Research Article
BibTex RIS Cite

Investigation of the Frequency of Rotavirus and Adenovirus in Patients with Acute Gastroenteritis; Sakarya

Year 2018, Volume: 8 Issue: 4, 746 - 752, 30.12.2018
https://doi.org/10.31832/smj.473812

Abstract

Objective

Among infectious diseases worldwide,
gastroenteritis is the third leading cause of death which brings about 527,000
losses of life among children annually. Rotavirus
and enteric adenoviruses are the most common agents of acute gastroenteritis in
children. Analysis of viral antigens in stool samples is important for
diagnosis. In this study we investigated to find out the frequency of rotavirus
and adenovirus in stool samples from patients with gastroenteritis. We also
evaluated the distribution of rotavirus and adenovirus according to gender, age
and the season.

 

Materials and Methods

In our study,
10.139 stool samples were investigated for the presence of rotavirus and 10.182
stool samples for the presence of adenovirus. The samples were obtained from
patients
with acute
gastroenteritis between June
2017-May 2018 were investigated retrospectively. The presence of rotavirus and adenovirus was investigated with
immunochromatographic method (RIDA®QUICK Rotavirus/Adenovirus combi, R-Biopharm
AG, Germany). The distribution of rotavirus and adenovirus frequency was
evaluated according to gender, age and the season.

Results

Rotavirus
antigen was detected in 1427 (%14,1) and adenovirus antigen in
773 (%7,6) of the investigated samples. Rotavirus antigen was determined in %13,8
of the male and %14,4 of the female patients. As a result of the statis­tical
analysis a significant difference was not found between genders (p=0,44). 1187
of the rotavirus antigen positi­ve cases (%83,1) were in the 0-5 years age
group and antigen positivity (19.1%) was determined mostly in children between
13-24 months of age. The most common season was determined as winter (9,6%).
Adenovirus antigen positivity (10,2%) was determined mostly in children between
0-12 months of age. Incremental rate was found statistically significant
comparing with the other age groups (p <0,05).  No statistically significant relati­onship
was determined between the presence of adenovirus antigen and gender (p=0,836)

Conclusion

















Rotavirus and
enteric adenoviruses cause important public health problems in terms of acute
gastroenteritis in children in our region. The data obtained in this study
showed that viral agents should be investigated in patients with acute
gastroenteritis.
Early detection
using sensitive and specific laboratory methods will be useful for prevention
and control of rotavirus and adenovirus infections.

References

  • Kaynaklar1. Akan H, Izbirak G, Gürol Y, Sarikaya S, Gündüz TS, Yilmaz G, et al. Rotavirus and adenovirus frequency among patients with acute gastroenteritis and their relationship to clinical parameters: A retrospective study in Turkey. Asia Pac Fam Med 2009;8:8.2. Akıncı N, Ercan TE, Yalman N, Eren A, Severge B, Ercan G. Akut gastroenteritli çocuklarda adenovirüs ve rotavirüs. Çocuk Enfeks Derg 2007;1:98-101.3.Carroll KC, Butel J, Morse S. Jawetz Melnick & Adelbergs Medical Microbiology. 27th ed. New York: McGraw-Hill Professional, 2015.4. Tate JE, Burton AH, Boschi-Pinto C, Steele AD, Duque J, Parashar UD. WHO-Coordinated Global Rotavirus Surveillance Network. 2008 estimate of worldwide rotavirus-associated mortality in children younger than 5 years before the introduction of universal rotavirus vaccination programmes: A systematic review and meta-analysis. Lancet Infect Dis 2012;12:136–141.5. Parashar UD, Hummelman EG, Bresee JS, Miller MA, Glass RI. Global illness and deaths caused by rotavirus disease in children. Emerg Infect Dis 2003;9:565–572. 6.Kapikian AZ, Chanock RM, Hoshino Y. Rotaviruses. In: Knipe DM,Howley PM (eds.), Field’s Virology. 4 th ed. Philadelphia: Lipincott Williams and Wilkins; 2001:1787-1833. 7. Bass DM. Rotavirus and other agents of viral gastroenteritis. In: Behrman RE, Kliegman EM, Jenson HB (eds.), Nelson Textbook of Pediatrics. 17 th ed. WB Saunders; 2004. p1081-1083. 8. Kim J, Kim HS, Kim HS, Kim JS, Song W, Lee KM. Evaluation of an immunochromatographic assay for the rapid and simultaneous detection of rotavirus and adenovi¬rus in stool samples. Ann Lab Med 2014;34:216-222.9. Malek MA, Teleb N, Abu-Elyazeed R, Riddle MS, El Sherif M, Steele AD, et al. The epidemiology of rotavirus diarrhea in countries in the Eastern Mediterranean Region. J Infect Dis 2010;202:S12–22. 10. Podkolzin A, Fenske E, Abramycheva NY, Shipulin G, Sagalova O, Mazepa V, et al. Hospital-based surveillance of rotavirus and other viral agents of diarrhea in children and adults in Russia, 2005–2007. J Infect Dis 2009;200:S228–33. 11. Khoury H, Ogilvie I, El Khoury AC, Duan Y, Goetghebeur MM. Burden of rotavirus gastroenteritis in the Middle Eastern and North African pediatric population. BMC Infect Dis 2011;11:9. 12. Mwenda JM, Ntoto KM, Abebe A, Enweronu-Laryea C, Amina I, Mchomvu J, et al. Burden and epidemiology of rotavirus diarrhea in selected African countries: Preliminary results from the African Rotavirus Surveillance Network. J Infect Dis 2010;202:S5–S11. 13. Centers for Disease Control & Prevention (CDC). Rotavirus Surveillance — Worldwide, 2009. Morbidity and Mortality Weekly Report 2011;60:514-516.14. Monavari SHR, Hadifar S, Mostafaei S, Miri A, Keshavarz M, Babaei F, et al. Epidemiology of Rotavirus in the Iranian Children: A Systematic Review and Meta-analysis. J Glob Infect Dis 2017;9:66–72. 15.Gültepe B, Yaman G, Çıkman A, Güdücüoğlu H. Çocukluk yaş grubu gastroenteritlerde rotavirus ve adenovirus sıklığı. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2012;42:16-20.16. Balkan ÇE, Çelebi D, Çelebi Ö, Altoparlak Ü. Erzurum’da 0-5 yaş arası çocuklarda rotavirus ve adenovirus sıklığının araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2012;42:51-54.17. Tekin A. Mardin’deki akut gastroenteritli çocuk¬larda rotavirüs ve enterik adenovirüs sıklığı. J Clin Exp Invest 2010;1:41-45.18. Türk Dağı H, Fındık D. Akut gastroenteritli hasta¬larda rotavirüs ve adenovirüs antijenlerinin araş-tırılması. J Clin Exp Invest 2014;5:256-260.
  • 19. Meral M, Bozdayı G. Dünyada ve ülkemizde rotavirus epidemiyolojisi. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2010;40:1-10. 20. Kirkwood CD, Roczo-Farkas S, Australian Rotavirus Surveillance Group. Australian Rotavirus Surveillance Program annual report, 2014. Commun Dis Intell Q Rep 2015;39:E337-346.21. Durmaz R, Bakkaloglu Z, Unaldi O, Karagoz A, Korukluoglu G, Kalaycioglu AT, et al. Prevalence and diversity of rotavirus A genotypes cirulating in Turkey during a 2-year sentinel surveillance period, 2014-2016. J Med Virol 2018;90:229-238. 22. Dennehy PH. Rotavirus Vaccines: an Overview. Clin Microbiol Rev 2008;21:198–208.
  • 23. Özdemir S, Delialioğlu N, Emekdaş G. Akut gastro¬enteritli çocuklarda rotavirüs, adenovirüs ve astrovirüs sıklığının araştırılması ve epidemiyolojik özelliklerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2010;44:571-578.
  • 24. Öztürk O, Demir B, Yalçın BM, Ünal M. Birinci basamakta adenovirüs enfeksiyonları. Klinik Tıp Aile Hekimliği Dergisi 2014;6:21-25.

Akut Gastroenteritli Hastalarda Rotavirüs ve Adenovirüs Sıklığının Araştırılması; Sakarya

Year 2018, Volume: 8 Issue: 4, 746 - 752, 30.12.2018
https://doi.org/10.31832/smj.473812

Abstract

Amaç

Gastroenteritler çocuklarda ölümle
sonuçlanan enfeksiyon hastalıkları arasında dünya genelinde üçüncü sıradadır ve
yılda yaklaşık 527.000 çocuğun ölümüne neden olmaktadır. Viral gastroenterit etkenlerinden rotavirüs
ve enterik adenovirüs­ler, çocuklarda akut gastroenteritlerin en sık görülen
etkenleridir. Dışkı örneklerinde viral antijen analizi tanı açısından
önemlidir. Bu çalışmada, gastroenterit ön tanılı hastaların dışkı
örneklerinde rotavirüs ve adenovirüs antijenlerinin görülme sık­lığını
incelenmiştir. Ayrıca bu etkenlerin cinsiyete, yaşa ve mevsimlere göre dağılımı
da değerlendirilmiştir.

Gereç
ve Yöntemler

Çalışmamızda,
rotavirüs araştırmak amacı ile 10.139, adenovirüs araştırmak amacı ile 10.182
dışkı örneği incelemeye alınmıştır.
Haziran 2017-Mayıs 2018 tarihleri arasında akut gastroenterit ön tanısı
ile laboratuarımıza gönderilen örneklere ait laboratuvar kayıtları retrospektif
olarak incelenmiştir. Viral enfeksiyon
etkenlerinden rotavirüs ve adenovirüs pozitifliği immünokromatografik yöntem (RIDA®QUICK
Rotavirus/Adenovirus combi, R-Biopharm, Almanya) kullanılarak araştırıl­mıştır.
Rotavirüs ve adenovirüs sıklığının hastaların cinsiyetlerine, yaşlarına ve
örneklerin gönderildiği mevsimlere göre dağılımı istatistiksel olarak
değerlendirilmiştir.

Bulgular                   

Araştırılan
örneklerin 1427’sinde (%14,1) rotavirüs,
773’ünde (%7,6) adenovirüs
antijeni tespit edilmiştir. Rotavirüs antijeni erkek hastaların %13,8’inde,
kadınların %14,4’ünde pozitif olarak saptanmış olup, cinsiyetler arasında
istatistiksel olarak anlamlı farklılık bulunmamıştır (p=0,44). Rotavirüs
antijeni pozitif bulunan olgu­ların 1187’si (%83,1) 0-5 yaş grubu hastalardan
oluşurken, antijen pozitifliği en çok yaş aralığı 13-24 ay (%19.1) arasında
bulunan çocuklarda saptanmıştır. Mevsim olarak en sık kış ayla­rında (%9,6) tespit edilmiştir. Adenovirüs antijeni
pozitifliği en yüksek yaş grubu 0-12 ay (%10,2) 
yaş grubu olmuştur.
Diğer gruplarla kıyaslandığında
da anlamlı seviyede yüksek oranda bulunmuştur. (p<0,05). Adenovirüs
anti­jenleri saptanması ile cinsiyet arasında anlamlı ilişki saptanmamıştır.
(p=0,836)

Sonuç















Bölgemizde 
rotavirüs ve enterik adenovirüs özellikle çocukluk çağı gastroenteritleri
arasında önemli bir halk sağlığı sorunu oluşturmaktadır. Çalışmamız sonucunda
elde edilen verilere göre viral etkenlerin de mutlaka araş­tırılması
gerekmektedir.
Rotavirüs
ve adenovirüs enfeksiyonlarının korunma ve kontrolünde bu enfeksiyonların
duyarlı ve spesifik laboratuar testleriyle erken tespiti faydalı olacaktır.

References

  • Kaynaklar1. Akan H, Izbirak G, Gürol Y, Sarikaya S, Gündüz TS, Yilmaz G, et al. Rotavirus and adenovirus frequency among patients with acute gastroenteritis and their relationship to clinical parameters: A retrospective study in Turkey. Asia Pac Fam Med 2009;8:8.2. Akıncı N, Ercan TE, Yalman N, Eren A, Severge B, Ercan G. Akut gastroenteritli çocuklarda adenovirüs ve rotavirüs. Çocuk Enfeks Derg 2007;1:98-101.3.Carroll KC, Butel J, Morse S. Jawetz Melnick & Adelbergs Medical Microbiology. 27th ed. New York: McGraw-Hill Professional, 2015.4. Tate JE, Burton AH, Boschi-Pinto C, Steele AD, Duque J, Parashar UD. WHO-Coordinated Global Rotavirus Surveillance Network. 2008 estimate of worldwide rotavirus-associated mortality in children younger than 5 years before the introduction of universal rotavirus vaccination programmes: A systematic review and meta-analysis. Lancet Infect Dis 2012;12:136–141.5. Parashar UD, Hummelman EG, Bresee JS, Miller MA, Glass RI. Global illness and deaths caused by rotavirus disease in children. Emerg Infect Dis 2003;9:565–572. 6.Kapikian AZ, Chanock RM, Hoshino Y. Rotaviruses. In: Knipe DM,Howley PM (eds.), Field’s Virology. 4 th ed. Philadelphia: Lipincott Williams and Wilkins; 2001:1787-1833. 7. Bass DM. Rotavirus and other agents of viral gastroenteritis. In: Behrman RE, Kliegman EM, Jenson HB (eds.), Nelson Textbook of Pediatrics. 17 th ed. WB Saunders; 2004. p1081-1083. 8. Kim J, Kim HS, Kim HS, Kim JS, Song W, Lee KM. Evaluation of an immunochromatographic assay for the rapid and simultaneous detection of rotavirus and adenovi¬rus in stool samples. Ann Lab Med 2014;34:216-222.9. Malek MA, Teleb N, Abu-Elyazeed R, Riddle MS, El Sherif M, Steele AD, et al. The epidemiology of rotavirus diarrhea in countries in the Eastern Mediterranean Region. J Infect Dis 2010;202:S12–22. 10. Podkolzin A, Fenske E, Abramycheva NY, Shipulin G, Sagalova O, Mazepa V, et al. Hospital-based surveillance of rotavirus and other viral agents of diarrhea in children and adults in Russia, 2005–2007. J Infect Dis 2009;200:S228–33. 11. Khoury H, Ogilvie I, El Khoury AC, Duan Y, Goetghebeur MM. Burden of rotavirus gastroenteritis in the Middle Eastern and North African pediatric population. BMC Infect Dis 2011;11:9. 12. Mwenda JM, Ntoto KM, Abebe A, Enweronu-Laryea C, Amina I, Mchomvu J, et al. Burden and epidemiology of rotavirus diarrhea in selected African countries: Preliminary results from the African Rotavirus Surveillance Network. J Infect Dis 2010;202:S5–S11. 13. Centers for Disease Control & Prevention (CDC). Rotavirus Surveillance — Worldwide, 2009. Morbidity and Mortality Weekly Report 2011;60:514-516.14. Monavari SHR, Hadifar S, Mostafaei S, Miri A, Keshavarz M, Babaei F, et al. Epidemiology of Rotavirus in the Iranian Children: A Systematic Review and Meta-analysis. J Glob Infect Dis 2017;9:66–72. 15.Gültepe B, Yaman G, Çıkman A, Güdücüoğlu H. Çocukluk yaş grubu gastroenteritlerde rotavirus ve adenovirus sıklığı. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2012;42:16-20.16. Balkan ÇE, Çelebi D, Çelebi Ö, Altoparlak Ü. Erzurum’da 0-5 yaş arası çocuklarda rotavirus ve adenovirus sıklığının araştırılması. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2012;42:51-54.17. Tekin A. Mardin’deki akut gastroenteritli çocuk¬larda rotavirüs ve enterik adenovirüs sıklığı. J Clin Exp Invest 2010;1:41-45.18. Türk Dağı H, Fındık D. Akut gastroenteritli hasta¬larda rotavirüs ve adenovirüs antijenlerinin araş-tırılması. J Clin Exp Invest 2014;5:256-260.
  • 19. Meral M, Bozdayı G. Dünyada ve ülkemizde rotavirus epidemiyolojisi. Türk Mikrobiyol Cem Derg 2010;40:1-10. 20. Kirkwood CD, Roczo-Farkas S, Australian Rotavirus Surveillance Group. Australian Rotavirus Surveillance Program annual report, 2014. Commun Dis Intell Q Rep 2015;39:E337-346.21. Durmaz R, Bakkaloglu Z, Unaldi O, Karagoz A, Korukluoglu G, Kalaycioglu AT, et al. Prevalence and diversity of rotavirus A genotypes cirulating in Turkey during a 2-year sentinel surveillance period, 2014-2016. J Med Virol 2018;90:229-238. 22. Dennehy PH. Rotavirus Vaccines: an Overview. Clin Microbiol Rev 2008;21:198–208.
  • 23. Özdemir S, Delialioğlu N, Emekdaş G. Akut gastro¬enteritli çocuklarda rotavirüs, adenovirüs ve astrovirüs sıklığının araştırılması ve epidemiyolojik özelliklerinin değerlendirilmesi. Mikrobiyol Bul 2010;44:571-578.
  • 24. Öztürk O, Demir B, Yalçın BM, Ünal M. Birinci basamakta adenovirüs enfeksiyonları. Klinik Tıp Aile Hekimliği Dergisi 2014;6:21-25.
There are 4 citations in total.

Details

Primary Language Turkish
Journal Section Articles
Authors

Hüseyin Agah Terzi 0000-0003-2343-439X

Özlem Aydemir 0000-0003-4533-6934

Publication Date December 30, 2018
Submission Date October 23, 2018
Published in Issue Year 2018 Volume: 8 Issue: 4

Cite

AMA Terzi HA, Aydemir Ö. Akut Gastroenteritli Hastalarda Rotavirüs ve Adenovirüs Sıklığının Araştırılması; Sakarya. Sakarya Tıp Dergisi. December 2018;8(4):746-752. doi:10.31832/smj.473812

30703

The published articles in SMJ are licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License.