensitive to imatinib despite inhibition of BCR-ABL activity. J Clin Invest 2011;121:396–409.
9. Chu S, McDonald T, Lin A, Chakraborty S, Huang Q, Snyder DS et al.Persistence of leukemia stem cells in chronic myelogenous leukemia patients in prolonged remission with imatinib treatment. Blood 2011;118:5565–5572.

10. Martiáñez Canales T, de Leeuw DC, Vermue E, Ossenkoppele GJ, Smit L. Specific Depletion of Leukemic Stem Cells: Can MicroRNAs Make the Difference? Cancers (Basel). 2017;9(7): 1-23.
11. Jørgensen HG, Holyoake TL. Characterization of cancer stem cells in chronic myeloid leukaemia. Biochem Soc Trans 2007;35:1347–1351.
12. Carvajal LA, Steidl U. Eliminating Cancer Stem Cells in CML with Combination Transcriptional Therapy. Cell Stem Cell 2016;19:6–8.
13. Di Stefano C, Mirone G, Perna S, Marfe G. The roles of microRNAs in the pathogenesis and drug resistance of chronic myelogenous leukemia (Review). Oncol Rep 2016;35(2):614–24.
14. Peláez N, Carthew RW. Biological robustness and the role of microRNAs: A network perspective. Curr Top Dev Biol 2012;99:237-255.
15. Nam JW, Rissland OS, Koppstein D, Abreu-Goodger C, Jan CH, Agarwal V, Yildirim MA et al. Global analyses of the effect of different cellular contexts on microRNA targeting. Mol Cell 2014;53:1031-1043.
16. Polakova KM, Koblihova J, Stopka T. Role of Epigenetics in Chronic Myeloid Leukemia. Curr Hematol Malig Rep 2013;8(2):28–36.
17. Yeh CH, Moles R, Nicot C. Clinical significance of microRNAs in chronic and acute human leukemia. Mol Cancer 2016;15(1):37.
18. Ferreira LAM, Capannacci J, Hokama NK, Nogueira CR, Ceccarelli M, Cerulo L et al. Circulating microRNAs expression profile in newly diagnosed and imatinib treated chronic phase-chronic myeloid leukemia. Leuk Lymphoma 2019;60(3):805-811.
19. Machova Polakova K, Koblihova J, Stopka T. Role of epigenetics in chronicmyeloid leukemia. Curr Hematol Malig Rep 2013;8(1):28-36.
20. Venturini L, Battmer K, Castoldi M, Schultheis B, Hochhaus A, Muckenthaler MU et al. Expression of the miR-17-92 polycistron in chronic myeloid leukemia (CML) CD34+ cells. Blood 2007;109(10):4399–405.
21. Machová Poláková K, Lopotová T, Klamová H, Burda P, Trněný M, Stopka T et al. Expression patterns of microRNAs associated with CML phases and their disease related targets. Mol Cancer 2011;10:41.
22. Flamant S, Richie W, Guilhot J, Hols J, Bonnet ML, Chomel JC et al. Micro-RNA response to imatinib mesylate in patients with chronic myeloid leukemia. Haematologica 2010;95:1325–1333.
23. Enériz ESJ, Román-Gómez J, Jiménez-Velasco A, Garate L, Maritn V, Coredu L et al. MicroRNA expression profiling in imatinib-resistant chronic myeloid leukemia patients without clinically significant ABLI-mutations. Mol Cancer 2009;8:69–72.
24. Li Y, Wang H, Tao K, Xiao Q, Huang Z, Zhong L et al. miR-29b suppresses CML cell proliferation and induces apoptosis via regulation of BCR/ABL1 protein. Exp Cell Res 2013;319(8):1094–1101.
25. Zofia L, Machalinski B. miRNAs in chronic myeloid leukemia: small molecules, essential function. Leukemia & Lymphoma 2016;58(6):1297-1305.
26. Mott J, Kobayashi S, Bronk SF, Gores JG. miR-29 Regulates Msl-1 Protein Expression and Apoptosis. Oncogene 2007;26(42):6133-6140.
27. Xu L, Xu Y, Jing Z, Wang X, Zha X, Zeng C et al. Altered expression pattern of miR-29a, miR29b and the target genes in myeloid leukemia. Exp Hematol Oncol 2014;3:17.
28. Zhi F, Cao X, Xie X, Wang B, Dong W, Gu W et al. Identification of circulating microRNAs as potential biomarkers for detecting acute myeloid leukemia. PLoS One 2013;8(2):e56718.
29. Wang B, Li W, Guo K, Xiao Y, Wang Y, Fan J. miR-181b promotes hepatic stellate cells proliferation by targeting p27 and is elevated in the serum of cirrhosis patients. Biochem Biophys Res Commun 2012;421(1):4-8.
30. Wu PY, Zhang XD, Zhu J, Guo XY, Wang JF. Low expression of microRNA-146b-5p and microRNA-320d predicts poor outcome of large B-cell lymphoma treated with cyclophosphamide, doxorubicin, vincristine, and prednisone. Hum Pathol 2014 ;45(8):1664-73.
31. Zhao J, Lu Q, Zhu J, Fu J, Chen Y. Prognostic value of miR-96 in patients with acute myeloid leukemia. Diagn Pathol 2014;9:76.
32. Rokah OH, Granot G, Ovcharenko A, Modai S, Pasmanik-Chor M, Toren A et al. Downregulation of Mir-31, Mir-155, and Mir-564 in Chronic Myeloid Leukemia Cells. PlosOne 2012;7(4):1-12.
33. Dell’Aversanal C, Altucci L. miRNA-mediated deregulation in leukemia. Front Genet 2012;3:252. 34. Cloonan N, Brown MK, Steptoe AL, Wani S, Chan WL, Forrest AR et al. The miR-17-5p microRNA is a key regulator of the G1/S phase cell cycle transition. Genome Biol 2008;9(8):127.
35. Wong P, Iwasaki M, Somervaille TC, Ficara F, Carico C, Arnold C et al. The miR-17-92 microRNA Polycistron Regulates MLL Leukemia Stem Cell Potential by Modulating p21 expression. Cancer Res 2010;70(9):3833-42.
36. Kang CD, Yoo SD, Hwang BW, Kim KW, Kim DW, Kim CM et al. The inhibition of ERK/MAPK not the activation of JNK/SAPK is primarily required to induce apoptosis in chronic myelogenous leukemic K562 cells. Leuk Res 2000; 24(6):527-34.

Details

Primary Language

Turkish

Subjects

Clinical Sciences

Journal Section

Research Article

Authors

Melek Pehlivan ^* This is me
Türkiye

Mustafa Soyöz

Hatice İlayhan Karahan Çöven This is me

Burcu Çerçi This is me

Tülay Kılıçaslan Ayna

Halil Ateş This is me

Zeynep Yüce This is me

Hakkı Ogün Sercan This is me

Publication Date

September 1, 2020

Submission Date

September 26, 2019

Acceptance Date

December 5, 2019

Published in Issue

Year 2020 Volume: 27 Number: 3

DOI

https://doi.org/10.17343/sdutfd.624530

IZ

https://izlik.org/JA97ZH28HW

Cite

RIS / Bibtex

APA

Pehlivan, M., Soyöz, M., Karahan Çöven, H. İ., Çerçi, B., Kılıçaslan Ayna, T., Ateş, H., Yüce, Z., & Sercan, H. O. (2020). KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ. Medical Journal of Süleyman Demirel University, 27(3), 315-321. https://doi.org/10.17343/sdutfd.624530

AMA

1.Pehlivan M, Soyöz M, Karahan Çöven Hİ, et al. KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ. Med J SDU. 2020;27(3):315-321. doi:10.17343/sdutfd.624530

Chicago

Pehlivan, Melek, Mustafa Soyöz, Hatice İlayhan Karahan Çöven, et al. 2020. “KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ”. Medical Journal of Süleyman Demirel University 27 (3): 315-21. https://doi.org/10.17343/sdutfd.624530.

EndNote

Pehlivan M, Soyöz M, Karahan Çöven Hİ, Çerçi B, Kılıçaslan Ayna T, Ateş H, Yüce Z, Sercan HO (September 1, 2020) KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ. Medical Journal of Süleyman Demirel University 27 3 315–321.

IEEE

[1]M. Pehlivan et al., “KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ”, Med J SDU, vol. 27, no. 3, pp. 315–321, Sept. 2020, doi: 10.17343/sdutfd.624530.

ISNAD

Pehlivan, Melek - Soyöz, Mustafa - Karahan Çöven, Hatice İlayhan - Çerçi, Burcu - Kılıçaslan Ayna, Tülay - Ateş, Halil - Yüce, Zeynep - Sercan, Hakkı Ogün. “KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ”. Medical Journal of Süleyman Demirel University 27/3 (September 1, 2020): 315-321. https://doi.org/10.17343/sdutfd.624530.

JAMA

1.Pehlivan M, Soyöz M, Karahan Çöven Hİ, Çerçi B, Kılıçaslan Ayna T, Ateş H, Yüce Z, Sercan HO. KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ. Med J SDU. 2020;27:315–321.

MLA

Pehlivan, Melek, et al. “KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ”. Medical Journal of Süleyman Demirel University, vol. 27, no. 3, Sept. 2020, pp. 315-21, doi:10.17343/sdutfd.624530.

Vancouver

1.Melek Pehlivan, Mustafa Soyöz, Hatice İlayhan Karahan Çöven, Burcu Çerçi, Tülay Kılıçaslan Ayna, Halil Ateş, Zeynep Yüce, Hakkı Ogün Sercan. KML VE KML LÖSEMİK KÖK HÜCRESİ ARASINDA MİKRORNA EKSPRESYON DEĞİŞİMLERİNİN DEĞERLENDİRİLMESİ. Med J SDU. 2020 Sep. 1;27(3):315-21. doi:10.17343/sdutfd.624530