Investigation on Possible Use of Recombinant Inbred Line Population as Possible Mapping Population in Safflower

Year 2011, Volume: 6 Issue: 2, 1 - 7, 01.09.2011

Muhammet Tonguç Sabri Erbaş Hasan Baydar

Abstract

Linkage maps have been developed for many plant species. Genetic maps could be used to
locate important genes on linkage groups and enable breeders to manipulate important genes and
characters. Safflower has been cultivated for centuries as oilseed crop but there is no genetic map
developed for safflower. In the present study, possible use of a recombinant inbred population (RIL)
as a mapping population was investigated. The population was developed by crossing Dincer 5-118
and Remzibey-05 cultivars and advanced to F6 generation. Sixteen lines along with parents were used
to screen 10 AFLP primer combinations to reveal polymorphisms. A total of 439 bands were
produced and 20 of those were found to be polymorphic both between parents and among the
individuals. Amount of polymorphisms produced by the primer combinations ranged between 0-4.
Among the polymorphic bands, 9 showed skewed distribution from the expected ratio

Keywords

AFLP, Carthamus tinctorius, linkage map, RIL

Aspirde Geliştirilen Rekombinant Saf Hat Populasyonunun Genetik Harita Populasyonu Olarak Kullanma İmkanlarının Araştırılması

Abstract

Genetik haritalar birçok bitki türü için geliştirilmiştir. Genetik haritalar tarımsal açıdan önemli genlerin kromozomlar üzerindeki yerlerinin belirlenmesi ve ıslah programlarında seçilen karakterlerin manipülasyonu için önemli avantajlar sağlamaktadırlar. Aspir yüzyıllardır tarımı yapılan bir yağ bitkisidir fakat bitki ıslahçıları tarafından kullanılabilecek bir genetik harita aspir için henüz mevcut değildir. Mevcut çalışmada Dinçer 5-118 ile Remzibey 05 çeşitlerinin çaprazlanması ile geliştirilen ve F6 seviyesine kadar ilerletilen rekombinant saf hatların (RIL) aspirde genetik haritalama populasyonu olarak kullanılıp kullanılamayacağı incelenmiştir. Çalışmada toplam 16 RIL hattı ve anaçlar arasındaki polimorfizmler 10 AFLP primer kombinasyonu kullanılarak incelenmiştir. Çalışmada AFLP primerleri ile toplam 439 bant gözlenmiş ve bu bantlardan 20 tanesi anaçlar ve hatlar arasında polimorfizm üretmiştir ve primer kombinasyonu başına üretilen polimorfizm sayısı 0-4 arasında değişmiştir. Elde edilen polimorfik bantlardan 9 tanesi beklenen orandan sapma göstermiştir.

Keywords

AFLP, Carthamus tinctorius, genetik harita, RIL