Detection of Virus Disease in Pepper Production Areas in Denizli Province

Abstract

Survey studies were carried out in the pepper production areas in Denizli province during the vegetation periods of 2021-2022. A total of 115 plant samples showing virus and virus-like symptoms were collected. The samples were tested according to DAS-ELISA (Double Antibody Sandwich Enzyme Linked Immunosorbent Assay) serological method. Commercial diagnostic kits specific to $Tomato$ $spotted$ $wilt$ $virus$ (TSWV), $Cucumber$ $mosaic$ $virus$ (CMV), $Tobacco$ $mosaic$ $virus$ (TMV) and $Pepper$ $mild$ $mottle$ $virus$ (PMMoV) were used in the serological test methods. The test results showed that 6.9% of the pepper samples were infected with TSWV, 3.4% with CMV, 2.6% with PMMoV and 1.7% with TMV by a single infection. In addition, double and triple mixed infections, TMV+TSWV, CMV+TSWV, PMMoV+TMV, PMMoV+CMV and PMMoV+TMV+CMV were detected at a rate of 0.86 %. To reduce the prevalence of these factors carried by both insects and seeds of production material, it is recommended to control the vector population and use certified production materials.

Keywords

• Pepper
• Virus
• Detection
• DAS-ELISA

Denizli İli Biber Üretim Alanlarında Virüs Hastalıklarının Belirlenmesi

Abstract

2021 ve 2022 yılları vejetasyon dönemlerinde Denizli ili biber üretim alanlarında arazi çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Virüs ve virüs benzeri simptomlar gösteren toplam 115 bitki örneği toplanmıştır. Örnekler, DAS-ELISA (Double Antibody Sandwich Enzyme Linked Immunosorbent Assay) serolojik yöntemine göre testlenmiştir. Serolojik test yöntemlerinin uygulanmasında Biber örneklerinin testlenmesinde $Tomato$ $spotted$ $wilt$ $virus$ (TSWV), $Cucumber$ $mosaic$ $virus$ (CMV), $Tobacco$ $mosaic$ $virus$ (TMV) ve $Pepper$ $mild$ $mottle$ $virus$ (PMMoV)’e spesifik tanı kitleri kullanılmıştır. Test sonuçları, biber örneklerinin %6.9’u TSWV, %3.4’ü CMV, %2.6’sı PMMoV ve %1.7 ‘inin TMV ile tek bir etmen tarafından enfekte olduğunu göstermiştir. Ayrıca, %0.86 oranında TMV+TSWV, CMV+TSWV, PMMoV+TMV, PMMoV+CMV ve PMMoV+TMV+CMV olmak üzere ikili ve üçlü karışık enfeksiyonlar saptanmıştır. Hem vektör böcek hem de üretim materyali tohumlar ile taşınan bu etmenlerin yaygınlığının azaltılmasında, vektör popülasyonunun kontrol altına alınması ve sertifikalı üretim materyalinin kullanılması önerilmektedir

Keywords

• Biber
• Virüs
• teşhis
• DAS-ELISA

References

1. Yalçın, D. (2008). Kırmızı pul biber üretiminde kritik kontrol noktaları ve tehlike analizleri. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi, Fen ve Mühendislik Dergisi, 11, 129-137.
2. Duman, A. D., Zorlugenç, B. & Evliya, B. (2002). Kahramanmaraş kırmızı biberinin önemi ve sorunları. Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi, Fen ve Mühendislik Dergisi, 5(1), 111-117.
3. FAO (2023, Mart). The World Lettuce Economy. http://www.fao.org/faostat/en/#data).
4. TUIK (2023, Mart). Bitkisel üretim istatistikleri. http://www.tuik.gov.tr/bitkiselapp/bitkisel.zul.
5. Yeşil, S. & Gömlekli, Ö. (2021). Determination of prevalence and reservoir weed species of tomato spotted wilt tospovirus-TSWV on peppers grown in greenhouses in Kumluca district of Antalya, Turkey. Turkish Journal of Agriculture -Food Science and Technology, 9, 2565-2570, https://doi.org/10.24925/turjaf.v9isp.2565-2570.4933
6. Akdura, N. & Çulal-Kılıç, H. (2022). Hakkari ili domates ve biber üretim alanlarında yonca mozaik virüsü ve domates lekeli solgunluk virüsü’nün belirlenmesi. Süleyman Demirel Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi, 26(3), 435-440.
7. Edwardson, J. R., & Christie R. G. (1997). Viruses infecting peppers and other solanaceous crops. University of Florida Agricultural Experimental Station, Florida.
8. Çandar, A. & Gümüş, M. (2012). Bitki virüslerinin vektörlerle taşınmasına moleküler yaklaşımlar. Türkiye Entomoloji Bülteni, 2(3), 207-222.

9. Palloix, A., Abak, K., Gognalons, P., Daubeze, A. M., Guldur, M., Memouchi, G. & Gebre-Selaissie, K. (1994, September 18-24). Virus Diseases Infecting Pepper Crops in Turkey [Conference presentation]. Proceedings of 9th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union, Kusadası, Aydın, Turkey
10. Yılmaz, M. A. & Davis, R. F. (1984). Purification and particle morphology of TMV, CMV and ZYMV isolated from various cultivated crops grown along the coast of Turkey. Journal of Turkish Phytopathology 13, 29-38.
11. Erkan, S. (1986). Potato virus Y on pepper in Turkey. Phytopathologia Mediterranean, 26, 149-150.
12. Çiçek, Y. & Yorgancı, Ü. (1991). Studies on the incidence of Tobacco Mosaic Virus on certified seed of tomato, pepper and eggplant in Aegean Region. The Journal of Turkish Phytopathology, 20(2-3), 57-65.
13. Güldür, M. E., Ozaslan, M., Baloglu, S. & Yılmaz, M. A. (1994, September 18-24). Pepper mild mottle Virus in Pepper in Turkey [Conference presentation]. Proceedings of 9th Congress of the Mediterranean Phytopathological Union, Kusadası, Aydın, Turkey
14. Arlı-Sökmen, M., Mennan, H., Sevik, M. A. & Ecevit, O. (2005). Occurrence of viruses in field- grown pepper crops and some of their reservoir weed hosts in Samsun, Turkey. Phytoparasitica, 33(4), 347-358. https://doi.org/10.1007/BF02981301
15. Buzkan, N., Demir, M., Öztekin, V., Mart, C., Çağlar, B. K. & Yılmaz M. A. (2006). Evaluation of the status of capsicum viruses in the main growing regions of Turkey. European and Mediterranean Plant Protection Organization Bulletin, 36(1), 15-19.
16. Özaslan, M., Baç, B., Aytekin, T. & Sıgırcı, Z. (2006). Identification of pepper viruses by das-elisa assays in Gaziantep-Turkey. Plant Pathology Journal, 5(1), 11-14. https://doi.org/ 10.3923/ppj.2006.11.14
17. Özdemir, S. & Erilmez, S. (2007, Ağustos, 27-29). Denizli Ilinde Yetiştirilen Biber, Patlıcan ve Marul Üretim Alanlarında Bazı Viral Etmenlerin Saptanması [Conference presentation]. Türkiye II. Bitki Koruma Kongresi, Isparta, Türkiye
18. Sevik, M. A. (2011). Occurrence of pepper mild mottle virus in greenhousegrown pepper (Capsicum annuum L.) in the West Mediterranean region of Turkey. African Journal of Biotechnology, 10(25), 4976-4979.
19. Buzkan, N., Arpacı, B. B., Simon, V., Fakhfakh, H. & Moury, B. (2013). High prevalence of poleroviruses in field-grown pepper in Turkey and Tunisia. Archives Virology, 158(4), 881-885. https://doi.org/10.1007/s00705-012-1553-y
20. Çulal-Kılıç, H., Yardimci N., Bal A., Güneş A. & Deniz F. (2017). Sensitive detection of tomato spotted wilt virus from pepper plants by DAS-ELISA, RT-PCR and IC-RT-PCR. Romanian Biotechnological Letters, 22, 12934-12939.
21. Keleş Öztürk, P. & Baloğlu, S., (2019). Doğu Akdeniz Bölgesi’nde açık alanda yetiştirilen biberlerde bazı virüslerin serolojik ve moleküler tanısı. Alatarım, 18(1), 1-11.
22. Fidan, H., Sarikaya, P., Yildiz, K., Topkaya, B., Erkis, G. & Calis, O. (2021). Robust molecular detection of the new tomato brown rugose fruit virus in infected tomato and pepper plants from Turkey. Journal of Integrative Agriculture, 20(8), 2170-2179. https://doi.org/10.1016/S2095-3119(20)63335-4.
23. Deligöz, İ., Baltacı, A., Çelik, N., Özdemir, S., Uzunoğulları, N. & Kutluk Yılmaz, N. D. (2023). Türkiye’de biberde enfeksiyon oluşturan virüslerin belirlenmesi. Anadolu Tarım Bilimleri Dergisi, 38(1), 117-130.
24. Güller, A., Usta, M., & Randa-Zelyüt, F. (2023). Genetic diversity and population structure of tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) variants from Antalya province, Turkey. Notulae Botanicae Horti Agrobotanici Cluj-Napoca, 51(3), 13356.
25. Can, S. & Baloğlu, S. (2020). Akdeniz Bölgesi’nde örtü altı biber üretim alanlarinda hıyar mozaik virüsü (cucumber mosaic virus, CMV) ‘nün saptanması ve karakterizasyonu. Çukurova Üniversitesi, Fen ve Mühendislik Bilimleri Dergisi, 39-3.
26. Güneş, N. & Gümüş, M. (2019). Detection and characterization of tomato spotted wilt virus and cucumber mosaic virus on pepper growing areas in Antalya. Journal of Agricultural Sciences, 25(3), 259-271. https://doi.org/10.15832/ankutbd.499144
27. Çulal-Kılıç, H. (2019). Biological, serological and molecular detection of tomato mosaic virus infecting pepper plants from Turkey. Applied Ecology and Environmental Research, 17, 6338-6347.
28. Güldür, M.E. & Çaglar, B. K. (2006). Outbreaks of Pepper mild mottle virus in greenhouses in Sanlıurfa, Turkey. Journalof Plant Pathology, 88(3), 337–340.
29. Çağlar, B. K., Fidan, H. & Elbeaino, T. (2013). Detection and molecular characterization of pepper mild mottle virus from Turkey. Journal of Phytopathology, 161(6), 434-438. https://doi.org/10.1111/jph.12068.
30. Çulal–Kılıç, H., Yardımcı, N., Serdar, T. & Konu, A. (2015). Cucumber mosaic virus and pepper mild mottle virus in pepper growing areas in Burdur Province Turkey. International Journal of Scientific and Technological Research, 1(1), 50-60.
31. Moury, B. & Verdin, E. (2012). Viruses of pepper crops in the Mediterranean Basin: A Remarkable stasis. In G. Loebenstein, H. Lecoq, (Ed). Advances in Virus Research. Academic Press, (pp. 127-162). https://doi.org/ 10.1016/B978-0-12-394314-9.00004-X.