Lettuce Mosaic Virus in Lettuce Production Areas in Finike District of Antalya Province

Abstract

This study was conducted for detection of Lettuce mosaic virus in lettuce growing areas in Finike district of Antalya province. DAS-ELISA (Double Antibody Sandwich Enzyme Linked Immunosorbent Assay) ve IC-RT-PCR (Immunocapture Reverse Transcription Polimerase Chain Reaction) methods were used for virus detection. For this purpose, 92 lettuce samples were collected from the research area. Samples were subjected to DAS-ELISA test using specific antibody for LMV. According to DAS-ELISA; the presence of LMV were detected in 5 samples. 5 samples that tested positive as a result of the DAS-ELISA test were used for IC-RT-PCR. In IC-RT-PCR studies, specific primer pairs (1190, 1087) were used for LMV and 800 bp fragments of LMV was amplified and observed under the UV light. The respected size of band for LMV was observed on agarose gel electrophoresis. In this study, the presence of LMV was revealed for the first time in lettuce production areas of Finike district of Antalya.

Keywords

• Lettuce
• virus
• Lettuce mosaic virus
• detection

Antalya İli Finike İlçesinde Marul Üretim Alanlarında Marul Mozaik Virüsü'nün Belirlenmesi

Abstract

Bu çalışmada, Antalya ili Finike ilçesi marul üretim alanlarında Marul mozaik virüsü (Lettuce mosaic virüs: LMV)’nün belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. Virüsün tanılama çalışmalarında DAS-ELISA (Double Antibody Sandwich Enzyme Linked Immunosorbent Assay) ve IC-RT-PCR (Immunocapture Ters Transkripsiyon Polimeraz Zincir Reaksiyonu) yöntemleri kullanılmıştır. Bu amaçla araştırma alanından 92 marul örneği toplanmıştır. Örnekler LMV etmenine spesifik antibadiler kullanılarak DAS-ELISA testine tabi tutulmuştur. DAS-ELISA yöntemine göre; 5 örnek LMV ile enfekteli bulunmuştur. DAS-ELISA testinde pozitif çıkan 5 örnek IC-RT-PCR çalışmalarında kullanılmıştır. IC-RT-PCR çalışmalarında, LMV’ye özgü primer çiftleri (1196, 1087) kullanılmış ve LMV’nin 800 bp’lik bir kısmı çoğaltılarak agaroz jel elektroforezinde beklenen seviyede bant elde edilmiştir. Bu çalışma ile Antalya ili Finike ilçesinde LMV’nin varlığı ilk kez ortaya konulmuştur.

Keywords

• Marul
• virüs
• Marul Mozayik Virüsü
• teşhis
• Lettuce
• virus
• Lettuce mosaic virus
• detection

References

1. Erkan, S., Gümüş, M., Paylan, İ. C., Duman, İ. & Ergün, M. (2013). İzmir ili ve çevresindeki bazı kışlık sebzelerde görülen viral etmenlerin saptanması. Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 50(3), 311-322.
2. Kandemir, D. & Balkaya, A. (2022). Türkiye’de marul yetiştiriciliği sorunları ve çözüm önerileri. Tarım Gündem Dergisi, 54-58.
3. FAO (2021, Şubat). The World Lettuce Economy. http://www.fao.org/faostat/en/#data.
4. TÜIK (2021, Nisan). Bitkisel üretim istatistikleri. http://www.tuik.gov.tr/bitkiselapp/bitkisel.zul.
5. Polat, E., Sönmez, S., Demir, H. & Kaplan, M. (2001, 14-16 Kasım). Farklı organik gübre uygulamalarının marulda verim, kalite ve bitki besin maddeleri alımına etkileri. Türkiye 2. Ekolojik Tarım Sempozyumu, Antalya.
6. Anonim (2022, Haziran). Marul Üretimi. www. turder.org.
7. Sertkaya, G. (2015). Hatay ili marul ve ıspanak alanlarında bazı virüslerin araştırılması. Mustafa Kemal Üniversitesi Ziraat Fakültesi Dergisi, 20(1), 7-12.
8. Zelyüt, F. R. (2016). Ankara İli marul ekim alanlarında görülen virüs hastalıklarının belirlenmesi. (Tez no. 434746) [Doktora Tezi, Ankara Üniversitesi].

9. Abadkhah, M., Hamidi, H. & Koolivand, D. (2021). Phylogenetic and population analysis of lettuce mosaic virus isolates based on the coat protein gene. Journal of Genetic Resources, 7(2), 210-218. https://doi.org/10.22080/jgr.2021.20849.1238
10. Akbaş, B., Morca, A. F. & Coşkan, S. (2021). Ankara, Eskişehir ve Konya illeri marul üretim alanlarında görülen viral hastalık etmenlerinin tespiti. Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi, 31(2), 387-395. https://doi.org/10.29133/yyutbd.818644
11. Yeşil S. & Ağca, H. I. (2021). Determination of virus diseases on lettuce in Konya province. Turkish Journal of Agriculture Food Science and Technology, 9, 2532-2536. https://doi.org/10.24925/turjaf.v9isp.2532-2536.4919
12. Helvacı, A. & Korkmaz, S. (2022). Ülkemiz Lettuce Mosaic Virus izolatının tüm genom analizi. Journal of Advanced Research in Natural and Applied Sciences, 8(1), 26-34. https://doi.org/10.28979/jarnas.960829
13. Pavan, M. A., Krause-Sakate, R., Silva, N., Zerbini, F. M., & Gall, O. (2008). Virus diseases of lettuce in Brazil. Plant Viruses, 2(1), 35-41.
14. Jagger, I. C. (1921). A transmissible mosaic disease of lettuce. Journal of Agricultural Research, 20, 737-741.
15. Horvath, J. (1980). Viruses of lettuce. II host ranges of lettuce mosaic virus and cucumber mosaic virus. Acta Agronomica Scientiarum Hungaricae, 29, 333-352.
16. Lim, S., Zhao, F., Yoo, R. H., Igori, D., Lee, S. H., Lim, S. H. & Moon, J. S. (2014). Characteristics of a Lettuce mosaic virus ısolate ınfecting lettuce in Korea. Plant Pathology Journal, 30(2), 183-187. http://dx.doi.org/10.5423/PPJ.NT.12.2013.0120
17. Revers, F., Lot, H., Souche, S., Gall, O. L., Candresse, T. & Dunez, J. (1997). Biological and molecular variability of Lettuce Mosaic Virus isolates. Phytopathology, 87, 397-403. https://doi.org/10.1094/phyto.1997.87.4.397
18. Bozdoğan, V. (2009). Antalya ilinde domates, biber ve marul yetiştirilen alanlarda Domates Lekeli Solgunluk Virüsü (Tomato Spotted Wilt Virus, TSWV)’nün saptanması. (Tez no. 244137) [Yüksek Lisans Tezi, Çukurova Üniversitesi]
19. Erdaş, E. & Çulal-Kılıç, H. (2022). Antalya ili marul üretim alanlarında Mirafiori Marul İri Damar Virüsü (MiLBVV)’nün belirlenmesi. Süleyman Demirel Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 26(2), 245-251. https://doi.org/10.19113/sdufenbed.1050253
20. Soleimani, P., Mosahebi, G. & Habibi, K. M. (2011). Identification of some viruses causing mosaic on lettuce and characterization of Lettuce mosaic virus from Tehran Province in Iran. African Journal of Agricultural Research, 6(13), 3029-3035. https://doi.org/10.5897/AJAR11.114
21. Krause-Sakate, R., Mello, R. N, Pavan, M. A., Zambolim, E. M., Carvalho, M. G., Le Gall, O. & Zerbini, F. M. (2001) Molecular characterization of two Brazilian isolates of Lettuce Mosaic Virus with distinct biological proporties. Fitopotologia Brasileira, 26, 153-157.
22. Sertkaya, G., Karaca, F., Nurel, S. & Yokarıbaş, H. (2009, 15-18 Temmuz) Marul alanlarında Marul mozaik virüsü ve Hıyar mozaik virüsü’nün biyolojik ve serolojik yöntemlerle araştırılması. Türkiye ІІІ. Bitki Koruma Kongresi, Van. Sağlam, H. N. & Kamberoğlu, M. A. (2021). Adana ve Mersin illeri’nde marul yetiştirilen alanlarda Marul mozaik virüsü (Lettuce mosaic virus, LMV)’nün saptanması ve karakterizasyonu. Mustafa Kemal Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi, 26(2), 257-265. https://doi.org/10.37908/mkutbd.822534
23. Özdemir, S. & Erilmez, S. (2007, 27-29 Ağustos). Denizli ilinde yetiştirilen biber, patlıcan ve marul üretim alanlarında bazı viral etmenlerin saptanması. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi, Isparta.
24. Zelyüt, F. R. & Ertunç, F. (2018). Molecular Characterization of Lettuce Mosaic Virus isolates in Ankara province. International Journal of Agriculture Innovations and Research, 6(5), 239-245.
25. Karanfil, A., Cevik, B. & Korkmaz, S. (2018). Detection of lettuce mosaic virus infection in South Marmara region of Turkey and coat protein gene characterization. Zemdirbyste-Agriculture, 105(4), 363-368. https://doi.org/10.13080/z-a.2018.105.046